سال 18، شماره 2 - ( فروردین - اردیبهشت 1403 )                   جلد 18 شماره 2 صفحات 96-89 | برگشت به فهرست نسخه ها


XML English Abstract Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Akhlaghi F, Nikokar I, Mojtahedi A, Mobin M, Atrkar Roshan Z, Karampour M. Molecular Detection of Mutations in gyrA, gyrB, parC, and parE Genes in the Quinolone Resistance Determining Region Among Pseudomonas aeruginosa Isolated From Burn Wound Infection. Iran J Med Microbiol 2024; 18 (2) :89-96
URL: http://ijmm.ir/article-1-2291-fa.html
اخلاقی فاطمه، نیکوکار ایرج، مجتهدی علی، مبین محمدرضا، عطرکار روشن زهرا، کرم پور مسلم. تشخیص مولکولی جهش در ژن‌های gyrA، gyrB، parC و parE در ناحیه تعیین‌کننده مقاومت به کینولون ها در سودوموناس آئروژینوزا جدا شده از عفونت زخم سوختگی. مجله میکروب شناسی پزشکی ایران. 1403; 18 (2) :89-96

URL: http://ijmm.ir/article-1-2291-fa.html


1- کمیته تحقیقات دانشجویی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی گیلان، رشت و کمیته تحقیقات دانشجویی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی گیلان، رشت
2- گروه میکروب شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی گیلان، رشت، ایران & مرکز تحقیقات بیوتکنولوژی پزشکی، آزمایشگاه میکروبیولوژی و ایمونولوژی بیماری‌های عفونی، دانشکده پیراپزشکی، دانشگاه علوم پزشکی گیلان، رشت، ایران ، nikokariraj@yahoo.com
3- گروه میکروب شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی ایران، تهران، ایران
4- گروه جراحی، دانشگاه علوم پزشکی گیلان، رشت، ایران
5- کمیته تحقیقات دانشجویی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی گیلان، رشت
چکیده:   (1105 مشاهده)

زمینه و اهداف:  شیوع مقاومت به فلوروکینولون در جدایه های سودوموناس آئروژینوزا به ویژه در عفونت های زخم سوختگی رو به افزایش است. علت اصلی مقاومت به سیپروفلوکساسین به تغییرات ژنتیکی در ناحیه تعیین کننده مقاومت به کینولون (QRDR) نسبت داده می شود. در این مطالعه، ما مشخصات مقاومت ضد میکروبی و جهش‌های ژن QRDR را در هر دو سویه مقاوم و غیرمقاوم به سیپروفلوکساسین از سودوموناس آئروژینوزا جدا شده از بیماران زخم سوختگی ارزیابی کردیم.
مواد و روش کار:  در مجموع ۳۰۰ نمونه از بیماران مبتلا به عفونت زخم سوختگی در گیلان جمع آوری شد. جدایه ها به عنوان سودوموناس آئروژینوزا شناسایی شدند و آزمایش های حساسیت دارویی با استفاده از روش دیسک دیفیوژن آگار انجام شد. استخراج DNA  و آنالیز واکنش زنجیره‌ای پلیمراز (PCR) برای تقویت و تعیین توالی ژن‌های gyrA، gyrB، parC و parE در ناحیه QRDR انجام شد.
یافته ها:  مقاومت به توبرامایسین، جنتامایسین، پیپراسیلین، سیپروفلوکساسین، سفتازیدیم و آمیکاسین به ترتیب در ۵۹/۳۲، ۵۵/۰۸، ۵۱/۵۹، ۵۰/۸۴، ۳۰/۵۰ درصد و ۲۶/۲۷ درصد از ایزوله ها مشاهده شد. چهل و دو (۵۹/۳۵ %) ایزوله ها مقاوم به چند دارو (MDR) بودند. نتایج توالی یابی در ناحیه QRDR نشان داد که اکثر جهش ها در ژن gyrA اتفاق افتاده و ۸۵/۷۱ درصد از این جهش ها جایگزینی ترئونین با ایزولوسین (Thr-۸۳ Ile) در سویه های مقاوم به سیپروفلوکساسین بود. جایگزینی غیرمعمول اسید آمینه در کدون ۴۷۰ ژن parE کد کننده DNA توپوایزومراز IV (اسید آسپارتیک جایگزین شده با آسپاراژین) در سویه مقاوم به سیپروفلوکساسین مشاهده شد. هیچ جهشی در ژن  هایgyrB  (ژن آنزیم جیراز) و ژن parC کد کننده DNA توپوایزومراز IV یافت نشد.
نتیجه‌گیری:  نتایج این مطالعه نشان می دهد که جهش در ژن gyrA (ژن جیراز) مکانیسم اصلی و مهم مقاومت به فلوروکینولون ها می باشد. شناسایی این جهش‌ها می‌تواند در شناسایی ایزوله‌های مقاوم به فلوروکینولون ، چالش‌های درمانی و انتخاب آنتی‌بیوتیک مناسب، موثر باشد.

