سال 14، شماره 3 - ( خرداد - تیر 1399 )                   جلد 14 شماره 3 صفحات 270-289 | برگشت به فهرست نسخه ها


XML English Abstract Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Chanbari M, Mirnejad R, Babapour E. Evaluation of Resistance to Fluoroquinolones and Its Relationship whit parC Gene Mutation in Klebsiella pneumoniae Clinical Isolates. Iran J Med Microbiol. 2020; 14 (3) :270-289
URL: http://ijmm.ir/article-1-987-fa.html
چنبری معصومه، میر نژاد رضا، باباپور ابراهیم. بررسی مقاومت به فلوروکوئینولون‌ها و ارتباط آن با موتاسیون در ژن parC در جدایه‌های کلینیکی کلبسیلا پنومونیه. مجله میکروب شناسی پزشکی ایران. 1399; 14 (3) :270-289

URL: http://ijmm.ir/article-1-987-fa.html


1- فارغ التحصیل دانشگاه آزاد اسلامی واحد کرج
2- استاد تمام دانشگاه علوم پزشکی بقیه الله (عج)
3- استادیار گروه میکروبیولوژی دانشگاه آزاد اسلامی واحد کرج ، e_babapoor@yahoo.com
چکیده:   (187 مشاهده)
زمینه و اهداف: کلبسیلا پنومونیه به دلیل ایجاد طیف وسیعی از بیماری‌ها و مقاومت آنتی‌بیوتیکی بسیار موردتوجه است. مقاومت به فلوروکوئینولون‌­­ها در این باکتری­های گرم منفی، ممکن است درنتیجه موتاسیون کروموزومی در ژن‌های gyr و par باشد. هدف از این مطالعه بررسی الگوی مقاومت به فلوروکوئینولون­‌ها و ارتباط آن با موتاسیون در ژن parC در میان جدایه‌های بالینی کلبسیلا پنومونیه هست.
روش کار: در این مطالعه توصیفی- تحلیلی، تعداد ۹۵ کلبسیلا پنومونیه پس از تشخیص بیوشیمیایی و مولکولی، ازنظر مقاومت به آنتی­بیوتیک­های مختلف، مطابق توصیه موسسه استاندارد آزمایشگاهی و بالینی CLSI بررسی و جدایه­‌های مقاوم به سیپروفلوکساسین غربالگری شدند. برای بررسی وجود موتاسیون در ژن parC در کلبسیلا پنومونیههای مقاوم به سیپروفلوکساسین، از طریق تکثیر این ژن به روش PCR و سپس تعیین توالی قطعه تکثیرشده و درنهایت مقایسه آن با توالی ژنوم باکتری استاندارد موجود در سایت NCBI، از طریق نرم‌افزارهای آنلاین، Insilico و Clustalw۲، بلاست گردید.
یافته‌ها:نتایج تست آنتی­بیوگرام حاکی از گسترش باکتری­های Multi Drug Resistant (MDR) بود. ۳/۱% جدایه­ها به همه­ی ۱۳ آنتی‌بیوتیک موردمطالعه و ۲/۲۴% جدایه‌­ها سیپروفلوکساسین مقاوم بودند. بیشترین و کم‌ترین درصد مقاومت آنتی‌بیوتیکی به ترتیب برای آمپی‌سیلین و آموکسی­سیلین (۹۸/۹%) و ایمی­پنم (۱۳/۶%) تعیین شد. آنالیز توالی یابی ژن parC نشان داد از ۲۳ جدایه مقاوم به سیپروفلوکساسین، ۱۶ جدایه در کدون ۸۰ (I۸۰S)، یکی در کدون ۸۴ (E۸۴K) و ۳ جدایه نیز دچار جهش در چارچوب بودند.
نتیجه گیری: جهش‌ در ژن parC می‌­تواند یکی از عوامل اصلی مقاومت به فلوروکوئینولون‌­ها و افزایش باکتری­‌های MDR و ایجاد عفونتهای بیمارستانی باشد.
متن کامل [PDF 1228 kb]   (42 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: مقاومت پادزیستی (آنتی بیوتیکی)
دریافت: 1398/8/7 | پذیرش: 1399/1/2 | انتشار الکترونیک: 1399/2/23

