سال 1، شماره 1 - ( بهار 1386 )
جلد 1 شماره 1 صفحات 22-17 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Doustdar F, Khosravi A, Farnia P, Bahremand A. Characterization of rpoB mutations in rifampin-resistant isolates of Mycobacterium tuberculosis cultured from the Iranian patients. Iran J Med Microbiol 2007; 1 (1) :17-22
URL: http://ijmm.ir/article-1-69-fa.html
URL: http://ijmm.ir/article-1-69-fa.html
دوستدار فرحنوش، خسروی آذردختآذردخت، فرنیا پریسا، بهره مند احمد رضا. شناسایی موتاسیونهای ژن rpoB در سویه های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس مقاوم به ریفامپین جدا شده از بیماران ایرانی. مجله میکروب شناسی پزشکی ایران. 1386; 1 (1) :17-22
1- گروه مییکروب شناسی،دانشکده پزشکی،دانشگاه علوم پزشکی جندی شاپور اهواز ، f_doustdar@yahoo.com
2- گروه مییکروب شناسی،دانشکده پزشکی،دانشگاه علوم پزشکی جندی شاپور اهواز
3- مرکز رفرانس سل کشوری،بیمارستان مسیح دانشوری تهران
4- انستیتو پاستور تهران
2- گروه مییکروب شناسی،دانشکده پزشکی،دانشگاه علوم پزشکی جندی شاپور اهواز
3- مرکز رفرانس سل کشوری،بیمارستان مسیح دانشوری تهران
4- انستیتو پاستور تهران
چکیده: (16037 مشاهده)
زمینه و اهداف: در این تحقیق، فراوانی موتاسیون ها در ناحیه پر موتاسیون بسیار متغیر ژن rpoB
سویه های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس مورد بررسی قرار گرفت. این سویه ها
مقاوم یا حساس به ریفامپین بوده و از بیماران مبتلا به سل مراجعه کننده به
مرکز رفرانس سل کشوری و مرکز رفرانس سل اهواز، جدا شده بودند. هدف از این
تحقیق بررسی چگونگی تاثیر غربالگری مولکولی این ناحیه از ژن rpoB در نمونه های بیماران مبتلا به سل در تشخیص سریع موارد مایکوباکتریوم توبرکلوزیس مقاوم به ریفامپین بود.
روش بررسی: تعداد 25 نمونه مایکوباکتریوم توبرکلوزیس مقاوم به ریفامپین و 5 مایکوباکتریوم توبرکلوزیس حساب به ریفامچین جدا شده از بیماران بصورت تصادفی برای انجام این تحقیق انتخاب شد. ناحیه RRDR کلیه نمونه های انتخاب شده پس از تکثیر به وسیله PCR، کاملا سکانس شد تا انواع و فراوانی موتاسیونهای مرتبط با مقاومت به ریفامپین در این ناحیه بررسی شود.
یافته ها: بر اساس نتایج حاصله، %96 از سویه های مقاوم به ریفامپین، تغییرات ژنتیکی در ناحیه RRDR را نشان دادند و 72 درصد از سویه های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس مقاوم به ریفامپین دارای موتاسیونهای missense بودند که منجر به عوض شدن اسید آمینه در کدون (%60) 531، کدون 526 (%16) و کدون 516 (%8) در ناحیه مرکزی ژن rpoB گردیده بود. در حالیکه در تحقیق ما مانند سایر نقاط دنیا کدون 531 دارای بیشترین تغییر بود ولی فراوانی موتاسیون در دو کدون شایع دیگر یعنی 526 و 516 متفاوت از فراوانی موتاسیون گزارش شده از سایر نقاط دنیا بود. این تفاوتها ممکن است ناشی از تغییرات ژنی جغرافیایی در نژ ادهای مایکوباکتریوم توبرکلوزیس مقاوم به ریفامپین و انتقال این نژادها در بیماران در کشورهای مختلف باشد.
نتیجه گیری: میزان بالای موتاسیون در ناحیه RRDR نمونه های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس مقاوم به ریفامپین جدا شده از بیماران، تایید کننده این مطلب است که غربالگری لین ناحیه ژنی برای تعیین مقاومت به ریفامپین در نمونه های کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس جدا شده از ایران مناسب است.
روش بررسی: تعداد 25 نمونه مایکوباکتریوم توبرکلوزیس مقاوم به ریفامپین و 5 مایکوباکتریوم توبرکلوزیس حساب به ریفامچین جدا شده از بیماران بصورت تصادفی برای انجام این تحقیق انتخاب شد. ناحیه RRDR کلیه نمونه های انتخاب شده پس از تکثیر به وسیله PCR، کاملا سکانس شد تا انواع و فراوانی موتاسیونهای مرتبط با مقاومت به ریفامپین در این ناحیه بررسی شود.
