<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian Journal of Medical Microbiology</title>
<title_fa>مجله میکروب شناسی پزشکی ایران</title_fa>
<short_title>Iran J Med Microbiol</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://ijmm.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-8612</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2345-4342</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.30699/ijmm</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1394</year>
	<month>1</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2015</year>
	<month>4</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>9</volume>
<number>1</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>تعیین گروه فیلوژنتیکی و الگوی مقاومت پادزیستی جدایه‌های انتروتوکسیژنیک اشریشیاکلی از موارد اسهال در شهرستان بم به روش PCR</title_fa>
	<title>Determination of phylogenetic groups and antibiotic resistance pattern of Enterotoxigenic Escherishia coli isolates from diarrheoic cases in Bam City by PCR</title>
	<subject_fa>باکتری شناسی پزشکی </subject_fa>
	<subject>Medical Bacteriology</subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Original Research Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;p style=&quot;text-align: justify&quot;&gt;&lt;strong&gt;زمینه و اهداف:&lt;/strong&gt; هدف از انجام این مطالعه تعیین گروه فیلوژنتیکی، فراوانی پاتوتیپ انتروتوکسیژنیک و تعیین مقاومت پادزیستی جدایه&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;­&lt;/span&gt;های&lt;em&gt; اشریشیاکلی&lt;/em&gt; از موارد اسهال در شهرستان بم بود.&lt;/p&gt;

&lt;p style=&quot;text-align: justify&quot;&gt;&lt;strong&gt;مواد و روش کار: &lt;/strong&gt;در این مطالعه 155 باکتری &lt;em&gt;اشریشیاکلی&lt;/em&gt; از نمونه&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;­&lt;/span&gt;های اسهالی از شهرستان بم جداسازی شدند. مقاومت پادزیستی جدایه&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;­&lt;/span&gt;ها بررسی شد. گروه فیلوژنتیکی جدایه&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;­&lt;/span&gt;ها و پاتوتیپ انتروتوکسیژنیک به ترتیب با شناسائی ژن&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;­&lt;/span&gt;های &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;chuA&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;، &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;yjaA&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;، &lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;TspE4C2&lt;/span&gt; و &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;LT&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; ،&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;ST&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; تعیین گردید.&lt;/p&gt;

&lt;p style=&quot;text-align: justify&quot;&gt;&lt;strong&gt;یافته‌ها: &lt;/strong&gt;جدایه&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;­&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;های مورد آزمایش در گروه&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;­&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;های فیلوژنی   (&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;A&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; (71/6%)،&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt; B1 &lt;/span&gt;&lt;/em&gt;(3/22%)،  &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;B2 &lt;/span&gt;&lt;/em&gt;(9/67% و &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;D (15/48)&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; انتشار داشتند. ژن&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;­&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;های مربوط به پاتوتیپ انتروتوکسیژنیک در 52 جدایه (33/54%) شناسائی گردید که ژن &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;ST&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; در 29 جدایه، ژن&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;LT &lt;/span&gt;&lt;/em&gt; در 16 جدایه و ژن های &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;ST&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; و &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;LT&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; در7 جدایه حضور داشتند&lt;strong&gt;. &lt;/strong&gt;بیست و نه جدایه واجد ژن &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;ST&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;، در سه گروه فیلوژنی &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;A&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; (48/28%)، &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;D&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; (38/41% و &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;ltr&quot;&gt;B2&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; (10/34% انتشار داشتند. بر اساس نتایج تعیین حساسیت پادزیستی بیشترین و کمترین مقاومت پادزیستی به ترتیب نسبت به تری متوپریم-سولفامتوکسازول (74/19%) و سیپروفلوکساسین و جنتامایسین (9/67%) تعیین گردید. پانزده الگوی مقاومت پادزیستی چندگانه در چهار گروه فیلوژنتیکی شناسائی گردید.&lt;/p&gt;

&lt;p align=&quot;right&quot; style=&quot;text-align: justify direction: rtl&quot;&gt;&lt;span dir=&quot;rtl&quot;&gt;&lt;strong&gt;نتیجه گیری: &lt;/strong&gt;جدایه­ های انتروتوکسیژنیک &lt;em&gt;اشریشیاکلی&lt;/em&gt; در شهرستان بم از مقاومت پادزیستی قابل ملاحظه ­ای برخودار بوده و در گروه های فیلوژنتیکی&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;&lt;p align=&quot;right&quot; style=&quot;text-align: justify direction: rtl&quot;&gt;&lt;span dir=&quot;rtl&quot;&gt; مختلفی انتشار دارند. از آنجائیکه تعداد قابل توجهی از جدایه­های &lt;em&gt;اشریشیاکلی&lt;/em&gt; از نظر ژن­ های &lt;/span&gt;&lt;em&gt;ST&lt;/em&gt;&lt;span dir=&quot;rtl&quot;&gt; و &lt;/span&gt;&lt;em&gt;LT&lt;/em&gt;&lt;span dir=&quot;rtl&quot;&gt; منفی بودند مطالعه سایر ژن­های حدت و زمینه فیلوژنتیکی آنها در موارد اسهال درشهرستان بم ضروری است&lt;br&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;

