<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian Journal of Medical Microbiology</title>
<title_fa>مجله میکروب شناسی پزشکی ایران</title_fa>
<short_title>Iran J Med Microbiol</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://ijmm.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-8612</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2345-4342</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.30699/ijmm</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1402</year>
	<month>3</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2023</year>
	<month>6</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>17</volume>
<number>3</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>en</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>تشخیص مولکولی و بررسی فیلوژنتیک &lt;i&gt;Entamoeba histolytica&lt;/i&gt; و &lt;i&gt;Giardia intestinalis&lt;/i&gt; در بیماران اسهالی در عراق</title_fa>
	<title>Molecular Diagnosis and Phylogenetic Investigation of &lt;i&gt;Entamoeba histolytica&lt;/i&gt; and &lt;i&gt;Giardia intestinalis&lt;/i&gt; among Diarrheal Patients in Iraq</title>
	<subject_fa>انگل شناسی پزشکی</subject_fa>
	<subject>Medical Parasitology</subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Original Research Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;p style=&quot;font-style: normal; text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span class=&quot;sanspYW&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;زمینه و اهداف:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:150%&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;em&gt;Entamoeba histolytica&lt;/em&gt; و &lt;em&gt;Giardia intestinalis&lt;/em&gt; دو انگل رایج مرتبط با عفونت&#8204;های گوارشی و بیماری&#8204;های اسهالی در سراسر جهان هستند. این مطالعه به بررسی شیوع، خصوصیات مولکولی و روابط فیلوژنتیکی&lt;em&gt; E. histolytica&lt;/em&gt; و&lt;em&gt; G. intestinalis &lt;/em&gt;در بیماران مبتلا به اسهال و اختلالات روده در بیمارستان&#8204;های سراسر عراق پرداخت.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span class=&quot;sanspYW&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;مواد و روش کار:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:150%&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;نمونه&#8204;های مدفوع از افرادی که علائم گوارشی داشتند جمع&#8204;آوری شد و یک معاینه میکروسکوپی برای غربالگری وجود &lt;em&gt;E. histolytica&lt;/em&gt; و &lt;em&gt;G. intestinalis&lt;/em&gt; انجام شد. DNA از نمونه های مثبت استخراج شد و تکثیر PCR با هدف قرار دادن ژن ۱۶S rRNA برای &lt;em&gt;E. histolytica &lt;/em&gt;و ژن تریوز فسفات ایزومراز (TPI) برای&lt;em&gt; G. intestinalis&lt;/em&gt; انجام شد. محصولات PCR به دست آمده تحت الکتروفورز ژل آگارز قرار گرفتند، خالص شدند و توالی یابی شدند. درختان فیلوژنتیک با استفاده از روش حداکثر درستنمایی بر اساس مدل Tamura-Nei ساخته شدند و تجزیه و تحلیل بوت استرپ انجام شد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span class=&quot;sanspYW&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;یافته ها:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:150%&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;از بین نمونه&#8204;های مورد مطالعه، (۸۵=n) ۲۷/۸ درصد &lt;em&gt;E. histolytica&lt;/em&gt; و (n=۶۰) ۱۹/۶ درصد &lt;em&gt;G. intestinalis&lt;/em&gt; مثبت بودند. تجزیه و تحلیل توالی حضور &lt;em&gt;E. histolytica&lt;/em&gt; و&lt;em&gt; G. intestinalis&lt;/em&gt; با تطبیق توالی های به دست آمده با آنهایی که در بانک ژن NCBI موجود است را تایید کرد. تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک تنوع ژنتیکی و ارتباط جدایه های &lt;em&gt;E. histolytica&lt;/em&gt; و &lt;em&gt;G. intestinalis&lt;/em&gt; را نشان داد. الگوهای خوشه&#8204;بندی خاص برای جمعیت عراق مشاهده شد که نشان&#8204;دهنده پویایی انتقال منطقه&#8204;ای بالقوه است.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span class=&quot;sanspYW&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;نتیجه&#8204;گیری:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:150%&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&amp;nbsp;این مطالعه بینش&#8204;های ارزشمندی در مورد شیوع، خصوصیات مولکولی و روابط فیلوژنتیکی &lt;em&gt;E. histolytica&lt;/em&gt; و &lt;em&gt;G. intestinalis&lt;/em&gt; در بیماران عراقی مبتلا به اسهال و اختلالات روده ارائه می&#8204;کند.