<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian Journal of Medical Microbiology</title>
<title_fa>مجله میکروب شناسی پزشکی ایران</title_fa>
<short_title>Iran J Med Microbiol</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://ijmm.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-8612</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2345-4342</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.30699/ijmm</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1402</year>
	<month>7</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2023</year>
	<month>10</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>17</volume>
<number>5</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>en</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>شیوع ژن های استافیلوکوکوس اورئوس مقاوم به چند دارو و سموم بیماری زا در بیماران عراقی، 2022-2023</title_fa>
	<title>Prevalence of Multidrug Resistant &lt;i&gt;Staphylococcus aureus&lt;/i&gt; and their Pathogenic Toxins Genes in Iraqi Patients, 2022-2023</title>
	<subject_fa>ژنتیک میکروبی</subject_fa>
	<subject>Microbial Genetics</subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Original Research Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;p style=&quot;font-style: normal; text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span class=&quot;sanspYW&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;زمینه و اهداف:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:150%&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;استافیلوکوکوس اورئوس مقاوم به متی سیلین (MRSA) باعث عفونت استاف، تولید سموم و فاکتورهای بیماریزای متعدد و مقاومت آنتی بیوتیکی می شود. بنابراین، این مطالعه با هدف شناسایی MRSA و الگوهای مقاوم به آنتی&#8204;بیوتیک آن و ارزیابی ژن&#8204;های سمی در جدایه&#8204;های استافیلوکوکوس اورئوس از بغداد، عراق انجام شد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span class=&quot;sanspYW&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;مواد و روش کار:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:150%&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;دویست و بیست نمونه باکتری از منابع بالینی مختلف در عراق در سال&#8204;های ۲۰۲۲-۲۰۲۳ جمع&#8204;آوری شد. تشخیص با استفاده از کشت سنتی، بررسی&#8204;های میکروسکوپی و تشخیص مولکولی با استفاده از ژن ۱۶srRNA و ژن mecA که برای تشخیص مقاومت متی سیلین استفاده می&#8204;شود، انجام شد. علاوه بر این، الگوهای مقاومت آنتی بیوتیکی با استفاده از VITEK-۲ شناسایی شد. همچنین ژن های سموم نیز با تعیین توالی تعیین شدند.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span class=&quot;sanspYW&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;یافته ها:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:150%&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;۵۰ ایزوله به عنوان استافیلوکوکوس اورئوس شناسایی شد و سویه ها مقاومت بالایی به بنزیل پنی سیلین، اریترومایسین، اگزاسیلین و کلیندامایسین نشان دادند. PCR شیوع ژن mecA را در ایزوله های استافیلوکوکوس اورئوس مقاوم به متی سیلین به میزان ۱۰۰% نشان داد، در حالی که ژن های سمی موجود در استافیلوکوکوس اورئوس ژن LukD/E ۵۰ (۱۰۰%)، ژن eta ۵۰ (۱۰۰%) و ژن etd بودند. ۴۷ (۹۴%)، ژن LukS/F ۳۴ (۶۸%) و ژن tst ۲۱ (۴۲%). آزمایش همه جدایه ها برای ژن etb منفی بود. نتایج تجزیه و تحلیل توالی ژن های مورد مطالعه نشان داد که هیچ جهش ژنتیکی وجود ندارد. آنها ۱۰۰٪ به جز ژن eta یکسان بودند و نتایج نشان دهنده سه جهش ژنتیکی بود.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span class=&quot;sanspYW&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;نتیجه&#8204;گیری:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:150%&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;تمام جدایه&#8204;های استافیلوکوکوس اورئوس دارای ژن mecA برای مقاومت به متی سیلین بودند و استافیلوکوکوس اورئوس دارای ژن&#8204;های سمی بود. تجزیه و تحلیل توالی ژن eta وجود جهش های مختلف از جمله جهش های خاموش را نشان داد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Background and Aim:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;Methicillin Resistance &lt;i&gt;Staphylococcus aureus&lt;/i&gt; (MRSA) causes staph infections, produces numerous toxins and virulence factors, and displays antibiotic resistance. Therefore, this study aimed to detect MRSA and its antibiotic-resistant patterns and evaluate the toxins genes in &lt;i&gt;S. aureus&lt;/i&gt; isolates from Baghdad, Iraq.