<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian Journal of Medical Microbiology</title>
<title_fa>مجله میکروب شناسی پزشکی ایران</title_fa>
<short_title>Iran J Med Microbiol</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://ijmm.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-8612</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2345-4342</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.30699/ijmm</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1399</year>
	<month>2</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2020</year>
	<month>5</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>14</volume>
<number>3</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>بررسی مقاومت به فلوروکوئینولون‌ها و ارتباط آن با موتاسیون در ژن parC در جدایه‌های کلینیکی کلبسیلا پنومونیه</title_fa>
	<title>Evaluation of Resistance to Fluoroquinolones and Its Relationship whit parC Gene Mutation in Klebsiella pneumoniae Clinical Isolates</title>
	<subject_fa>مقاومت پادزیستی (آنتی بیوتیکی) </subject_fa>
	<subject>Antibiotic Resistance</subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Original Research Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;div style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#008080;&quot;&gt;زمینه و اهداف:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&amp;nbsp;کلبسیلا پنومونیه&lt;/em&gt; به دلیل ایجاد طیف وسیعی از بیماری&#8204;ها و مقاومت آنتی&#8204;بیوتیکی بسیار موردتوجه است. مقاومت به فلوروکوئینولون&#8204;&amp;shy;&amp;shy;ها در این باکتری&amp;shy;های گرم منفی، ممکن است درنتیجه موتاسیون کروموزومی در ژن&#8204;های &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;gyr&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; و &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;par&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; باشد. هدف از این مطالعه بررسی الگوی مقاومت به فلوروکوئینولون&amp;shy;&#8204;ها و ارتباط آن با موتاسیون در ژن &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;par&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;C&lt;/span&gt; در میان جدایه&#8204;های بالینی &lt;em&gt;کلبسیلا پنومونیه&lt;/em&gt; هست.&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#008080;&quot;&gt;روش کار:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;در این مطالعه توصیفی- تحلیلی، تعداد ۹۵ &lt;em&gt;کلبسیلا پنومونیه&lt;/em&gt; پس از تشخیص بیوشیمیایی و مولکولی، ازنظر مقاومت به آنتی&amp;shy;بیوتیک&amp;shy;های مختلف، مطابق توصیه موسسه استاندارد آزمایشگاهی و بالینی &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;CLSI&lt;/span&gt; بررسی و جدایه&amp;shy;&#8204;های مقاوم به سیپروفلوکساسین غربالگری شدند. برای بررسی وجود موتاسیون در ژن &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;parC&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; در&lt;em&gt; کلبسیلا پنومونیه&lt;/em&gt;های مقاوم به سیپروفلوکساسین، از طریق تکثیر این ژن به روش &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt; و سپس تعیین توالی قطعه تکثیرشده و درنهایت مقایسه آن با توالی ژنوم باکتری استاندارد موجود در سایت &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;NCBI&lt;/span&gt;، از طریق نرم&#8204;افزارهای آنلاین، &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Insilico&lt;/span&gt; و &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Clustalw۲&lt;/span&gt;، بلاست گردید.&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#008080;&quot;&gt;یافته&#8204;ها:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;نتایج تست آنتی&amp;shy;بیوگرام حاکی از گسترش باکتری&amp;shy;های &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Multi Drug Resistant&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt; (MDR)&lt;/span&gt; بود. ۳/۱% جدایه&amp;shy;ها به همه&amp;shy;ی ۱۳ آنتی&#8204;بیوتیک موردمطالعه و ۲/۲۴% جدایه&#8204;&amp;shy;ها سیپروفلوکساسین مقاوم بودند. بیشترین و کم&#8204;ترین درصد مقاومت آنتی&#8204;بیوتیکی به ترتیب برای آمپی&#8204;سیلین و آموکسی&amp;shy;سیلین (۹۸/۹%) و ایمی&amp;shy;پنم (۱۳/۶%) تعیین شد. آنالیز توالی یابی ژن &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;parC&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; نشان داد از ۲۳ جدایه مقاوم به سیپروفلوکساسین، ۱۶ جدایه در کدون ۸۰ &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;(I۸۰S)&lt;/span&gt;، یکی در کدون ۸۴ &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;(E۸۴K)&lt;/span&gt; و ۳ جدایه نیز دچار جهش در چارچوب بودند.