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Background and Aim:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;i&gt;Entamoeba histolytica&lt;/i&gt; and &lt;i&gt;Giardia intestinalis &lt;/i&gt;are two common parasites associated with gastrointestinal infections and diarrheal diseases worldwide. This study investigated the prevalence, molecular characterization, and phylogenetic relationships of &lt;i&gt;E. histolytica&lt;/i&gt; and &lt;i&gt;G. intestinalis &lt;/i&gt;among patients with diarrhea and intestinal disorders in hospitals across Iraq.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Materials and Methods:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;Stool samples were collected from individuals presenting with gastrointestinal symptoms, and a microscopic examination was performed to screen for the presence of &lt;i&gt;E. histolytica&lt;/i&gt; and &lt;i&gt;G. intestinalis&lt;/i&gt;. DNA was extracted from positive samples, and PCR amplification targeting the 16S rRNA gene for &lt;i&gt;E. histolytica&lt;/i&gt; and the triose phosphate isomerase (TPI) gene for &lt;i&gt;G. intestinalis&lt;/i&gt; was carried out. The resulting PCR products were subjected to agarose gel electrophoresis, purified, and sequenced. Phylogenetic trees were constructed using the Maximum Likelihood method based on the Tamura-Nei model, and bootstrap analysis was performed.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Results:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;Among the studied samples, 27.8% (n=85) were positive for &lt;i&gt;E. histolytica&lt;/i&gt;, while 19.6% (n=60) were positive for &lt;i&gt;G. intestinalis.&lt;/i&gt; Sequence analysis confirmed the presence of &lt;i&gt;E. histolytica&lt;/i&gt; and &lt;i&gt;G. intestinalis &lt;/i&gt;by matching the obtained sequences with those available in the NCBI gene bank. The phylogenetic analysis revealed the genetic diversity and relatedness of the &lt;i&gt;E. histolytica&lt;/i&gt; and &lt;i&gt;G. intestinalis&lt;/i&gt; isolates. Clustering patterns specific to the Iraqi population were observed, suggesting potential regional transmission dynamics.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Conclusion:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;This study provides valuable insights into the prevalence, molecular characterization, and phylogenetic relationships of &lt;i&gt;E. histolytica&lt;/i&gt; and &lt;i&gt;G. intestinalis&lt;/i&gt; in Iraqi patients with diarrhea and intestinal disorders.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;/p&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;div&gt;&lt;/div&gt;&lt;/p&gt;</abstract>
	<keyword_fa>انتامبا هیستولیتیکا, ژیاردیا روده ای, اسهال, اختلالات روده, خصوصیات مولکولی, آنالیز فیلوژنتیک</keyword_fa>
	<keyword>Entamoeba histolytica, Giardia intestinalis, Diarrhea, Intestinal Disorders, Molecular Characterization, Phylogenetic Analysis</keyword>
	<start_page>361</start_page>
	<end_page>368</end_page>
	<web_url>http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-2301-1&amp;slc_lang=en&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Ola Nasrat</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Abdulraheem Al-rawi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>اولا نصرت</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>عبدلرحمان الراوی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>ola.21scp87@student.uomosul.edu.iq</email>
	<code>100319475328460025596</code>
	<orcid>0009-0000-5155-3105</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Biology, College of Science, University of Mosul, Mosul, Iraq</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه زیست شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه موصل، موصل، عراق</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Najah</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Subhi Naef Al-Omar</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>نجاح</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>سوبحی نائف العمر</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>Najhsbio26@uomosul.edu.iq</email>
	<code>100319475328460025597</code>
	<orcid>100319475328460025597</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Biology, College of Science, University of Mosul, Mosul, Iraq</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه زیست شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه موصل، موصل، عراق</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
