سال 17، شماره 5 - ( مهر - آبان 1402 )
جلد 17 شماره 5 صفحات 549-541 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
M. Alsubaiei R, Gharbi J, Almalki M, Alahmed K, Ali Brahim A, Alshakes F et al . Viral Etiology and Epidemiology of Children Acute Gastroenteritis (AGE) in Al-Ahsa Province - Saudi Arabia during the period 2021-2022. Iran J Med Microbiol 2023; 17 (5) :541-549
URL: http://ijmm.ir/article-1-2211-fa.html
URL: http://ijmm.ir/article-1-2211-fa.html
م. السوبایی ریم، غربی جوهر، المالکی محمد، الاحمد خالد، علی براهیم عبدالله ثام، الشاکس فاطیما و همکاران.. علت شناسی ویروسی و اپیدمیولوژی گاستروانتریت حاد کودکان (AGE) در استان الاحساء - عربستان سعودی طی دوره 2021-2022. مجله میکروب شناسی پزشکی ایران. 1402; 17 (5) :541-549
ریم م. السوبایی1 
، جوهر غربی 
2، محمد المالکی1 ، خالد الاحمد3 ، عبدالله ثام علی براهیم4 ، فاطیما الشاکس4 ، مانل بن ام. هادب5
، جوهر غربی 2، محمد المالکی1 ، خالد الاحمد3 ، عبدالله ثام علی براهیم4 ، فاطیما الشاکس4 ، مانل بن ام. هادب5
1- گروه علوم زیستی، کالج علوم، دانشگاه ملک فیصل، الاحساء، عربستان سعودی
2- گروه علوم زیستی، کالج علوم، دانشگاه ملک فیصل، الاحساء، عربستان سعودی ، jagharbi@kfu.edu.sa
3- گروه پلی کلینیک، دانشگاه ملک فیصل، الاحساء، عربستان سعودی
4- بخش اطفال، بیمارستان الموسی، الاحساء، عربستان سعودی
5- واحد تحقیقات ویروس شناسی و استراتژی های ضد ویروسی UR17ES30، موسسه عالی بیوتکنولوژی، دانشگاه المنستیر، المنستیر، تونس
2- گروه علوم زیستی، کالج علوم، دانشگاه ملک فیصل، الاحساء، عربستان سعودی ، jagharbi@kfu.edu.sa
3- گروه پلی کلینیک، دانشگاه ملک فیصل، الاحساء، عربستان سعودی
4- بخش اطفال، بیمارستان الموسی، الاحساء، عربستان سعودی
5- واحد تحقیقات ویروس شناسی و استراتژی های ضد ویروسی UR17ES30، موسسه عالی بیوتکنولوژی، دانشگاه المنستیر، المنستیر، تونس
چکیده: (592 مشاهده)
زمینه و اهداف: کودکان زیر پنج سال مستعد ابتلا به بیماری‌زای گاستروانتریت حاد (AGE) هستند. بنابراین، هدف اصلی پژوهش حاضر، بررسی اپیدمیولوژی و علت AGE در کودکان در عربستان سعودی است.
مواد و روش کار: در این مطالعه پیشینه ای از Multiplex PCR برای شناسایی ویروس‌های گوارشی شامل RoVA (روتاویروس A)، NoVGI (نوروویروس گروه I)، NoVGII (نوروویروس گروه دوم)، HAstV (آستروویروس انسانی)، EAdV (آدنوویروس روده‌ای) بررسی شده است و HEV (انتروویروس انسانی) در ۹۲ نمونه مدفوع جمع آوری شده از کودکان کمتر از ۷ سال بستری در بیمارستان های استان الاحساء در عربستان سعودی از دسامبر ۲۰۲۱ تا ژوئن ۲۰۲۲.
