fa بررسی فراوانی زیرگونه های پیلی نوع چهار سودوموناس آئروژینوزا بدست آمده از منابع محیطی، بیماران فیبروزیس سیستیک و سوختگی میکروب شناسی مولکولی Molecular Microbiology مقاله پژوهشی Original Research Article <p dir="rtl"><span style="font-family: tahoma"><strong>زمینه و اهداف:</strong> پیلی نوع چهار <em>سودوموناس آئروژینوزا</em> با عملکرد های گوناگون، واسطه ای مهم در به وجود آمدن تنوع در ساختار ژنومی باکتری محسوب می شود. بر اساس طبقه بندی رایج، دو زیر گونه<span dir="ltr">IVa </span>، <span dir="ltr">IVb</span> پیلی نوع چهار توسط ژن های<em><span dir="ltr">pilA</span></em>  و <em><span dir="ltr">pilS2</span></em>  که کد کننده زیر واحد های اصلی دو زیر گونه پیلی می باشند سنتز می شوند. هدف این مطالعه بررسی میزان فراوانی ژن های <em><span dir="ltr">pilA</span></em> و <em><span dir="ltr">pilS2</span></em> به عنوان شاخص زیر گونه<span dir="ltr">IVa </span>، <span dir="ltr">IVb</span> از پیلی نوع چهار <em>سودوموناس آئروژینوزا</em> در بین سویه های فیبروزیس سیستیک ، سوختگی و ایزوله های محیطی می باشد.</span></p> <p dir="rtl"><span style="font-family: tahoma"><strong>مواد و روش کار: </strong>تعداد 100 ایزوله <em>سودوموناس</em> <em>آئروژینوزا</em> در طی فروردین 1392 تا آذر1392 جمع آوری گردید. ایزوله ها از بیماران فیبروزیس سیستیک ، سوختگی و محیطی  که از شبکه فاضلاب مرکز مراقبت های سوختگی ایزوله شد، بدست آمد. فرایند <span dir="ltr">PCR</span> با استفاده از پرایمرهای اختصاصی انجام گرفت. تجزیه و تحلیل آماری با استفاده از نرم افزار  17<span dir="ltr"> SPSS</span>انجام گرفت.</span></p> <p dir="rtl"><span style="font-family: tahoma"><strong>یافته‌ها: </strong>میزان فراوانی ژن <em><span dir="ltr">pilA</span></em> <em>سودوموناس آئروژینوزا</em> به تفکیک ایزوله ها ،3/63% در سویه های فیبروزیس سیستیک، 7/56%  در سویه های سوختگی و 5/42% در سویه های محیطی بود. فراوانی ژن <em><span dir="ltr">pilS2</span></em> به تفکیک، 5/57% در ایزوله های محیطی،5/67% در سویه های فیبروزیس سیستیک  و3/73% در ایزوله های سوختگی مشاهده شد.</span></p> <p dir="rtl"><span style="font-family: tahoma"><strong>نتیجه‌گیری</strong>: مطالعه ما نشان داد که فراوانی پیلی نوع چهار در بین سویه های <em>سودوموناس آئروژینوزا</em> بدست آمده از منابع مختلف بالا است و زیرگونه <em><span dir="ltr"> IVb</span></em>از پیلی نوع چهار در مقایسه با زیرگونه <em><span dir="ltr"> Iva</span></em> در بین منابع مورد مطالعه از فراوانی بالاتری برخوردار می باشد.</span></p> <p class="MsoNormal" style="direction: ltr unicode-bidi: embed"><b>Background and Aim: </b>Type IV pilin molecule in <i>Pseudomonas aeruginosa</i> with wide functions, has important role in the diversity of the bacterial genome.  According to the latest classification, Type IV pilin is divided to two main subtypes IVa, IVb. The major subunit encoding Type IV pilin subtypes IVa, IVb is <i>pilA</i> and <i>pilS2</i> genes respectively which serve as a marker for the detection of the Type IV pilin subtypes. The purpose of the current study was to evaluate the frequency of <i>pilA</i> and <i>pilS2</i> gene in cystic fibrosis, burns, and environmental isolates.