فهرست منابع
1. Alves MS, Dias RC, De Castro AC, Riley LW,Moreira BM.Identification of clinical isolates of indole-positive and indole-negative Klebsiella spp. J Clin Microbiol. 2006 [DOI:10.1128/JCM.00940-06] [PMID] [PMCID]
2. October;44(10):3646-3640.
3. Babypadmini S, Appalaraju B. Extended spectrum-lactamases in urinary isolates of Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae-prevalence and susceptibility pattern in a tertiary care hospital. Indian Journal of Medical Microbiology. 2004;22(3):172.
4. Deguchi T, Fukuoka A, Yasuda M, Nakano M, Ozeki S, Kanematsu E, et al. Alterations in the GyrA subunit of DNA gyrase and the ParC subunit of topoisomerase IV in quinolone-resistant clinical isolates of Klebsiella pneumoniae. Antimicrob Agents Chemother 1997;41(3):699. [DOI:10.1128/AAC.41.3.699] [PMID] [PMCID]
5. Molana Z, Ferdosi Shahandashti E, Gharavi S, Shafii M, Norkhomami S, Ahangarkani F, et al. Molecular investigation of class I integron in Klebsiella Pneumoniae isolated from intensive care unit (Shahid Beheshti Hospital of Babol 2010). J Babol Univ Med Sci 2011;13(6): 7-13.
6. Ferragut C, Izard D, Gavini F, Kersters K, De Ley J, Leclerc H. Klebsiella trevisanii: a new species from water and soil. Int J Syst Bacteriol.1983; 33(2):133-42. [DOI:10.1099/00207713-33-2-133]
7. Izard D, Ferragut C, Gavini F, Kersters K, De Ley J, Leclerc H. Klebsiella terrigena, a new species from soil and water. Int J Syst Bacteriol.1981; 31(2): 116-27. [DOI:10.1099/00207713-31-2-116]
8. Drancourt M, Bollet C, Carta A, Rousselier P. Phylogenetic analyses of Klebsiella species delineate Klebsiella and Raoultella gen. nov., with 201 description of R. ornithinolytica comb. nov., R. terrigena comb. nov. and R. planticola comb. nov. Int J Syst Evol Microbiol.2001;51(3): 925-32. [DOI:10.1099/00207713-51-3-925] [PMID]
9. Ko WC, Paterson DL, Sagnimeni AJ, Hansen DS, Von Gottberg A, Mohapatra S, et al. Community-acquired Klebsiella pneumoniae bacteremia: global differences inclinical patterns. Emerg Infect Dis. 2002;8(2):160-6. [DOI:10.3201/eid0802.010025] [PMID] [PMCID]
10. Rahmati Roodsari R, Fallah F, Taherpour A, Hakemi M, Hashemi A. Carbapenem- Resistant Bacteria and Laboratory Detection Methods. Archives of Pediatric Infectiou Diseases.2013; 1(4): 191-188. [DOI:10.5812/pedinfect.5193]
11. Peleg AY, Seifert H, Paterson DL. Acinetobacter baumannii: emergence of a successful pathogen. Clin Microbiol Rev. 2008; 21(3): 538-582. [DOI:10.1128/CMR.00058-07] [PMID] [PMCID]
12. Perez F, Hujer AM, Hujer KM, Dacker BK, Rather PN, Bonomo RA. Global challenge of multidrug- resistant Acinetobacter baumannii. Antimicrob Agents Chemother. 2007; 51(10): 3471-84. [DOI:10.1128/AAC.01464-06] [PMID] [PMCID]
13. Chien ST, Lin CH, Hsueh JC, Lip L, Hsu CH, Chang SH, et al. Mutation of gyrA and parC in clinical isolates of Acinetobacter baumannii and its relationship with antimicrobial drugs resistance in Taiwan. Annals of Microbioligy. 2009; 59(2): 369-372 [DOI:10.1007/BF03178341]
14. Hamouda A, Amyes SG. Novel gyrA and parC point mutations in two strains of Acinetobacter baumannii resistant to ciprofloxacin. J Antimicrob Chemother. 2004; 54(3): 695-6. [DOI:10.1093/jac/dkh368] [PMID]
15. Chiu CH, Lee HY, Tseng LY, Chen CL, Chia JH, Su LH, et al. Mechanisms of resistance to ciprofloxacin, ampicillin/sulbactam and imipenem in Acinetobacter baumannii clinical isolates in Taiwan. Int J Antimicrob Agents. 2010; 35(4): 382-6. [DOI:10.1016/j.ijantimicag.2009.12.009] [PMID]
16. Hujer K, Hujer A, Hulten E, Bajaksouzian S, Adams J, Donskey C, et al. "Analysis of Antibiotic Resistance Genes in Multidrug-Resistant Acinetobacter sp. Isolates from Military and Civilian Patients treated at the Walter Reed Army Medical Center." Antimicrob. Agents Chemother. 2006; 50(12): 4114-23. [DOI:10.1128/AAC.00778-06] [PMID]
17. Mohammad Alipour Z, Asadpour L, Ranji N. Fluoroquinolone resistance and mutation in gyrA gene in clinical isolates of Klebsiella pnemoniae. Iran J Med Microbiol 2016;10(5): 31-7.
18. Fallah F, Taherpour A, Hakemi Vala MH, Hashemi A. Global spread of New Delhi Mettallo - beta - lactamase -1 (NDM -1) Archives of Clinical Infectious Diseases. 2012; 6(4):177-171.
19. Chander Y, Ramakrishnan M, Jindal N, Hanson K, Goyal SM. Differentiation of Klebsiella pneumoniae and K.oxytoca by multiplex polymerase chain reaction. International Journal of Applied Research inVeterinary Medicine. 2011;9(2):138.
