سال 18، شماره 2 - ( فروردین - اردیبهشت 1403 )
جلد 18 شماره 2 صفحات 105-97 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Agab Hamed N, Khudhur Abdljalel M, Ibrahim Sood L. Investigating the Salivary Microbiome Through Meta-Genomics: A Clinical Study on Periodontal Health. Iran J Med Microbiol 2024; 18 (2) :97-105
URL: http://ijmm.ir/article-1-2111-fa.html
URL: http://ijmm.ir/article-1-2111-fa.html
عکاب حامد نهی، خضر عبد الجلیل محمد، ابراهیم سعود لمیاء. بررسی میکروبیوم بزاقی از طریق متا ژنومیکس: مطالعه بالینی بر سلامت پریودنتال. مجله میکروب شناسی پزشکی ایران. 1403; 18 (2) :97-105
1- گروه دندانپزشکی پریودنتیک، دانشکده دندانپزشکی، دانشگاه انبار، رمادی، عراق ، den.nuha.agab@uoanbar.edu.iq
2- گروه دندانپزشکی فک و صورت، دانشکده دندانپزشکی، دانشگاه انبار، رمادی، عراق
3- گروه دندانپزشکی کودکان، دانشکده دندانپزشکی، دانشگاه انبار، رمادی، عراق
2- گروه دندانپزشکی فک و صورت، دانشکده دندانپزشکی، دانشگاه انبار، رمادی، عراق
3- گروه دندانپزشکی کودکان، دانشکده دندانپزشکی، دانشگاه انبار، رمادی، عراق
چکیده: (681 مشاهده)
زمینه و اهداف: بیماری های پریودنتال بیماری های بهداشتی دهان و دندان بسیار شایع با چالش‌های تشخیصی قابل توجه هستند. مطالعات بسیار کمی به ارزیابی میکروبی میکروبیوم بزاق به عنوان پلت فرم توسعه نشانگرهای زیستی پرداخته اند. هدف از این مطالعه بررسی فراوانی افتراقی گونه‌های میکروبی دهان در نمونه‌های بزاق بیماران مبتلا به بیماری پریودنتال و افراد سالم برای کشف بیومارکر تشخیصی مبتنی بر میکروبیوتای دهان بود.
مواد و روش کار: نمونه‌های بزاق از یک کوهورت با فنوتیپ خوب و تحت پروتکل تأیید شده توسط مؤسسه ملی تحقیقات دندان پزشکی و جمجمه صورتی توسط هیئت بررسی مؤسسه جمع‌آوری شد. DNA ژنومی از نمونه ها استخراج شد. پروفایل های میکروبیوتا با پردازش نواحی متغیر ژن ۱۶S rRNA با استفاده از توالی یابی نسل بعدی توسط پلت فرم Illumina MiSeq تولید شد. آزمایش فراوانی افتراقی با استفاده از DESeq۲ انجام شد. یکی از روش های خوشه بندی آزمون رتبه بندی در نقشه حرارتی به همراه فراوانی نسبی تاکسون ارائه شد. در نهایت، پروفایل متاژنومیکس انجام شد.
یافته ها: پورفیروموناس ژنژیوالیس و تانرلا فورسیتیا از نظر فراوانی افتراقی در نمونه‌های بزاق بیماران پریودنتال به‌طور معنی‌داری فراوان‌تر بودند. استرپتوکوک سانگوئینیس دارای پتانسیل به عنوان بیومارکر تشخیصی مبتنی بر میکروبیوتای دهانی مرتبط با بیماری است. یافته‌ها از نظر آماری معنی‌دار بودند و با یافته‌های مطالعات میکروبیوم دهان قبلی تأیید شدند.
نتیجه‌گیری: یافته‌های ما شواهدی را ارائه می‌دهد که میکروبیوم بزاقی می‌تواند منبع غنی بیومارکرهای تشخیصی باشد که در استراتژی‌های تشخیصی فعلی برای بیماری‌های پریودنتال مانند ژنژیویت و پریودنتیت وجود ندارد. این بیومارکرها نه تنها ممکن است پاتوژنز بیماری را روشن کنند، بلکه ما را به شناسایی اهداف مولکولی جدید برای بهبود درمان و مدیریت بیماری‌های پریودنتال هدایت کنند.
