<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian Journal of Medical Microbiology</title>
<title_fa>مجله میکروب شناسی پزشکی ایران</title_fa>
<short_title>Iran J Med Microbiol</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://ijmm.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-8612</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2345-4342</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.30699/ijmm</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1389</year>
	<month>6</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2010</year>
	<month>9</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>4</volume>
<number>1</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>مطالعه فیلوژنتیکی ویروس انفلوآنزا A، ساب تایپ H5N1 ، در همسایگان ایران طی سال های 2006-2003</title_fa>
	<title>Phylogenetic Study of Influenza A Virus Subtype H5N1 in Iran and neighboring countries during 2003 and 2006</title>
	<subject_fa>ویروس شناسی پزشکی</subject_fa>
	<subject>Medical Virology</subject>
	<content_type_fa>مقاله کوتاه پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Brief Original Article</content_type>
	<abstract_fa>زمینه و اهداف: ساب تایپ H5N1 ویروس انفلوآنزا، که با قدرت کشندگی بالا می باشد، در سال‌های اخیر باعث تلفات زیادی در منطقه آسیا و به‌ویژه در کشورهای آسیای شرقی و خاور میانه شده‌است. هدف این مطالعه تعیین فیلوژنتیک ویروس انفلوآنزا A، ساب تایپ H5N1 ، در همسایگان ایران طی سال‌‌های 2006-2003 بود. 
روش بررسی: از الگوریتم‌های بیوانفورماتیکی همترازی سکانس‌ها استفاده شد. سکانس‌های ژنی و پروتئینی ژن هماگلوتینین ساب تایپ H5N1 ویروس انفلوآنزا که در بانک‌های ژنی و پروتئینی  کشور‌های همسایه ایران گزارش شده بود، استخراج شد و مورد بررسی و تجزیه و تحلیل قرار گرفت.    
یافته ها: بین سال‌های 2006-2003، از بروز عفونت انفلوآنزا ساب تایپ H5N1  در کشورهای همسایه ایران 237 گزارش به بانک ژنوم (GenBank) گزارش شده بود. پس از بررسی 64 مورد سکانس غیر تکراری استخراج شد. در نهایت 64 سکانس ژن و پروتئین هماگلوتینین با استفاده از الگوریتم بیوانفورماتیکی Clustal و نرم افزارهای  clustalW و MEGA4  سکانس ژنومی و اسیدآمینه بررسی و تجزیه و تحلیل شد.  سرانجام درخت فیلوژنتیکی این ویروس‌ها تعیین گردید. تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی ژن هماگلوتینین نشان داد که این ویروس از مرز‌های شمالی کشور به‌ویژه روسیه و کشور‌های تازه استقلال یافته آسیای میانه وارد ایران شده است. سپس از منطقه شمالی در داخل کشور گسترش یافته است. 
نتیجه گیری: ویروس انفلوانزای نوع H1N1 از طریق کشورهای همسایه شمالی وارد کشور ایران شده‌است.
</abstract_fa>
	<abstract>Background and Objectives: Influenza viruses, especially the subtype H1N1, arecontinuously 
evolving  viruses,  which  have  caused  significant  morbidity  and  mortality  in  Eastern  Asian 
countries as well as in the Middle East. The aim ofthis study was to analyze genetic variations 
in  hemaglutinin  (HA)  gene  of  the  H1N1  viruses  circulating  in  the  countries  neighboring  Iran 
during 2003 till 2006
Material  and  methods:  In  this  study  we  used  multiple  sequence  alignment  software  for
analysis of sequences. Genetic analyses were performed on 64 hemagglutinin gene in influenza 
A(H5N1) viruses derived from GeneBank reported in Iran and neighboring countries between 
2003 and 2006.
Results:  HA phylogenetic analysis of these viruses showed multiple clades circulated around 
the  world  with  regional  prevalence  patterns.  Our  analysis  seems  to  indicate  that  the  H1N1 
viruses  have  initially  entered  Iranian  borders  from its  northern  bordering  countries,  such  as 
Russia and the other CIS countries. They have subsequently spread inward towards the interior 
of mainland Iran. 
Conclusion:This study suggested that influenza A (H5N1) viruses might have migrated from 
neighboring countries of Iran to this country.</abstract>
	<keyword_fa>فیلوژنتیک، انفلوآنزا A ، H5N1، ایران</keyword_fa>
	<keyword>Phylogenetic, influenza A, H5N1, Iran</keyword>
	<start_page>100</start_page>
	<end_page>103</end_page>
	<web_url>http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-1-42&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Ali</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Najafi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>علی</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>نجفی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>1003194753284600212</code>
	<orcid>1003194753284600212</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Molecular Biology Research Center, Baqiyatallah University of Medical Sciences, Tehran , Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات بیولوژی مولکولی، دانشگاه علوم پزشکی بقیه الله(عج).</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>HamidReza</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Tavakoli</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>حمید رضا </first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>توکلی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>h.tavakoli1344@yahoo.com</email>
	<code>1003194753284600213</code>
	<orcid>1003194753284600213</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Nutrition, Health Research Center, Baqiyatallah University of Medical Sciences,Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه تغذیه ، مرکز تحقیقات بهداشتی، دانشگاه علوم پزشکی بقیه الله(عج)</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Ali</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Mehrabi Tavana</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa> علی </first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>مهرابی توانا </last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>1003194753284600214</code>
	<orcid>1003194753284600214</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Health Research Center , Baqiyatallah University of Medical Sciences, Tehran , Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات بهداشت و مدیریت سلامت ، دانشگاه علوم پزشکی بقیه الله (عج)</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mahdi</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Qorbanalizadgan</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مهدی</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>قربانعلی زادگان </last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>1003194753284600215</code>
	<orcid>1003194753284600215</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Molecular Biology Research Center, Baqiyatallah University of Medical Sciences, Tehran , Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات بیولوژی مولکولی، دانشگاه علوم پزشکی بقیه الله(عج).</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Reza</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Ranjbar</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>رضا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>رنجبر</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>1003194753284600216</code>
	<orcid>1003194753284600216</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Molecular Biology Research Center, Baqiyatallah University of Medical Sciences, Tehran , Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات بیولوژی مولکولی، دانشگاه علوم پزشکی بقیه الله(عج).</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