متن کامل [PDF 549 kb]   (559 دریافت)    
نوع مطالعه: مقاله پژوهشی | موضوع مقاله: باکتری شناسی پزشکی
دریافت: 1402/10/18 | پذیرش: 1403/2/21 | انتشار الکترونیک: 1403/3/5

فهرست منابع
1. Qin S, Xiao W, Zhou C, Pu Q, Deng X, Lan L, et al. Pseudomonas aeruginosa: pathogenesis, virulence factors, antibiotic resistance, interaction with host, technology advances and emerging therapeutics. Signal Transduct Target Ther. 2022;7(1):1-27. [DOI:10.1038/s41392-022-01056-1]
2. Shariati A, Asadian E, Fallah F, Azimi T, Hashemi A, Sharahi JY, et al. Evaluation of Nano-curcumin effects on expression levels of virulence genes and biofilm production of multidrug-resistant Pseudomonas aeruginosa isolated from burn wound infection in Tehran, Iran. Infect Drug Resist. 2019;12:2223. [DOI:10.2147/IDR.S213200] [PMID] [PMCID]
3. Hassannia M, Naderifar M, Salamy S, Akbarizadeh MR, Mohebi S, Moghadam MT. Engineered phage enzymes against drug-resistant pathogens: a review on advances and applications. Bioprocess Biosyst Eng. 2024;47(3):301-12. [DOI:10.1007/s00449-023-02938-6] [PMID]
4. Boroujeni MB, Mohebi S, Malekian A, Shahraeini SS, Gharagheizi Z, Shahkolahi S, et al. The therapeutic effect of engineered phage, derived protein and enzymes against superbug bacteria. Biotechnology and Bioengineering. 2024;121(1):82-99. [DOI:10.1002/bit.28581] [PMID]
5. Chegini Z, Khoshbayan A, Taati Moghadam M, Farahani I, Jazireian P, Shariati A. Bacteriophage therapy against Pseudomonas aeruginosa biofilms: a review. Ann Clin Microbiol Antimicrob. 2020;19(1):45. [DOI:10.1186/s12941-020-00389-5] [PMID] [PMCID]
6. Shahbandeh M, Taati Moghadam M, Mirnejad R, Mirkalantari S, Mirzaei M. The efficacy of AgNO3 nanoparticles alone and conjugated with imipenem for combating extensively drug-resistant Pseudomonas aeruginosa. Int J Nanomed. 2020;15:6905-16. [DOI:10.2147/IJN.S260520] [PMID] [PMCID]
7. Hosseini M, Ahmed Hamad M, Mohseni G, Salamy S, Dehghan Tarzjani S, Taati Moghadam M. Prediction of tsunami of resistance to some antibiotics is not far‐fetched which used during COVID‐19 pandemic. J Clin Lab Anal. 2023;37(15-16):e24959. [DOI:10.1002/jcla.24959] [PMID] [PMCID]
8. Pang Z, Raudonis R, Glick BR, Lin T-J, Cheng Z. Antibiotic resistance in Pseudomonas aeruginosa: mechanisms and alternative therapeutic strategies. Biotechnol Adv. 2019;37(1):177-92. [DOI:10.1016/j.biotechadv.2018.11.013] [PMID]
9. Magiorakos A-P, Srinivasan A, Carey RB, Carmeli Y, Falagas M, Giske C, et al. Multidrug-resistant, extensively drug-resistant and pandrug-resistant bacteria: an international expert proposal for interim standard definitions for acquired resistance. Clin Microbiol Infect. 2012;18(3):268-81. [DOI:10.1111/j.1469-0691.2011.03570.x] [PMID]
10. Nouri R, Ahangarzadeh Rezaee M, Hasani A, Aghazadeh M, Asgharzadeh M. The role of gyrA and parC mutations in fluoroquinolones-resistant Pseudomonas aeruginosa isolates from Iran. Braz J Microbiol. 2016;47:925-30. [DOI:10.1016/j.bjm.2016.07.016] [PMID] [PMCID]
11. Norouzi A, Hossieni NH, Mohebi S, Kandehkar GM, Taati MM. Frequency of plasmid-mediated qnrA, qnrB, and qnrS genes and determination of antibiotic susceptibility among quinolones and fluoroquinolones resistance Escherichia coli isolated from Kerman hospitals. Razi J Med Sci. 2016;23:98-105.
