<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian Journal of Medical Microbiology</title>
<title_fa>مجله میکروب شناسی پزشکی ایران</title_fa>
<short_title>Iran J Med Microbiol</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://ijmm.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-8612</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2345-4342</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.30699/ijmm</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1394</year>
	<month>11</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2016</year>
	<month>2</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>9</volume>
<number>4</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>ارزیابی تجزیه زیستی آلودگی های نفتی بوسیله سویه Phaeosphaeria spp. UTMC 5003</title_fa>
	<title>Evaluation of crude oil biodegradation by Phaeosphaeria spp. UTMC 5003</title>
	<subject_fa>بیوتکنولوژی میکروبی</subject_fa>
	<subject>Microbial Biotechnology</subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Original Research Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;p dir=&quot;RTL&quot; style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;strong&gt;زمینه و اهداف: &lt;/strong&gt;آلودگی محیط زیست با آلاینده&amp;shy;های نفتی یکی از نگرانی&#8204;های جهانی است. هدف از این پژوهش جداسازی و بررسی توانمندی قارچ&#8204;های بومی ایران به منظور پاکسازی مناطق آلوده به ترکیبات نفتی می&#8204;باشد.&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;RTL&quot; style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;strong&gt;مواد و روش&amp;shy;ها: &lt;/strong&gt;ابتدا نمونه های خاک آلوده به نفت جمع آوری و در محیط پایه حداقل نمک همراه با 1% نفت خام و کلرامفنیکل به مدت سه هفته غنی سازی و جدایه ها خالص سازی شد. در ادامه توانمندی هر یک از جدایه ها از نظر میزان تخریب نفت خام با استفاده از روش سنجش کل محتوای هیدروکربنی نفت (&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;TPH&lt;/span&gt;) در420 نانومتر اندازه&amp;shy;گیری شد. جهت تایید میزان حذف نفت، محتوای هیدروکربنی باقیمانده با روش &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;FT-IR&lt;/span&gt; نیز بررسی شد. سپس فعالیت لاکازی جدایه منتخب ارزیابی گشت. در نهایت برترین جدایه از طریق ریخت شناسی و مولکولی شناسایی گردید.&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;RTL&quot; style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;strong&gt;یافته ها: &lt;/strong&gt;در این مطالعه 30 گونه قارچی جداسازی شد. تست &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;TPH&lt;/span&gt; در این جدایه ها نشان داد که جدایه &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;G-05&lt;/span&gt; با 66% میزان حذف نفت طی 15 روز توانمندترین جدایه در حذف هیدروکربن&#8204;های نفتی می&#8204;باشد. آنالیز &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;FTIR&lt;/span&gt; نیز حاکی از حذف 90% ترکیبات آلیفاتیک توسط این جدایه بود. همچنین ارزیابی فعالیت لاکاز نشان داد این جدایه قادر به تولید &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;U/L&lt;/span&gt; 1440 آنزیم در انتهای روز 15 می&#8204;باشد. حضور آنزیم لاکاز در این جدایه نشان داد که استفاده از آنزیم های لیگنولیتیک و به صورت غیر اختصاصی مسیر تجزیه هیدروکربن های نفتی در این جدایه است. &amp;nbsp;شناسایی&#8204;های ریخت شناسی و مولکولی نشان داد که&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt; G-05 &lt;/span&gt;&amp;nbsp;متعلق به جنس &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Phaeosphaeria&lt;/span&gt; &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;spp.&lt;/span&gt; می&#8204;باشد.&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;RTL&quot; style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;strong&gt;بحث: &lt;/strong&gt;با وجود توانمندی بالای قارچ&#8204;ها در حذف زیستی آلاینده ها مطالعات کمی در این زمینه صورت گرفته است. نتایج به دست آمده نشان می&#8204;دهد جدایه &amp;nbsp;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Phaeosphaeria spp&lt;em&gt;.&lt;/em&gt; UTMC 5003&lt;/span&gt;برای اولین بار در جهت حذف زیستی نفت به عنوان قارچی توانمند در پاک&#8204;سازی خاک&#8204;های آلوده به هیدروکربن&#8204;های نفتی در دنیا گزارش شده است.&amp;nbsp;&lt;/p&gt;
</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;strong&gt;Background:&lt;/strong&gt; Environmental pollution by petroleum compounds have turned into one of the global concerns. The aim of the present research was evaluation of the indigenous fungal strains of Iran to remove crude oil pollutants.&lt;/p&gt;

&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;strong&gt;Materials and&lt;/strong&gt; &lt;strong&gt;Methods:&lt;/strong&gt; First, the contaminated soil samples were collected. The samples were enriched in minimal salts medium (MSM) medium with 1% crude oil and chloramphenicol for 3 weeks and the isolates were purified. The crude oil degradation was measured by total petroleum hydrocarbon (TPH) assay method at 420 nm. In order to confirm the amount of oil degradation by selected isolate, the residual hydrocarbon content was evaluated by FT-IR. Laccase activity in the presence of 1% crude oil was measured. Finally, the selected isolate was identified using morphological molecular (18s rRNA gene sequence analysis) methods.&lt;/p&gt;

&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;strong&gt;Results:&lt;/strong&gt; In this study 30 fungal strains were isolated. The isolate G-05 was selected as a premium isolate by TPH test. This strain showed that 66% degradation of petroleum hydrocarbons after 15 days. Residual crude oil analysis with FT-IR spectrophotometry showed that G-05 is able to degrade 90% of aliphatic compounds. Evaluation of laccase activity showed that this isolate can produced 1440 U/l of enzyme after 15 days. Presence of laccase activity in G-05 was showed that using of non-specific ligninolytic enzymes are the main mechanisms of oil hydrocarbons degradation in mentioned strain. The strain was identified as a member of Phaeosphaeria genus by molecular and morphological tests.&lt;/p&gt;

&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;strong&gt;Conclusion:&lt;/strong&gt; Fungi have high potential in bioremediation of contaminants such as crude oil pollutants; however, few studies have been carried out in this field. For the first time, the results of this study showed that Phaeosphaeria has a high potential in bioremediation of the oil contaminated soils.&lt;/p&gt;
</abstract>
	<keyword_fa>قارچ, حذف زیستی, نفت خام, Phaeosphaeria spp</keyword_fa>
	<keyword>Bioremediation, Crude oil, , Phaeosphaeria spp. </keyword>
	<start_page>63</start_page>
	<end_page>72</end_page>
	<web_url>http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-349-1&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Hamid</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Moghimi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>حمید</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>مقیمی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>hmoghimi@ut.ac.ir</email>
	<code>10031947532846005702</code>
	<orcid>10031947532846005702</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbial Biotechnology, School of Biology and Center of Excellence in Phylogeny of Living Organisms, College of Science, University of Tehran, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>بخش زیست فناوری میکربی، دانشکده زیست شناسی و قطب تبار زایی موجودات زنده، پردیس علوم، دانشگاه تهران، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Rezvan</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Heidarytabar</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>رضوان</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>حیدری تبار</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>rezvan_he@yahoo.com</email>
	<code>10031947532846005703</code>
	<orcid>10031947532846005703</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Microbial Technology and Products Research Center, University of Tehran, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز پژوهشی فناوری‌ها و فراورده های میکربی دانشگاه تهران، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Javad</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Hamedi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>جواد</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>حامدی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>jhamedi@ut.ac.ir</email>
	<code>10031947532846005704</code>
	<orcid>10031947532846005704</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Microbial Technology and Products Research Center, University of Tehran, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز پژوهشی فناوری‌ها و فراورده های میکربی دانشگاه تهران، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
