Iranian Journal of Medical Microbiology
مجله میکروب شناسی پزشکی ایران
Iran J Med Microbiol
Medical Sciences
http://ijmm.ir
1
admin
1735-8612
2345-4342
8
10.30699/ijmm
14
8888
13
en
jalali
1399
2
1
gregorian
2020
5
1
14
3
online
1
fulltext
fa
بررسی مقاومت به فلوروکوئینولونها و ارتباط آن با موتاسیون در ژن parC در جدایههای کلینیکی کلبسیلا پنومونیه
Evaluation of Resistance to Fluoroquinolones and Its Relationship whit parC Gene Mutation in Klebsiella pneumoniae Clinical Isolates
مقاومت پادزیستی (آنتی بیوتیکی)
Antibiotic Resistance
مقاله پژوهشی
Original Research Article
<div style="text-align: justify;"><span style="font-family:IRANsans;"><span style="font-size:14px;"><span style="color:#ffffff;"><strong><span style="background-color:#008080;">زمینه و اهداف:</span></strong></span><em> کلبسیلا پنومونیه</em> به دلیل ایجاد طیف وسیعی از بیماریها و مقاومت آنتیبیوتیکی بسیار موردتوجه است. مقاومت به فلوروکوئینولون­­ها در این باکتری­های گرم منفی، ممکن است درنتیجه موتاسیون کروموزومی در ژنهای <em><span dir="LTR">gyr</span></em> و <em><span dir="LTR">par</span></em> باشد. هدف از این مطالعه بررسی الگوی مقاومت به فلوروکوئینولون­ها و ارتباط آن با موتاسیون در ژن <em><span dir="LTR">par</span></em><span dir="LTR">C</span> در میان جدایههای بالینی <em>کلبسیلا پنومونیه</em> هست.<strong><span style="font-size:12.0pt;"></span></strong><br>
<span style="color:#ffffff;"><strong><span style="background-color:#008080;">روش کار:</span></strong></span> در این مطالعه توصیفی- تحلیلی، تعداد ۹۵ <em>کلبسیلا پنومونیه</em> پس از تشخیص بیوشیمیایی و مولکولی، ازنظر مقاومت به آنتی­بیوتیک­های مختلف، مطابق توصیه موسسه استاندارد آزمایشگاهی و بالینی <span dir="LTR">CLSI</span> بررسی و جدایه­های مقاوم به سیپروفلوکساسین غربالگری شدند. برای بررسی وجود موتاسیون در ژن <em><span dir="LTR">parC</span></em> در<em> کلبسیلا پنومونیه</em>های مقاوم به سیپروفلوکساسین، از طریق تکثیر این ژن به روش <span dir="LTR">PCR</span> و سپس تعیین توالی قطعه تکثیرشده و درنهایت مقایسه آن با توالی ژنوم باکتری استاندارد موجود در سایت <span dir="LTR">NCBI</span>، از طریق نرمافزارهای آنلاین، <span dir="LTR">Insilico</span> و <span dir="LTR">Clustalw۲</span>، بلاست گردید.<br>
<span style="color:#ffffff;"><strong><span style="background-color:#008080;">یافتهها:</span></strong></span>نتایج تست آنتی­بیوگرام حاکی از گسترش باکتری­های <span dir="LTR">Multi Drug Resistant</span><span dir="LTR"> (MDR)</span> بود. ۳/۱% جدایه­ها به همه­ی ۱۳ آنتیبیوتیک موردمطالعه و ۲/۲۴% جدایه­ها سیپروفلوکساسین مقاوم بودند. بیشترین و کمترین درصد مقاومت آنتیبیوتیکی به ترتیب برای آمپیسیلین و آموکسی­سیلین (۹۸/۹%) و ایمی­پنم (۱۳/۶%) تعیین شد. آنالیز توالی یابی ژن <em><span dir="LTR">parC</span></em> نشان داد از ۲۳ جدایه مقاوم به سیپروفلوکساسین، ۱۶ جدایه در کدون ۸۰ <span dir="LTR">(I۸۰S)</span>، یکی در کدون ۸۴ <span dir="LTR">(E۸۴K)</span> و ۳ جدایه نیز دچار جهش در چارچوب بودند.<br>
<strong><span style="color:#ffffff;"><span style="background-color:#008080;">نتیجه گیری:</span></span> </strong>جهش در ژن <em><span dir="LTR">parC</span></em> می­تواند یکی از عوامل اصلی مقاومت به فلوروکوئینولون­ها و افزایش باکتری­های <span dir="LTR">MDR</span> و ایجاد عفونت<span dir="LTR"></span>های بیمارستانی باشد.</span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:B Lotus;"><span style="font-size:14.0pt;"></span></span></span></div>
