Iranian Journal of Medical Microbiology

fa ارزیابی حضور و تنوع ژن Alt a 1 در آلترناریاهای جداسازی شده از هوای تهران Distribution and diversity of Alt a 1 gene in Alternaria species isolated from outdoor air of Tehran قارچ شناسی پزشکی Medical Mycology مقاله پژوهشی Original Research Article زمینه و اهداف: در تحقیق حاضر، الگوی پراکندگی و فیلوژنی گونه های آلترناریای جدا شده از هوای تهران بر اساس حضور و تنوع ژن Alt a1 مورد بررسی قرار گرفت. مواد و روش کار: تعداد 48 جدایه آلترناریا متعلق به گونه های آلترناریا الترناتا (33/4%)، آلترناریا سولانی (23%)، آلترناریا تنئوایسیما (23%)، آلترناریا پوری (16/6%) و آلترناریا براسیکولا (4%) جداسازی شده از نمونه های هوای شهر تهران در پلیت های سابورو دکستروز آگار کشت و DNAآنها استخراج گردید. محصولات PCR از DNA ژنومی با استفاده از پرایمر‌های مستقیم و معکوس ژن Alt a1تکثیر شدند و قطعات 500-600 جفت بازی حاصل بمنظور بررسی ارتباط فیلوژنیک جدایه‌های آلترناریا تعیین توالی گردیدند. یافته‌ها: دندروگرام حاصل نشان داد که جدایه‌های متعلق به گونه‌های آلترناریا آلترناتا و آلترناریا سولانی در 4 زیر شاخه و آلترناریا براسیکولا، آلترناریا پوری و آلترناریا تنئویسما هر یک در 2 زیر شاخه ی مجزا طبقه بندی شدند. 81 درصد از جدایه های آلترناریا الترناتا، 73 درصد از جدایه های آلترناریا سولانی، 45/5 درصد از جدایه های آلترناریا تنئویسیما و 12/5 درصد از جدایه های آلترناریا پوری با تشابه 99 درصد به ترتیب در زیر شاخه های I، ІI، IV ، І VIدسته بندی شدند. نتیجه‌گیری: نتایج بدست امده نشان داد که ژن Alt a1 در کلیه گونه های مورد بررسی آلترناریا حضور دارد و اختلافات موجود در توالی ژن مذکور می تواند بیانگر اهمیت نقش نوع گونه و جدایه های آلترناریا در القاء پاسخ های آلرژیک در افراد مستعد ابتلا بویژه مبتلایان به آسم آلرژیک باشد. Background and Aim: In the present study, distribution pattern and phylogeny of Alternaria species isolated from Tehran air was determine based on the homology of Alt a1 gene. Materials and Methods: A number of 48 Alternaria isolates belonging to A. alternata (33.4%), A. solani (23%), A. tenuissima (23%), A. porri (16.6%), and A. brassicicola (4%) obtained from Tehran air were cultured on Sabouraud dextrose agar. Genomic DNA was extracted from the isolates and amplified with forward and reverse specific primers of Alt a1 gene. The resultant fragments of 500 to 600 bp of genomic DNA were sequenced and compared with genomic data of NCBI gene bank to evaluate phylogenetic relationship of Alternaria species. Results: Based on the resulting dendrogram, isolates belonging to A. alternata and A. solani were distributed in 4 clusters and those of A. brassicicola, A. porri, and A. tenuissima each in 2 clusters. Approximately, 81% of A. alternata isolates, 73% of A. solani isolates, 45.5% of A. tenuissima isolates and 12.5% of A. porri isolates showed a similarity of 99% and resided in clusters I, II, IV and VII, respectively. Conclusions: Our results indicated that Alt a1 gene was present in all examined species and differences of sequence similarities of this gene shows the importance of species and strains of Alternaria in induction of allergenic reactions in suspected patients especially those with allergic asthma. گونه های آلترناریا, آلرژن, تنوع, ژن Alt a1 , تهران Alternaria species, Allergen, Diversity, Alt a1 gene, Tehran 39 46 http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-174-1&slc_lang=fa&sid=1 Homa Afshar هما افشار mshamsgh@yahoo.com 10031947532846004394 10031947532846004394 No Tarbiat ModaresDepartment of Mycology, Faculty of Medical Sciences, Tarbiat Modares University, Tehran University گروه قارچ شناسی پزشکی، دانشکده علوم پزشکی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران. Masoomeh Shams-hahfarokhi معصومه شمس قهفرخی shamsm@modares.ac.ir 10031947532846004393 10031947532846004393 Yes Department of Mycology, Faculty of Medical Sciences, Tarbiat Modares University, Tehran گروه قارچ شناسی پزشکی، دانشکده علوم پزشکی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران. Mehdi Razzaghi-Abyaneh مهدی رزاقی ابیانه mrab442@yahoo.com 10031947532846004395 10031947532846004395 No Department of Mycology, Pasteur Institute of Iran گروه قارچ شناسی، انستیتو پاستور ایران، تهران، ایران.