<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian Journal of Medical Microbiology</title>
<title_fa>مجله میکروب شناسی پزشکی ایران</title_fa>
<short_title>Iran J Med Microbiol</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://ijmm.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-8612</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2345-4342</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.30699/ijmm</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1395</year>
	<month>11</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2017</year>
	<month>2</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>10</volume>
<number>6</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>تعیین سروگروپ های O در سویه‌های اشریشیاکلی جداشده از بیماران مبتلابه عفونت دستگاه ادراری با استفاده از روش PCR</title_fa>
	<title>O-serogrouping of Escherichia coli strains isolated from patients with Urinary tract infection by using PCR method</title>
	<subject_fa>باکتری شناسی پزشکی </subject_fa>
	<subject>Medical Bacteriology</subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Original Research Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;p dir=&quot;RTL&quot; style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;strong&gt;زمینه و اهداف:&lt;/strong&gt; عفونت ادراری&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt; (UTI) &lt;/span&gt;یکی از شایع&#8204;ترین عفونت&#8204;ها بوده و &lt;em&gt;اشرشیاکلی&lt;/em&gt; رایج&#8204;ترین دلیل بروز عفونت ادراری می&#8204;باشد. آنتی&#8204;ژن &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;O&lt;/span&gt; متشکل از واحدهای الیگوساکاریدی تکراری است که یکی از اجزاء لیپوپلی ساکارید (&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;LPS&lt;/span&gt;) در غشاء خارجی باکتری&#8204;های گرم منفی می&#8204;باشد. تغییرات آنتی&#8204;ژن &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;O&lt;/span&gt; مبنای اصلی مطالعات سرولوژیک در باکتری&#8204;های گرم منفی می&#8204;باشد. هدف از این مطالعه بررسی شیوع انواع سروگروپ&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&amp;shy;&lt;/span&gt;های &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;O&lt;/span&gt; در باکتری &lt;em&gt;اشریشیاکلی&lt;/em&gt; جداشده از بیماران مبتلابه عفونت ادراری بود.&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;RTL&quot; style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;strong&gt;مواد و روش کار: &lt;/strong&gt;در طول سه ماه، 210 بیمار مبتلا به عفونت ادراری، مراجعه&#8204;کننده به سه بیمارستان شهرهای تهران، سنندج و بروجرد موردبررسی قرار گرفتند. جدایه های &lt;em&gt;اشریشیاکلی&lt;/em&gt; با استفاده از روش&#8204;های استاندارد تعیین هویت شدند. سپس تعیین سروگروپ های این جدایه ها با استفاده از روش &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt; انجام گرفت.&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;RTL&quot; style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;strong&gt;یافته&#8204;ها: &lt;/strong&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;از تعداد کل بیماران مورد مطالعه قرار گرفته، 150 جدایه &lt;em&gt;اشریشیاکلی&lt;/em&gt; از نمونه ادرار جدا شد. شایع&#8204;ترین انواع&lt;/span&gt; آنتی&#8204;ژن &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;O&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;، (13/33%)&lt;strong&gt;1&lt;/strong&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;O&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;، (8%) &lt;strong&gt;16&lt;/strong&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;O&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;، (5/33%) &lt;strong&gt;8&lt;/strong&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt; O&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;و (4%)&lt;strong&gt;21&lt;/strong&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;O&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; گزارش شد و هیچ جدایه مثبتی برای ژن&#8204;های &lt;strong&gt;22&lt;/strong&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;O&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; و &lt;strong&gt;83&lt;/strong&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;O&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; شناسایی نگردید.&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;RTL&quot; style=&quot;margin-right: 18pt; text-align: justify;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;نتیجه&#8204;گیری&lt;/span&gt;: &lt;/strong&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;مطالعه حاضر نشان داد که &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;سروگروپ&lt;/span&gt; &lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;1&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;O&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt; با حداکثر تکرار و به دنبال آن سروگروپ های &lt;/span&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;16&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;O&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;، &lt;/span&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;8&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;O&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt; و &lt;/span&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;21&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;O&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;، به ترتیب از فراوانی بیشتری برخوردار بودند. در &lt;em&gt;اشریشیاکلی&lt;/em&gt; مولد عفونت ادراری (&lt;/span&gt;UPEC&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;، &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;سروگروپ&lt;/span&gt;&lt;strong&gt;&amp;shy;&lt;/strong&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;های &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;می&#8204;توانند با الگوی عوامل ویرولانس در هر سویه در ارتباط باشند. علاوه بر این، مطالعات بیشتر در خصوص فراوانی انواع سروگروپ ها در سایر نقاط ایران واز دیگر &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;سروگروپ&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt; توصیه می&#8204;شود.&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;strong&gt;Background and Aim: &lt;/strong&gt;Urinary tract infection (UTI) is one of the most common infections, and &lt;em&gt;E&lt;/em&gt;scherichia &lt;em&gt;coli &lt;/em&gt;is so far the most common causative agent of this disease. The O antigen, consisting of many repeats of an oligosaccharide unit, is part of the lipopolysaccharide (LPS) in the outer membrane of Gram-negative bacteria. The variability of the O antigen provides the major basis for serological schemes of Gram-negative bacteria. The aim of this study was to investigate the prevalence of O-serogroups among &lt;em&gt;E. coli&lt;/em&gt; isolated from patients with UTI.&lt;/p&gt;