<p style="text-align: justify;"><span style="font-size:16px;"><span style="font-family:Times New Roman;"><span style="color:#ffffff;"><strong><span style="background-color:#008080;">Background & Objective</span></strong><span style="background-color:#008080;">:</span></span><em><span style="color:#ffffff;"><span style="background-color:#008080;"> </span></span> Klebsiella pneumoniae </em>has received attention due to a wide range of diseases and antibiotic resistance.The resistance to fluoroquinolones in gram-negative bacteria is often due to chromosomal mutations in the <em>gyr</em> and <em>par </em>genes. This research aimed at investigating the pattern of fluoroquinolone resistance and its relation with a mutation in the <em>par</em>C gene among clinical isolates of <em>K. Pneumoniae</em>.<br>
<span style="color:#ffffff;"><strong><span style="background-color:#008080;"> Methods:</span></strong></span> In this descriptive-analytical study, 95 <em>K. pneumoniae</em>, after biochemical and molecular diagnosis, were evaluated for resistance to different antibiotics by disk diffusion agar according to CLSI recommendations and screening for ciprofloxacin-resistant isolates. Mutation in the ciprofloxacin resistance determinant region of the <em>par</em>C gene of <em>K.</em> <em>pneumoniae</em> resistant to ciprofloxacin was performed by PCR amplification and then amplified fragment sequencing and finally with the standard bacterial genome sequencing available at NCBI site, became BLAST through online software, Insilico, and Clustalw2.<br>
<span style="color:#ffffff;"><strong><span style="background-color:#008080;">Results:</span></strong><span style="background-color:#008080;"> </span></span> The result of the antibiogram showed implies an expansion of MDR bacteria. 3.1% of isolates were resistant to all 13 antibiotics studied and 24.2% were ciprofloxacin-resistant. The highest and lowest percentages of antibiotic resistance were determined for ampicillin and amoxicillin (98.9%) and imipenem (13.6%), respectively. Sequence analysis of the <em>par</em>C gene showed that of 23 isolates resistant to ciprofloxacin, 16 isolates at codon 80 (I80S), one at codon 84 (E84K) were and 3 isolates also had frame-shift mutations.<br>
<span style="color:#ffffff;"><strong><span style="background-color:#008080;">Conclusion:</span></strong></span> Mutations in the <em>par</em>C gene can be one of the major contributors to resistance to fluoroquinolones and increased MDR bacteria and nosocomial infections.</span></span></p>
کلبسیلا پنومونیه, فلوروکوئینولونها, ژن parC, PCR
Klebsiella pneumoniae, Fluoroquinolones, parC gene, PCR
270
289
http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-733-3&slc_lang=fa&sid=1
Massoumeh
Chanbari
معصومه
چنبری
M.chanbari111@gmail.com
100319475328460016202
000000027190474X
No
Department of Microbiology, Faculty of Sciences, Karaj Branch, Islamic Azad University, Karaj, Iran
فارغ التحصیل دانشگاه آزاد اسلامی واحد کرج
Reza
Mirnejad
رضا
میر نژاد
rmirnejad@yahoo.com
100319475328460016203
100319475328460016203
No
Molecular Biology Research Center, Baqiyatallah University of MeIrandical of Sciences, Tehran, Iran
استاد تمام دانشگاه علوم پزشکی بقیه الله (عج)
Ebrahim
Babapour
ابراهیم
باباپور
e_babapoor@yahoo.com
100319475328460016204
0000000318829178
Yes
Department of Microbiology, Karaj Branch, Islamic Azad University, Karaj, Iran
استادیار گروه میکروبیولوژی دانشگاه آزاد اسلامی واحد کرج