Iranian Journal of Medical Microbiology

en خصوصیات مولکولی و تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک ژن ITS2 جدایه های Enterobius vermicularis Molecular Characterization and Phylogenetic Analysis of the ITS2 Gene of Enterobius vermicularis Isolates ژنتیک میکروبی Microbial Genetics مقاله پژوهشی Original Research Article   <div style="direction:rtl">زمینه و اهداف:  انتروبیوس ورمیکولاریس (E.vermicularis) یک نماتد انگلی است که در برخی از کشورها با شیوع بالای ۳۵ درصد، انسان و عمدتاً کودکان را آلوده می‌کند. مطالعات مولکولی آن هنوز اندک است. تشخیص دقیق و درک تنوع ژنتیکی در مدیریت انتروبیازیس ضروری است. این مطالعه از توالی‌یابی DNA و آنالیز فیلوژنتیکی برای تشخیص E.vermicularis با تنوع ژنتیکی در ژن داخلی رونویسی شده spacer ۲ (ITS۲) استفاده کرد.</div> <div style="direction:rtl">مواد و روش کار:  نمونه‌های مدفوع از ۵۶ بیمار آلوده و ۶۰ فرد سالم به‌عنوان گروه کنترل به‌طور تصادفی جمع‌آوری شد. DNA ژنومی جدا شد و PCR با استفاده از پرایمرهای ناحیه ITS۲ rDNA انجام شد. تحقیقات ما با نهایت دقت انجام شد، همانطور که توسط توالی یابی DNA مشخص می شود که ارتباط ژنتیکی و تغییرات rDNA (ITS۲) در بین جدایه های E. vermicularis را تعیین می کند. سپس توالی‌ها با توالی‌های NCBI-BLAST برای همولوژی ژنتیکی و تجزیه و تحلیل تنوع مقایسه شدند و از دقت و قابلیت اطمینان نتایج اطمینان حاصل کردند.</div> <div style="direction:rtl">یافته ها:  در آزمایش مولکولی، ۳۲ نمونه از ۵۶ نمونه برای ژن ITS۲ E.vermicularis مثبت بودند. درصد هویت ایزوله های محلی E.vermicularis IQN.۱-۱۰ با موارد موجود در همسانی پایگاه داده NCBI-BLAST از ۹۹.۵۴% تا ۹۹.۵۶% متغیر بود. تجزیه و تحلیل تنوع ژنتیکی سه حذف و جهش جانشینی را با درصد تغییرات کلی ۰.۴۴٪ تا ۰.۴۶٪ نشان داد. این یافته‌ها نه تنها درک عمیق‌تری از E. vermicularis ارائه می‌دهند، بلکه نویدبخش توسعه استراتژی‌های مؤثرتری برای مدیریت انتروبیازیس هستند که به آینده امیدوار می‌شوند.</div> <div style="direction:rtl">نتیجه‌گیری:  نتایج حاکی از دقت بالای تشخیص مولکولی و اهمیت ITS۲ به عنوان مهم ترین نشانگر ژنتیکی به دلیل ماهیت بسیار حفاظت شده آن است. این داده‌های جدید روی ژنوتیپ‌های E.vermicularis از عراق منعکس‌کننده تنوع هستند و بنابراین مطالعات مولکولی بیشتری را در سراسر عراق برای در نظر گرفتن مؤثر چشم‌انداز ژنتیکی و کمک به اقدامات تشخیصی و کنترلی ضروری می‌سازند.</div> Background and Aim: Enterobius vermicularis (E. vermicularis) is a parasitic nematode infecting humans, mainly children, with a prevalence rate above 35% in some countries. Its molecular studies are still scant. Precise diagnosis and understanding of genetic variation are essential in managing enterobiasis. This study used DNA sequencing and phylogenetic analysis to detect E. vermicularis by genetic variation in the internal transcribed spacer 2 (ITS2) gene. Materials and Methods: Stool samples were collected randomly from 56 infected patients and 60 healthy individuals as the control group. Genomic DNA was isolated, and PCR was done using primers against ITS2 region of rDNA. Our research was conducted with the utmost thoroughness, as evidenced by DNA sequencing determining the genetic associations and variations of rDNA (ITS2) among E. vermicularis isolates. The sequences were then compared with NCBI-BLAST sequences for the genetic homology and variation analysis, ensuring the accuracy and reliability of the results. Results: In the molecular testing, 32 of the 56 samples were positive for the ITS2 gene of E. vermicularis. The percentage identity of local E. vermicularis IQN.1-10 isolates with those available in the NCBI-BLAST database homology ranged from 99.54% to 99.56%. The genetic variation analysis revealed three deletions and substitution mutations, with a total variation percentage of 0.44% to 0.46%. These findings not only provide a deeper understanding of E. vermicularis but also hold promise for the development of more effective strategies for managing enterobiasis, giving hope for the future. Conclusion: The results indicated high accuracy of the molecular diagnosis and the importance of ITS2 as the most important genetic marker due to its highly conserved nature. These new data on E. vermicularis genotypes from Iraq reflect the diversity and thus warrant further molecular studies across Iraq to effectively consider the genetic landscape and help in diagnostic and control measures. <div></div> تنوع ژنتیکی, فاصله‌گذار رونویسی داخلی, PCR, درخت فیلوژنتیک, rRNA Genetic Variation, Internal Transcribed Spacer, PCR, Phylogenetic Tree, rRNA 172 180 http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-2604-1&slc_lang=en&sid=1 Manar Karem Kadhim منار کریم کاظم manar.alsaedy@utq.edu.iq 100319475328460030725 100319475328460030725 No Thi-Qar Education Directorate, Nasiriyah, Iraq اداره آموزش و پرورش ثی قار، ناصریه، عراق Ruaa Majid Khazaal روآ مجید خزعل ruaa.m1982@stu.edu.iq 100319475328460030726 100319475328460030726 Yes Department of Medical Laboratory Techniques, Nasiriyah Technical Institute, Southern Technical University, Nasiriyah, Iraq گروه تکنیک های آزمایشگاهی پزشکی، موسسه فنی ناصریه، دانشگاه فنی جنوب، ناصریه، عراق Mohammed Hassan Flaih محمد حسن فلیح moh.alqurayshi@stu.edu.iq 100319475328460030727 100319475328460030727 No Department of Nursing Techniques, Nasiriyah Technical Institute, Southern Technical University, Nasiriyah, Iraq گروه فنون پرستاری، موسسه فنی ناصریه، دانشگاه فنی جنوب، ناصریه، عراق Khwam Reissan Hussein خوام ریسان حسین krhussein@stu.edu.iq 100319475328460030728 100319475328460030728 No Department of Nursing Techniques, Nasiriyah Technical Institute, Southern Technical University, Nasiriyah, Iraq گروه فنون پرستاری، موسسه فنی ناصریه، دانشگاه فنی جنوب، ناصریه، عراق