</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p dir=&quot;ltr&quot; style=&quot;text-align: justify&quot;&gt;&lt;strong&gt;Background and Aim: &lt;/strong&gt;Purposes of this study were to determine the phylogenetic groups, prevalence of enterotoxigenic pathotype and antibiotic resistance of &lt;em&gt;Escherichia coli &lt;/em&gt;(&lt;em&gt;E. coli&lt;/em&gt;) isolates from diarrheic cases in Bam city.&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;ltr&quot; style=&quot;text-align: justify&quot;&gt;&lt;strong&gt;Materials and Methods: &lt;/strong&gt;In this study 155 &lt;em&gt;E. coli&lt;/em&gt; were isolated from diarrheic samples in Bam city&lt;em&gt;. &lt;/em&gt;Phylogenetic groups of isolates and enterotoxigenic pathotype were determined by detection of &lt;em&gt;chuA, yjaA, &lt;/em&gt;TspE4C2 and &lt;em&gt;ST, LT &lt;/em&gt;genes respectively.&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;ltr&quot; style=&quot;text-align: justify&quot;&gt;&lt;strong&gt;Results: &lt;/strong&gt;One hundred fifty five examined isolates were distributed in phylogenetic groups: A (71.60%), B1 (3.22%), B2 (9.67%) and D (15.48%). The genes for enterotoxigenic pathotype were detected in 52 isolates (33.54%), which &lt;em&gt;ST&lt;/em&gt; gene were found in 29 isolates, &lt;em&gt;LT&lt;/em&gt; in 16 isolates and &lt;em&gt;LT, ST&lt;/em&gt; genes in 7 isolates. Twenty nine &lt;em&gt;ST&lt;/em&gt; gene positive isolates were distributed in three phylogenetic groups A (48.28%), D (41.38%) and B2 (10.34%). According to the antibiotic susceptibility tests maximum and minimum antibiotic resistance rate was against to trimethoprim/sulfamethoxazole (74.19%) and ciprofloxacin and gentamycin (9.67%). Fifteen multiple antibiotic resistance patterns were detected in four phylogenetic groups.&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;ltr&quot; style=&quot;text-align: justify&quot;&gt;&lt;strong&gt;Conclusions: &lt;/strong&gt;&lt;em&gt;Escherichia coli &lt;/em&gt;isolates from enterotoxigenic pathotype have a considerable antibiotic resistance rate in Bam city and were distributed in different phylogenetic groups. Since a considerable number of isolates were negative for &lt;em&gt;LT&lt;/em&gt; and &lt;em&gt;ST&lt;/em&gt; genes, it is necessary to study the other virulence genes and their phylogenetic background in &lt;em&gt;E. coli&lt;/em&gt; isolates from diarrheic cases in Bam city.&lt;/p&gt;
</abstract>
	<keyword_fa> اشریشیاکلی, انتروتوکسیژنیک, فیلوژنتیک, آنتی بیوتیک, اسهال</keyword_fa>
	<keyword>Escherichia coli, Enterotoxigenic, Antibiotic, Phylogenetic, Diarrhea</keyword>
	<start_page>6</start_page>
	<end_page>13</end_page>
	<web_url>http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-413-1&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Hesam</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Alizade</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>حسام</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>علیزاده</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>alizade.h2000@yahoo.com</email>
	<code>10031947532846004140</code>
	<orcid>10031947532846004140</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Research Center for Tropical and Infectious Diseases, Kerman University of Medical Sciences &amp; Zoonosis Research Committee, Kerman University of Medical Sciences, Kerman, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات بیماریهای عفونی و گرمسیری دانشگاه علوم پزشکی کرمان و کمیته تحقیقات زئونوز دانشگاه علوم پزشکی کرمان، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Reza</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Ghanbarpour</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>رضا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>قنبرپور</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>ghanbar@uk.ac.ir</email>
	<code>10031947532846004141</code>
	<orcid>10031947532846004141</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Molecular Microbiology Department, Faculty of Veterinary Medicine, Shahid Bahonar University &amp; Zoonosis Research Committee,  Kerman University of Medical Sciences, Kerman, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروبیولوژی، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه شهید باهنر کرمان و کمیته تحقیقات زئونوز دانشگاه علوم پزشکی کرمان، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mohammad Reza</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Aflatoonian</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمد رضا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>افلاطونیان</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>mraflatoonian@yahoo.com</email>
	<code>10031947532846004142</code>
	<orcid>10031947532846004142</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Zoonosis Research Committee, Kerman University of Medical Sciences &amp; Research Center for Tropical and Infectious Diseases, Kerman University of Medical Sciences, Kerman, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>کمیته تحقیقات زئونوز دانشگاه علوم پزشکی کرمان و مرکز تحقیقات بیماریهای عفونی و گرمسیری دانشگاه علوم پزشکی کرمان، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mohammad Hosein</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Sobhanipour</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمد حسین</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>سبحانی پور</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>sobhani6557@yahoo.com</email>
	<code>10031947532846004143</code>
	<orcid>10031947532846004143</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, Kerman University of Medical Sciences, Kerman, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروبیولوژی، دانشگاه علوم پزشکی کرمان، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
