<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian Journal of Medical Microbiology</title>
<title_fa>مجله میکروب شناسی پزشکی ایران</title_fa>
<short_title>Iran J Med Microbiol</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://ijmm.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-8612</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2345-4342</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.30699/ijmm</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1399</year>
	<month>6</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2020</year>
	<month>9</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>14</volume>
<number>5</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>شناسایی ژن‌های بتالاکتاماز وسیع‌الطیف CTX-M-2، CTX-M-8 و ژن  CMY وابسته به Ampc در شیگلا سونئی جداسازی شده از نمونه‌های اسهال کودکان با روش Multiplex-PCR  و تعیین الگوی مقاومت آنتی‌بیوتیکی آن‌ها</title_fa>
	<title>Identification of Broad-Spectrum Beta-lactamase CTX-M-2, CTX-M-8, and Ampc-dependent CMY Genes in Shigella sonnei Isolated from Pediatric Diarrhea Specimens by Multiplex-PCR and Antibiotic Resistance Pattern Determination</title>
	<subject_fa>میکروب شناسی مولکولی</subject_fa>
	<subject>Molecular Microbiology</subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Original Research Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;div style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#2980b9;&quot;&gt;زمینه و اهداف: &lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;گونه&#8204;های شیگلا به&#8204;عنوان یکی از عوامل شایع دیسانتری باسیلی و گاهی مرگ&#8204;ومیر به&#8204;ویژه در کودکان و افراد دارای نقص ایمنی مطرح هستند. تنوع گونه&#8204;های ایجادکننده بیماری و بروز مقاومت دارویی، انتخاب آنتی&#8204;بیوتیک مناسب برای درمان شیگلوزیس را با مشکل مواجه می&#8204;سازد. یکی از عوامل مهم بروز مقاومت در ایزوله&#8204;های شیگلا حضور ژن&#8204;های کدکننده بتالاکتامازهای وسیع&#8204;الطیف می&#8204;باشد. لذا، هدف از این مطالعه تعیین فراوانی سویه&#8204;های &lt;em&gt;شیگلا سونئی&lt;/em&gt; تولیدکننده ژن&#8204;های بتالاکتامازهای&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;CTX-M-2 &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&amp;lrm;&lt;/span&gt;&amp;rlm; ، &amp;rlm;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;CTX-M-8&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&amp;lrm;&lt;/span&gt;، &amp;rlm;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;CMY&lt;/span&gt;&amp;rlm; با روش&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt; Multiplex PCR &lt;/span&gt;و بررسی ارتباط آن&#8204;ها باوجود مقاومت آنتی&#8204;بیوتیکی در سویه&#8204;های &lt;em&gt;شیگلا سونئی&lt;/em&gt; است&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;.&lt;/span&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#2980b9;&quot;&gt;مواد و روش کار:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;/strong&gt;در این مطالعه توصیفی-مقطعی که در یک بازه زمانی 6 ماهه از ابتدای خرداد لغایت انتهای آبان 1395 انجام گردید. تعداد 200 نمونه اسهالی از بیماران مشکوک به شیگلوزیس از بیمارستان مرکز طبی اطفال (تهران) جمع&#8204;آوری گردید. آزمون حساسیت آنتی&#8204;بیوتیکی با استفاده از روش انتشار از دیسک بر روی محیط مولر هینتون آگار و مطابق با دستورالعمل&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt; CLSI &lt;/span&gt;&amp;nbsp;انجام شد. پس از استخراج &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;DNA&lt;/span&gt;، حضور ژن&#8204;های&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;CTX-M-2&lt;/span&gt; ، &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;CTX-M-8&lt;/span&gt;، &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;CMY &lt;/span&gt;&amp;nbsp;وابسته به &amp;rlm;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Ampc&lt;/span&gt;&amp;rlm; با استفاده از پرایمرهای اختصاصی توسط&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt; Multiplex-PCR &lt;/span&gt;تعیین گردید&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;.&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#2980b9;&quot;&gt;یافته&#8204;ها:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt; از مجموع نمونه&#8204;های اخذشده، تعداد 60 (30%) سویه &lt;em&gt;شیگلا سونئی&lt;/em&gt; با استفاده از آزمون&#8204;های استاندارد میکروبیولوژیکی و بیوشیمیایی به&#8204;دست آمد. اکثر سویه&#8204;ها به اریترومایسین (26 سویه، %43/3) و سفپیم (24 سویه 40%) مقاوم بودند. نتایج آزمون مولکولی نشان داد که 40 (66/6%) و 33 (55%) از سویه&#8204;ها به ترتیب حامل ژن&#8204;های&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt; CTX-M-8 &lt;/span&gt;و&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&amp;nbsp; CMY &lt;/span&gt;بودند&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt; (&lt;em&gt;P&lt;/em&gt;&lt;0.05). &lt;/span&gt;همچنین ژن&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;CTX-M-2 &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&amp;lrm;&lt;/span&gt; در هیچ&#8204;یک از نمونه&#8204;ها شناسایی نگردید&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;.&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#2980b9;&quot;&gt;نتیجه&#8204;گیری:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#2980b9;&quot;&gt; &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;نتایج بیانگر فراوانی بالای ژن&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt; CMY &lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;در میان ایزوله&#8204;های &lt;em&gt;شیگلا سونئی&lt;/em&gt; و&amp;nbsp; مقاومت بیشتر این سویه&#8204;ها نسبت به اریترومایسین و سفپیم است. به همین جهت مراقبت&#8204;های دقیق پزشکی و استفاده صحیح و به&#8204;موقع از آنتی&#8204;بیوتیک&#8204;های مناسب جهت جلوگیری از شیوع ایزوله&#8204;های مقاوم امری اجتناب&#8204;ناپذیر به نظر می&#8204;رسد&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/div&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;div style=&quot;direction: ltr; text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background:#1F497D;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:white;&quot;&gt;Background:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;/strong&gt;&amp;nbsp;&lt;em&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;Shigella&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;color: black;&quot;&gt; species are one of the most common causes of bacillary dysentery and sometimes death especially in children and immune-compromised individuals. The diversity of disease-causing species and the emergence of drug resistance make it difficult to select the appropriate antibiotic to treat shigellosis. One of the important causes of resistance in &lt;em&gt;Shigella&lt;/em&gt; isolates is the presence of genes encoding broad-spectrum beta-lactamase enzymes. The aim of this study was to determine the frequency of &lt;em&gt;Shigella sonnei&lt;/em&gt; strains producing &lt;em&gt;CTX-M-2&lt;/em&gt;, &lt;em&gt;CTX-M-8&lt;/em&gt;, and &lt;em&gt;CMY&lt;/em&gt; beta-lactamase genes by Multiplex PCR and to investigate their association with antibiotic resistance in &lt;em&gt;Shigella sonnei&lt;/em&gt; strains.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/div&gt;

