<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian Journal of Medical Microbiology</title>
<title_fa>مجله میکروب شناسی پزشکی ایران</title_fa>
<short_title>Iran J Med Microbiol</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://ijmm.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-8612</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2345-4342</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.30699/ijmm</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1397</year>
	<month>4</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2018</year>
	<month>7</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>12</volume>
<number>2</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>جداسازی آمیب‌های آزادزی و شناسایی مولکولی آکانتامبا  از آب‌های راکد کاشان</title_fa>
	<title>Isolation of Free-living amoeba and Molecular Characterization of Acanthamoeba From Stagnant Water, Kashan, Iran</title>
	<subject_fa>انگل شناسی پزشکی</subject_fa>
	<subject>Medical Parasitology</subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Original Research Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;span style=&quot;font-size:12px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:iransans;&quot;&gt;&lt;strong&gt;زمینه و هدف:&lt;/strong&gt; &lt;em&gt;آکانتامبا&lt;/em&gt; شایع&#8204;ترین آمیب آزادزی است که به&#8204;وفور در آب، خاک و گردوغبار وجود دارد و عامل آنسفالیت گرانولوماتوز آمیبی است. مطالعه حاضر برای تشخیص آمیب &amp;shy;های آزادزی و شناسایی ژنوتایپ&#8204;های &lt;em&gt;آکانتامبا&lt;/em&gt; در آب&#8204;های راکد شهر کاشان انجام شده است.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;مواد و روش&#8204; کار:&lt;/strong&gt; در این مطالعه توصیفی، ۱۳۸ نمونه آب راکد از مساجد و پارک&#8204;های کاشان جمع&#8204;آوری شد. این نمونه&#8204;ها پس از عبوردادن از فیلتر ۰/۴۵ میکرونی و کشت در آگار غیرمغذی از نظر آمیب آزادزی بررسی شدند. برای شناسایی مولکولی &lt;em&gt;آکانتامبا&lt;/em&gt; از واکنش زنجیره&#8204;های پلی مراز و پرایمر&#8204;های اختصاصی استفاده شد. پس از تکثیر قطعۀ &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;bp&lt;/span&gt;۴۹۰ و تعیین توالی نوکلئوتیدی، ژنوتایپ ۱۰ ایزوله &lt;em&gt;آکانتامبا&lt;/em&gt; شناسایی شد. &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;pH&lt;/span&gt;، دما، فصل نمونه&#8204;گیری و نتایج در &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;SPSS&lt;/span&gt; نسخۀ ۱۶ ثبت و تحلیل شد.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;یافته&#8204;ها:&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;۸۸/۴ درصد از نمونه&#8204;ها آلوده به آمیب آزادزی بودند که با استفاده از&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR &lt;/span&gt;&amp;nbsp;۵۹/۴ درصد آنها به&#8204;عنوان &lt;em&gt;آکانتامبا&lt;/em&gt; شناسایی و تأیید شدند. از میان نمونه&#8204;های تأییدشده ۸۰ درصد مربوط به ژنوتایپ &lt;em&gt;آکانتامبا&lt;/em&gt; &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;T۴&lt;/span&gt; و ۲۰ درصد &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&amp;nbsp;T۲&lt;/span&gt;بودند. بین فصول نمونه&#8204;گیری و آلودگی با آمیب آزادزی ارتباط معنی&#8204;داری مشاهده شد (۰/۰۱ = &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;P&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;)&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;.&lt;/span&gt; بیشترین میزان آلودگی آب راکد به آمیب آزادزی و &lt;em&gt;آکانتامبا&lt;/em&gt; در ۷&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;pH&lt;/span&gt; مشاهده شد. در این مطالعه ارتباط معنی&#8204;داری بین &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;pH &lt;/span&gt;و دما با آلودگی آمیب آزادزی و &lt;em&gt;آکانتامبا&lt;/em&gt; مشاهده نشد.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;نتیجه&#8204;گیری: &lt;/strong&gt;این مطالعه نشان داد که آلودگی آب&#8204;های راکد به آمیب آزادزی و &lt;em&gt;آکانتامبا&lt;/em&gt; در کاشان بالا است. همچنین ژنوتیپ غالب &lt;em&gt;آکانتامبا&lt;/em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;T۴ &lt;/span&gt;&amp;nbsp;است که از سویه&#8204;های بیماری&#8204;زا است. با توجه به عوارض خطرناک ناشی از این آمیب، آموزش بهداشت برای افزایش آگاهی در زمینه انتقال و نیز اقدامات بهداشتی برای پیشگیری از آلودگی توصیه می&#8204;شود. &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-size:12px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:iransans;&quot;&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;div style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman;&quot;&gt;&lt;strong&gt;Background and Aims:&lt;/strong&gt; &lt;em&gt;Acanthamoeba&lt;/em&gt;, the causative agent of granulomatous amebic encephalitis &lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;)&lt;/span&gt;GAE), is among the most prevalent free-living amoebas (FLA) existing in water, soil and dust. This study was conducted to determine FLA and identify &lt;em&gt;Acanthamoeba &lt;/em&gt;genotypes isolated from stagnant water in Kashan, Iran.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Materials and Methods: &lt;/strong&gt;In this descriptive study, 138 stagnant water samples were collected from Kashan mosques and public parks. The samples were filtered (0.45&amp;micro;m) and cultured onto non-nutrient agar for the presence of FLA. &lt;em&gt;Acanthamoeba &lt;/em&gt;spp. was identified by polymerase chain reaction (PCR) using specific primers, which amplified a 490 bp fragment. Among ten sequenced isolates of &lt;em&gt;Acanthamoeba&lt;/em&gt;, different genotypes were determined by sequence analysis. The parameters such as pH, temperature, sampling season and related results were recorded and analyzed using SPSS16.