<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian Journal of Medical Microbiology</title>
<title_fa>مجله میکروب شناسی پزشکی ایران</title_fa>
<short_title>Iran J Med Microbiol</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://ijmm.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-8612</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2345-4342</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.30699/ijmm</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1395</year>
	<month>4</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2016</year>
	<month>7</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>10</volume>
<number>2</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>بررسی فراوانی جدایه های شیگلا سونئی از کودکان مبتلا به اسهال مراجعه کننده به دو بیمارستان امام خمینی و میلاد در تهران در سال 1391 و بررسی الگوی حساسیت آنتی بیو تیکی ایزوله‌ها</title_fa>
	<title>Investigation of prevalence of Shigella sonnei in children with diarrhea admitted to two hospital Emam Khomeini and Milad in Tehran in 1391 with Antimicrobial susceptibility of isolates</title>
	<subject_fa>باکتری شناسی پزشکی </subject_fa>
	<subject>Medical Bacteriology</subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Original Research Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;p dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;strong&gt;زمینه و اهداف:&lt;/strong&gt; &lt;em&gt;شیگلا &lt;/em&gt;از عوامل شایع اسهال و مرگ و میر در کودکان زیر 10 سال در کشورهای در حال توسعه شناخته شده است. روش&#8204;های روتین ازمایشگاهی برای جداسازی انواع شیگلا وقت گیر و هزینه بر می&#8204;باشد&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;, &lt;/span&gt;&amp;nbsp;در این مطالعه به جداسازی زیر گونه&#8204;های شیگلا سونئی از نمونه بیماران مبتلا به دیسانتری بر اساس اهمیت تشخیص ژن تهاجمی و اختصاصی&amp;nbsp; &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;ipaH)&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;) با &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt;&lt;em&gt; در &lt;/em&gt;مقایسه با روشهای روتین بیوشیمیایی و سرولوژیک پرداخته شده است.&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;strong&gt;مواد و روش کار: &lt;/strong&gt;در این مطالعه تعداد 3000 نمونه مدفوع از کودکان مبتلا به اسهال مراجعه کننده به دو بیمارستان امام خمینی و میلاد در تابستان و پاییز 1391 جمع آوری گردید. سپس بر روی نمونه&#8204;ها آزمون&#8204;های استاندارد بیوشیمیایی و سرولوژیک مربوط به گونه&#8204;های &lt;em&gt;شیگلا&lt;/em&gt; انجام شد. برای تأیید ایزوله&#8204;های &lt;em&gt;شیگلا&lt;/em&gt; شناسایی شده به وسیله آزمون&#8204;ها بیوشیمیایی، حضور ژن &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;ipaH&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; به وسیله &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt; مورد ارزیابی قرارگرفت. آزمون سرولوژیک مربوط به زیر گونه&#8204;های شیگلا (تهیه شده از شرکت بهار افشان) انجام شد و سویه &lt;em&gt;شیگلا سونئی&lt;/em&gt; جداسازی گردید. تست انتی بیوگرام مربوط به 10 آنتی بیوتیک (بر اساس جدول &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;CLSI&lt;/span&gt;) بر روی ایزوله&#8204;های &lt;em&gt;شیگلا سونئی&lt;/em&gt; انجام شد.&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;strong&gt;یافته&#8204;ها: &lt;/strong&gt;تعداد 160 ایزوله&#8204;ی &lt;em&gt;شیگلا&lt;/em&gt; جدا سازی شد و حضور ژن &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;ipaH&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; در انها تائید گردید و دقت این روش در مقایسه با آزمون&#8204;های روتین سرولوژیک 100% گزارش می&#8204;شود. از میان 160 ایزوله 50 ایزوله (32%) با استفاده از آزمون&#8204;های بیوشیمیایی و هم&#8204;چنین آنتی&#8204;سرم&#8204;های اختصاصی در گروه &lt;em&gt;شیگلا سونئی&lt;/em&gt; طبقه&#8204;بندی شده&#8204;اند. همچنین 90% ایزوله&#8204;های &lt;em&gt;شیگلا سونئی&lt;/em&gt; مقاومت به تتراسایکلین و کوتریماکسازول و استرپتومایسین و مینو سایکلین نشان دادند.&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;strong&gt;نتیجه&#8204;گیری&lt;/strong&gt;: استفاده از روش &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt; &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;ipaH&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; قابل اطمینان تر، حساس تر، آسان تر و تکرار پذیر تر از روش های مرسوم بیوشیمیایی و سرولوژیک است. همچنین عامل اسهال شایع، &lt;em&gt;شیگلا سونئی&lt;/em&gt; مقاوم به آنتی بیوتیک ها گزارش می شود.&amp;nbsp;&lt;/p&gt;
</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p&gt;&lt;strong&gt;Background and Aim: &lt;/strong&gt;&lt;em&gt;Shigella&lt;/em&gt; infection is one of the prevalent causes of diarrhea disease in most developing countries in children under 10 years old. Conventional microbiological examination to identify &lt;em&gt;Shigella&lt;/em&gt; species are time-consuming and requires a lot of work and cost. The object of the present research was to isolate and identify of serotypes of &lt;em&gt;Shigella&lt;/em&gt;, &lt;em&gt;Shigella sonnei&lt;/em&gt; from patients with bacillary dysentery and to detect their one major virulence genes &lt;em&gt;ipaH &lt;/em&gt;by using PCR&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;.