12. Nikokar I, Tishayar A, Flakiyan Z, Alijani K, Rehana-Banisaeed S, Hossinpour M, et al. Antibiotic resistance and frequency of class 1 integrons among Pseudomonas aeruginosa, isolated from burn patients in Guilan, Iran. Iran J Microbiol. 2013;5(1):36-41.
13. Khosravi AD, Motahar M, Abbasi Montazeri E. The frequency of class1 and 2 integrons in Pseudomonas aeruginosa strains isolated from burn patients in a burn center of Ahvaz, Iran. PloS One. 2017;12(8):e0183061. [DOI:10.1371/journal.pone.0183061] [PMID] [PMCID]
14. Humphries R, Bobenchik AM, Hindler JA, Schuetz AN. Overview of changes to the clinical and laboratory standards institute performance standards for antimicrobial susceptibility testing, M100. J Clin Microbiol. 2021;59(12):10-128. [DOI:10.1128/JCM.00213-21] [PMID] [PMCID]
15. Mohebi S, Hossieni Nave H, Norouzi A, Kandehkar Gharaman M, Taati Moghadam M. Detection of extended spectrum beta lactamases on class I integron in escherichia coli isolated from clinical samples. J Maz Univ Med Sci. 2016;26(138):66-76.
16. Moradi M, Norouzi A. Prevalence of bla-CTX-M, bla-SHV, and bla-TEM Genes and Comparison of Antibiotic Resistance Pattern in Extended-spectrum β-lactamase producing and non-producing groups of Klebsiella pneumoniae Isolated from Clinical Samples in Kerman Hospitals. J Adv Biomed Sci. 2016;6(1):120-8.
17. Moghadam M, Shariati A, Mirkalantari S, Karmostaji A. The complex genetic region conferring transferable antibiotic resistance in multidrug-resistant and extremely drug-resistant Klebsiella pneumoniae clinical isolates. New Microbes New Infect. 2020;36:100693. [DOI:10.1016/j.nmni.2020.100693] [PMID] [PMCID]
18. Taati Moghadam M, Hossieni Nave H, Mohebi S, Norouzi A. The evaluation of connection between integrons class I and II and ESBL-producing and Non-ESBL klebsiella pneumoniae isolated from clinical samples, Kerman. Iran J Med Microbiol. 2016;10(4):1-9.
19. Wang Y-T, Lee M-F, Peng C-F. Mutations in the quinolone resistance-determining regions associated with ciprofloxacin resistance in Pseudomonas aeruginosa isolates from Southern Taiwan. Biomark Genom Med. 2014;6(2):79-83. [DOI:10.1016/j.bgm.2014.03.003]
20. Dou Y, Huan J, Guo F, Zhou Z, Shi Y. Pseudomonas aeruginosa prevalence, antibiotic resistance and antimicrobial use in Chinese burn wards from 2007 to 2014. J Int Med Res. 2017;45(3):1124-37. [DOI:10.1177/0300060517703573] [PMID] [PMCID]
21. Tarafdar F, Jafari B, Azimi T. Evaluating the antimicrobial resistance patterns and molecular frequency of blaoxa-48 and blaGES-2 genes in Pseudomonas aeruginosa and Acinetobacter baumannii strains isolated from burn wound infection in Tehran, Iran. New Microbes New Infect. 2020;37:100686. [DOI:10.1016/j.nmni.2020.100686] [PMID] [PMCID]
22. Kishk RM, Abdalla MO, Hashish AA, Nemr NA, El Nahhas N, Alkahtani S, et al. Efflux MexAB-mediated resistance in P. aeruginosa isolated from patients with healthcare associated infections. Pathogens. 2020;9(6):471. [DOI:10.3390/pathogens9060471] [PMID] [PMCID]
23. Tchakal-Mesbahi A, Metref M, Singh VK, Almpani M, Rahme LG. Characterization of antibiotic resistance profiles in Pseudomonas aeruginosa isolates from burn patients. Burns. 2021;47(8):1833-43. [DOI:10.1016/j.burns.2021.03.005] [PMID] [PMCID]
24. Vaez H, Salehi-Abargouei A, Khademi F. Systematic review and meta-analysis of imipenem-resistant Pseudomonas aeruginosa prevalence in Iran. Germs. 2017;7(2):86-97. [DOI:10.18683/germs.2017.1113] [PMID] [PMCID]
