fa پیشگویی مناطق آنتی ژنی در دو توالی پروتئینی ALS1 و HWP1 در جدایه های واژینالی کاندیدا آلبیکنس با تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی قارچ شناسی پزشکی Medical Mycology مقاله پژوهشی Original Research Article <p style="text-align: justify" dir="rtl"><strong>زمینه و اهداف:</strong> توانایی تشخیص مناطق آنتی ژنی در پروتئین ها از جمله عوامل مهم برای درمان می باشد. هدف از این مطالعه پیشگویی مناطق آنتی ژنی در دو توالی پروتئینی <span dir="ltr">ALS1</span> (<span dir="ltr">Agglutinin Like Sequence</span>) و<span dir="ltr"> HWP1 </span>(<span dir="ltr">Hyphal Wall Protein Sequences</span>) در جدایه های <em>کاندیدا آلبیکنس</em> عامل عفونت واژینالی با تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی می باشد.</p> <p style="text-align: justify" dir="rtl"><strong>مواد و روش کار: </strong>در این بررسی 7 جدایه از زنان مبتلا به عفونت واژینال که طی سال های 1390و 1391 از مراکز مختلف پزشکی تهران جدا شده بود انتخاب گردید. استخراج <span dir="ltr">DNA</span> به روش فنل- کلروفرم- ایزوآمیل الکل صورت گرفت. سپس <span dir="ltr">Multiplex PCR</span> با استفاده از پرایمرهای اختصاصی انجام شد. به منظور مطالعات بیوانفورماتیکی، ژن ها توالی یابی و ترجمه شدند. سپس مناطق آنتی ژنی دو توالی پروتئینی از طریق برنامه  <span dir="ltr">Physico-Chemical Profiles</span>شناسایی شدند.</p> <p style="text-align: justify" dir="rtl"><strong>یافته‌ها: </strong>نتایج حاصل حضور دو ژن <em><span dir="ltr">als1</span></em> و <em><span dir="ltr">hwp1</span></em> در جدایه های مورد مطالعه را نشان داد. در دو توالی پروتئینی <em><span dir="ltr">ALS1</span></em> و <em><span dir="ltr">HWP1</span></em> به ترتیب 2 و 1 منطقه آنتی ژنی تشخیص داده شد.</p> <p align="justify" style="text-align: justify direction: rtl"><strong>نتیجه‌گیری</strong>: طبق مطالعات گذشته، فسفریلاسیون سرین و ترئونین یکی از مکانیسم های موثر در آنتی ژنسیته دو پروتئین <em><span dir="ltr">ALS1</span></em> و <em><span dir="ltr">HWP1</span></em> است. نتایج حاصل از این مطالعه تایید نمود که سرین و ترئونین عمده ترین آمینواسیدها در این مناطق با خاصیت آنتی ژنتی بالا می باشند.</p> <p dir="ltr"><strong>Background and Aim: </strong>The ability to predict antigenic sites on proteins is of major importance for medication. The aim of this study was to predict the antigenic sites on Agglutin in Like Sequence (ALS1) and Hyphal Wall Protein Sequences (HWP1) in <em>Candida albicans</em> isolated of vaginal infections using Physico-Chemical Profiles server.</p> <p dir="ltr"><strong>Materials and Methods: </strong>7 isolates were obtained from women with vaginal infection which were collected from various medical centers of Tehran in 2011 and 2012. At the first,DNA was extracted  by Phenol-Chloroform method. Multiplex PCR was performed by using specific primers. In order to do bioinformatic studies, the genes were sequenced and then translated. Antigenic sites of protein sequences were identified by Physico-Chemical Profiles program.</p> <p dir="ltr"><strong>Results: </strong>The results showed that the presence of two genes <em>als1</em> and <em>hwp1</em> in isolates. In ALS1 and HWP1, respectively 2 and 1 antigenic site with the most antigenicity were identified.</p> <p dir="ltr"><strong>Conclusions: </strong>According to previous studies, Serine and Threonine phosphorylation is an important mechanism in pathogenesis of ALS1 and HWP1 proteins. Results in this study showed that serine and threonine are the most amino acids in the antigenic sites with high antigenicity property.</p> کاندیدا آلبیکنس, بیوفیلم, عفونت واژینال, بیوانفورماتیک Candida albicans, Biofilm, Vaginal infection, Bioinformatics 29 34 http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-268-1&slc_lang=fa&sid=1 Mona Pakdel مونا پاکدل moonapakdel@yahoo.com 10031947532846004418 10031947532846004418 No Department of Biology, Faculty of Sciences, Alzahra University, Tehran, Iran. گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه،دانشگاه الزهرا (س)، تهران، ایران. Mahbubeh Zarrabi محبوبه ضرابی zarrab_m@yahoo.com 10031947532846004419 10031947532846004419 No Department of Biology, Faculty of Sciences, Alzahra University, Tehran, Iran. گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه،دانشگاه الزهرا (س)، تهران، ایران. Ezat Asgarani عزت عسگرانی asgarani@gmail.com 10031947532846004420 10031947532846004420 No Department of Biology, Faculty of Sciences, Alzahra University, Tehran, Iran. گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه،دانشگاه الزهرا (س)، تهران، ایران. Parisa Mohammadi پریسا محمدی p.mohammadi@alzahra.ac.ir 10031947532846004421 10031947532846004421 Yes Department of Biology, Faculty of Sciences, Alzahra University, Tehran, Iran. گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه،دانشگاه الزهرا (س)، تهران، ایران.