سال 14، شماره 4 - ( مرداد - شهریور 1399 )                   جلد 14 شماره 4 صفحات 347-342 | برگشت به فهرست نسخه ها

XML English Abstract Print

Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Heydargoy M H. Investigation of Antiviral Drugs with Direct Effect on RNA Polymerases and Simulation of Their Binding to SARS-CoV-2 (COVID-19) RNA-Dependent RNA Polymerase by Molecular Docking Method. Iran J Med Microbiol 2020; 14 (4) :342-347
URL: http://ijmm.ir/article-1-1105-fa.html
حیدرگوی محمدحسین. بررسی داروهای ضد ویروسی با تأثیر بر RNA پلیمراز و شبیه سازی اتصال آنها به RNA پلیمراز وابسته به RNA در SARS-CoV-2 به روش داکینگ مولکولی. مجله میکروب شناسی پزشکی ایران. 1399; 14 (4) :342-347

URL: http://ijmm.ir/article-1-1105-fa.html

بررسی داروهای ضد ویروسی با تأثیر بر RNA پلیمراز و شبیه سازی اتصال آنها به RNA پلیمراز وابسته به RNA در SARS-CoV-2 به روش داکینگ مولکولی
محمدحسین حیدرگوی
گروه میکروب شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد شهر قدس، تهران، ایران ، heydoc92@gmail.com
چکیده:   (5461 مشاهده)

زمینه و اهداف: به دنبال شیوع SARS-CoV (سندرم شدید و حاد تنفسی کروناویروس) در سال ۲۰۰۲ و شیوع سندرم تنفسی کرونا ویروس خاورمیانه (MERS-CoV) در سال ۲۰۱۲ ، با گسترش سریع کرونا ویروس جدید کرونا (COVID-۱۹) در سال ۲۰۱۹ روبرو هستیم.تعدد شیوع ویروس و همچنین گستردگی شیوع آن نیازمند طراحی دارو و واکسن در کمترین زمان ممکن دارد. این امر امکان پذیر نیست مگر با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیک. در این مطالعه ، اتصال داروهای مؤثر بر RNA پلیمراز به ساختار RNA پلی مراز وابسته به RNA  متعلق بهSARS-CoV-۲ با روش داکینگ مولکولی، شبیه سازی گردیده است.
مواد و روش کار: ساختار داروهای مورد استفاده در درمان COVID-۱۹ و ساختارهای مشابه آنها از بانک اطلاعاتی drugbank دریافت شده است. سپس توسط نرم افزار AutoDock Vina ، داکینگ مولکولی انجام گرفت. ساختار دارویی که منفی ترین انرژی پیوند را داشت، در جایگاه اختصاصی تر، دوباره داک شد. سرانجام ، اسیدهای آمینه درگیر در اتصال توسط نرم افزار Discovery Studio  مورد بررسی قرار گرفت.
یافته‌ها: در شرایط کامپیوتری(insillico)، دارویRifabutin  بهترین عملکرد را برای اتصال به RNA پلی مراز وابسته به RNA متعلق بهSARS-CoV-۲  داشت و محل اتصال مشخص شده برای این دارو با محل اتصال نشان داده شده در پایگاه داده PDB متفاوت بود.
نتیجه‌گیری: تحقیقات بیشتر در مورد Rifabutin می تواند کلید اصلی کشف داروهای جدید برای COVID-۱۹ باشد.

واژه‌های کلیدی: COVID-19، SARS-CoV-2، Molecular docking، Structural bioinformatics
متن کامل [PDF 558 kb]   (1763 دریافت)    
نوع مطالعه: مقاله پژوهشی | موضوع مقاله: بیوانفورماتیک میکروبی
دریافت: 1399/1/22 | پذیرش: 1399/5/6 | انتشار الکترونیک: 1399/4/30
ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA
ارسال پیام به نویسنده مسئول

بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.

کلیه حقوق این وب سایت متعلق به مجله میکروب شناسی پزشکی ایران می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق   ناشر: موسسه فرنام

© 2024 CC BY-NC 4.0 | Iranian Journal of Medical Microbiology

Designed & Developed by : Yektaweb Publishr: Farname Inc.