20. Conejo MC, Domínguez MC, López-Cerero L, Serrano L, Rodríguez-Baño J, Pascual A. Isolation of multidrug-resistant Klebsiella oxytoca carrying bla IMP-8, associated with OXY hyperproduction, in the intensive care unit of a community hospital in Spain. Journal of antimicrobial chemotherapy. 2010;3-1071: 65(5). [DOI:10.1093/jac/dkq063] [PMID]
21. Mahmood A, Al Hakawati MI. Non-beta-lactam Antimicrobials versus Extended Spectrum Beta-lactamase Producing Gram Negative Bacteria: In vitro Susceptibility Study. Infect Dis Soc of Pak. 2011;43(5): 507-11.
22. Holt KE, Wertheim H, Zadoks RN, Baker S, Whitehouse CA, Dance D, et al. Genomic analysis of diversity, population structure, virulence, and antimicrobial resistance in Klebsiella pneumoniae, an urgent threat to public health. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2015;112(27): E3574-E81. [DOI:10.1073/pnas.1501049112] [PMID]
23. Ahanjan M, Naderi F, Solimanii A. Prevalence of Beta-lactamases genes and antibiotic resistance pattern of Klebsiella pneumoniae isolated from teaching hospitals, Sari, Iran, 2014. J Mazandaran Univ Med Sci 2017; 27 (149):79-87 (Persian).
24. Hashemi A, Fallah F, Taherpour A, Goudarzi H, Erfanimanesh S, Taki E. Evaluation of genetic pattern and determination of oqxA gene expression levels among clinical isolates of Klebsiella pneumoniae strains. Journal of Mazandaran University of Medical Sciences. 2014;24(119):48-61.
25. Pourali Sheshblouki G, Mardaneh J, Hosseinzadeh Z. Klebsiella pneumoniae Infections in Hospitalized Patients: Characterization of Antibiotic Cross-resistance and Detection of Cefepime Susceptible-dose Dependent (SDD) Strains. J Fasa Univ Med Sci 2016;6(1): 52-9.
26. Shivaee A, Meskini M, Shahbazi Sh, Hasani D, Masjedian Jazi F, Zargar M. Prevalence of flmA, flmH, mrkA, ecpA, and mrkD virulence genes affecting biofilm formation in clinical isolates of K. pneumonia. Feyz, Journal of Kashan University of Medical Sciences. 2019; 23, (2): 168-176.
27. Norouzi A, Azizi O, Hosseini H, Shakibaie S, Shakibaie Mr. Amino acid substitution mutations analysis of gyrA and parC genes in clonal lineage of Klebsiella pneumoniae conferring high-level quinolone resistance. J Med Microbiol Infectious Diseases 2014;2(3): 109-17.
28. Mohammad Alipor AH, Shams F, Aghazadeh M. Assessment of epsilometer test over 3 molecular detection for quinolone resistance in Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae clinical isolates: A predictable schedaule on routine basis. Life Sci J 2014;11(12s): 1027-31.
29. Minarini LA, Darini ALC. Mutations in the quinolone resistance-determining regions of gyrA and parC in Enterobacteriaceae isolates from Brazil. Braz J Microbiol. 2012 Oct;43(4):1309-14. [DOI:10.1590/S1517-83822012000400010] [PMID]
30. Brisse S, Verhoef J. Phylogenetic diversity of Klebsiella pneumoniae and Klebsiella oxytoca clinical isolates revealed by randomly amplified polymorphic DNA, gyrA and parC genes sequencing and automated ribotyping. Int J Syst Evol Microbiol 2001;51(Pt 3):915-24. [DOI:10.1099/00207713-51-3-915] [PMID]
31. Piekarska K, Wolkowicz T, Zacharczuk K, Rzeczkowska M, Chrost A, Bareja E, et al. Co-existence of plasmid-mediated quinolone resistance determinants and mutations in gyrA and parC among fluoroquinolone-resistant clinical Enterobacteriaceae isolated in a tertiary hospital in Warsaw, Poland. Int J Antimicrob Agents 2015;45(3):238-43. [DOI:10.1016/j.ijantimicag.2014.09.019] [PMID]
32. Park KS, Yang HS, Nam YS, Lee HJ. Mutations in DNA Gyrase and Topoisomerase IV in Ciprofloxacin-Nonsusceptible Extended-Spectrum -Lactamase-Producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae. Clin lab 2017;63(3): 535-41. [DOI:10.7754/Clin.Lab.2016.160924] [PMID]
33. Chen FJ, Lauderdale TL, Ho M, Lo HJ. The roles of mutations in gyrA, parC, and ompK35 in fluoroquinolone resistance in Klebsiella pneumoniae. Microb Drug Resist. 2003;9(3):265-71. [DOI:10.1089/107662903322286472] [PMID]

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA

ارسال پیام به نویسنده مسئول


کلیه حقوق این وب سایت متعلق به مجله میکروب شناسی پزشکی ایران می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق   ناشر: موسسه فرنام

© 2020 All Rights Reserved | Iranian Journal of Medical Microbiology

Designed & Developed by : Yektaweb Publishr: Farname Inc.