<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian Journal of Medical Microbiology</title>
<title_fa>مجله میکروب شناسی پزشکی ایران</title_fa>
<short_title>Iran J Med Microbiol</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://ijmm.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-8612</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2345-4342</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.30699/ijmm</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1397</year>
	<month>11</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2019</year>
	<month>2</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>12</volume>
<number>6</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>ارزیابی فنوتیپی تشکیل بیوفیلم و تعیین حضور ژن‌های icaA و icaD در جدایه‌های بالینی  استافیلوکوکوس اپیدرمیدیس </title_fa>
	<title>Phenotypic Investigation of Biofilm Formation and the Prevalence of icaA and icaD Genes in Staphylococcus epidermidis Isolates </title>
	<subject_fa>باکتری شناسی پزشکی </subject_fa>
	<subject>Medical Bacteriology</subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Original Research Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;div style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:iransans;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;زمینه و هدف:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt; مهم&#8204;ترین فاکتور در بیماری&#8204;زایی &lt;em&gt;استافیلوکوکوس اپیدرمیدیس &lt;/em&gt;توانایی تشکیل بیوفیلم است. شناسایی سویه&#8204;های ایجادکنندۀ بیوفیلم با استفاده از یک روش مناسب و شناخت مکانیسم&#8204;های اتصالی آنها در تولید بیوفیلم می&#8204;تواند به فهم درست استفاده از تجهیزات پزشکی مصنوعی و جلوگیری از افزایش مقاومت به داروها کمک کند. هدف از این مطالعه، ارزیابی روش&#8204;های فنوتیپی (لوله&#8204;ای، کنگورد آگار و میکروتیتر پلیت) و روش مولکولی &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt; با ژن&#8204;های &lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;icaA&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt; و &lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;icaD&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt; برای شناسایی بیوفیلم &lt;em&gt;استافیلوکوکوس اپیدرمیدیس&lt;/em&gt; و تعیین الگوی مقاومت دارویی و رابطۀ آن با تشکیل بیوفیلم در نمونه&#8204;های بالینی و ناقلین سالم بود.&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;مواد و روش&#8204;کار:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt; عداد ۵۰ جدایۀ بالینی و ۴۰ جدایه از ناقلین &lt;em&gt;استافیلوکوکوس اپیدرمیدیس&lt;/em&gt; با استفاده از روش&#8204;های فنوتیپی لوله&#8204;ای، کنگورد آگار و میکروتیتر پلیت و روش مولکولی &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt; با ژن&#8204;های &lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;icaA&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt; و &lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;icaD&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt; بررسی شدند. مقاومت آنتی&#8204;بیوتیکی سویه&#8204;ها با استفاده از روش دیسک دیفیوژن براساس استانداردهای &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;CLSI&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt; انجام شد.&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;یافته&#8204;ها:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; &lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;با استفاده از روش لوله&#8204;ای ۶۳/۳۴درصد از جدایه&#8204;ها و با استفاده از روش کنگورد آگار &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family: iransans; font-size: 12px;&quot;&gt;۳۷&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:iransans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;/۷۸درصد و با روش میکروتیتر پلیت &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family: iransans; font-size: 12px;&quot;&gt;۶۷&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:iransans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;/۷۹درصد جدایه&#8204;ها، توانایی تشکیل بیوفیلم را داشتند. تفاوت معنی&#8204;داری بین دو گروه بیمار و ناقل مشاهده نشد. &lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;icaA&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt; در ۱۰۰درصد و &lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;icaD&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt; در &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family: iransans; font-size: 12px;&quot;&gt;۸۵&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:iransans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;/۲۴درصد سویه&#8204;های تشکیل&#8204;دهندۀ بیوفیلم شناسایی شد.&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;نتیجه&#8204;گیری: &lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;مقایسۀ بین روش&#8204;های فنوتیپی و روش&#8204;های مولکولی با استفاده از ژن&#8204;های &lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;icaA&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt; و &lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;icaD&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt; برای تشخیص بیوفیلم نشان داد که &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;MTP&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt; بهترین روش برای تشخیص بیوفیلم با بیشترین حساسیت و اختصاصیت است و استفادۀ هم&#8204;زمان آن با روش&#8204;های مولکولی توصیه می&#8204;شود.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/div&gt;
</abstract_fa>
