<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian Journal of Medical Microbiology</title>
<title_fa>مجله میکروب شناسی پزشکی ایران</title_fa>
<short_title>Iran J Med Microbiol</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://ijmm.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-8612</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2345-4342</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.30699/ijmm</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1389</year>
	<month>6</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2010</year>
	<month>9</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>4</volume>
<number>1</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>شناسایی گونه‌های کاندیدا جدا شده از نمونه خون بیماران مبتلا به کاندیدمی به روش Seminested PCR</title_fa>
	<title>Identification of CandidaSpecies by Seminested PCR in Candidemia </title>
	<subject_fa>قارچ شناسی پزشکی</subject_fa>
	<subject>Medical Mycology</subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Original Research Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;div align=&quot;right&quot; style=&quot;direction: rtl&quot;&gt;
&lt;b&gt;زمینه و هدف:&lt;/b&gt; شاهد شیوع عفونت‌های قارچی از جمله کاندیدا و شیوع بیشتر بیماری ایدز، بدخیمی ها و افزایش اختلالات سیستم ایمنی هستیم. این امر زمینه را برای افزایش شیوع کاندیدیازیس سیستمیک و سپتی سمی کاندیدایی خصوصا با گونه‌های غیر آلبیکنس کاندیدا فراهم کرده است. هدف از این مطالعه تعیین هویت گونه‌های کاندیدا جدا شده از  نمونه های کشت خون با استفاده از روش Seminested PCR بود.
&lt;br&gt;&lt;b&gt;روش بررسی:&lt;/b&gt; 2516 نمونه‌ کشت خون در بیمارستان بقیه ا... در سال 1388 از نظر رشد عوامل مخمری بررسی شد. نمونه‌های مثبت از جهت حضور کاندیدا  با آزمون های فنوتیپی (مورفولوژی، بررسی رنگ کلنی روی محیط کروم آگار کاندیدا، آزمون لوله زایا و تولید کلامیدوسپور)و ژنوتیپی (Seminested PCR)، بررسی شد. DNAی همه نمونه‌ها به‌طور مستقیم ازکشت خون و با استفاده از کیت DNG-plus استخراج شد. برای PCR مرحله اول از پرایمرهای CTSF و CTSR  که قطعه ITS2) Internal Transcribed Spacer2) را تکثیر می کند استفاده شد. محصول مرحله اول به عنوان DNAی الگو برای انجام PCR مرحله دوم با استفاده از پرایمر عقبی مرحله اول(CTSR) و در حضور پرایمرهای اختصاصی گونه به نام های CADET ، CPDET ،CTDET ،CGDET و CDDET استفاده شد.  پرایمرهای اختصاصی به ترتیب برای شناسایی گونه‌های کاندیدا آلبیکنس، کاندیدا پاراپسیلوزیس، کاندیدا تروپیکالیس، کاندیدا گلابراتا و کاندیدا دابلینینسیس بود. گونه مخمر با توجه به الگوی باندهای ایجاد شده روی ژل و اندازه آن تشخیص داده شد.
&lt;br&gt;&lt;b&gt;یافته ها:&lt;/b&gt; از١٤ (0.5%) نمونه کشت خون 16 ایزوله کاندیدا جدا و شناسایی شد. از این تعداد، ٦ ایزوله کاندیدا آلبیکنس، ٤ ایزوله کاندیدا پاراپسیلوزیس، ٤ ایزوله کاندیدا گلابراتا، ٢ ایزوله کاندیدا تروپیکالیس بود. در دو نمونه خون، به‌طور همزمان دو گونه کاندیدا مشاهده و تعیین هویت شد(عفونت مخلوط). کاندیدا دابلینینسیس از هیچ نمونه‌ای جدا نشد.
&lt;br&gt;&lt;b&gt;نتیجه گیری: &lt;/b&gt;با استفاده از روش مولکولی Seminested PCR ، امکان تشخیص سریع گونه های پاتوژن کاندیدا از نمونه‌های خون با حساسیت و ویژگی بالا، فراهم شد.

