Iranian Journal of Medical Microbiology
مجله میکروب شناسی پزشکی ایران
Iran J Med Microbiol
Medical Sciences
http://ijmm.ir
1
admin
1735-8612
2345-4342
8
10.30699/ijmm
14
8888
13
en
jalali
1386
3
1
gregorian
2007
6
1
1
1
online
1
fulltext
fa
شناسایی موتاسیونهای ژن rpoB در سویه های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس مقاوم به ریفامپین جدا شده از بیماران ایرانی
Characterization of rpoB mutations in rifampin-resistant isolates of Mycobacterium tuberculosis cultured from the Iranian patients
اپیدمیولوژی مولکولی
Molecular Epidemiology
مقاله پژوهشی
Original Research Article
<div align="right" style="direction: rtl"><span lang="FA" style="font-size: 10pt font-family: 'Tahoma','sans-serif'"><b>زمینه و اهداف:</b> در این تحقیق، فراوانی موتاسیون ها در ناحیه پر موتاسیون بسیار متغیر ژن </span><span style="font-size: 10pt font-family: 'Tahoma','sans-serif'" dir="ltr">rpoB</span><span dir="rtl"></span><span lang="FA" style="font-size: 10pt font-family: 'Tahoma','sans-serif'"><span dir="rtl"></span>
سویه های <i>مایکوباکتریوم توبرکلوزیس</i> مورد بررسی قرار گرفت. این سویه ها
مقاوم یا حساس به ریفامپین بوده و از بیماران مبتلا به سل مراجعه کننده به
مرکز رفرانس سل کشوری و مرکز رفرانس سل اهواز، جدا شده بودند. هدف از این
تحقیق بررسی چگونگی تاثیر غربالگری مولکولی این ناحیه از ژن </span><span style="font-size: 10pt font-family: 'Tahoma','sans-serif'" dir="ltr">rpoB</span><span dir="rtl"></span><span lang="FA" style="font-size: 10pt font-family: 'Tahoma','sans-serif'"><span dir="rtl"></span> در نمونه های بیماران مبتلا به سل در تشخیص سریع موارد <i>مایکوباکتریوم توبرکلوزیس</i> مقاوم به ریفامپین بود.</span><br><span lang="FA" style="font-size: 10pt font-family: 'Tahoma','sans-serif'"><b>روش
بررسی:</b> تعداد 25 نمونه<i> مایکوباکتریوم توبرکلوزیس</i> مقاوم به ریفامپین و 5 <i>
مایکوباکتریوم توبرکلوزیس</i> حساب به ریفامچین جدا شده از بیماران بصورت
تصادفی برای انجام این تحقیق انتخاب شد. ناحیه </span><span style="font-size: 10pt font-family: 'Tahoma','sans-serif'" dir="ltr">RRDR</span><span dir="rtl"></span><span lang="FA" style="font-size: 10pt font-family: 'Tahoma','sans-serif'"><span dir="rtl"></span> کلیه نمونه های انتخاب شده پس از تکثیر به وسیله </span><span style="font-size: 10pt font-family: 'Tahoma','sans-serif'" dir="ltr">PCR</span><span dir="rtl"></span><span lang="FA" style="font-size: 10pt font-family: 'Tahoma','sans-serif'"><span dir="rtl"></span>، کاملا سکانس شد تا انواع و فراوانی موتاسیونهای مرتبط با مقاومت به ریفامپین در این ناحیه بررسی شود.</span><br><span lang="FA" style="font-size: 10pt font-family: 'Tahoma','sans-serif'"><b>یافته ها:</b> بر اساس نتایج حاصله، </span><span dir="ltr"></span><span style="font-size: 10pt font-family: 'Tahoma','sans-serif'" dir="ltr"><span dir="ltr"></span>%96</span><span dir="rtl"></span><span lang="FA" style="font-size: 10pt font-family: 'Tahoma','sans-serif'"><span dir="rtl"></span> از سویه های مقاوم به ریفامپین، تغییرات ژنتیکی در ناحیه </span><span style="font-size: 10pt font-family: 'Tahoma','sans-serif'" dir="ltr">RRDR</span><span dir="rtl"></span><span lang="FA" style="font-size: 10pt font-family: 'Tahoma','sans-serif'"><span dir="rtl"></span> را نشان دادند و 72 درصد از سویه های <i>مایکوباکتریوم توبرکلوزیس</i> مقاوم به ریفامپین دارای موتاسیونهای </span><span style="font-size: 10pt font-family: 'Tahoma','sans-serif'" dir="ltr">missense</span><span dir="rtl"></span><span lang="FA" style="font-size: 10pt font-family: 'Tahoma','sans-serif'"><span dir="rtl"></span> بودند که منجر به عوض شدن اسید آمینه در کدون </span><span dir="ltr"></span><span style="font-size: 10pt font-family: 'Tahoma','sans-serif'" dir="ltr"><span dir="ltr"></span>(%60) 531</span><span dir="rtl"></span><span lang="FA" style="font-size: 10pt font-family: 'Tahoma','sans-serif'"><span dir="rtl"></span>، کدون 526 </span><span dir="ltr"></span><span style="font-size: 10pt font-family: 'Tahoma','sans-serif'" dir="ltr"><span dir="ltr"></span>(%16)</span><span dir="rtl"></span><span lang="FA" style="font-size: 10pt font-family: 'Tahoma','sans-serif'"><span dir="rtl"></span> و کدون 516 </span><span dir="ltr"></span><span style="font-size: 10pt font-family: 'Tahoma','sans-serif'" dir="ltr"><span dir="ltr"></span>(%8)</span><span dir="rtl"></span><span lang="FA" style="font-size: 10pt font-family: 'Tahoma','sans-serif'"><span dir="rtl"></span> در ناحیه مرکزی ژن </span><span style="font-size: 10pt font-family: 'Tahoma','sans-serif'" dir="ltr">rpoB</span><span dir="rtl"></span><span lang="FA" style="font-size: 10pt font-family: 'Tahoma','sans-serif'"><span dir="rtl"></span>
