fa بررسی میزان تنوع توالی‌های تکرارشونده درسویه های اشریشیا کلی جداشده از منابع آب استان البرز میکروب شناسی مولکولی Molecular Microbiology مقاله پژوهشی Original Research Article <p dir="RTL"><strong>زمینه و اهداف:</strong> <em>اشریشیا کلی</em> <span dir="LTR">(<em>E. coli</em>)</span> باسیل گرم منفی از خانواده انتروباکتریاسه است. باکتری <em><span dir="LTR">E. coli</span></em> به‌عنوان شاخص آلودگی آب شهری به فاضلاب استفاده می‌شود. توالی‌های تکرارشونده، تکرارهایی از خود ژن‌ها یا قسمت‌هایی از آن‌ها است که تکرار شده‌اند. تکرارهای پشت سرهم ممکن ازنظر تعداد تکرارها در یک موجود نسبت به سایر جمعیت‌های آن موجود متفاوت باشند، که در اصطلاح به آن‌ها، تکرارهای پشت سرهم با تعداد متغییر می‌گویند. هدف از این مطالعه بررسی میزان تنوع توالی‌های تکرارشونده مربوط به دو لوکوس مهم یعنی <span dir="LTR">ms06</span> و <span dir="LTR">ms23</span> در <em><span dir="LTR">E.coli</span></em> های جداشده از منابع آب استان البرز است.</p> <p dir="RTL"><strong>مواد و روش کار: </strong>تعداد 72 ایزوله جداشده <em><span dir="LTR">E. coli</span></em> که از مهرماه سال 91 تا مهرماه سال 92، از منابع آب استان البرز جمع‌آوری‌شده بودند موردبررسی قرار گرفت و از آزمون‌های بیوشیمیایی و استاندارد جهت شناسایی و جداسازی باکتری <strong><em><span dir="LTR">E. coli</span></em></strong> استفاده شد و پس‌ازآن استخراج ژنوم به‌وسیله روش جوشاندن صورت گرفت<strong><span dir="LTR">.</span></strong> بررسی میزان تنوع توالی‌های تکرارشونده مربوط به دو لوکوس <span dir="LTR">ms06</span> و <span dir="LTR">ms23</span> در <em><span dir="LTR">E.coli</span></em> با استفاده از روش واکنش زنجیره‌ای پلیمراز انجام گرفت.</p> <p dir="RTL"><strong>یافته‌ها: </strong>نتایج حاصل از انجام الکتروفورز در 2 لوکوس <em><span dir="LTR">ms06</span></em> و <em><span dir="LTR">ms23</span></em> نشان داد که لوکوس <em><span dir="LTR">ms06</span></em> دارای 5 نوع الل متفاوت (1 تکرار، 2 تکرار، 3 تکرار،4 تکرار، 5 تکرار) و لوکوس <em><span dir="LTR">ms23</span></em> دارای 4 نوع الل متفاوت (1 تکرار، 2 تکرار،5/2 تکرار) می‌باشد و نیز لوکوس <em><span dir="LTR">ms23</span></em>، دارای الل <em><span dir="LTR">null</span></em> می‌باشد.</p> <p><strong><span dir="RTL">نتیجه‌گیری</span>: </strong><span dir="RTL">مطالعه حاضر برای اولین بار بر روی </span><em>E. coli </em><span dir="RTL">های جداشده از منابع آب استان البرز انجام‌شده است. میزان تنوع توالی‌های تکرارشونده در سویه‌های موردبررسی زیاد بود.</span></p> <p><strong>Background and Aim: </strong><em>E.coli</em> is a gram-negative bacillus from the family of Enterobacteriaceae. <em>E. coli</em> bacteria is used as a water indicator of urban sewage pollution. The repeating sequences, are replications of the genes or parts of them that are repeated. Tandem repeats may be available for the number of iterations in a different creature than other populations, which are called as consequent replications with variable numbers. The purpose of this study was to evaluate the diversity of repeated sequences of <em>ms06</em> and <em>ms23</em> loci in <em>E. coli</em> strains isolated from water resources in Alborz province.</p> <p><strong>Materials and Methods: </strong>A total of 72 <em>E.coli</em> isolates which obtained from water sources in Alborz, Iran, from September 2012 to October in 2013, were analyzed, then standard and biochemical tests were used to identify and isolate <em>E. coli</em> bacteria, after that, DNA extraction was performed by boiling method. The diversity of repeated sequences of <em>ms06</em> and <em>ms23</em> loci in <em>E. coli</em> was conducted using polymerase chain reaction.</p> <p><strong>Results: </strong>The current study showed that the locus <em>ms06</em> had five different alleles (1 repeat, 2 repeat, 3 repeat, 4 repeat, 5 repeat) and locus <em>ms23</em> showed four alleles (1 repeat, 2 repeat, 2.5 repeat). It is also founded that <em>ms23</em> loci contain a null allele.</p> <p><strong>Conclusions: </strong>This is the first study on the diversity of repeated sequences in <em>E.coli</em> strains isolated from water resources in Alborz. In this study, the variation of repeated sequences was high.</p> اشریشیا کلی, توالی‌های تکرارشونده, واکنش زنجیره‌ای پلی مراز, استان البرز Escherichia coli, Repeated sequences, Polymerase Chain Reaction, Alborz province 16 24 http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-531-1&slc_lang=fa&sid=1 Samaneh Shokoohi Mostafavi سمانه شکوهی مصطفوی samashokoohi@yahoo.com 10031947532846008150 10031947532846008150 No Department of Microbiology, Islamic Azad University, Damghan Branch, Damghan, Iran گروه میکروب شناسی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد دامغان، دامغان، ایران Reza Ranjbar رضا رنجبر ranjbarre@gmail.com 10031947532846008151 10031947532846008151 Yes Molecular Biology Research Center, Baqiyatallah University of Medical Sciences, Tehran, Iran مرکز تحقیقات بیولوژی مولکولی، دانشگاه علوم پزشکی بقیه ا... (عج)، تهران، ایران