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Results: &lt;/strong&gt;The rate of FLA was 88.4 %, 59.4% of which were confirmed as &lt;em&gt;Acanthamoeba &lt;/em&gt;spp&lt;em&gt;. &lt;/em&gt;using PCR method. The rate of &lt;em&gt;Acanthamoeba&lt;/em&gt; T4 and T2 genotypes were 80% and 20%, respectively. There was a significant relation between FLA rate and sampling season (&lt;em&gt;P&lt;/em&gt;= 0.01). The highest rate of FLA and &lt;em&gt;Acanthamoeba&lt;/em&gt; was observed at pH 7. There was no significant relationship between FLA and &lt;em&gt;Acanthamoeba spp&lt;/em&gt;. with pH and temperature.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&amp;nbsp;Conclusions: &lt;/strong&gt;The rate of FLA and &lt;em&gt;Acanthamoeba&lt;/em&gt; in stagnant water were high in Kashan. The dominant &lt;em&gt;Acanthamoeba&lt;/em&gt; genotype (T4) is pathogen. Due to serious amoeba-induced complications, hygienic education is recommended to increase the public awareness on transmission and health/preventive measurements.&lt;/span&gt;&lt;/div&gt;
</abstract>
	<keyword_fa>آب‌های راکد, آمیب آزادزی, آکانتامبا, ژنوتایپ</keyword_fa>
	<keyword> Free-living amoeba, Acanthamoeba, Stagnant water, Genotype. </keyword>
	<start_page>125</start_page>
	<end_page>132</end_page>
	<web_url>http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-86-1&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Mohammad Hossein</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Golestani</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمدحسین</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>گلستانی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>It93.mohammadgolestani@yahoo.com</email>
	<code>100319475328460012594</code>
	<orcid>100319475328460012594</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Parasitology and Mycology, Faculty of Medicine, Kashan University of Medical Sciences, Kashan, Iran </affiliation>
	<affiliation_fa>گروه انگل شناسی و قارچ شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی کاشان، کاشان، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Sima</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Rasti</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سیما</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>راستی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>Rasti_s@yahoo.com</email>
	<code>100319475328460012595</code>
	<orcid>100319475328460012595</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Parasitology and Mycology, Faculty of Medicine, Kashan University of Medical Sciences, Kashan, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه انگل شناسی و قارچ شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی کاشان، کاشان، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Hossein</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Hooshyar</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>حسین</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>هوشیار</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>hooshyar4@yahoo.com</email>
	<code>100319475328460012596</code>
	<orcid>100319475328460012596</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Parasitology and Mycology, Faculty of Medicine, Kashan University of Medical Sciences, Kashan, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه انگل شناسی و قارچ شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی کاشان، کاشان، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mahdi</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Delavari</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مهدی</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>دلاوری</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>mdelavari1@gmail.com</email>
	<code>100319475328460012597</code>
	<orcid>100319475328460012597</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Parasitology and Mycology, Faculty of Medicine, Kashan University of Medical Sciences, Kashan, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه انگل شناسی و قارچ شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی کاشان، کاشان، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Gholam Abbas</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Mousavi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>غلام عباس</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>موسوی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>g.a.moosavi@gmail.com</email>
	<code>100319475328460012598</code>
	<orcid>100319475328460012598</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Statistics and Public Health, Faculty of Health, Kashan University of Medical Sciences, Kashan, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه آمار و بهداشت، دانشکده بهداشت، دانشگاه علوم پزشکی کاشان، کاشان، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Leila</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Iranshahi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>لیلا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>ایرانشاهی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>leilairanshahi@Kaums.ac.ir</email>
	<code>100319475328460012599</code>
	<orcid>100319475328460012599</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Public Health, Faculty of Health, Kashan University of Medical Sciences, Kashan, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه بهداشت محیط، دانشکده بهداشت، دانشگاه علوم پزشکی کاشان، کاشان، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