یافته ها: بر اساس نتایج حاصله، %96 از سویه های مقاوم به ریفامپین، تغییرات ژنتیکی در ناحیه RRDR را نشان دادند و 72 درصد از سویه های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس مقاوم به ریفامپین دارای موتاسیونهای missense بودند که منجر به عوض شدن اسید آمینه در کدون (%60) 531، کدون 526 (%16) و کدون 516 (%8) در ناحیه مرکزی ژن rpoB گردیده بود. در حالیکه در تحقیق ما مانند سایر نقاط دنیا کدون 531 دارای بیشترین تغییر بود ولی فراوانی موتاسیون در دو کدون شایع دیگر یعنی 526 و 516 متفاوت از فراوانی موتاسیون گزارش شده از سایر نقاط دنیا بود. این تفاوتها ممکن است ناشی از تغییرات ژنی جغرافیایی در نژ ادهای مایکوباکتریوم توبرکلوزیس مقاوم به ریفامپین و انتقال این نژادها در بیماران در کشورهای مختلف باشد.
نتیجه گیری: میزان بالای موتاسیون در ناحیه RRDR نمونه های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس مقاوم به ریفامپین جدا شده از بیماران، تایید کننده این مطلب است که غربالگری لین ناحیه ژنی برای تعیین مقاومت به ریفامپین در نمونه های کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس جدا شده از ایران مناسب است.
نوع مطالعه: مقاله پژوهشی |
موضوع مقاله:
اپیدمیولوژی مولکولی
دریافت: 1392/8/19 | پذیرش: 1392/8/19 | انتشار الکترونیک: 1392/8/19
دریافت: 1392/8/19 | پذیرش: 1392/8/19 | انتشار الکترونیک: 1392/8/19
فهرست منابع
1. Marshall J, Chahin A, Rush B. Review of Clinical Databases. In: "MIT Critical Data, Secondary Analysis of Electronic Health Records" First Online: September 2016, Chapter 2. [DOI:10.1007/978-3-319-43742-2_2] [PMCID]
2. Debra Revere D, Hills RH, Dixon BE, Gibson PJ, Graniss SJ. Notifiable condition reporting practices: implications for public health agency participation in a health information exchange. BMC Public Health. 2017; 11; 17 (1):247. [DOI:10.1186/s12889-017-4156-4] [PMID] [PMCID]
3. Collen MF, Slack WV, Bleich HL. Medical Databases and Patient Record Systems. In The History of Medical Informatics in USA. Collen M, Ball M. 2017 Springer International Publishing AG..
4. Hajia M, Rahbar M, Farzami MR, Asl HM, Dolatyar A, Imani M, et al. Assessing clonal correlation of epidemic Vibrio cholerae isolates during 2011 in 16 provinces of Iran. Curr Microbiol. 2015;70(3):408-14. [DOI:10.1007/s00284-014-0725-2] [PMID]
5. Mafi M, Hajia M, Goya MM. A five years study on the epidemiological approaches of Cholera in Iran. Caspian J Inter Medicine. 2016; 7 (3), 162-167.
6. M Hajia, M Rahbar, F Fallah, N Safadel. Detection of Bordetella pertussis in infants suspected to have whooping cough. The Open Resp Med J. 2012; 6: 34-36. [DOI:10.2174/1874306401206010034] [PMID] [PMCID]
7. Khoo SH, Hajia M, Storey CC, Klapper PE, Wilkins EG, Denning DW, Dunbar EM, Corbitt G, Mandal BK. Influenza-like episodes in HIV-positive patients: the role of viral and'atypical'infections. AIDS (London, England). 1998 May;12(7):751-7.
8. Hajia M, Mohammad Rahbar M, Amini R. Is PCR assay reliable for diagnosis of extrapulmonary tuberculosis? African Journal of Microbiology Research. 2009; 3(12):877-881.
9. Dahim P, Amini R, Safadel N. Implementation of Quality Management System in Iranian. Medical Laboratories. Iran J Public Health. 2009; 38 (Suppl. 1):150-152.
10. Aisu S, Nyegenye W, Kiyaga C, Dfendu M, Sewanyana I , Namakula A (et al). Quality assurance as an integral component of diagnostic testing in clinical laboratories and point-of care testing: the Uganda experience: country profile. African Journal of Laboratory Medicine. 2016; 5(2):1-5. [DOI:10.4102/ajlm.v5i2.447] [PMID] [PMCID]
11. Ravaghi H, Khodayari Zarnaq R, Adel A, Badpa M, Adel M, Abolhassani N. A Survey on Clinical Governance Awareness Among Clinical Staff: A Cross-Sectional Study. Global Journal of Health Science. 2014; 6(6):37-42. [DOI:10.5539/gjhs.v6n6p37] [PMID] [PMCID]
12. Anjarani S, Safadel N, Dahim P. Amini R, Mahdavi S, Samiee S. Establishment of national laboratory standards in public and private hospital laboratories. Iranian J Public Health. 2013;42:96-101.
