Bazrgari N, Garoosi G A, Dadar M. Genetic Diversity and Phylogenetic Relationship of Clinical Isolates of Brucella melitensis Based on Gene Polymorphism of β Subunit of RNA Polymerase (rpoB) Gene in Iran. Iran J Med Microbiol 2020; 14 (5) :425-440
URL:
http://ijmm.ir/article-1-1182-fa.html
بذرگری نسیم، گروسی قاسم علی، دادار مریم. تنوع ژنتیکی و رابطه فیلوژنی ایزولههای بالینی بروسلا ملی تنسیس بر اساس پلیمورفیسم ژن زیرواحد β آنزیم RNA پلیمراز) ژن (rpoB در ایران. مجله میکروب شناسی پزشکی ایران. 1399; 14 (5) :425-440
URL: http://ijmm.ir/article-1-1182-fa.html
1- گروه بیوتکنولوژی کشاورزی ، دانشگاه بین المللی امام خمینی ، قزوین ، ایران
2- بخش بروسلوز، موسسه تحقیقات واکسن و سرمسازی رازی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران. ، dadar.m77@gmail.com
چکیده: (6065 مشاهده)
زمینه و اهداف: گسترش عفونتهای بروسلا در حیوانات و انسان نیاز اساسی آزمایشگاههای مرجع منطقهای/ محلی مختلف را برای استفاده از رویکردهای معتبر تعیین گونه به منظور تسهیل تبادل دادهها و مقایسه آنها نشان داده است. هدف از این مطالعه ارزیابی زیرواحد β آنزیم RNA پلیمراز (rpoB) به عنوان یک نشانگر مولکولی در تمایز گونه های بروسلا و تعیین ژنوتیپ گونه های بروسلا ملی تنسیس با استفاده از تجزیه و تحلیل چندشکلی تک نوکلیوتیدی (SNP) است.
مواد و روش کار: در این مطالعه، نمونه خون و مایع مغزی نخاعی از ۱۰۸بیمار مبتلا به بروسلوزیس گرفته شد. پس از کشت نمونه ها در محیط کشت بروسلا آگار حاوی آنتی بیوتیک، تعداد ۱۱ سویه باکتری بروسلا جداسازی شد و با روش های بیوتایپینگ کلاسیک و مولکولی شناسایی شد. سپس ژن rpoB هر کدام از ایزوله ها تکثیر و توالی یابی گردید. نتایج توالی یابی توسط برنامه Mega۶ آنالیز گردید.
یافته ها: طبق نتایج، ژن rpoB قادر به تمایز گونه های بروسلا از همدیگر و سایر باکتریها بود و همچنین مشخص شد که ایزوله های بالینی بروسلا دارای تیپ دو rpoB و ژنوتیپ ۲ بروسلا ملی تنسیس هستند. در حالی که تنها یکی از ایزوله ها متعلق به تیپ ۱ بود. از ۱۰ سویه rpoB تیپ ۲، شش نمونه با تنها یک نوع منحصر به فرد جهش نقطه ای در کدون ۹۸۵ مشاهده شدند که نوع جدیدی از تحت گونه ژنوتیپ ۲ می باشد.
نتیجهگیری: نتایج ما نشاندهنده قدرت تمایز بالای ژن rpoB در بین جدایه های بروسلا از برخی مناطق مختلف ایران است که منجر به تعیین ژنوتایپ دقیق و شناسایی این باکتریها شد.
نوع مطالعه:
مقاله پژوهشی |
موضوع مقاله:
بیماری های مشترک انسان - دام دریافت: 1399/4/20 | پذیرش: 1399/6/24 | انتشار الکترونیک: 1399/7/14