25. Ahmadian L, Haghshenas MR, Mirzaei B, Norouzi Bazgir Z, Goli HR. Distribution and molecular characterization of resistance gene cassettes containing class 1 integrons in multi-drug resistant (MDR) clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa. Infect Drug Resist. 2020:2773-81. [DOI:10.2147/IDR.S263759] [PMID] [PMCID]
26. Pachori P, Gothalwal R, Gandhi P. Emergence of antibiotic resistance Pseudomonas aeruginosa in intensive care unit; a critical review. Genes Dis. 2019;6(2):109-19. [DOI:10.1016/j.gendis.2019.04.001] [PMID] [PMCID]
27. Mensa J, Barberán J, Soriano A, Llinares P, Marco F, Cantón R, et al. Antibiotic selection in the treatment of acute invasive infections by Pseudomonas aeruginosa: Guidelines by the Spanish Society of Chemotherapy. Revista Española de Quimioterapia. 2018;31(1):78.
28. Rashid Mahmood A, Mansour Hussein N. Study of Antibiotic Resistant Genes in Pseudomonas aeroginosa Isolated from Burns and Wounds. Arch Razi Inst. 2022;77(1):403-11.
29. Jacoby GA. Mechanisms of resistance to quinolones. Clin Infect Dis. 2005;41(Supplement_2):S120-S6. [DOI:10.1086/428052] [PMID]
30. Akasaka T, Tanaka M, Yamaguchi A, Sato K. Type II topoisomerase mutations in fluoroquinolone-resistant clinical strains of Pseudomonas aeruginosa isolated in 1998 and 1999: role of target enzyme in mechanism of fluoroquinolone resistance. Antimicrob Agents Chemother. 2001;45(8):2263-8. [DOI:10.1128/AAC.45.8.2263-2268.2001] [PMID] [PMCID]
31. Avsar C, Yegin Z. The Effect of Topoisomerase Mutations on the Resistance to the Second Generation Quinolones in Pseudomonas aeruginosa Clinical Isolates. Res Rev Res J Biol. 2017;5(1):2322-0066.
32. Ogunleye A. Identification of GyrA mutations conferring fluoroquinolone resistance in Pseudomonas aeruginosa isolated from poultry in Ibadan, Oyo State, Nigeria. Afr J Microbiol Res. 2012;6:1573-8. [DOI:10.5897/AJMR11.1466]
33. Salma R, Dabboussi F, Kassaa I, Hamze M, Khudary R. gyrA and parC mutations in quinolone-resistant clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa from Nini Hospital in north Lebanon. J Infect Chemother. 2013;19(1):77-81. [DOI:10.1007/s10156-012-0455-y] [PMID]
34. Farahi RM, Ali AA, Gharavi S. Characterization of gyrA and parC mutations in ciprofloxacin-resistant Pseudomonas aeruginosa isolates from Tehran hospitals in Iran. Iran J Microbiol. 2018;10(4):242.
35. Fazeli H, Havaei SA, Saeidi S, Badamchi A, Zamani FZ, Solgi H. Molecular Detection of gyrA, parC and oprD Mutation in Pseudomonas aeruginosa Isolates from a University Hospital of Isfahan, Iran during 2016. J Med Bacteriol. 2017;6(1-2):21-7.
36. Wydmuch Z, Skowronek-Ciolek O, Cholewa K, Mazurek U, Pacha J, Kepa M, et al. GyrA mutations in ciprofloxacin-resistant clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa in a Silesian Hospital in Poland. Pol J Microbiol. 2005;54(3):201-6.

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA

ارسال پیام به نویسنده مسئول


بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.

کلیه حقوق این وب سایت متعلق به مجله میکروب شناسی پزشکی ایران می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق   ناشر: موسسه فرنام

© 2025 CC BY-NC 4.0 | Iranian Journal of Medical Microbiology

Designed & Developed by : Yektaweb Publishr: Farname Inc.