13. Safadel N, Anjarani S, Farzami MR, Amini R, Samiee SM, Dahim P. Establishing an Iranian medical laboratory standard based on ISO 15189. Accreditation and Quality Assurance. 2014;19(6): 473-476. [DOI:10.1007/s00769-014-1090-3]
14. Hajia M, Safadel N, Samiee SM, Dahim P, Anjarani S, Nafisi N, et al. Quality Assurance Program for Molecular Medicine Laboratories. Iran J Public Health. 2013; 42(Supple1): 119-124.
15. Grannis SJ. Electronic Laboratory Data Quality and the Value of a Health Information exchange to support public health reporting processes. AMIA Annu Symp Proc. 2011:322-330.
16. Hajia M. Uncertainty results of molecular diagnostic methods: Causes and Barriers.
17. Safadel N, Dahim P, Anjarani S, Rahnamaye Farzam Mi, Mirab Samiee S, Amini R, et al. Challenges of implementing Iranian national laboratory standards. Iranian J Public Health. 2013; 42:125-128.
18. Hajia M, Sohrabi A. Current situation and required future policy of molecular methods at Iranian diagnostic centers. Submitted Draft.
19. Abhyankar S, Demner-Fushman D, McDonald CJ. Standardizing clinical laboratory data for secondary use. Journal of Biomedical Informatics 2012; 45: 642-650. [DOI:10.1016/j.jbi.2012.04.012] [PMID] [PMCID]
20. Dixon BE, Siegel JA, Oemig T, Grannis S. Electronic Health Information Quality Challenges and Interventions to Improve Public Health Surveillance Data and Practice. Electronic Health Information Quality. 2013; 128:546-553. [DOI:10.1177/003335491312800614] [PMID] [PMCID]
21. Bean NH, Martin SM. Implementing a network for electronic surveillance reporting from public health reference laboratories: an international perspective. Emerg Infect Dis. 2001 Sep-Oct; 7(5):773-9. [DOI:10.3201/eid0705.010002] [PMID] [PMCID]
22. Jonnalagadda SR, Goyal P, Huffman MD. Automating data extraction in systematic reviews: a systematic review. Systematic Reviews. 2015; 4(78):1-16. [DOI:10.1186/s13643-015-0066-7] [PMID] [PMCID]
23. Dixon BE, Grannis SJ, Revere D. Measuring the impact of a health information exchange intervention on provider-based notifiable disease reporting using mixed methods: a study protocol. BMC Medical Informatics and Decision Making 2013, 13:121. [DOI:10.1186/1472-6947-13-121] [PMID] [PMCID]
24. Hajia M, Amirzargar A, Ghoreish M, Sam M. Estimation the frequency of human immunodeficiency virus among male and female patients, Iran. Cell Journal. 2012;13(4):237-242.
25. Hajia M, M RahbarM, Alikhani Y. Efficiency of PCR Method for Screening Pulmonary Tuberculosis Patients under DOTs Protocol Therapy. Iranian Journal of Public Health. 2005; 34(2):9-13.
26. Shafiei R, Mahmoodzadeh A, Hajia M, Sanati A, Shafiei F. Epidemiology of malaria in Khorasan Razavi province, northeast of Iran, within 7 years (April 2001-March 2008) Ann Trop Med Publ Health. 2011; 4(1):12-17. [DOI:10.4103/1755-6783.80515]
27. Rahbar M, Zahraei M, Omidvarnia A, Afshani MT, Glami M, Sabourian R, et al. Survey of epidemiology and bacteriology features of cholera in Iran. Asian Pac J Trop Med. 2010; 3(1):45-47. [DOI:10.1016/S1995-7645(10)60030-2]
28. Wadhwa V, Rai S, Thukral T. Laboratory quality management system: Road to accreditation and beyond. Indian J Med Microbiol. 2012; 30(2):131-140. [DOI:10.4103/0255-0857.96647] [PMID]
29. Gulley ML. Clinical Laboratory Reports in Molecular Pathology. Arch. Of Path & Lab Medicine. 2007:131 (6).
30. Silk BJ, Berkelman RL. A Review of Strategies for Enhancing the Completeness of Notifiable Disease Reporting. Journal of Public Health Management & Practice. 2005; 11: 191-200. [DOI:10.1097/00124784-200505000-00003]
31. Morse SS, Mazet JA, Woolhouse M, Parrish CR, Carroll D, Karesh WB, Zambrana-Torrelio C, Lipkin WI, Daszak P. Prediction and prevention of the next pandemic zoonosis. The Lancet. 2012 Dec 1;380(9857):1956-65. [DOI:10.1016/S0140-6736(12)61684-5]
32. Voldstedlund M, Haarh M, Mølbak K. The Danish microbiology database (MiBa) 2010 to 2013. Eurosurveillance. 2014; Jan 9;19(1):20667. [DOI:10.2807/1560-7917.ES2014.19.1.20667] [PMID]
ارسال پیام به نویسنده مسئول
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
