سال 10، شماره 6 - ( بهمن - اسفند 1395 )
جلد 10 شماره 6 صفحات 8-1 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Goudarzi V, Mirzaee M, Ranjbar R. O-serogrouping of Escherichia coli strains isolated from patients with Urinary tract infection by using PCR method. Iran J Med Microbiol 2017; 10 (6) :1-8
URL: http://ijmm.ir/article-1-527-fa.html
URL: http://ijmm.ir/article-1-527-fa.html
گودرزی وحید، میرزایی محسن، رنجبر رضا. تعیین سروگروپ های O در سویه‌های اشریشیاکلی جداشده از بیماران مبتلابه عفونت دستگاه ادراری با استفاده از روش PCR. مجله میکروب شناسی پزشکی ایران. 1395; 10 (6) :1-8
وحید گودرزی1 
، محسن میرزایی 2، رضا رنجبر3
، محسن میرزایی 2، رضا رنجبر3
1- گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، واحد بروجرد، دانشگاه آزاد اسلامی، بروجرد، ایران
2- گروه علوم آزمایشگاهی، واحد بروجرد، دانشگاه آزاد اسلامی، بروجرد، ایران ،mirzaei.iaub@gmail.com
3- مرکز تحقیقات بیولوژی مولکولی، دانشگاه علوم پزشکی بقیه ا...(عج)، تهران، ایران
2- گروه علوم آزمایشگاهی، واحد بروجرد، دانشگاه آزاد اسلامی، بروجرد، ایران ،
3- مرکز تحقیقات بیولوژی مولکولی، دانشگاه علوم پزشکی بقیه ا...(عج)، تهران، ایران
چکیده: (11858 مشاهده)
زمینه و اهداف: عفونت ادراری (UTI) یکی از شایع‌ترین عفونت‌ها بوده و اشرشیاکلی رایج‌ترین دلیل بروز عفونت ادراری می‌باشد. آنتی‌ژن O متشکل از واحدهای الیگوساکاریدی تکراری است که یکی از اجزاء لیپوپلی ساکارید (LPS) در غشاء خارجی باکتری‌های گرم منفی می‌باشد. تغییرات آنتی‌ژن O مبنای اصلی مطالعات سرولوژیک در باکتری‌های گرم منفی می‌باشد. هدف از این مطالعه بررسی شیوع انواع سروگروپهای O در باکتری اشریشیاکلی جداشده از بیماران مبتلابه عفونت ادراری بود.
مواد و روش کار: در طول سه ماه، 210 بیمار مبتلا به عفونت ادراری، مراجعه‌کننده به سه بیمارستان شهرهای تهران، سنندج و بروجرد موردبررسی قرار گرفتند. جدایه های اشریشیاکلی با استفاده از روش‌های استاندارد تعیین هویت شدند. سپس تعیین سروگروپ های این جدایه ها با استفاده از روش PCR انجام گرفت.
یافته‌ها: از تعداد کل بیماران مورد مطالعه قرار گرفته، 150 جدایه اشریشیاکلی از نمونه ادرار جدا شد. شایع‌ترین انواع آنتی‌ژن O، (13/33%)1O، (8%) 16O، (5/33%) 8 Oو (4%)21O گزارش شد و هیچ جدایه مثبتی برای ژن‌های 22O و 83O شناسایی نگردید.
نتیجه‌گیری: مطالعه حاضر نشان داد که سروگروپ 1O با حداکثر تکرار و به دنبال آن سروگروپ های 16O، 8O و 21O، به ترتیب از فراوانی بیشتری برخوردار بودند. در اشریشیاکلی مولد عفونت ادراری (UPEC، سروگروپهای می‌توانند با الگوی عوامل ویرولانس در هر سویه در ارتباط باشند. علاوه بر این، مطالعات بیشتر در خصوص فراوانی انواع سروگروپ ها در سایر نقاط ایران واز دیگر سروگروپ توصیه می‌شود.
نوع مطالعه: مقاله پژوهشی |
موضوع مقاله:
باکتری شناسی پزشکی
دریافت: 1394/11/10 | پذیرش: 1395/1/29 | انتشار الکترونیک: 1395/7/26
دریافت: 1394/11/10 | پذیرش: 1395/1/29 | انتشار الکترونیک: 1395/7/26
فهرست منابع
1. Schaechter M, Engleberg NC, Dirita VJ, Dermody TS. Schaechter's mechanisms of microbial disease. Pathophysiology of infection disease. 2nd ed. Lippincott Williams & Wilkins; 2012. p. 643-650. [Article]
2. Hamid-Farahani R, Tajik A, Noorifard M, Keshavarz A. Antibiotic resistance pattern of E.coli isolated from urine culture in 660 Army clinical laboratory center in Tehran 2008. J Army Univ Med Sci 2012; 10 (1): 45-49. [in Persian] [Article]
3. Wilson BA, Salyers AA, Whitt DD, Winkler ME. Bacterial pathogenesis: a molecular approach. 2nd ed. ASM Press; 2011. p. 823-832.