یافته ها: از ۹۲ نمونه مورد آزمایش، ۶۳ نمونه (۶۸.۴%) نتایج مثبت نشان دادند که نشان دهنده وجود حداقل یک عفونت ویروسی گوارشی بود. گروه RoV A با ۵۴ درصد، HAstV با ۲۷ درصد، EAdV با ۲۲.۲ درصد، NoVGI با ۹.۵ درصد و HEV با ۶.۳ درصد بیشترین ویروس شناسایی شده بود. تک عفونت ویروس گوارشی بسیار بیشتر از عفونت همزمان بود و ۷۹.۳٪ بود. کودکان در گروه سنی (۱Y-۲Y) با ۴۱.۳٪ در مقایسه با سایر گروه ها، بیشترین آلودگی به AGE ویروسی را داشتند. کودکان پسر بیشتر از دختران در ۳۸٪ آلوده بودند. علائم اصلی AGE ویروسی که در همه کودکان مثبت آشکار شد، اسهال، استفراغ، تهوع و تب بود که به ترتیب ۱۰۰٪، ۹۵.۲، ۹۲.۱٪ و ۸۱٪ بود.
نتیجه‌گیری: نتایج نشان داد که شیوع عفونت‌های گوارشی در کودکان مرتبط است و باید مورد توجه مقامات بهداشتی کشور قرار گیرد. این مطالعه اولین کاری است که در استان الاحساء عربستان سعودی انجام شده است. این می تواند داده های اپیدمیولوژیک و علت شناسی سن کودکان در استان را بهبود بخشد.
نوع مطالعه: مقاله پژوهشی |
موضوع مقاله:
ویروس شناسی پزشکی
دریافت: 1402/5/22 | پذیرش: 1402/8/24 | انتشار الکترونیک: 1402/9/8
دریافت: 1402/5/22 | پذیرش: 1402/8/24 | انتشار الکترونیک: 1402/9/8
فهرست منابع
1. Zaraket R, Salami A, Bahmad M, El Roz A, Khalaf B, Ghssein G, et al. Prevalence, risk factors, and clinical characteristics of rotavirus and adenovirus among Lebanese hospitalized children with acute gastroenteritis. Heliyon. 2020;6(6):e04248. [DOI:10.1016/j.heliyon.2020.e04248] [PMID] [PMCID]
2. Ouédraogo N, Kaplon J, Bonkoungou IJO, Traoré AS, Pothier P, Barro N, et al. Prevalence and genetic diversity of enteric viruses in children with diarrhea in Ouagadougou, Burkina Faso. PLoS One. 2016;11(4):e0153652. [DOI:10.1371/journal.pone.0153652] [PMID] [PMCID]
3. Kargar M, Javdani N, Najafi A, Tahamtan Y. First molecular detection of group A rotavirus in urban and hospital sewage systems by nested-RT PCR in Shiraz, Iran. J Environ Health Sci Eng. 2013;11(1):4. [DOI:10.1186/2052-336X-11-4] [PMID] [PMCID]
4. Gallimore CI, Taylor C, Gennery AR, Cant AJ, Galloway A, Xerry J, et al. Contamination of the hospital environment with gastroenteric viruses: comparison of two pediatric wards over a winter season. J Clin Microbiol. 2008;46(9):3112-5. [DOI:10.1128/JCM.00400-08] [PMID] [PMCID]
5. Mitra S, Nayak MK, Majumdar A, Sinha A, Chatterjee S, Deb A, et al. Development and evaluation of a multiplex conventional reverse-transcription polymerase chain reaction assay for the detection of common viral pathogens causing acute gastroenteritis. Diagn Microbiol Infect Dis. 2020;97(4):115061. [DOI:10.1016/j.diagmicrobio.2020.115061] [PMID]
6. Bányai K, Estes MK, Martella V, Parashar UD. Viral gastroenteritis. Lancet. 2018;392(10142):175-86. [DOI:10.1016/S0140-6736(18)31128-0] [PMID]
7. Levidiotou S, Gartzonika C, Papaventsis D, Christaki C, Priavali E, Zotos N, et al. Viral agents of acute gastroenteritis in hospitalized children in Greece. Clin Microbiol Infect. 2009;15(6):596-8. [DOI:10.1111/j.1469-0691.2009.02855.x] [PMID] [PMCID]
8. Graves NS. Acute gastroenteritis. Prim Care Clin Off Pract. 2013;40(3):727-41. [DOI:10.1016/j.pop.2013.05.006] [PMID] [PMCID]
9. Guarino A, Aguilar J, Berkley J, Broekaert I, Vazquez-Frias R, Holtz L, et al. Acute Gastroenteritis in Children of the World: What Needs to Be Done? J Pediatr Gastroenterol Nutr. 2020;70(5):694-701. [DOI:10.1097/MPG.0000000000002669] [PMID] [PMCID]