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#008080;&quot;&gt;نتیجه گیری:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;/strong&gt;جهش&#8204; در ژن &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;parC&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; می&#8204;&amp;shy;تواند یکی از عوامل اصلی مقاومت به فلوروکوئینولون&#8204;&amp;shy;ها و افزایش باکتری&amp;shy;&#8204;های &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;MDR&lt;/span&gt; و ایجاد عفونت&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&#8204;&lt;/span&gt;های بیمارستانی باشد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Lotus;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14.0pt;&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/div&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#008080;&quot;&gt;Background &amp; Objective&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#008080;&quot;&gt;:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#008080;&quot;&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;Klebsiella pneumoniae &lt;/em&gt;has received attention due to a wide range of diseases and antibiotic resistance.The resistance to fluoroquinolones in gram-negative bacteria is often due to chromosomal mutations in the &lt;em&gt;gyr&lt;/em&gt; and &lt;em&gt;par &lt;/em&gt;genes. This research aimed at investigating the pattern of fluoroquinolone resistance and its relation with a mutation in the &lt;em&gt;par&lt;/em&gt;C gene among clinical isolates of &lt;em&gt;K. Pneumoniae&lt;/em&gt;.&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#008080;&quot;&gt;&amp;nbsp;Methods:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt; In this descriptive-analytical study, 95 &lt;em&gt;K. pneumoniae&lt;/em&gt;, after biochemical and molecular diagnosis, were evaluated for resistance to different antibiotics by disk diffusion agar according to CLSI recommendations and screening for ciprofloxacin-resistant isolates. Mutation in the ciprofloxacin resistance determinant region of the &lt;em&gt;par&lt;/em&gt;C gene of &lt;em&gt;K.&lt;/em&gt; &lt;em&gt;pneumoniae&lt;/em&gt; resistant to ciprofloxacin was performed by PCR amplification and then amplified fragment sequencing and finally with the standard bacterial genome sequencing available at NCBI site, became BLAST through online software, Insilico, and Clustalw2.&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#008080;&quot;&gt;Results:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#008080;&quot;&gt; &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;The result of the antibiogram showed implies an expansion of MDR bacteria. 3.1% of isolates were resistant to all 13 antibiotics studied and 24.2% were ciprofloxacin-resistant. The highest and lowest percentages of antibiotic resistance were determined for ampicillin and amoxicillin (98.9%) and imipenem (13.6%), respectively. Sequence analysis of the &lt;em&gt;par&lt;/em&gt;C gene showed that of 23 isolates resistant to ciprofloxacin, 16 isolates at codon 80 (I80S), one at codon 84 (E84K) were and 3 isolates also had frame-shift mutations.&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#008080;&quot;&gt;Conclusion:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;Mutations in the &lt;em&gt;par&lt;/em&gt;C gene can be one of the major contributors to resistance to fluoroquinolones and increased MDR bacteria and nosocomial infections.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;</abstract>
	<keyword_fa>کلبسیلا پنومونیه, فلوروکوئینولون‌ها, ژن parC, PCR</keyword_fa>
	<keyword>Klebsiella pneumoniae, Fluoroquinolones, parC gene, PCR</keyword>
	<start_page>270</start_page>
	<end_page>289</end_page>
	<web_url>http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-733-3&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Massoumeh</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Chanbari</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>معصومه</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>چنبری</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>M.chanbari111@gmail.com</email>
	<code>100319475328460016202</code>
	<orcid>000000027190474X</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, Faculty of Sciences, Karaj Branch, Islamic Azad University, Karaj, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>فارغ التحصیل دانشگاه آزاد اسلامی واحد کرج</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Reza</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Mirnejad</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>رضا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>میر نژاد</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>rmirnejad@yahoo.com</email>
	<code>100319475328460016203</code>
	<orcid>100319475328460016203</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Molecular Biology Research Center, Baqiyatallah University of MeIrandical of Sciences, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>استاد تمام دانشگاه علوم پزشکی بقیه الله (عج)</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Ebrahim</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Babapour</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>ابراهیم</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>باباپور</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>e_babapoor@yahoo.com</email>
	<code>100319475328460016204</code>
	<orcid>0000000318829178</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, Karaj Branch, Islamic Azad University, Karaj, Iran </affiliation>
	<affiliation_fa>استادیار گروه میکروبیولوژی دانشگاه آزاد اسلامی واحد کرج</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