4. Sarkar S, Ulett GC, Totsika M, Phan M-D, Schembri MA. Role of Capsule and O Antigen in the Virulence of Uropathogenic Escherichia coli. PloS one 2014; 9(4): e94786. [Article] [PubMed]
5. Kalynych S, Yao D, Magee J, Cygler M. Structural characterization of closely related O-antigen lipopolysaccharide (LPS) chain length regulators. J Biol Chem 2012; 287(19):15696–705. [Article] [PubMed]
6. Wang Q, Perepelov AV, Beutin L, Senchenkova SN, Xu Y, Shashkov AS and et al. Structural and genetic characterization of the Escherichia coli O180 O antigen and identification of a UDP-GlcNAc 6-dehydrogenase. Glycobiology 2012; 22(10):1321–31. [Article] [PubMed]
7. Debroy C, Roberts E, Valadez AM, Dudley EG, Cutter CN. Detection of Shiga toxin–producing Escherichia coli O26, O45, O103, O111, O113, O121, O145, and O157 serogroups by multiplex polymerase chain reaction of the wzx gene of the O-antigen gene cluster. Foodborne Pathog Dis 2011; 8(5):651-2. [Article] [PubMed]
8. Liu Y, Yan X, Debroy C, Fratamico PM, Needleman DS, Li RW, Wang W, Losada L, Brinkac L, Radune D, Toro M. Escherichia coli O-antigen gene clusters of serogroups O62, O68, O131, O140, O142, and O163: DNA sequences and similarity between O62 and O68, and PCR-based serogrouping. Biosensors 2015; 5(1):51-68. [PubMed]
9. DebRoy C, Roberts E, Fratamico PM. Detection of O antigens in Escherichia coli. Anim Health Res Rev 201; 12 (2): 169–185. [PubMed]
10. Momtaz H, Karimian A, Madani M, Safarpoor Dehkordi F, Ranjbar R, Sarshar M, Souod N. Uropathogenic Escherichia coli in Iran: Serogroup distributions, virulence factors and antimicrobial resistance properties. Ann Clin Microbiol Antimicrob 2013; 12 (8): e 23627669. [PubMed]
11. Yun KW, Kim DS, Kim W, Lim IS. Molecular typing of uropathogenic Escherichia coli isolated from Korean children with urinary tract infection. Korean J Pediatr 2015; 58(1): 20-7. [PubMed]
12. Molina-López J, Aparicio-Ozores G, Ribas-Aparicio RM, Gavilanes-Parra S, Chávez-Berrocal ME, Hernández-Castro R, Manjarrez-Hernández HÁ. Drug resistance, serotypes, and phylogenetic groups among uropathogenic Escherichia coli including O25-ST131 in Mexico City. J Infect Dev Ctries 2011; 5(12):840-9. [Article] [PubMed]
13. Li D, Liu B, Chen M, Guo D, Guo X, Liu F, Feng L, Wang L. A multiplex PCR method to detect 14 Escherichia coli serogroups associated with urinary tract infections. J Microbiol Methods 2010; 82(1):71-7 [PubMed]
14. Kulkarni R, Dhakal BK, Slechta ES, Kurtz Z, Mulvey MA, Thanassi DG. Roles of putative type II secretion and type IV pilus systems in the virulence of uropathogenic Escherichia coli. PLoS One 2009; 4(3): e4752. [PubMed]
15. Nielubowicz GR and Harry M. Host–pathogen interactions in urinary tract infection. Nat Rev Urol 2010; 7 (8): 430-441. [PubMed]
16. Karimian A, Momtaz H, Madani M. Detection of uropathogenic Escherichia coli virulence factors in patients with urinary tract infections in Iran. Afr J Microbiol Res 2012; 6(39): 6811-6. [Article]
17. Kudinha T, Kong F, Johnson JR, Andrew SD, Anderson P, Gilbert GL. Multiplex PCR-based reverse line blot assay for simultaneous detection of 22 virulence genes in uropathogenic Escherichia coli. Appl Environ Microbiol 2012; 78(4): 1198–202. [PubMed]
18. Asadi S, Kargar M, Solhjoo K, Najafi A, and Ghorbani-Dalini S. The association of virulence determinants of uropathogenic Escherichia coli with antibiotic resistance. Jundishapur J Microbiol 2014; 7 (7): e9936. [in Persian] [PubMed]
19. Rashki A and Hussein AA. O-serotyping of Escherichia coli Strains isolated from Patients with Urinary Tract Infection in Southeast of Iran. Int J Enteric Pathog 2014; 2(4): e20968 [Article]
20. Wang Q, Perepelov AV, Beutin L, Senchenkova SN, Xu Y, Shashkov AS, et al. Structural and genetic characterization of the Escherichia coli O180 O antigen and identification of a UDP-GlcNAc 6-dehydrogenase.Glycobiolog 2012; 22(10):1321-31. [Article]
21. Shweta S, Nirmaljit K, Shalini M, Preeti M, Wasim A and Charoo H. Serotyping and Antimicrobial Susceptibility Pattern of Escherichia coli Isolates from Urinary Tract Infections in Pediatric Population in a Tertiary Care Hospital. J Pathog 2016; e2548517. [PubMed]
22. Emamghoraishi F, Farshad S, Kalani M. Relationship between O serotype and virulent genes in Escherichia coli causing urinary tract infections. Iran J Kidney Dis 2011; 5(4):234-7. [in Persian] [PubMed]
23. Dormanesh B, Safarpoor F, Hosseini S, Momtaz H, Mirnejad R, Hoseini MJ, Yahaghi E. Virulence factors and O-serogroups profiles of uropathogenic Escherichia coli isolated from Iranian pediatric patients. Iran Red Crescent Med J 2014; 16 (2). e14627. [in Persian] [PubMed]
24. Issazadeh K, Naghibi SN, Khoshkholgh-Pahlaviani MM. Drug Resistance and Serotyping of Uropathogenic Escherichia coli among Patients with Urinary Tract Infection in Rasht, Iran. Zahedan J Res Med Sci 2015; 17 (6): 1-5. [in Persian] [Article] [Google Scholar]
ارسال پیام به نویسنده مسئول
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