10. Lopman BA, Reacher MH, Van Duijnhoven Y, Hanon FX, Brown D, Koopmans M. Viral gastroenteritis outbreaks in Europe, 1995-2000. Emerg Infect Dis. 2003;9(1):90-6. [DOI:10.3201/eid0901.020184] [PMID] [PMCID]
11. Rovida F, Campanini G, Piralla A, Adzasehoun KMG, Sarasini A, Baldanti F. Molecular detection of gastrointestinal viral infections in hospitalized patients. Diagn Microbiol Infect Dis. 2013;77(3):231-5. [DOI:10.1016/j.diagmicrobio.2013.07.020] [PMID] [PMCID]
12. Desselberger U. Viral gastroenteritis. Medicine. 2017;45(11):690-4. [DOI:10.1016/j.mpmed.2017.08.005] [PMID] [PMCID]
13. Biscaro V, Piccinelli G, Gargiulo F, Ianiro G, Caruso A, Caccuri F, et al. Detection and molecular characterization of enteric viruses in children with acute gastroenteritis in Northern Italy. Infect Genet Evol. 2018;60:35-41. [DOI:10.1016/j.meegid.2018.02.011] [PMID]
14. Japhet MO, Famurewa O, Adesina OA, Opaleye OO, Wang B, Höhne M, et al. Viral gastroenteritis among children of 0-5 years in Nigeria: Characterization of the first Nigerian aichivirus, recombinant noroviruses and detection of a zoonotic astrovirus. J Clin Virol. 2019;111:4-11. [DOI:10.1016/j.jcv.2018.12.004] [PMID]
15. Shen W, Sheng Y, Weng J, Li G, Wang D, Qiu D, et al. Molecular epidemiology of norovirus associated with acute gastroenteritis in Taizhou, China: A retrospective study. Infect Public Health. 2020;13(1):34-9. [DOI:10.1016/j.jiph.2019.06.006] [PMID]
16. Gallimore Chris I, Taylor C, Gennery Andrew R, Cant Andrew J, Galloway A, Iturriza-Gomara M, et al. Environmental Monitoring for Gastroenteric Viruses in a Pediatric Primary Immunodeficiency Unit. J Clin Microbiol. 2006;44(2):395-9. [DOI:10.1128/JCM.44.2.395-399.2006] [PMID] [PMCID]
17. Logan C, O'Leary John J, O'Sullivan N. Real-Time Reverse Transcription-PCR for Detection of Rotavirus and Adenovirus as Causative Agents of Acute Viral Gastroenteritis in Children. J Clin Microbiol. 2006;44(9):3189-95. [DOI:10.1128/JCM.00915-06] [PMID] [PMCID]
18. Meqdam MM, Thwiny IR. Prevalence of group a rotavirus, enteric adenovirus, norovirus and astrovirus infections among children with acute gastroenteritis in Al-Qassim, Saudi Arabia. Pak J Med Sci. 2007;23(4):551.
19. Zhang J, Wang F, Jin H, Hu J, Yuan Z, Shi W, et al. Laboratory monitoring of bacterial gastroenteric pathogens Salmonella and Shigella in Shanghai, China 2006-2012. Epidemiol Infect. 2015;143(3):478-85. [DOI:10.1017/S0950268814001162] [PMID] [PMCID]
20. Duman M, Gencpinar P, Biçmen M, Arslan N, Özden Ö, Üzüm Ö, et al. Fecal calprotectin: can be used to distinguish between bacterial and viral gastroenteritis in children? Am J Emerg Med. 2015;33(10):1436-9. [DOI:10.1016/j.ajem.2015.07.007] [PMID]
21. Barrett J, Fhogartaigh CN. Bacterial gastroenteritis. Medicine. 2017;45(11):683-9. [DOI:10.1016/j.mpmed.2017.08.002]
22. McAuliffe GN, Anderson TP, Stevens M, Adams J, Coleman R, Mahagamasekera P, et al. Systematic application of multiplex PCR enhances the detection of bacteria, parasites, and viruses in stool samples. J Infect. 2013;67(2):122-9. [DOI:10.1016/j.jinf.2013.04.009] [PMID]