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Materials and Methods:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;Two hundred twenty bacterial samples were collected from different clinical sources in Iraq, 2022-2023. The diagnosis was made using traditional culture, microscopic examinations, and molecular diagnosis using the &lt;i&gt;16srRNA&lt;/i&gt; gene and &lt;i&gt;mecA&lt;/i&gt; gene used for Methicillin Resistance detection. In addition, Antibiotic resistance patterns were detected using VITEK-2. Also, the toxins genes were determined by sequencing.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Results:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;Fifty isolates were identified as&lt;i&gt; S. aureus&lt;/i&gt;, and the strains showed high resistance to Benzylpenicillin, Erythromycin, Oxacillin, and Clindamycin. PCR showed a prevalence of the &lt;i&gt;mecA&lt;/i&gt; gene in methicillin resistance &lt;i&gt;S. aureus &lt;/i&gt;isolates by 100%, while toxin genes that were present in &lt;i&gt;S. aureus&lt;/i&gt; were &lt;i&gt;LukD/E &lt;/i&gt;gene 50(100%), &lt;i&gt;eta&lt;/i&gt; gene 50(100%), &lt;i&gt;etd&lt;/i&gt; gene 47(94%), &lt;i&gt;LukS/F&lt;/i&gt; gene 34(68%) and &lt;i&gt;tst&lt;/i&gt; gene 21(42%). All isolates tested negative for the &lt;i&gt;etb&lt;/i&gt; gene. The results of the sequencing analysis of the studied genes showed that there were no genetic mutations. They were 100% identical except for &lt;i&gt;the eta gene,&lt;/i&gt; and the results indicated three genetic mutations.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Conclusion:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;All &lt;i&gt;S. aureus&lt;/i&gt; isolates had the &lt;i&gt;mecA&lt;/i&gt; gene for methicillin resistance, and &lt;i&gt;S. aureus&lt;/i&gt; possessed toxin genes. The sequencing analysis of the &lt;i&gt;eta &lt;/i&gt;gene indicated the presence of various mutations, including the silent mutations.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;/p&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;div&gt;&lt;/div&gt;&lt;/p&gt;</abstract>
	<keyword_fa>مقاومت آنتی بیوتیکی, توالی یابی DNA, مقاومت به متی سیلین, استافیلوکوکوس اورئوس, ژن های توکسین</keyword_fa>
	<keyword>Antibiotic resistance, DNA Sequencing, methicillin resistance, Staphylococcus aureus, Toxin genes</keyword>
	<start_page>559</start_page>
	<end_page>570</end_page>
	<web_url>http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-2400-1&amp;slc_lang=en&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Rasha</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Zaid Tariq Ahmed</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>رشا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>زیاد طاریق احمد</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>rasha_zaid@ihcoedu.uobaghdad.edu.iq</email>
	<code>100319475328460027249</code>
	<orcid>0009-0006-2231-6235</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Biology, College of Education for Pure Science (Ibn Al-Haitham), University of Baghdad, Baghdad, Iraq</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه زیست شناسی، دانشکده آموزش علوم ناب (ابن الحیثم)، دانشگاه بغداد، بغداد، عراق</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Rana</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Mujahid Abdullah</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>رعنا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>مجاهد عبدالله</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>dr.ranamujahid@gmail.com</email>
	<code>100319475328460027250</code>
	<orcid>100319475328460027250</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Biology, College of Education for Pure Science (Ibn Al-Haitham), University of Baghdad, Baghdad, Iraq</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه زیست شناسی، دانشکده آموزش علوم ناب (ابن الحیثم)، دانشگاه بغداد، بغداد، عراق</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