واژه‌های کلیدی: DESeq2، متاژنومیکس، پورفیروموناس ژنژیوالیس، استرپتوکوکوس سانگوئینیس، تانرلا فورسیتیا
نوع مطالعه: مقاله پژوهشی |
موضوع مقاله:
باکتری شناسی پزشکی
دریافت: 1402/12/3 | پذیرش: 1403/2/26 | انتشار الکترونیک: 1403/3/5
دریافت: 1402/12/3 | پذیرش: 1403/2/26 | انتشار الکترونیک: 1403/3/5
فهرست منابع
1. Komori E, Kato-Kogoe N, Imai Y, Sakaguchi S, Taniguchi K, Omori M, et al. Changes in salivary microbiota due to gastric cancer resection and its relation to gastric fluid microbiota. Sci Rep. 2023;13(1):15863. [DOI:10.1038/s41598-023-43108-8] [PMID] [PMCID]
2. Li Z, Fu R, Huang X, Wen X, Zhang L. A decade of progress: bibliometric analysis of trends and hotspots in oral microbiome research (2013-2022). Front Cell Infect Microbiol. 2023;13:1195127. [DOI:10.3389/fcimb.2023.1195127] [PMID] [PMCID]
3. Hamed NA, Mirza KB, AL-Rubaie MS. Effects of oral contraceptives intake on the gingiva. Iraqi Postgrad Med J. 2010;9:335-41.
4. Morrison AG, Sarkar S, Umar S, Lee STM, Thomas SM. The contribution of the human oral microbiome to oral disease: a review. Microorganisms. 2023;11(2):318. [DOI:10.3390/microorganisms11020318] [PMID] [PMCID]
5. Moussa DG, Ahmad P, Mansour TA, Siqueira WL. Current state and challenges of the global outcomes of dental caries research in the meta-omics era. Front Cell Infect Microbiol. 2022;12:887907. [DOI:10.3389/fcimb.2022.887907] [PMID] [PMCID]
6. Murugesan S, Al Khodor S. Salivary microbiome and hypertension in the Qatari population. J Transl Med. 2023;21(1):454. [DOI:10.1186/s12967-023-04247-8] [PMID] [PMCID]
7. Sood LI, Hamed NA, Jabbar MRA, Altaee ZA. Evaluation of some oral factors and periodontal health status in primary school-children. J Popul Ther Clin Pharmacol. 2023;30(1):312-23. [DOI:10.47750/jptcp.2023.1065]
8. Nagata N, Nishijima S, Kojima Y, Hisada Y, Imbe K, Miyoshi-Akiyama T, et al. Metagenomic identification of microbial signatures predicting pancreatic cancer from a multinational study. Gastroenterology. 2022;163(1):222-38. [DOI:10.1053/j.gastro.2022.03.054] [PMID]
9. Okiye ME, Velez MA, Sugai J, Kinney J, Giannobile WV, Tripathi A, Sherman DH. Investigating Metabolic Trends in the Oral Cavity to Identify Novel Metabolites. bioRxiv. 2023:2023-06. [DOI:10.1101/2023.06.26.546600]
10. Rahman B, Al-Marzooq F, Saad H, Benzina D, Al Kawas S. Dysbiosis of the subgingival microbiome and relation to periodontal disease in association with obesity and overweight. Nutrients. 2023;15(4):826. [DOI:10.3390/nu15040826] [PMID] [PMCID]
11. Gül F, Karadayı S, Yurdabakan Z, Özbek T, Karadayı B. Investigating changes in salivary microbiota due to dental treatment: A metagenomic analysis study for forensic purposes. Forensic Sci Int. 2022;340:111447. [DOI:10.1016/j.forsciint.2022.111447] [PMID]
12. Hajishengallis G. Interconnection of periodontal disease and comorbidities: Evidence, mechanisms, and implications. Periodontol 2000. 2022;89(1):9-18. [DOI:10.1111/prd.12430] [PMID] [PMCID]
13. Hajjo R, Sabbah DA, Al Bawab AQ. Unlocking the potential of the human microbiome for identifying disease diagnostic biomarkers. Diagnostics. 2022;12(7):1742. [DOI:10.3390/diagnostics12071742] [PMID] [PMCID]
14. Mira A, Simon‐Soro A, Curtis MA. Role of microbial communities in the pathogenesis of periodontal diseases and caries. J Clin Periodontol. 2017;44:S23-38. [DOI:10.1111/jcpe.12671]
15. Imchen M, Anju VT, Busi S, Mohan MS, Subhaswaraj P, Dyavaiah M, et al. Metagenomic insights into taxonomic, functional diversity and inhibitors of microbial biofilms. Microbiol Res. 2022;265:127207. [DOI:10.1016/j.micres.2022.127207] [PMID]