گردیده بود. در حالیکه در تحقیق ما مانند سایر نقاط دنیا کدون 531 دارای
بیشترین تغییر بود ولی فراوانی موتاسیون در دو کدون شایع دیگر یعنی 526 و
516 متفاوت از فراوانی موتاسیون گزارش شده از سایر نقاط دنیا بود. این
تفاوتها ممکن است ناشی از تغییرات ژنی جغرافیایی در نژ ادهای <i>مایکوباکتریوم
توبرکلوزیس</i> مقاوم به ریفامپین و انتقال این نژادها در بیماران در کشورهای
مختلف باشد.</span><span style="font-size: 10pt font-family: 'Tahoma','sans-serif'" dir="ltr"></span><br><span style="font-size: 10pt font-family: 'Tahoma','sans-serif'" dir="ltr"></span><b><span lang="FA" style="font-size: 10pt font-family: 'Tahoma','sans-serif'">نتیجه گیری:</span><span dir="ltr"></span></b><span lang="FA" style="font-size: 10pt font-family: 'Tahoma','sans-serif'" dir="ltr"><b><span dir="ltr"></span></b> </span><span lang="FA" style="font-size: 10pt font-family: 'Tahoma','sans-serif'">میزان بالای موتاسیون در ناحیه </span><span style="font-size: 10pt font-family: 'Tahoma','sans-serif'" dir="ltr">RRDR</span><span dir="rtl"></span><span lang="FA" style="font-size: 10pt font-family: 'Tahoma','sans-serif'"><span dir="rtl"></span>
نمونه های<i> مایکوباکتریوم توبرکلوزیس</i> مقاوم به ریفامپین جدا شده از
بیماران، تایید کننده این مطلب است که غربالگری لین ناحیه ژنی برای تعیین
مقاومت به ریفامپین در نمونه های کلینیکی <i>مایکوباکتریوم توبرکلوزیس</i> جدا شده
از ایران مناسب است.</span></div>
<b>Background and objectives:</b> In this project we investigated the frequency of mutations within the rifampin
resistance-determining region (RRDR) of rpoB gene to determine whether this region is useful for molecular
detection of rifampin resistant isolates of <i>Mycobacterium tuberculosis</i> from Iranian patients.
<br><b>Material and Methods:</b> A set of 25 rifampin resistant and 5 randomly chosen fully susceptible <i>M.
tuberculosis</i> complex strains obtained from sputum samples of individual patients were investigated. The <i>M.
tuberculosis</i> H37RvT and CDC 1551 standard strains were used as controls. Using the specific primers, the
entire RRDR of rpoB gene of selected samples was amplified and sequenced directly.
<br><b>Results:</b> Genetic alterations in the RRDR were present among 96.0% of isolates. The majority of rifampin
resistant isolates (72.0 %) showed missense mutations in the core region of rpoB that led to substitutions of
amino acids at Ser-531 (60.0 %), His-526 (16.0 %) orAsp-516 (8.0 %). While the codon 531 has been the
most common site of nucleotide substitutions worldwide, the frequencies of mutations at the codons 526 and
516 among the Iranian isolates were different from other geographical regions. Mutation at codon 533 was
found at higher frequency (8%) comparing to the report from other countries.
'<br><b>Conclusion:</b>The high rate of mutations within the RRDR of the rpoB gene suggests that targeted screening
of the RRDR may be feasible for the determination of rifampin resistance in clinical isolates of
<i>Mycobacterium tuberculosis</i> from Iran.
مایکوباکتریوم توبرکلوزیس، ریفامپین، مقاومت دارویی، موتاسیون
Mycobacterium tuberculosis, rifampin resistance, mutation
17
22
http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-1-45&slc_lang=fa&sid=1
Farahnoush
Doustdar
فرحنوش
دوستدار
f_doustdar@yahoo.com
1003194753284600226
1003194753284600226
Yes
Dept. of Microbiology, School of Medicine, Ahwaz Jundishapour University of Medical Sciences, Ahwaz, Iran
گروه مییکروب شناسی،دانشکده پزشکی،دانشگاه علوم پزشکی جندی شاپور اهواز
Azardokht
Khosravi
آذردختآذردخت
خسروی
1003194753284600227
1003194753284600227
No
Dept. of Microbiology, School of Medicine, Ahwaz Jundishapour University of Medical Sciences, Ahwaz, Iran
گروه مییکروب شناسی،دانشکده پزشکی،دانشگاه علوم پزشکی جندی شاپور اهواز
Parisa
Farnia
پریسا
فرنیا
1003194753284600228
1003194753284600228
No
Iranian National Reference TB laboratory, National Research Institute of Tuberculosis and Lung Disease (NRITLD), WHO Collaborating Centre of Tuberculosis, Tehran, Iran
مرکز رفرانس سل کشوری،بیمارستان مسیح دانشوری تهران
AhmadReza
Bahremand
احمد رضا
بهره مند
1003194753284600229
1003194753284600229
No
Dept. of Mycobacteriology, Iran Pasteur institute.
انستیتو پاستور تهران