<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian Journal of Medical Microbiology</title>
<title_fa>مجله میکروب شناسی پزشکی ایران</title_fa>
<short_title>Iran J Med Microbiol</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://ijmm.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-8612</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2345-4342</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.30699/ijmm</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1396</year>
	<month>1</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2017</year>
	<month>4</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>11</volume>
<number>1</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>بررسی فراوانی ژن‌های exoY،exoS ، exoT و exoU از سودوموناس آئروژینوزا جداشده از بیماران بیمارستان‌های تهران با روش Multiplex-PCR</title_fa>
	<title>Frequency of exoY, exoS, exoT and exoU genes among Pseudomonas aeruginosa Isolated from patients in Tehran hospitals by Multiplex PCR</title>
	<subject_fa>میکروب شناسی مولکولی</subject_fa>
	<subject>Molecular Microbiology</subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Original Research Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;p dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;strong&gt;زمینه و اهداف:&lt;/strong&gt; &lt;em&gt;سودوموناس آئروژینوزا&lt;/em&gt; یک پاتوژن گرم منفی است که باعث انواع عفونت&#8204;های جدی عمدتاً در بیماران نقص ایمنی می&#8204;شود. جهت افزایش شدت بیماری&lt;em&gt;، سودوموناس&lt;/em&gt; از یک نوع سیستم ترشحی نوع سه برای تزریق پروتئین افکتور سمی به سیتوپلاسم سلول&#8204;های یوکاریوتی استفاده می&#8204;کند. چهار پروتئین افکتور در &lt;em&gt;سودوموناس&lt;/em&gt; شرح داده&#8204;شده است: &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;ExoU&lt;/span&gt;، &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;ExoS&lt;/span&gt;،&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;ExoT&lt;/span&gt; و &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;ExoY&lt;/span&gt;. هدف از این مطالعه بررسی شیوع ژن&#8204;های کد کننده توکسین سیستم ترشحی نوع سه میان جدایه&#8204;های &lt;em&gt;سودوموناس&lt;/em&gt; جمع&#8204;آوری&#8204;شده از نمونه&#8204;های بالینی مختلف مانند ادرار، زخم، خون و ترشحات تنفسی بیماران بود.&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;strong&gt;مواد و روش کار: &lt;/strong&gt;55 جدایه &lt;em&gt;سودوموناس آئروژینوزا&lt;/em&gt; از بیماران بستری در تهران در سال 1395-1394 با استفاده از آزمون میکروبیولوژی متداول مشخص شدند. حساسیت جدایه&#8204;ها به آنتی&#8204;بیوتیک&#8204;ها با استفاده از آزمون دیسک دیفیوژن بررسی شد. پس از استخراج &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;DNA&lt;/span&gt;، &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt; چندگانه در جدایه های &lt;em&gt;سودوموناس&lt;/em&gt; برای تشخیص ژن&#8204;های کد کننده توکسین ترشحی انجام شد.&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;strong&gt;یافته&#8204;ها: &lt;/strong&gt;میزان مقاومت بالا برای سفپیم (89%)، سفتازیدیم (85/45%)، آزترونام (83/63%)، توبرامایسین (78/18%) و جنتامایسین (60%) مشاهده شد. شیوع ژن&#8204;ها در میان تمام نمونه&#8204;های جداشده به شرح زیر بود؛ (76/32%)&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;exoT&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;، (30/90%)&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;exoS&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;، (14/54%) &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;exoY&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;و (67/27%)&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;exoU&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;. &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;exoU&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; در میان گونه&#8204;های &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;MDR&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; نسبت به بخش غیر &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;MDR&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; بالاتر (81/3% در مقابل 16/6%) بود. جدایه&#8204;های &lt;sup&gt;+&lt;/sup&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;exoU&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; مقاوم به فلوروکینولون نسبت به نمونه&#8204;های &lt;sup&gt;+&lt;/sup&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;exoS&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; مقاوم به فلوروکینولون (32% در مقابل 17%) بود.&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;نتیجه&#8204;گیری&lt;/span&gt;:&lt;/strong&gt; &lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;ژن&#8204;های کد کننده سیستم ترشحی نوع سه موجود در جدایه&#8204;های &lt;em&gt;سودوموناس&lt;/em&gt;، که در آن ژن&#8204;های &lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;em&gt;exoT&lt;/em&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;،&lt;/span&gt;&lt;em&gt;exoU&lt;/em&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt; و &lt;/span&gt;&lt;em&gt;exoS&lt;/em&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt; در اغلب جدایه&#8204;ها&lt;/span&gt; &lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;شناسایی شد درحالی&#8204;که ژن&lt;/span&gt; &lt;em&gt;exoY&lt;/em&gt; &lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;در تعداد کمی از سویه&#8204;ها تشخیص داده شد.