<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian Journal of Medical Microbiology</title>
<title_fa>مجله میکروب شناسی پزشکی ایران</title_fa>
<short_title>Iran J Med Microbiol</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://ijmm.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-8612</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2345-4342</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.30699/ijmm</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1398</year>
	<month>7</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2019</year>
	<month>10</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>13</volume>
<number>3</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>en</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>تشخیص مایکروباکتریوم به روش‌های مولکولی و کشت از بخش مراقبت‌های ویژه بیمارستان  TELANGANA</title_fa>
	<title>Detection of Mycobacterium tuberculosis - Microscopy to Molecular Techniques at the  Tertiary Care Hospital in Telangana</title>
	<subject_fa>باکتری شناسی پزشکی </subject_fa>
	<subject>Medical Bacteriology</subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Original Research Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;div style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:iransans;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;زمینه و اهدف:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; &lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;بیماری سل همه&#8204;ساله بیشتر از یک میلیون نفر را در میان کشورهای با درآمد کم و یا متوسط می&#8204;کشد. درک روند وقوع، شیوع و مرگ&#8204;ومیر توبرکلوز (سل) برای پیگیری موفقیت در برنامه&#8204;های کنترل آن بسیار مهم است. تشخیص میکروبیولوژیکی بیماری&#8204;های ناشی از مایکوباکتری&#8204;ها باید سریع و مؤثر باشد تا از ابتلا به بیماری جلوگیری و مدیریت عفونت را بهینه کند.&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&amp;nbsp;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;مواد و روش کار&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; &lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;درمجموع، 1412 نمونۀ بالینی سل ریوی و خارج ریوی از ژانویه تا دسامبر 2017 در انستیتوی علوم پزشکی نظام، حیدرآباد، پاکستان، مطالعه شد. تمام نمونه&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;&#8204;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;ها مطابق رویه&#8204;های عملیاتی استاندارد پردازش شدند. تمام نمونه&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;&#8204;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;ها با میکروسکوپ، کشت، و با کمک دستگاه تشخیص مولکولی &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;GeneXpert&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;بررسی شدند.&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&amp;nbsp;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;یافته&#8204;ها:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; &lt;span style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;از 1412 نمونۀ دریافت&#8204;شده 813 نفر مرد (57/6%) و 599 زن (42/4%) بودند. از بین این نمونه&#8204;ها، 818 مورد (57/9%) نمونۀ سل ریوی و 594 نمونۀ خارج ریوی وجود داشت. شیوع مایکوباکتریوم 6/21% بود که از این تعداد &lt;em&gt;مایکوباکتریوم توبرکلوزیس&lt;/em&gt; در 3/18% و &lt;em&gt;مایکوباکتریوم&#8204;های غیر توبرکولوز&lt;/em&gt; (25/3%) مشاهده شد. میزان آلودگی 2/6% (37 مورد از 1412) بود. در میان موارد مثبت، شایع&#8204;ترین گروه سنی مبتلا 30-21 سال (22/2%) بود. حدود 64 نفر (4/43 درصد) اسمیر مثبت داشتند. در مجموع 200 ایزوله (16/14%) باحداقل یک سیستم کشت &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;LJ&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;یا سیستم&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;BacT Alert 3D&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;&amp;nbsp;بازیابی شدند. &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;MTB&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;در 216 (15/29) توسط &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;GeneXpert&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;بازیابی شد. &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;MDRTB&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;در 8 (3/7%) توسط &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:8.0pt;&quot;&gt;GeneXpert&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;تشخیص داده شد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:5.0pt;&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&amp;nbsp;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;نتیجه&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;&#8204;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;گیری:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; &lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;کمپلکس &lt;em&gt;مایکوباکتریوم توبرکلوزیس&lt;/em&gt; مسئول عوارض و مرگ و میر عظیمی در سراسر جهان است. تاخیر در تشخیص ممکن است استفاده از درمان مناسب را به تعویق اندازد و برای بیمار مضر باشد. به دلیل طولانی بودن زمان کشت سنتی، تکنیک&#8204;های جدید مولکولی امکان تشخیص سریع آزمایشگاهی و حساستر &lt;em&gt;توبرکلوزیس&lt;/em&gt; را فراهم می&#8204;کند.