&lt;div style=&quot;direction: ltr; text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&amp;nbsp;&lt;span style=&quot;letter-spacing:-.1pt;background:#1F497D;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:white;&quot;&gt;Materials &amp; Methods:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp; &lt;/strong&gt;&amp;nbsp;&lt;span style=&quot;letter-spacing: -0.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;This descriptive cross-sectional study was conducted in a period of 6 months from the beginning of June to the end of October 2016. A total of 200 diarrhea specimens were collected from the patients with suspected shigellosis from the Children&amp;#39;s Medical Center (Tehran). The antibiotic susceptibility testing was performed using disk diffusion method on M&amp;uuml;ller-Hinton agar in accordance with CLSI instructions. After DNA extraction, the presence of &lt;em&gt;CTX-M-2&lt;/em&gt;, &lt;em&gt;CTX-M-8&lt;/em&gt;, and Ampc-dependent &lt;em&gt;CMY&lt;/em&gt; genes was determined by Multiplex-PCR using specific primers.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/div&gt;
&lt;div style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;/div&gt;

&lt;div style=&quot;direction: ltr; text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background:#1F497D;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:white;&quot;&gt;Results:&amp;nbsp; &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;&lt;span style=&quot;color: black;&quot;&gt;From all the samples, 60 (30%) &lt;em&gt;Shigella sonnei&lt;/em&gt; strains were obtained using standard microbiological and biochemical tests. Majority of the strains were resistant to erythromycin (26 strains, 43.3%) and cefepime (24 strains, 40%). The molecular test results showed that 40 (66.6%) and 33 (55%) of the strains carried the &lt;em&gt;CTX-M-8&lt;/em&gt; and &lt;em&gt;CMY&lt;/em&gt; genes, respectively (&lt;em&gt;P&lt;/em&gt;&lt;0.05). The &lt;em&gt;CTX-M-2&lt;/em&gt; gene was not detected in any of the samples.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/div&gt;
&lt;div style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;/div&gt;

&lt;div style=&quot;direction: ltr; text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background:#1F497D;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:white;&quot;&gt;Conclusion: &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;&lt;span style=&quot;color: black;&quot;&gt;&amp;nbsp;The results indicate a high frequency of &lt;em&gt;CMY&lt;/em&gt; gene among &lt;em&gt;Shigella sonnei&lt;/em&gt; isolates and higher resistance of these strains was found against erythromycin and cefepime. Therefore, careful medical care and proper and timely use of appropriate antibiotics to prevent the spread of resistant isolates seems inevitable.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/div&gt;</abstract>
	<keyword_fa>شیگلا سونئی, بتالاکتاماز وسیع‌الطیف, دیسک دیفیوژن, Multiplex-PCR</keyword_fa>
	<keyword>Broad-spectrum beta-lactamase, Disk diffusion, Multiplex-PCR, Shigella sonnei</keyword>
	<start_page>501</start_page>
	<end_page>511</end_page>
	<web_url>http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-969-1&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Kumarss</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Amini</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>کیومرث</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>امینی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>dr_kumarss_amini@yahoo.com</email>
	<code>100319475328460015694</code>
	<orcid>100319475328460015694</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, Saveh Branch, Islamic Azad University, Saveh, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم پایه، واحد ساوه، دانشگاه آزاد اسلامی، ساوه، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mona</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Konkori</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مونا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>کنکوری</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>k1985mona@gmail.com</email>
	<code>100319475328460015695</code>
	<orcid>100319475328460015695</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, Saveh Branch, Islamic Azad University, Saveh, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم پایه، واحد ساوه، دانشگاه آزاد اسلامی، ساوه، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