16. Fiorillo L, Cervino G, Laino L, D'Amico C, Mauceri R, Tozum TF, et al. Porphyromonas gingivalis, periodontal and systemic implications: a systematic review. Dent J. 2019;7(4):114. [DOI:10.3390/dj7040114] [PMID] [PMCID]
17. Jiang Z, Wang J, Qian X, Zhang Z, Wang S. Oral microbiota may predict the presence of esophageal squamous cell carcinoma. J Cancer Res Clin Oncol. 2023;149(8):4731-9. [DOI:10.1007/s00432-022-04393-4] [PMID]
18. Joseph S, Carda-Diéguez M, Aduse-Opoku J, Alsam A, Mira A, Curtis MA. The murine oral metatranscriptome reveals microbial and host signatures of periodontal disease. J Dent Res. 2023;102(5):565-73. [DOI:10.1177/00220345221149675] [PMID] [PMCID]
19. Kikuchi T, Hayashi J ichiro, Mitani A. Next-generation examination, diagnosis, and personalized medicine in periodontal disease. J Pers Med. 2022;12(10):1743. [DOI:10.3390/jpm12101743] [PMID] [PMCID]
20. Kim JM, Yoo SY, An JS, Woo JJ, Cho YD, Park HE, et al. Effect of a multichannel oral irrigator on periodontal health and the oral microbiome. Sci Rep. 2023;13(1):12043. [DOI:10.1038/s41598-023-38894-0] [PMID] [PMCID]
21. Santonocito S, Ferlito S, Polizzi A, Ronsivalle V, Sclafani R, Valletta A, et al. Therapeutic and metagenomic potential of the biomolecular therapies against periodontitis and the oral microbiome: current evidence and future perspectives. Int J Mol Sci. 2022;23(22):13708. [DOI:10.3390/ijms232213708] [PMID] [PMCID]
22. Belibasakis GN, Bostanci N, Marsh PD, Zaura E. Applications of the oral microbiome in personalized dentistry. Arch Oral Biol. 2019;104:7-12. [DOI:10.1016/j.archoralbio.2019.05.023] [PMID]
23. Huang S, He T, Yue F, Xu X, Wang L, Zhu P, et al. Longitudinal multi-omics and microbiome meta-analysis identify an asymptomatic gingival state that links gingivitis, periodontitis, and aging. MBio. 2021;12(2):10-128. [DOI:10.1128/mBio.03281-20] [PMID] [PMCID]
24. Sedghi LM, Bacino M, Kapila YL. Periodontal disease: the good, the bad, and the unknown. Front Cell Infect Microbiol. 2021;11:766944. [DOI:10.3389/fcimb.2021.766944] [PMID] [PMCID]
25. Vasquez AA, Ram JL, Qazazi MS, Sun J, Kato I. Oral Microbiome: Potential Link to Systemic Diseases and Oral Cancer. In: Sun, J., Dudeja, P. (eds) Mechanisms Underlying Host-Microbiome Interactions in Pathophysiology of Human Diseases. Physiology in Health and Disease. Springer: Boston, MA. 2018. pp. 195-246. [DOI:10.1007/978-1-4939-7534-1_9]
26. Zhu B, Macleod LC, Kitten T, Xu P. Streptococcus sanguinis biofilm formation & interaction with oral pathogens. Future Microbiol. 2018;13(08):915-32. [DOI:10.2217/fmb-2018-0043] [PMID] [PMCID]
27. Uzochukwu I, Moyes D, Proctor G, Ide M. The key players of dysbiosis in Noma disease; A systematic review of etiological studies. Front Oral Health. 2023;4:1095858. [DOI:10.3389/froh.2023.1095858] [PMID] [PMCID]
28. Ouwehand AC, Forssten S, Hibberd AA, Lyra A, Stahl B. Probiotic approach to prevent antibiotic resistance. Ann Med. 2016;48(4):246-55. [DOI:10.3109/07853890.2016.1161232] [PMID]
29. Wang L, Li F, Gu B, Qu P, Liu Q, Wang J, et al. Metaomics in clinical laboratory: potential driving force for innovative disease diagnosis. Front Microbiol. 2022;13:883734. [DOI:10.3389/fmicb.2022.883734] [PMID] [PMCID]
30. Wu TT, Sohn M, Manning S, Beblavy R, Gill S, Quataert S, et al. Metagenomic analysis examines oral microbiome changes and interplay with immune response following prenatal total oral rehabilitation. J Transl Med. 2023;21(1):172. [DOI:10.1186/s12967-023-03997-9] [PMID] [PMCID]
ارسال پیام به نویسنده مسئول
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