&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;&lt;strong&gt;Materials and Methods: &lt;/strong&gt;3000 stool sample from children with diarrhea admitted in two famous hospitals in1391 in summer &amp; autumn in Tehran were used in this study. The identification of isolated was done by serogrouping and biochemical test &amp; the prevalence of &lt;em&gt;ipaH &lt;/em&gt;gene determined by PCR method using specific pairs of primers. Antimicrobial susceptibility of isolates was performed according to the CLSI guidelines.&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;&lt;strong&gt;Results: &lt;/strong&gt;All &lt;em&gt;Shigella spp &lt;/em&gt;isolates in this study harbored the&lt;em&gt; ipaH &lt;/em&gt;gene. Out of 160&lt;em&gt; shigella&lt;/em&gt; isolates, 50 isolates determined as &lt;em&gt;S. sonnei &lt;/em&gt;with serogrouping and biochemical test&lt;em&gt;.&lt;/em&gt; 90% of isolates were resistant to Tetracycline, Cotrimoxazole, Streptomycin and Minocycline.&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;&lt;strong&gt;Conclusions: &lt;/strong&gt;We conclude that &lt;em&gt;ipaH&lt;/em&gt; PCR procedure is more reliable, sensitive, easier, reproducible and specific which is significantly faster than current conventional detection assays such as serologic test. Althuogh in this study we report that among &lt;em&gt;Shigella .spp&lt;/em&gt; cause diarrhea infection most of them are &lt;em&gt;S .sonnei&lt;/em&gt; resistant antibiotic.&lt;/p&gt;
</abstract>
	<keyword_fa>شیگلا سونئی, حساسیت آنتی بیوتیکی, کودکان بیمار</keyword_fa>
	<keyword>Shigell sonnei, Antibiotic Suspectibility, Pediatric patients</keyword>
	<start_page>16</start_page>
	<end_page>22</end_page>
	<web_url>http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-235-2&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Nasim</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Afshari</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>نسیم</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>افشاری ابرغان</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>afsharii.nasim@gmail.com</email>
	<code>10031947532846008216</code>
	<orcid>10031947532846008216</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Islamic Azad University Science &amp; Research Branch, Department of Microbiology, Saveh, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم دانشگاه ازاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات ساوه، ساوه، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Bita</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Bakhshi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>بیتا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>بخشی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>b.bakhshi@modares.ac.ir</email>
	<code>10031947532846008217</code>
	<orcid>10031947532846008217</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Bacteriology, Faculty of Medical Sciences, Tarbiat Modares University, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه باکتری شناسی دانشکده علوم پزشکی دانشگاه تربیت مدرس تهران، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Azam</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Mahmoudi aznaveh</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>اعظم</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>محمودی ازناوه</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>a.mahmoudiaznaveh@modares.ac.ir</email>
	<code>10031947532846008218</code>
	<orcid>10031947532846008218</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Bacteriology, Faculty of Medical Sciences, Tarbiat Modares University, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه باکتری شناسی دانشکده علوم پزشکی دانشگاه تربیت مدرس تهران، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Fatemeh</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Fallah</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>فاطمه</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>فلاح</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846008219</code>
	<orcid>10031947532846008219</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Bacteriology, Pediatric Infection Research Center of  Mofid Hospital ,Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه باکتری شناسی، مرکز تحقیقات عفونی اطفال بیمارستان مفید تهران، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mohammad</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Rahbar</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمد</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>رهبر</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846008220</code>
	<orcid>10031947532846008220</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Iranian Reference Health Laboratory, Faculty of Medical Microbiology, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروب شناسی، ازمایشگاه مرجع سلامت تهران، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Sedigheh</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Rafiei Tabatabaei</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>صدیقه</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>رفیعی طباطبایی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846008221</code>
	<orcid>10031947532846008221</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Bacteriology, Pediatric Infection Research Center of  Mofid Hospital ,Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه باکتری شناسی، مرکز تحقیقات عفونی اطفال بیمارستان مفید تهران، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