&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;strong&gt;Materials and Methods: &lt;/strong&gt;During three months, 210 patients with urinary tract infection, referred to three hospitals of Tehran, Sanandaj and Boroujerd. &lt;em&gt;E&lt;/em&gt;. &lt;em&gt;coli&lt;/em&gt; isolates were identified using standard methods then serogrouping was performed by using PCR method.&lt;/p&gt;

&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;strong&gt;Results: &lt;/strong&gt;A total of 150 &lt;em&gt;E. coli&lt;/em&gt; strains were isolated from the urine samples. The most common types of O antigens were O1 (13.33%), O16 (8%), O8 (5.33%) and O21 (4%). There was no positive isolate for O22 and O83 genes.&lt;/p&gt;

&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;strong&gt;Conclusions: &lt;/strong&gt;The present study revealed that serogroup O1 was isolated with maximum frequency followed by O16, O8 and O21, respectively. In UPEC, the O-serogroups can be related to the virulence factor profile of each strain. Further studies from other parts of Iran and on other serogroup are recommended.&lt;/p&gt;
</abstract>
	<keyword_fa>اشریشیاکلی, عفونت دستگاه ادراری, آنتی‌ژن O</keyword_fa>
	<keyword>Escherichia coli, Urinary tract infection, O-Antigen</keyword>
	<start_page>1</start_page>
	<end_page>8</end_page>
	<web_url>http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-406-2&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Vahid</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Goudarzi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>وحید</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>گودرزی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>goudarzivahid.iuab@gmail.com</email>
	<code>10031947532846008206</code>
	<orcid>10031947532846008206</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Cell and Molecular Biology, Boroujerd Branch, Islamic Azad University, Boroujerd, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، واحد بروجرد، دانشگاه آزاد اسلامی،  بروجرد، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mohsen</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Mirzaee</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محسن</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>میرزایی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>mirzaei.iaub@gmail.com</email>
	<code>10031947532846008207</code>
	<orcid>10031947532846008207</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Medical Laboratory Sciences, Boroujerd Branch, Islamic Azad University, Boroujerd, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه علوم آزمایشگاهی، واحد بروجرد، دانشگاه آزاد اسلامی، بروجرد، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Reza</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Ranjbar</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>رضا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>رنجبر</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>ranjbarre@gmail.com</email>
	<code>10031947532846008208</code>
	<orcid>10031947532846008208</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Molecular Biology Research Center, Baqiyatallah University of Medical Sciences, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات بیولوژی مولکولی، دانشگاه علوم پزشکی بقیه ا...(عج)، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
