<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian Journal of Medical Microbiology</title>
<title_fa>مجله میکروب شناسی پزشکی ایران</title_fa>
<short_title>Iran J Med Microbiol</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://ijmm.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-8612</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2345-4342</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.30699/ijmm</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1403</year>
	<month>5</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2024</year>
	<month>8</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>18</volume>
<number>4</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>en</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>تشخیص مولکولی سویه های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس مقاوم به دارو با استفاده از ژن IS6110 در بیماران مبتلا به سل</title_fa>
	<title>Molecular Diagnosis of Drug-Resistant &lt;i&gt;Mycobacterium tuberculosis&lt;/i&gt; Isolates Using &lt;i&gt;IS6110&lt;/i&gt; Gene in Tuberculosis Patients</title>
	<subject_fa>میکروب شناسی مولکولی</subject_fa>
	<subject>Molecular Microbiology</subject>
	<content_type_fa>مقاله کوتاه پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Brief Original Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;p style=&quot;font-style: normal; text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span class=&quot;sanspYW&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;زمینه و اهداف:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;مایکوباکتریوم توبرکلوزیس یکی از خطرناک ترین بیماری های عفونی در جهان است. ت&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;عیین تشخیص&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt; M. tuberculosis &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;بر اساس کشت و آزمایشات فنوتیپی هفته ها طول می کشد و روش های مناسبی برای ارزیابی تشخیص قطعی وجود ندارد. ب&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;نابراین، تکنیک&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt; PCR &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;ژن&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt; IS۶۱۱۰ &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;روشی دقیق، سریع و ارزان برای تشخیص&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt; M. tuberculosis&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;&amp;nbsp;است. ب&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;ه طور کلی، هدف از این مطالعه، ارائه سویه&#8204;های هویت مولکولی&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt; M. tuberculosis &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;مقاوم به داروهای خط اول (ریفامپین و ایزونیازید) است که توسط&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt; PCR-IS۶۱۱۰ &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;از بیماران شناسایی شده&#8204;اند.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span class=&quot;sanspYW&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;مواد و روش کار:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;از ۳۰۱۲ مورد مشکوک به مایکوباکتریوم، ۶۰ نمونه مایکوباکتریوم مقاوم به دارو&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt; (MDR) &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;با اسمیر، کشت، تست&#8204;های فنوتیپی و آنتی&#8204;بیوگرام مورد بررسی قرار گرفتند.&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;جدایه ها پس از استخراج&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt; DNA &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;توسط ژن&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt; IS۶۱۱۰ &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;شناسایی شدند.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span class=&quot;sanspYW&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;یافته ها:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;از ۶۰ نمونه جمع&#8204;آوری&#8204;شده، ۵۴ نمونه مثبت از گروه&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt; M. tuberculosis (۹۰%) &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;و ۶ نمونه منفی (۱۰%) از گروه غیر سلی گزارش شد.&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;از ۳۰۱۲ نمونه بالینی، ۱۰۰ نمونه کشت مثبت (۳/۳%)، از ۵۴ نمونه&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt; M. tuberculosis &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;نمونه، ۳ نمونه به ریفامپین (۵%) مقاوم و بقیه نمونه ها&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt; MDR (۹۴%) &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;بودند.&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;ژن&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt; IS۶۱۱۰ &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;یکی از بهترین ژن های نشانگر برای تمایز کمپلکس مایکوباکتریوم است&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span class=&quot;sanspYW&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;نتیجه&#8204;گیری:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;این مطالعه نشان داد که روش&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt; PCR-IS۶۱۱۰ &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;روشی ساده و دقیق برای شناسایی مقاومت دارویی ایزوله&#8204;های بالینی&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt; M. tuberculosis &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;در آزمایشگاه&#8204;های بالینی است.