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&amp;nbsp;&lt;/div&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;div style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;strong&gt;Background and Aims&lt;/strong&gt;: Tuberculosis kills more than 1 million people every year, most of them in low-income and middle-income countries. An understanding of the trends in tuberculosis incidence, prevalence, and mortality s crucial to track the success of tuberculosis control programs. Microbiological diagnosis of diseases caused by Mycobacteria should be fast and effective to prevent contagions and optimize the management of infections.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Materials and Methods:&lt;/strong&gt; A total of 1412 clinical pulmonary and extra pulmonary specimens were studied from January 2017 to December 2017 at Nizam&amp;#39;s Institute of Medical Sciences, Hyderabad. All specimens were processed according to standard operating procedures. All the specimens were subjected to microscopy, culture, GeneXpert.&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Results:&lt;/strong&gt; Among 1412 samples received 813 were males (57.6%) and 599 females (42.4%). Among these 818 (57.9%) were pulmonary samples and 594 extra pulmonary samples. Mycobacterium prevalence was (21.6%) out of which Mycobacterium tuberculosis was found in 18.3% and Non tuberculous Mycobacteria (3.25%). The contamination rate was 2.6% (37 out of 1412). Among the positives, the most common affected age group was 21-30 yrs (22.2%). About 64 (4.53%) were smear positive. A total of 200 isolates (14.16%) were recovered by at least one culture LJ medium or BacT Alert 3D system&lt;strong&gt;. &lt;/strong&gt;MTB was recovered in 216 (15.29%) by GeneXpert. MDRTB was detected in 8 (3.7%) by GeneXpert.&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Conclusion:&lt;/strong&gt; &lt;em&gt;M. tuberculosis&lt;/em&gt; complex is responsible for immense worldwide morbidity and mortality. Delays in diagnosis may postpone administration of appropriate treatment and be detrimental to patient outcomes. Since traditional culture methods are slow, newer molecular techniques allow more rapid and sensitive laboratory diagnosis of tuberculosis.&lt;/div&gt;</abstract>
	<keyword_fa>ریوی, خارج ریوی, آلودگی, اسمیر, کاشت, GeneXpert</keyword_fa>
	<keyword>Pulmonary, Extra pulmonary, Contamination, Smear, Culture, GeneXpert</keyword>
	<start_page>175</start_page>
	<end_page>179</end_page>
	<web_url>http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-1207-1&amp;slc_lang=en&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Neelima</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Angaali</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>نیلما</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>آنگالی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>neelimasudharshan@gmail.com</email>
	<code>100319475328460014035</code>
	<orcid>100319475328460014035</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation> Department of Microbiology, Nizams Institute of Medical Sciences, Panjagutta, Hyderabad, India</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروبیولوژی، موسسۀ علوم پزشکی، پنجاگاتا، حیدرآباد، هند</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Madhusudhan </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Apparao Patil</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مدهوسودان</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>آپارو پاتیل</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>anushamap@yahoo.com</email>
	<code>100319475328460014036</code>
	<orcid>100319475328460014036</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation> Department of Microbiology, Nizams Institute of Medical Sciences, Panjagutta, Hyderabad , India</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروبیولوژی، موسسۀعلومپزشکی، پنجاگاتا،حیدرآباد، هند</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Vijay</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Dharma Teja</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>ویجای</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>دارما تجا</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>100319475328460014037</code>
	<orcid>100319475328460014037</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, Nizams Institute of Medical Sciences, Panjagutta, Hyderabad, India</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروبیولوژی، موسسۀ علوم پزشکی، پنجاگاتا، حیدرآباد، هند</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
