<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian Journal of Medical Microbiology</title>
<title_fa>مجله میکروب شناسی پزشکی ایران</title_fa>
<short_title>Iran J Med Microbiol</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://ijmm.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-8612</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2345-4342</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.30699/ijmm</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1392</year>
	<month>9</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2013</year>
	<month>12</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>7</volume>
<number>3</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>طراحی پرایمرهای اختصاصی بوردتلا پرتوسیس با استفاده از تکنیک Real-time PCR و مقایسه حساسیت و ویژگی آن‌ها با کیت تجاری</title_fa>
	<title>Design of primers for pertussis diagnosis by Real Time PCR and determination of its sensitivity and specificity in comparison with commercial kits.</title>
	<subject_fa>میکروب شناسی مولکولی</subject_fa>
	<subject>Molecular Microbiology</subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Original Research Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;b&gt;زمینه و اهداف:&lt;/b&gt; در کشور ما واکسیناسیون سیاه‌سرفه سال‌هاست که انجام می‌شود و در 85% موارد ایمنی کامل به وسیله واکسیناسیون و یا احیاناً ابتلا به بیماری ایجاد گردیده است؛ لذا همه‌گیری های 5-2 ساله ناشی از شیوع مجدد در بزرگ‌سالان غیر ایمن است که سبب ابتلا کودکان و شیرخواران می‌شود. روش Real-time PCR با توجه به نواحی ژنومی محافظت‌شده و میزان اختصاصیت پرایمر مورد استفاده می‌تواند یک روش جایگزین آسان، ارزان، سریع و با حساسیت بالا باشد.
&lt;br&gt;&lt;b&gt;مواد و روش کار:&lt;/b&gt; در یک مطالعه کاربردی 170 سوآب نازوفارنژیال از کودکان شیرخوار باسابقه سرفه بیش از 2 هفته به دست آوردیم. در اولین مرحله تشخیص باکتری&lt;i&gt; بوردتلا پرتوسیس&lt;/i&gt; با روش کشت و Real-time PCR با استفاده از کیت خارجی انجام شد و سپس با پرایمرهای جدید طراحی‌شده، آزمایش تکرار گردید.
&lt;br&gt;&lt;b&gt;یافته‌ها:&lt;/b&gt; عملکرد پرایمرهای مذکور به منظور تشخیص بیماری سیاه‌سرفه بر اساس یافته‌های کیت تجاری و راهنمای کلاسیک تشخیصی (WHO) و (CDC) قابل‌قبول است. در این پروژه نتایج حاصل از کیت تجاری با روش طراحی‌شده مطابقت داشته و حداقل کپی قابل‌تشخیص در این روش 10copies/ml در مقایسه با کیت تجاری که 20copies/ml بود بدست آمد. همچنین در این روش حساسیت و ویژگی100% بدست آمد.
&lt;br&gt;&lt;b&gt;نتیجه‌گیری:&lt;/b&gt; آزمون Real-time PCR با پرایمرهای جدید، در مقایسه با روش کشت، آزمون تائیدی مناسب‌تر, با حساسیت، ویژگی و ارزش های اخباری بالاتر برای تشخیص بیماری است. با این روش می‌توان به تشخیص سریع‌تر بیماران و درمان آنها پرداخت و از سایر عوارض بیماری جلوگیری کرد.

</abstract_fa>
	<abstract>&lt;b&gt;Background and Aim:&lt;/b&gt; Pertussis vaccination in this country has been going on for many years and active infection or vaccination will provide immunity in 85% of cases. However, every 2-5 years outbreaks in unprotected adults creates an epidemy for children and infants. Based on conserved genomic sequences, Real time PCR could be an easy, cost- benefit, fast  and highly sensitive method for pertussis detection.
&lt;br&gt;&lt;b&gt;Materials and Methods: &lt;/b&gt;A total of 170 nasopharyngeal swabs of infants with history of cough for more than 2 weeks were collected. In the first stage, Bordetella pertussis bacteria detection was performed by culture and followed by Real time PCR using a commercial kit and then repeated with newly designed primers.
&lt;br&gt;&lt;b&gt;Results: &lt;/b&gt;Performance of our home made primers for detecting pertussis using Real Time PCR in comparison with those by commercial kit was acceptable based on diagnostic classical guidance (WHO) and the (CDC). 
&lt;br&gt;&lt;b&gt;Conclusions: &lt;/b&gt;Real time PCR test with new primers in comparison with culture techniques is more suitable, high sensitivity and can provide more informative values for pertussis detection.

</abstract>
	<keyword_fa>بوردتلا پرتوسیس,  Real time-PCR.</keyword_fa>
	<keyword></keyword>
	<start_page>1</start_page>
	<end_page>7</end_page>
	<web_url>http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-1-189&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Hamidreza</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Monavari</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سید حمید رضا </first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>منوری</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>hrmonavari@yahoo.com</email>
	<code>10031947532846002218</code>
	<orcid>10031947532846002218</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department  of  Virology  and  AntiMicrobial  Resistance  Research  Center,  Tehran  University  of  Medical Sciences, Tehran, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه ویروس شناسی دانشکده پزشکی دانشگاه علوم پزشکی تهران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Samile</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Nourbakhsh</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>ثمیله </first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>نوربخش</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846002219</code>
	<orcid>10031947532846002219</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات عفونی اطفال دانشگاه علوم پزشکی تهران، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mitra</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Barati</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>میترا </first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>براتی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846002220</code>
	<orcid>10031947532846002220</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات عفونی اطفال دانشگاه علوم پزشکی تهران، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Anahita</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Izadi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>آناهیتا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>ایزدی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846002221</code>
	<orcid>10031947532846002221</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات عفونی اطفال دانشگاه علوم پزشکی تهران، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Seyed Ali</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Mosavi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سید علی جواد</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>موسوی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846002222</code>
	<orcid>10031947532846002222</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات عفونی اطفال دانشگاه علوم پزشکی تهران، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Shima</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Javadi nia</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>شیما </first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>جوادی نیا</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846002223</code>
	<orcid>10031947532846002223</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات عفونی اطفال دانشگاه علوم پزشکی تهران، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