<o:p /></p> <p class="MsoNormal" style="direction: ltr unicode-bidi: embed"><b>Materials and Methods: </b>The samples for <i>P.aeruginosa </i>were collected from cystic fibrosis, burns, and environment wastewater during the April 2013 to December 2013. Samples were cultured and identified using microbial and biochemical methods. DNA of isolates was extracted by commercial kit. PCR was performed using specific primers. Statistical analysis was done using SPSS 17.0 software.<o:p /></p> <p class="MsoNormal" style="direction: ltr unicode-bidi: embed"><b>Results: </b>A total of 100 <i>P.aeruginosa</i> isolates were collected 30 cystic fibrosis, 30 burn, 40 environmental. The prevalence of the  <i>pilA</i> gene were 63.3% , 56.7% and 45/2%<span dir="rtl"></span><span dir="rtl"></span><span dir="rtl"><span dir="rtl"></span><span dir="rtl"></span> </span><span dir="ltr"></span><span dir="ltr"></span><span dir="ltr"></span><span dir="ltr"></span> for cystic fibrosis, for burns  and environmental strains . The <i>PilS2</i> gene frequency was 57.5% of the environmental isolates, 67.5% of cystic fibrosis strains and 73.3 % of the isolates were burned<span dir="rtl"></span><span dir="rtl"></span><span lang="FA" dir="rtl"><span dir="rtl"></span><span dir="rtl"></span>.</span><o:p /></p> <p class="MsoNormal" style="margin-bottom: 0.0001pt text-indent: 0in direction: ltr unicode-bidi: embed"><b>Conclusions: </b>Our study showed that the frequency of <i>P.aeruginosa</i> T4P major pilin subunits in our <i>P. aeruginosa</i> population was high. The incidence of <i>pilS2 </i>gene was greater than <i>pilA</i> and was more frequent in <i>Pseudomonas aeruginosa </i>isolated from hospitalized burn patients.<o:p /></p> سودوموناس آئروژینوزا, type IV pilin , سیستیک فیبریوزیس Pseudomonas aeruginosa, type IV pilin, Cystic Fibrosis 1 7 http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-66-1&slc_lang=fa&sid=1 Alireza Salimi chirani علیرضا سلیمی چیرانی Alireza.salimichirani@gmail.com 10031947532846003588 10031947532846003588 No Department of Medical Microbiology, School of Medicine, Shahid Beheshti University of Medical Sciences, Tehran, Iran. گروه میکروب شناسی پزشکی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، تهران، ایران. Hossein Dabiri حسین دبیری Hodabiri@gmail.com 10031947532846003589 10031947532846003589 Yes Department of Medical Microbiology, School of Medicine, Shahid Beheshti University of Medical Sciences, Tehran, Iran. گروه میکروب شناسی پزشکی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، تهران، ایران. Iraj Nikokar ایرج نیکوکار inikokar@sbmu.ac.ir 10031947532846003590 10031947532846003590 No Monireh Ebrahim pour komleh منیره ابراهیم پور کومله m.ebrahimpour@gmail.com 10031947532846003591 10031947532846003591 No Frahnoosh Dousdar فرحنوش دوستدار f_doostdar@gmail.com 10031947532846003592 10031947532846003592 No Hossein Goudarzi حسین گودرزی Hgoudarzi@sbmu.ac.ir. 10031947532846003593 10031947532846003593 No Fatemeh Fallah فاطمه فلاح dr_fallah@yahoo.com 10031947532846003594 10031947532846003594 No Ali Esmaili علی اسماعیلی ali.esmaili@sbmu.ac.ir 10031947532846003595 10031947532846003595 No