سال 9، شماره 1 - ( بهار 1394 )                   جلد 9 شماره 1 صفحات 34-29 | برگشت به فهرست نسخه ها

XML English Abstract Print

Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Pakdel M, Zarrabi M, Asgarani E, Mohammadi P. Prediction of antigenic sites on ALS1 and HWP1 protein sequences in vaginal isolated C. albicans of using bioinformatics analysis. Iran J Med Microbiol 2015; 9 (1) :29-34
URL: http://ijmm.ir/article-1-319-fa.html
پاکدل مونا، ضرابی محبوبه، عسگرانی عزت، محمدی پریسا. پیشگویی مناطق آنتی ژنی در دو توالی پروتئینی ALS1 و HWP1 در جدایه های واژینالی کاندیدا آلبیکنس با تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی. مجله میکروب شناسی پزشکی ایران. 1394; 9 (1) :29-34

URL: http://ijmm.ir/article-1-319-fa.html

پیشگویی مناطق آنتی ژنی در دو توالی پروتئینی ALS1 و HWP1 در جدایه های واژینالی کاندیدا آلبیکنس با تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی
مونا پاکدل1 ، محبوبه ضرابی1 ، عزت عسگرانی1 ، پریسا محمدی2
1- گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه،دانشگاه الزهرا (س)، تهران، ایران.
2- گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه،دانشگاه الزهرا (س)، تهران، ایران. ، p.mohammadi@alzahra.ac.ir
چکیده:   (12513 مشاهده)

زمینه و اهداف: توانایی تشخیص مناطق آنتی ژنی در پروتئین ها از جمله عوامل مهم برای درمان می باشد. هدف از این مطالعه پیشگویی مناطق آنتی ژنی در دو توالی پروتئینی ALS1 (Agglutinin Like Sequence) و HWP1 (Hyphal Wall Protein Sequences) در جدایه های کاندیدا آلبیکنس عامل عفونت واژینالی با تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی می باشد.

مواد و روش کار: در این بررسی 7 جدایه از زنان مبتلا به عفونت واژینال که طی سال های 1390و 1391 از مراکز مختلف پزشکی تهران جدا شده بود انتخاب گردید. استخراج DNA به روش فنل- کلروفرم- ایزوآمیل الکل صورت گرفت. سپس Multiplex PCR با استفاده از پرایمرهای اختصاصی انجام شد. به منظور مطالعات بیوانفورماتیکی، ژن ها توالی یابی و ترجمه شدند. سپس مناطق آنتی ژنی دو توالی پروتئینی از طریق برنامه  Physico-Chemical Profilesشناسایی شدند.

یافته‌ها: نتایج حاصل حضور دو ژن als1 و hwp1 در جدایه های مورد مطالعه را نشان داد. در دو توالی پروتئینی ALS1 و HWP1 به ترتیب 2 و 1 منطقه آنتی ژنی تشخیص داده شد.

نتیجه‌گیری: طبق مطالعات گذشته، فسفریلاسیون سرین و ترئونین یکی از مکانیسم های موثر در آنتی ژنسیته دو پروتئین ALS1 و HWP1 است. نتایج حاصل از این مطالعه تایید نمود که سرین و ترئونین عمده ترین آمینواسیدها در این مناطق با خاصیت آنتی ژنتی بالا می باشند.

واژه‌های کلیدی: کاندیدا آلبیکنس، بیوفیلم، عفونت واژینال، بیوانفورماتیک
متن کامل [PDF 680 kb]   (3264 دریافت)    
نوع مطالعه: مقاله پژوهشی | موضوع مقاله: قارچ شناسی پزشکی
دریافت: 1393/5/3 | پذیرش: 1393/9/23 | انتشار الکترونیک: 1394/1/29
ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA
ارسال پیام به نویسنده مسئول

بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.

کلیه حقوق این وب سایت متعلق به مجله میکروب شناسی پزشکی ایران می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق   ناشر: موسسه فرنام

© 2025 CC BY-NC 4.0 | Iranian Journal of Medical Microbiology

Designed & Developed by : Yektaweb Publishr: Farname Inc.