fa تعیین ژنوتیپ ایزوله های هلیکوباکترپیلوری جداشده از بیماران مبتلا به زخم های پپتیک، سرطان معده و سوء هاضمه های بدون زخم با روش میکروب شناسی مولکولی Molecular Microbiology مقاله کوتاه پژوهشی Brief Original Article زمینه و اهداف: هلیکوباکترپیلوری پاتوژنی با پتانسیل بالای تغییرات ژنتیکی است. این باکتری می تواند میلیون ها انسان را بصورت مزمن در سراسر جهان آلوده کند. هلیکوباکترپیلوری از عوامل مهم زخم های پپتیک و سرطان معده در بیماران مبتلا است. هدف از این مطالعه تعیین ژنویپ هر یک از سویه های هلیکوباکترپیلوری جداشده از بیماران مبتلا به زخم های پپتیک، سرطان معده و سوء هاضمه های بدون زخم با استفاده از روش RAPD-PCR می باشد. روش بررسی: 80 بیوپسی از بیماران با مشکلات معدی که توسط پزشک متخصص تشخیص داده شده بود از بخش آندوسکوپی بیمارستان ها بدست آمد. نمونه های بیوپسی بر روی محیط اختصاصی تحت شرایط میکروآئروفیلیک طی 3 الی 5 روز کشت داده شد. سپس ژنوم باکتری استخراج گردید و RAPD-PCR برای تعیین ژنوتیپ مورد استفاده قرار گرفت. یافته ها: 6 الگوی مختلف (A-F) با استفاده از این روش بدست آمد. این الگوها عبارتند از: الگوی A: 10 ایزوله (16.98%)، B: 6 ایزوله (11.33%)، C: 5 ایزوله (9.43%)، D: 3 ایزوله (5.66%)، E: 2 ایزوله (3.77%) و F: 2 ایزوله (3.77%). ضمنا 26 ایزوله (49.06%) باقیمانده از 54 ایزوله دارای الگوی واحد و مشابه ای با یکدیگر و با شش الگوی دیگر نبودند. ارتباط معنی داری بین هیچ کدام از الگوهای RAPD و بیماری خاص معدی در این مطالعه دیده نشد (P>0.05). نتیجه گیری: نتایج این تحقیق نشان می دهد که تغییرات ژنومی زیادی در سویه های هلیکوباکترپیلوری مورد بررسی در این مطالعه وجود دارد و بهتر است تعیین ترادف ژنومی بعنوان روش مکملی همراه با روش RAPD-PCR بکار رود. <b>Background and Objectives:</b> Helicobacter pylori is a genetically diverse gastric pathogen that chronically infects billions of people worldwide, typically beginning in infancy and lasting for decades. It is a major cause of peptic ulcers and it is an early risk factor for gastric cancer which is the most frequently lethal malignancy globally. This project was designed to genotype <i>H. pyloriisolates</i> isolated from patients with NUD, DU, GU and GC by the polymerase chain reaction(PCR)-based on Randomly Amplified Polymorphic DNA (RAPD) fingerprinting technique. <br><b>Material and Methods:</b> Eighty patients admitted to the gastroenterology unit at Sharyati hospital in Iran were included in this study. Gastric biopsy specimens were inoculated onto selective medium then were cultured for 3 to 5 days at 37 ° C under microaerobic conditions. Genomic DNA was extracted using a commercially available Qiagen kit. RAPD-PCR was used to genotype isolates. <br><b>Results:</b> Six different RAPD patterns (A-F) were seen in morethan one isolate which were as follow pattern A: 9 (16.98%), B: 6 (11.33%), C: 5 (9.43%), D: 3 (5.66%), E: 2 (3.77%) and F: 2 (3.77%). Twenty six (49.06%) of 53 isolates showed a unique RAPD pattern that were not similar to each other. A significant relationship was not seen between a single RAPD pattern and a gastric disorder (P>0.05). <br><b>Conclusion:</b> The results of this study suggest a high level of DNA sequence diversity among H. pylori isolates and it is better to use sequencing method for surveying of Helicobacter pylorigenome rather than RAPD-PCR. Keywords: H هلیکوباکترپیلوری، RAPD-PCR، ژنوتایپینگ Helicobacter pylori, RAPD-PCR, Genotyping 21 25 http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-1-57&slc_lang=fa&sid=1 Amir Ghasemi امیر قاسمی 1003194753284600284 1003194753284600284 No Department of Pathobiology, School of Public Health, Medical Sciences/University of Tehran بخش میکروب شناسی، گروه پاتوبیولوژی، دانشکده بهداشت، دانشگاه علوم پزشکی تهران Mohhamad Shirazi محمدحسن شیرازی 1003194753284600285 1003194753284600285 No Department of Pathobiology, School of Public Health, Medical Sciences/University of Tehran بخش میکروب شناسی، گروه پاتوبیولوژی، دانشکده بهداشت، دانشگاه علوم پزشکی تهران Mohhamad Pourmand محمدرضا پورمند mpourmand@tums.ac.ir 1003194753284600286 1003194753284600286 Yes Department of Pathobiology, School of Public Health, Medical Sciences/University of Tehran بخش میکروب شناسی، گروه پاتوبیولوژی، دانشکده بهداشت، دانشگاه علوم پزشکی تهران Javad Zaemi Yazdi جواد زعیمی یزدی 1003194753284600287 1003194753284600287 No Department of Pathobiology, School of Public Health, Medical Sciences/University of Tehran بخش میکروب شناسی، گروه پاتوبیولوژی، دانشکده بهداشت، دانشگاه علوم پزشکی تهران NourKhoda Sadeghifard نورخدا صادقی فرد 1003194753284600288 1003194753284600288 No Department of Pathobiology, School of Public Health, Medical Sciences/University of Tehran بخش میکروب شناسی، گروه پاتوبیولوژی، دانشکده بهداشت، دانشگاه علوم پزشکی تهران Sahar Bagherzadeh سحر باقرزاده یزدچی 1003194753284600289 1003194753284600289 No Department of Pathobiology, School of Public Health, Medical Sciences/University of Tehran بخش میکروب شناسی، گروه پاتوبیولوژی، دانشکده بهداشت، دانشگاه علوم پزشکی تهران Solmaz Aghamiri سولماز آقاامیری 1003194753284600290 1003194753284600290 No Department of Pathobiology, School of Public Health, Medical Sciences/University of Tehran بخش میکروب شناسی، گروه پاتوبیولوژی، دانشکده بهداشت، دانشگاه علوم پزشکی تهران