&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;به جای استفاده از روش&#8204;های فنوتیپی که زمان&#8204;بر بوده و نتایج متغیری در آزمایشگاه&#8204;های تشخیصی دارند، استفاده مستقیم از روش&#8204;های مولکولی به&#8204;ویژه توالی&#8204;یابی ژن&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt; IS۶۱۱۰ &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;پیشنهاد می&#8204;شود&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:150%&quot;&gt;&lt;b&gt;&lt;span style=&quot;line-height:150%&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;Background and Objective&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/b&gt;&lt;span style=&quot;line-height:150%&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;: &lt;i&gt;Mycobacterium tuberculosis&lt;/i&gt; (&lt;i&gt;M. tuberculosis&lt;/i&gt;) is one of the most dangerous infectious diseases all over the world. Diagnosis of &lt;i&gt;M. tuberculosis&lt;/i&gt; based on the culture and phenotypic tests takes weeks that make them inappropriate methods to evaluate a definitive diagnosis. PCR on the &lt;i&gt;IS6110&lt;/i&gt; gene is an accurate, quick, and inexpensive method for the &lt;i&gt;M. tuberculosis&lt;/i&gt; detection. This study aimed to provide molecular diagnosis for the strains of &lt;i&gt;M. tuberculosis&lt;/i&gt; resistant to the first-line drugs (rifampin and isoniazid) by &lt;i&gt;IS6110&lt;/i&gt; gene PCR.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;line-height:150%&quot;&gt;&lt;b&gt;&lt;span style=&quot;line-height:150%&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;Materials and Methods&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/b&gt;&lt;span style=&quot;line-height:150%&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;: Of the 3012 &lt;i&gt;Mycobacterium&lt;/i&gt; suspected cases, 60 samples of mycobacterium drug-resistant (MDR) were examined by smear, culture, phenotypic tests, and antibiogram. The isolates were identified by &lt;i&gt;IS6110&lt;/i&gt; gene amplification.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;line-height:150%&quot;&gt;&lt;b&gt;&lt;span style=&quot;line-height:150%&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;Results &amp; Conclusion&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/b&gt;&lt;span style=&quot;line-height:150%&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;: Among 60 tested samples, 54 (90%) positive samples from the &lt;i&gt;M. tuberculosis&lt;/i&gt; group and 6 (10%) negative samples from non-tuberculosis group were reported. Out of 3012 clinical samples, 100 (3.3%) cultures were positive, 3 samples (5%) were resistant to rifampin, and the other samples (94%) were MDR. The &lt;i&gt;IS6110&lt;/i&gt; gene is one of the best markers for the Mycobacterium complex differentiation. This study showed that &lt;i&gt;IS6110&lt;/i&gt; gene PCR is a simple and accurate method for identifying drug resistance in &lt;i&gt;M. tuberculosis&lt;/i&gt; clinical isolates.&amp;nbsp;It is recommended to use molecular methods especially &lt;i&gt;IS6110&lt;/i&gt; gene sequencing instead of time-consuming with high variability phenotypic methods.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-size:11pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:200%&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Calibri,sans-serif&quot;&gt;&lt;b&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:200%&quot;&gt;&lt;span new=&quot;&quot; roman=&quot;&quot; style=&quot;font-family:&quot; times=&quot;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/b&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;</abstract>
	<keyword_fa>مایکوباکتریوم توبرکلوزیس, سویه های  MDR, ژن IS6110</keyword_fa>
	<keyword>Mycobacterium tuberculosis, MDR Strains, IS6110 Gene</keyword>
	<start_page>265</start_page>
	<end_page>269</end_page>
	<web_url>http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-1998-5&amp;slc_lang=en&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Arash</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Zia Sheybani</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>آرش</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>ضیاء شیبانی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>arash_9171@yahoo.com</email>
	<code>100319475328460030175</code>
	<orcid>0009-0008-4173-8649</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, Faculty of Life Sciences, Islamic Azad University, North Tehran Branch, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروب شناسی، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد تهران شمال، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Shaghayegh</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Hoseinzadeh</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>شقایق</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>حسین زاده</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>shshaghayegh00@gmail.com</email>
	<code>100319475328460030176</code>
	<orcid>0009-0007-6860-6913</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, Faculty of Life Sciences, Islamic Azad University, Parnad Branch, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروب شناسی، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد پرند، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Shadi</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Habibnia</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>شادی</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>حبیب نیا</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>habibnia315@gmail.com</email>
	<code>100319475328460030177</code>
	<orcid>100319475328460030177</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, School of Medicine, Shahid Beheshti University of Medical Sciences, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروب شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