23. Tilmanne A, Martiny D, Quach C, Wautier M, Vandenberg O, Lepage P, et al. Enteropathogens in paediatric gastroenteritis: comparison of routine diagnostic and molecular methods. Clin Microbiol Infect. 2019;25(12):1519-24. [DOI:10.1016/j.cmi.2019.07.021] [PMID]
24. Buss Sarah N, Leber A, Chapin K, Fey Paul D, Bankowski Matthew J, Jones Matthew K, et al. Multicenter Evaluation of the BioFire FilmArray Gastrointestinal Panel for Etiologic Diagnosis of Infectious Gastroenteritis. J Clin Microbiol. 2015;53(3):915-25. [DOI:10.1128/JCM.02674-14] [PMID] [PMCID]
25. Martínez Miguel A, Soto-del Río María de los D, Gutiérrez Rosa M, Chiu Charles Y, Greninger Alexander L, Contreras Juan F, et al. DNA Microarray for Detection of Gastrointestinal Viruses. J Clin Microbiol. 2014;53(1):136-45. [DOI:10.1128/JCM.01317-14] [PMID] [PMCID]
26. Prado T, Silva DM, Guilayn WC, Rose TL, Gaspar AMC, Miagostovich MP. Quantification and molecular characterization of enteric viruses detected in effluents from two hospital wastewater treatment plants. Water Res. 2011;45(3):1287-97. [DOI:10.1016/j.watres.2010.10.012] [PMID]
27. Huh J-W, Kim W-H, Moon S-G, Lee J-B, Lim Y-H. Viral etiology and incidence associated with acute gastroenteritis in a 5-year survey in Gyeonggi province, South Korea. J Clin Virol. 2009;44(2):152-6. [DOI:10.1016/j.jcv.2008.11.016] [PMID]
28. Al Ayed MS, Asaad AM, Mahdi AA, Qureshi MA. Aetiology of acute gastroenteritis in children in Najran region, Saudi Arabia. J Health Specialties. 2013;1:84. [DOI:10.4103/1658-600X.114688]
29. Akihara S, Phan TG, Nguyen TA, Hansman G, Okitsu S, Ushijima H. Existence of multiple outbreaks of viral gastroenteritis among infants in a day care center in Japan. Arch Virol. 2005;150(10):2061-75. [DOI:10.1007/s00705-005-0540-y] [PMID]
30. Goldar S, Rajbongshi G, Chamuah K, Alam ST, Sharma A. Occurrence of Viral Gastroenteritis in Children below 5 Years: A Hospital-based Study from Assam, India. Indian J Med Microbiol. 2019;37(3):415-7. [DOI:10.4103/ijmm.IJMM_19_79] [PMID]
31. Pitkänen O, Markkula J, Hemming-Harlo M. A major decrease in viral acute gastroenteritis in hospitalized Finnish children as rotavirus returns as the most detected pathogen. Int J Infect Dis. 2022;114:273-8. [DOI:10.1016/j.ijid.2021.11.016] [PMID]
32. Cunliffe NA, Booth JA, Elliot C, Lowe SJ, Sopwith W, Kitchin N, et al. Healthcare-associated viral gastroenteritis among children in a large pediatric hospital, United Kingdom. Emerg Infect Dis. 2010;16(1):55-62. [DOI:10.3201/eid1601.090401] [PMID] [PMCID]
33. Tayeb HT, Balkhy HH, Aljuhani SM, Elbanyan E, Alalola S, Alshaalan M. Increased prevalence of rotavirus among children associated gastroenteritis in Riyadh Saudi Arabia. Virol J. 2011;8(1):548. [DOI:10.1186/1743-422X-8-548] [PMID] [PMCID]
34. Nguyen Trung V, Le Van P, Le Huy C, Weintraub A. Diarrhea Caused by Rotavirus in Children Less than 5 Years of Age in Hanoi, Vietnam. J Clin Microbiol. 2004;42(12):5745-50. [DOI:10.1128/JCM.42.12.5745-5750.2004] [PMID] [PMCID]
35. Pietruchinski E, Benati F, Lauretti F, Kisielius J, Ueda M, Volotão EM, et al. Rotavirus diarrhea in children and adults in a southern city of Brazil in 2003: distribution of G/P types and finding of a rare G12 strain. J Med Virol. 2006;78(9):1241-9. [DOI:10.1002/jmv.20686] [PMID]
ارسال پیام به نویسنده مسئول
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