&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p&gt;&lt;strong&gt;Background and Aim: &lt;/strong&gt;&lt;em&gt;Pseudomonas aeruginosa &lt;/em&gt;is a gram-negative pathogen that causes a variety of serious infections predominantly in immunocompromised patients. To promote severe illness, &lt;em&gt;P&lt;/em&gt;. &lt;em&gt;aeruginosa&lt;/em&gt; uses a type III secretion system to inject toxic effector proteins into the cytoplasm of eukaryotic cells. Four effector proteins have been described in &lt;em&gt;P&lt;/em&gt;. &lt;em&gt;aeruginosa&lt;/em&gt;: ExoU, ExoS, ExoT, and ExoY. The aim of the study was to determine the prevalence of the type III secretion system toxins-encoding genes among &lt;em&gt;P. aeruginosa &lt;/em&gt;isolates collected from different clinical specimens such as urine, wound, blood and respiratory secretions from patients.&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;&lt;strong&gt;Materials and Methods: &lt;/strong&gt;55 &lt;em&gt;Pseudomonas aeruginosa&lt;/em&gt; isolates were identified from hospitalized patients in Tehran during 2015 &amp;ndash; 2016, using conventional microbiological tests. The susceptibility of isolates to antibiotics were assessed using disk diffusion test. After DNA extraction, Multiplex PCR was performed on the &lt;em&gt;P. aeruginosa&lt;/em&gt; isolates to detect the secretion toxins-encoding genes.&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;&lt;strong&gt;Results: &lt;/strong&gt;High resistance rates were seen for cefipime (89%), ceftazidime (85.45%), aztreonam (83.63%), tobramycin (78.18%) and gentamicin (60%). The prevalence of the genes among all isolates was as follows; &lt;em&gt;exoT&lt;/em&gt; (76.32%), &lt;em&gt;exoS&lt;/em&gt; (30.90%), &lt;em&gt;exoY&lt;/em&gt; (14.54%) and &lt;em&gt;exoU&lt;/em&gt; (67.27%). &lt;em&gt;exoU&lt;/em&gt; was more prevalent among MDR than in non-MDR strains (81.3% versus16.6%). &lt;em&gt;exoU&lt;/em&gt;&lt;sup&gt;+&lt;/sup&gt; isolates were more likely to be fluoroquinolone-resistant than &lt;em&gt;exoS&lt;/em&gt;&lt;sup&gt;+&lt;/sup&gt; isolates (32% versus 17%).&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;&lt;strong&gt;Conclusions: &lt;/strong&gt;Type III secretion system toxins-encoding genes found in isolated &lt;em&gt;P.aeruginosa&lt;/em&gt;, in which &lt;em&gt;exoT, exoU&lt;/em&gt; and &lt;em&gt;exoS&lt;/em&gt; gene detected in most isolates while &lt;em&gt;exoY&lt;/em&gt; gene was detected in minaroty of the isolates&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;.&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;&lt;/p&gt;
</abstract>
	<keyword_fa>سودوموناس آئروژینوزا, سیستم ترشحی نوع سه, PCR چندگانه</keyword_fa>
	<keyword>Pseudomonas aeruginosa, Type III secretion system, Multiplex PCR</keyword>
	<start_page>9</start_page>
	<end_page>17</end_page>
	<web_url>http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-573-3&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Maryam</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Mahdavi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مریم</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>مهدوی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>Dr_kumarss_amini@yahoo.com</email>
	<code>10031947532846008477</code>
	<orcid>10031947532846008477</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, Faculty of Basic Science, Saveh Branch, Islamic Azad University, Saveh, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه آزاد اسلامی واحد ساوه، ساوه، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Taghi</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Zahraei Salehi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>تقی</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>زهرایی صالحی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>tsalehi@ut.ac.ir</email>
	<code>10031947532846008478</code>
	<orcid>10031947532846008478</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, Faculty of Veterinary medicine, Tehran University, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروبیولوژی، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه تهران، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Kumarss</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Amini</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>کیومرث</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>امینی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846008479</code>
	<orcid>10031947532846008479</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, Faculty of Basic Science, Saveh Branch, Islamic Azad University, Saveh, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه آزاد اسلامی واحد ساوه، ساوه، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Parisa</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Mobasseri</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>پریسا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>مبصری</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>p.mobasseri2011@gmail.com</email>
	<code>10031947532846008480</code>
	<orcid>10031947532846008480</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, Faculty of Biology sciences, Tehran North Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد تهران شمال، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