	<abstract>&lt;div style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman;&quot;&gt;&lt;strong&gt;Background and Aims:&lt;/strong&gt; The most important factor for pathogenicity of &lt;em&gt;Staphylococcus epidermidis&lt;/em&gt; is the ability to produce biofilm. Identification of biofilm-forming strains using an appropriate method and recognizing the mechanisms of biofilm formation can help understand the proper use of artificial medical equipment and prevent increased drugs resistance . The aim of this study was to 1) evaluate the biofilm formation of &lt;em&gt;S. epidermidis&lt;/em&gt; isolates using phenotypic methods such as Tube Method (TM), Congo Red Agar Method (CRA) and Microtiter Plates Method (MTP) as well as PCR of the genes &lt;em&gt;icaA&lt;/em&gt; and &lt;em&gt;icaD&lt;/em&gt; 2) determine the drug resistance pattern of &lt;em&gt;S. epidermidis&lt;/em&gt; isolates and its association with biofilm formation among clinical specimens and samples of healthy carriers.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Materials and Methods: &lt;/strong&gt;A total of 90 strains of &lt;em&gt;S. epidermidis&lt;/em&gt; including 50 clinical isolates and 40 strains from healthy carriers were studied using the phenotypic methods TM, CRA and MTP, and the molecular PCR of the genes &lt;em&gt;icaA&lt;/em&gt; and &lt;em&gt;icaD&lt;/em&gt;. Antibiotic resistance profile of the strains was performed using disk diffusion method according to the CLSI standards.&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Results: &lt;/strong&gt;A total of 90 strains ( 63.34% by TM, 37.78% by CRA method and 67.79% of MTP method) were able to form biofilm. No significant differences were found between the healthy and carriers groups in terms of antibiotic resistance. The &lt;em&gt;icaA&lt;/em&gt; and &lt;em&gt;icaD&lt;/em&gt; genes were detected among 100% and 85.24% of the biofilm forming strains, respectively.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&amp;nbsp;Conclusions: &lt;/strong&gt;Comparing the phenotypic and molecular methods for the detection of biofilm formation among &lt;em&gt;S. epidermidis &lt;/em&gt;isolatesshowed that MTP is the best method with the highest sensitivity and specificity and its simultaneous use with molecular methods is recommended.&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/div&gt;
</abstract>
	<keyword_fa>استافیلوکوکوس اپیدرمیدیس, بیوفیلم, مقاومت آنتی بیوتیکی, PCR</keyword_fa>
	<keyword>Staphylococcus epidermidis, Biofilm, Antibiotic resistance, PCR.</keyword>
	<start_page>371</start_page>
	<end_page>381</end_page>
	<web_url>http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-1138-1&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Teena</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Dadgar</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>تینا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>دادگر</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>dadgar_teena@yahoo.com</email>
	<code>100319475328460013154</code>
	<orcid>100319475328460013154</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Biology, Gorgan Branch, Islamic Azad University, Gorgan, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه زیست‌شناسی، واحدگرگان، دانشگاه آزاد اسلامی، گرگان، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Zahra</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Vahedi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>زهرا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>واحدی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>zahra.vahedi@yahoo.com</email>
	<code>100319475328460013155</code>
	<orcid>100319475328460013155</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Biology, Gorgan Branch, Islamic Azad University, Gorgan, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه زیست‌شناسی، واحدگرگان، دانشگاه آزاد اسلامی، گرگان، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Sajjad</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Yazdansetad</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سجاد</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>یزدان ستاد</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>sajjad.yazdansetad@gmail.com</email>
	<code>100319475328460013156</code>
	<orcid>100319475328460013156</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, School of Medicine, Golestan University of Medical Sciences, Gorgan, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروب‌شناسی، دانشکدۀ پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی گلستان، گرگان، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Elahe</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Kiaei</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>الهه</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>کیایی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>elahe.kiaei@yahoo.com</email>
	<code>100319475328460013157</code>
	<orcid>100319475328460013157</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Young Researchers Club, Gorgan Branch, Islamic Azad University, Gorgan, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>باشگاه پژوهشگران جوان، واحدگرگان، دانشگاه آزاداسلامی، گرگان، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Hanieh</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Asaadi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>هانیه</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>اسعدی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>hanie.asaadi@yahoo.com</email>
	<code>100319475328460013158</code>
	<orcid>100319475328460013158</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology and Parasitology, Faculty of Medicine, Bushehr University of Medical Sciences, Bushehr, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروب‌شناسی و انگل‌شناسی، دانشکدۀ پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی بوشهر، بوشهر، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
