<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian Journal of Medical Microbiology</title>
<title_fa>مجله میکروب شناسی پزشکی ایران</title_fa>
<short_title>Iran J Med Microbiol</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://ijmm.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-8612</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2345-4342</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.30699/ijmm</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1396</year>
	<month>5</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2017</year>
	<month>8</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>11</volume>
<number>3</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>مقایسه روش‌های صفحه کشت بافت، کنگورد آگار و لوله برای سنجش بیوفیلم اشریشیا کلی یوروپاتوژن
</title_fa>
	<title>Comparison of Tissue Culture Plate, Congo red Agar and Tube Methods for Evaluation of Biofilm Formation among Uropathogenic E. coli Isolates</title>
	<subject_fa>باکتری شناسی پزشکی </subject_fa>
	<subject>Medical Bacteriology</subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Original Research Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;p dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:tahoma;&quot;&gt;&lt;strong&gt;زمینه و اهداف:&lt;/strong&gt; میکروارگانیسم&#8204;های موجود در بیوفیلم باکتریایی که در دستگاه&#8204;های پزشکی قرار داده&#8204;شده در بافت&#8204;های بدن یافت می&#8204;شوند، به ترکیبات ضد میکروبی مقاوم هستند و نقش عمده&#8204;ای در ایجاد عفونت&#8204;های بیمارستانی به&#8204;ویژه عفونت مجاری ادراری دارند. &lt;em&gt;اشریشیا کلی یوروپاتوژن&lt;/em&gt; شایع&#8204;ترین عامل عفونت&#8204;های ادراری بیمارستانی است و قادر به تشکیل بیوفیلم در سلول&#8204;های اپی تلیوم مثانه بوده و این امر نقش مهمی در بیماری&#8204;زایی آن بازی می&#8204;کند. شناسایی جدایه های تولیدکننده بیوفیلم &lt;em&gt;اشریشیا کلی یوروپاتوژن&lt;/em&gt; با استفاده از روش&#8204;های آزمایشگاهی برای درک بهتر نقش این باکتری در عفونت ادراری مهم است.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;مواد و روش کار: &lt;/strong&gt;100 جدایه &lt;em&gt;اشریشیا کلی یوروپاتوژن&lt;/em&gt; از بیماران مبتلا به عفونت مجاری ادراری مراجعه کننده به بیمارستان میلاد تهران در سال 1394 جمع&#8204;آوری شد. تشخیص جدایه ها توسط تست&#8204;های بیوشیمیایی و توانایی تشکیل بیوفیلم به &#8204;وسیله روش&#8204;های صفحه کشت بافت، کنگورد آگار و لوله تعیین شد. حساسیت و ویژگی روش&#8204;ها ارزیابی شد.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;یافته&#8204;ها: &lt;/strong&gt;درروش لوله 23% و 59% جدایه ها دارای بیوفیلم قوی و بیوفیلم ضعیف بودند. در روش کشت بافت 40%، 22% و 28% جدایه ها به ترتیب بیوفیلم قوی، متوسط و ضعیف تشکیل دادند و 10% بیوفیلم منفی بودند. با روش کنگورد آگار تنها 4% سویه&#8204;ها بیوفیلم قوی داشتند، 65% و 31% به ترتیب بیوفیلم ضعیف و فاقد بیوفیلم بودند. حساسیت روش&#8204;های کنگورد آگار و لوله به ترتیب 39/1% و 50/9% و ویژگی آن&#8204;ها به ترتیب 78/3% و 79/7% به دست آمد.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;نتیجه&#8204;گیری&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; نتایج نشان داد روش کشت بافت برای تعیین تشکیل&amp;nbsp; بیوفیلم اشریشیا کلی یوروپاتوژن مهم است. کنگورد آگار و لوله روش های مناسبی برای این منظور نیستند.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&amp;nbsp;&lt;/p&gt;
</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p&gt;&lt;strong&gt;Background and Aims: &lt;/strong&gt;Microorganisms within biofilms,, formed on medical devices in the body are highly resistant to antimicrobial compounds and host responses and play a major role in nosocomial infections, especially urinary tract infections (UTIs). &lt;em&gt;Uropathogenic Escherichia coli&lt;/em&gt; (&lt;em&gt;UPEC&lt;/em&gt;) causes 50% of the hospital-acquired urinary tract infections and is capable to form biofilm in the bladder epithelium which plays an important role in its pathogenesisThe identification of biofilm producing &lt;em&gt;UPEC &lt;/em&gt;strains by routine laboratory methods is important for the better understanding of the pathogenesis of this bacterium in UTIs.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Materials and Methods: &lt;/strong&gt;A total of 100 &lt;em&gt;UPEC&lt;/em&gt; strains were collected from patients with UTIs in a hospital inTehran in 2016 and diagnosed by biochemical tests and the ability of biofilm formation was determined by Tissue Culture Plate (TCP), tube method (TM) and Congo red agar (CRA) methods. Sensitivity and specificity of methods were determined.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Results: &lt;/strong&gt;In tube method, 23% of the isolates formed strong and 59% formed weak biofilm&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;.&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; In Tissue Culture Plate method 40%, 22% and 28% of isolates formed strong, moderate and weak biofilm respectively and 10% were biofilm negative. According to the Congo red agar method only 4% of the isolates formed strong biofilm, 65% and 31% respectively had a weak biofilm and no biofilm. The sensitivity and specificity of Congo red agar and Tube methods were 39.1%, 50.9% and their features were 78.3%, 79.7% respectively.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Conclusions: &lt;/strong&gt;The results showed that Tissue Culture Plate method is important for the determination of&lt;em&gt; UPEC&lt;/em&gt; biofilm formation. Tube method and Congo red agar are not reliable methods for this purpose.&lt;br&gt;
&amp;nbsp;&lt;/p&gt;
</abstract>
	<keyword_fa>اشریشیا کلی یوروپاتوژن, تشکیل بیوفیلم, روش‌های فنوتیپی </keyword_fa>
	<keyword>Uropathogenic Escherichia coli, Biofilm formation, Phenotypic methods</keyword>
	<start_page>49</start_page>
	<end_page>58</end_page>
	<web_url>http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-823-1&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Nafiseh</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Nosrati</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>نفیسه</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>نصرتی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>nafise.n2014@gmail.com</email>
	<code>10031947532846009523</code>
	<orcid>10031947532846009523</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, Islamic Azad University, Varamin- Pishva Branch, Varamin, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد ورامین- پیشوا، ورامین، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Sahar</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Honarmand Jahromy</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سحر</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>هنرمند  جهرمی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>sahar_hj2@yahoo.com</email>
	<code>10031947532846009524</code>
	<orcid>10031947532846009524</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, Islamic Azad University, Varamin- Pishva Branch, Varamin, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد ورامین- پیشوا، ورامین، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Shohreh</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Zare Karizi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>شهره</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>زارع کاریزی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>shohrehzare@yahoo.com</email>
	<code>10031947532846009525</code>
	<orcid>10031947532846009525</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Genetic, Islamic Azad University, Varamin- Pishva Branch, Varamin, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه ژنتیک، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد ورامین- پیشوا، ورامین، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