&lt;/div&gt;</abstract_fa>
	<abstract>
&lt;b&gt;Background  and  Objective:&lt;/b&gt;  In  recent  decades,  the  incidence  of  fungal  infections  has 
increased. Invasive  Candida nfection is an increasing cause of morbidity and  mortality in the 
immunocompromised  patients,  for  example,  neuropenic patient  with  hematological 
malignancies,  recipients  of  allogeneic  transplants  and  HIV-infected  individuals.  There  is  an 
increasing  incidence  of  bloodstream  infections  caused  by  Candida  species.  In  this  study,  we 
applied  Seminested  PCR  for  detection  and  identification  of  Candida species  in  blood 
specimens. &lt;br&gt;
&lt;b&gt;Materials and Method:&lt;/b&gt; A total of 2516 blood culture samples in Baghiyetollah hospital were 
investigated for the presence of yeast cells duringthe year 2009. Fourteen blood samples which 
were found to be infected with Candidaspecies, as proved by culture, were analysed. All yeasts 
cells were identified by germ tube test, chlamydospor production on cornmeal agar and using 
CHROMagar Candida medium. DNA was extracted by DNG-plus kit from whole blood. The 
universal  outer  primers  (CTSF  &amp;  CTSR)  amplified  the Internal  Transcribed  Spacer2  (ITS2). 
The  species-specific  primers  (CADET,  CPDET,  CTDET,  CGDET  and  CDDET), 
complementary  to  unique  sequences  within  the  ITS2  of  each  test  species,  amplified  speciesspecific  DNA  in  the  reamplification  step  of  snPCR.   PCR  products  were  identified  by 
electrophoresis.&lt;br&gt;&lt;b&gt;Results:&lt;/b&gt; Among the 14 (0.5%) blood samples, 16 Candidaspecies were detected and identified 
by using snPCR. Using snPCR for Candidaspecies identification indicated that 6 isolates were 
C.  albicans,  4  isolates  of  C.  parapsilosis,  4  isolates  of  C.  glabrata,  and  2  isolates  of  C. 
tropicalis. Two of the patients had dual infection with  C. tropicalisand either C. albicansor C. 
glabrata. C. dubliniensiswasn’t detected in blood samples. &lt;br&gt;
&lt;b&gt;Conclusion:&lt;/b&gt;  The  Seminested  PCR  that  was  applied  and  evaluated  in  this  study  is  a  rapid, 
specific  and  sensitive  method  for  the  diagnosis  of  candidemia  or  hematogenous  candidiasis 
caused by common pathogenic Candidaspecies.
</abstract>
	<keyword_fa>کاندیدا آلبیکنس، کاندیداهای غیر آلبیکنس، کشت خون، Seminested PCR ، ITS2 </keyword_fa>
	<keyword></keyword>
	<start_page>91</start_page>
	<end_page>99</end_page>
	<web_url>http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-1-41&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Mohhamad Hossein</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Shahhosseiny </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمد حسن </first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>شاه حسینی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>Shahhosseiny@yahoo.com</email>
	<code>1003194753284600207</code>
	<orcid>1003194753284600207</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology , Islamic Azad University,Shahr-e- Qods Branch, Tehran, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکرب شناسی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد شهر قدس </affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mohhamad</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Nematian Soteh</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمد</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>نعمتیان سوته</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>1003194753284600208</code>
	<orcid>1003194753284600208</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Biology, Islamic Azad University, Science and Research branch , Tehran, Ira</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه زیست‌شناسی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد علوم و تحقیقات تهران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mohhamad</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Ghahri</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa> محمد </first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>قهری</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>1003194753284600209</code>
	<orcid>1003194753284600209</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Biology , Imam Hossein University ,Tehran, Iran </affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکرب شناسی، دانشگاه امام حسین(ع) </affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Sara</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Saadatmand</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سارا </first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>سعادتمند</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>1003194753284600210</code>
	<orcid>1003194753284600210</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Biology, Islamic Azad University, Science and Research branch , Tehran, Ira</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه زیست‌شناسی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد علوم و تحقیقات تهران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Seyed Ahmad</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Hosseiny</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سید احمد </first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>حسینی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>1003194753284600211</code>
	<orcid>1003194753284600211</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation> Resalat medical laboratory, Tehran, Iran </affiliation>
	<affiliation_fa>آزمایشگاه رسالت، تهران </affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
