<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian Journal of Medical Microbiology</title>
<title_fa>مجله میکروب شناسی پزشکی ایران</title_fa>
<short_title>Iran J Med Microbiol</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://ijmm.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-8612</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2345-4342</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.30699/ijmm</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1398</year>
	<month>7</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2019</year>
	<month>10</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>13</volume>
<number>3</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>بررسی حضور ژن‌های فرعی پیلی تیپ چهارم در سویه‌های سودوموناس آئروژینوزای جدا شده از نمونه‌های بالینی و غیربالینی</title_fa>
	<title>Investigating the Presence of Type IV Pilin Subgenus in Pseudomonas Aeruginosa Isolated from Clinical and Non-Clinical Samples</title>
	<subject_fa>باکتری شناسی پزشکی </subject_fa>
	<subject>Medical Bacteriology</subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Original Research Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;strong&gt;زمینه و هدف:&lt;/strong&gt; پیلی تیپ&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;IV &lt;/span&gt;یک فاکتور کلونیزاسیون مهم برای پاتوژن فرصت طلب سودوموناس آئروژینوزا است، که در شکل گیری بیوفیلم و اتصال به سلولهای میزبان نقش دارد. هر تیپ پیلی با یک ژن کمکی خاص کد می شود. از این رابطه ی مشخص میتوان به عنوان یک هدف درمانی برای تشخیص سویه های سودوموناس آئروژینوزا و همچنین تیپ بندی مولکولی آن استفاده کرد. هدف این مطالعه ارزیابی فراوانی تیپهای مختلف ژنهای کمکی در نمونه های فیبروز سیستیک&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;(CF) &lt;/span&gt;، سوختگی و محیطی می باشد.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;مواد و روشها&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; نمونه های سودوموناس آئروژینوزا از بیماران&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;CF &lt;/span&gt;، سوختگی و همچنین پسماندهای محیطی در طی سال 95-94، جمع آوری گردید. نمونه ها با استفاده از روشهای استاندارد میکروبی و بیوشیمیایی کشت داده و شناسایی شد. استخراج&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;DNA &lt;/span&gt;&amp;nbsp;توسط جوشاندن انجام شد و&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR &lt;/span&gt;&amp;nbsp;از طریق پرایمرهای اختصاصی انجام شد.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;یافته ها:&lt;/strong&gt; روی هم رفته &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;90&lt;/span&gt; ایزوله ی سودوموناس آئروژینوزا( &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;35&lt;/span&gt; نمونه محیطی، &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;30&lt;/span&gt; نمونه سوختگی و &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;25&lt;/span&gt; نمونه&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;(CF &lt;/span&gt;&amp;nbsp;مورد بررسی قرار گرفت&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;TfpO . &lt;/span&gt;&amp;nbsp;و&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;TfpZ &lt;/span&gt;&amp;nbsp;به ترتیب در &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;71&lt;/span&gt; و &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;2&lt;/span&gt; ایزوله مثبت بودند.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;نتیجه گیری:&lt;/strong&gt; براساس نتایج بدست آمده ما نشان دادیم که تیپ پیلی سودوموناس آئروژینوزا بسیار متنوع است. صرف نظر از منبع نمونه ها، شایعترین&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Tfp &lt;/span&gt;،&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;TfpO &lt;/span&gt;&amp;nbsp;بود. با در نظر گرفتن این واقعیت که&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;TfpZ &lt;/span&gt;&amp;nbsp;فقط در نمونه های سوختگی دیده شد، میتوان فرض کرد این تیپ خاص ممکن است در شرایط حاد بالینی ظاهر شود. در نهایت انجام این مطالعه بر جامعه ی آماری بزرگتر و بهره گیری از روشهای جامعتر تایپینگ را پیشنهاد میکنیم.</abstract_fa>
	<abstract>&lt;strong&gt;Background and Aims&lt;/strong&gt;: The type IV Pilin is an important colonization factor for opportunistic pathogens of &lt;em&gt;Pseudomonas aeruginosa&lt;/em&gt;, which plays a role in the formation of biofilms and binding to the host cells. Each type of Pilin is coded with a particular auxiliary gene. This specific relationship can be used as a therapeutic target for detecting &lt;em&gt;P. aeruginosa&lt;/em&gt; strains as well as its molecular classification. The purpose of this study was to evaluate the frequency of different types of auxiliary genes in cystic fibrosis, burns, and environmental samples.&lt;br&gt;
&amp;nbsp;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Materials and Methods:&lt;/strong&gt; Pseudomonas aeruginosa samples were collected from patients with cystic fibrosis, burns as well as environmental wastewaters during 2016-2017. Samples were cultured and identified using standard microbial and biochemical methods. DNA extraction was performed by boiling and PCR was performed through specific primers.&lt;br&gt;
&amp;nbsp;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Results:&lt;/strong&gt; Totally, 90 isolates of &lt;em&gt;P. aeruginosa&lt;/em&gt; samples (35 environmental, 30 burns, and 25 cystic fibrosis) were examined. &lt;em&gt;tfpO&lt;/em&gt; and &lt;em&gt;tfpZ&lt;/em&gt; were positive in 71 and 2 isolates, respectively&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;.&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&amp;nbsp;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Conclusion:&lt;/strong&gt; The results indicated that Pseudomonas aeruginosa Pilin types are very diverse. Regardless of the source of the samples, the most common &lt;em&gt;tfp&lt;/em&gt; was &lt;em&gt;tfpO&lt;/em&gt;. Taking into account the fact that &lt;em&gt;tfpZ&lt;/em&gt; was found only in burns, it can be assumed that this particular type may appear in severe clinical conditions. Ultimately, larger statistical population and use of more comprehensive typing methods is suggested for better results.</abstract>
	<keyword_fa>سودوموناس آئروژینوزا, پیلی تیپIV, سیستیک فیبروزیس</keyword_fa>
	<keyword>Pseudomonas aeruginosa, Type IV Pilin, Cystic fibrosis</keyword>
	<start_page>164</start_page>
	<end_page>174</end_page>
	<web_url>http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-66-4&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Nasim</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Sameni</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>فاطمه</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>ثامنی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>nasimsameni@yahoo.com</email>
	<code>100319475328460014032</code>
	<orcid>100319475328460014032</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, Faculty of Advanced Sciences &amp; Technology, Pharmaceutical  Sciences Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم و فناوری‌های نوین، واحد علوم دارویی دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mehrnaz</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Shahbeik</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مهرناز</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>شاهبیک</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>mehrnaz_66@gmail.com</email>
	<code>100319475328460014033</code>
	<orcid>100319475328460014033</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, Faculty of Advanced Sciences &amp; Technology, Pharmaceutical  Sciences Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم و فناوری‌های نوین، واحد علوم دارویی دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Hosein</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Dabiri</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>حسین</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>دبیری</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>hodabiri@gmail.com</email>
	<code>100319475328460014034</code>
	<orcid>100319475328460014034</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Clinical Microbiology, School of Medicine, Shahid Beheshti University of Medical Sciences, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروب‌شناسی پزشکی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
