سال 3، شماره 4 - ( زمستان 1388 )                   جلد 3 شماره 4 صفحات 14-9 | برگشت به فهرست نسخه ها

XML English Abstract Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Tahmourespour A, Salehi R, kermanshahi R, Eslami G. RNA extraction from Streptococcus mutans biofilms. Iran J Med Microbiol. 2010; 3 (4) :9-14
URL: http://ijmm.ir/article-1-163-fa.html
طهمورث پور آرزو، صالحی رسول، کسری کرمانشاهی روحا، اسلامی گیلدا. استخراج RNA از سلول های بیوفیلم استرپتوکوکوس موتانس. مجله میکروب شناسی پزشکی ایران. 1388; 3 (4) :14-9

URL: http://ijmm.ir/article-1-163-fa.html


1- گروه میکروب شناسی، دانشکده علوم پایه پزشکی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد خوراسگان اصفهان ، arezootahmourespour@gmail.com
2- Department of Genetics , Basic medical science faculty , Isfahan University of Medical Sciences
3- Department of Microbiology , Biology faculty, Alzahra University, Tehran
4- Department of Parasitoligy , Basic medical science faculty -Shahid Sadoughi University of Medical Sciences, Yazd
چکیده:   (18319 مشاهده)
زمینه و اهداف: استخراجRNA با کمیت و کیفیت مناسب جهتreverse transcriptas PCR ، هیبریدیزاسیون در نورترن بلاتینگ و آنالیز بیان ژن با Real Time PCR از اهمیت بسیاری برخوردار است. در بیوفیلم استرپتوکوکوس موتانس پلی ساکارید های خارج سلولی محلول و غیر محلول تولید شده مانع استخراج RNA می شوند. لذا، بدون کاربرد روش مناسب برای حذف این پلی ساکاریدها روش های مولکولی مبتنی بر RNA برای این باکتری ها مقدور نیست. هدف از این مطالعه استخراج RNA از سلول های بیوفیلم استرپتوکوکوس موتانس بود.
روش بررسی: برای استخراج RNA از سلول های تشکیل دهنده بیوفیلم، استرپتوکوکوس موتانس ATCC35668 و یک سویه استرپتوکوکوس موتانس جداسازی شده از پلاک دندانی استفاده شد. پس از تشکیل بیوفیلم در پلیت های میکروتیتر پلی استیرنی 24 خانه ای استخراج RNA با 3 روش انجام شد. 1: روش معمول استخراج RNA از سلول های پلانکتونیک با محلول RNX-Plus(سیناژن). 2: کیت و دستگاه HYBAID Ribolyser و لوله های حاوی انواع دانه های شیشه ای، پلاستیکی و سرامیکی به منظور لیز بهتر سلول ها. 3: تلفیقی از دو روش محلولRNX-Plus ، دستگاه HYBAID Rybolyser و لوله های حاوی انواع دانه. میانگین نسبت جذب نوری در 260.280 نانومتر هر روش با نرم افزار excel و برآورد فاصله اطمینان توافقی از خطای استاندارد مقایسه شد.
یافته ها: نتایج نشان داد روش معمول برای استخراج RNA (روش 1) از سلول های پلانکتونیک مناسب نیست. استفاده از دستگاه HYBAID ribolyser و لوله های حاوی دانه های شیشه ای، پلاستیکی و سرامیکی با شکل و اندازه متفاوت، حداکثر لیز سلولی را بدون آسیب به RNA ایجاد کرد. در روش های 2 و 3 (دستگاه HYBAID ribolyser به تنهایی و همراه با محلول RNX-Plus) میانگین نسبت جذب نوری حاصل از RNA استخراج شده تفاوت معنی دار آماری با روش معمول (روش 1) نشان داد (P<0.05 ).
نتیجه گیری: فناوری های مناسب در حذف پلی ساکاریدها و ایجاد حداکثر لیز سلولی موثرتر از روش های معمول استخراج RNA از سلول های بیوفیلم است. اما، استفاده از دستگاه و محلول تجاری RNX plus(روش سوم) به دلیل استفاده از محلول های ارزان تر و قابل دسترس مناسب تر است
متن کامل [PDF 222 kb]   (5651 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: میکروب شناسی مولکولی
دریافت: 1392/9/1 | پذیرش: 1392/9/1 | انتشار الکترونیک: 1392/9/1

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA

ارسال پیام به نویسنده مسئول


بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.

کلیه حقوق این وب سایت متعلق به مجله میکروب شناسی پزشکی ایران می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق   ناشر: موسسه فرنام

© 2022 CC BY-NC 4.0 | Iranian Journal of Medical Microbiology

Designed & Developed by : Yektaweb Publishr: Farname Inc.