<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian Journal of Medical Microbiology</title>
<title_fa>مجله میکروب شناسی پزشکی ایران</title_fa>
<short_title>Iran J Med Microbiol</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://ijmm.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-8612</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2345-4342</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.30699/ijmm</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1402</year>
	<month>5</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2023</year>
	<month>8</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>17</volume>
<number>4</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>en</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>اپیدمیولوژی مولکولی جدایه های &lt;i&gt;Blastocystis&lt;/i&gt; spp در بندرعباس، جنوب ایران</title_fa>
	<title>Molecular Epidemiology of &lt;i&gt;Blastocystis&lt;/i&gt; spp. Isolates in Bandar Abbas, South of Iran</title>
	<subject_fa>انگل شناسی پزشکی</subject_fa>
	<subject>Medical Parasitology</subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Original Research Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;p style=&quot;font-style: normal; text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span class=&quot;sanspYW&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;زمینه و اهداف:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;گونه بلاستوسیستیس (&lt;em&gt;Blastocystis&lt;/em&gt; sp) &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;یک انگل روده ای بی هوازی تک سلولی با شیوع جهانی است که در دستگاه گوارش تحتانی انسان و بسیاری از حیوانات، مانند انواع متعددی از مهره داران یافت می شود. تا به امروز ۱۷ ژنوتیپ شناسایی شده است. ۹ مورد از این ژنوتیپ ها در انسان رایج است. ارگانیسم در افراد سالم و در معرض خطر یافت می شود، از این رو بیماری زایی آن بحث برانگیز است. هدف از این مطالعه بررسی فراوانی ژنوتیپ های گونه بلاستوسیستیس در بندرعباس، &amp;nbsp;ایران در سال &amp;nbsp;۲۰۲۲ بود.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span class=&quot;sanspYW&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;مواد و روش کار:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;در مجموع ۳۷۸ نمونه مدفوع از بیمارستان ها و مراکز بهداشتی درمانی بندرعباس، استان هرمزگان، ایران، جمع آوری شد. نمونه های مدفوع با روش مستقیم و فرمالین اتیل استات (غلظت) بررسی شدند. نمونه های مثبت برای گونه بلاستوسیستیس جداسازی و استخراج &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;DNA&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt; انجام شد. تمام &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;DNA&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt; استخراج&#8204;شده از نمونه ها برای اطمینان از کمیت و کیفیت توسط نانودراپ تجزیه و تحلیل شدند. برای شناسایی ژنوتیپ های انگل از تکنیک &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt; استفاده شد و تمام نمونه ها برای تایید ژنوتیپ، توالی یابی شدند.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span class=&quot;sanspYW&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;یافته ها:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;در نهایت ۱۴ نمونه از نظر میکروسکوپی مثبت و ۸ نمونه با روش &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt; تایید شدند. ژنوتیپ های جدا شده شامل ۴ نمونه &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;ST۱ (۵۰%)&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;، ۳ &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;ST۳&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt; (۳۷.۵%) و یک &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;ST۲&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt; (۱۲.۵%) بودند. تمام نمونه های منفی و مثبت ۳ بار برای تایید صحت آنالیز شدند.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span class=&quot;sanspYW&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;نتیجه&#8204;گیری:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;بلاستوسیستیس شایع ترین انگل تک یاخته ای روده انسان است که با وجود مطالعات انجام شده، ابهامات زیادی در مورد بیماری زایی آن وجود دارد. طراحی مطالعه فعلی و انجام &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt;آن&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:107%&quot;&gt; در طی همه گیر کووید-۱۹ و بیماران مثبت کمتر ممکن است با ملاحظات شدید بهداشتی و مصرف آنتی بیوتیک های مختلف در بین جمعیت مرتبط باشد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Background and Aim:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:200%&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:200%&quot;&gt;&lt;i&gt;Blastocystis &lt;/i&gt;spp.&lt;i&gt; &lt;/i&gt;is an anaerobic, single-celled intestinal parasite with global prevalence that is found in the lower digestive tract of humans and many animals, such as numerous types of vertebrates. To date, 17 genotypes have been identified. Nine of these genotypes are common in humans. Organism is found in both healthy and compromised individuals, hence its pathogenicity is controversial. The aim of this study was to investigate the frequency of &lt;i&gt;Blastocystis&lt;/i&gt; spp. genotypes in Bandar Abbas, Iran during 2022.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Materials and Methods:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:200%&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:200%&quot;&gt;Totally, 378 stool samples were collected from hospitals and health centers of Bandar Abbas, Hormozgan province, Iran. Stool samples examined by direct and formalin ethyl acetate (concentration) methods. Positive samples for &lt;i&gt;Blastocystis&lt;/i&gt; spp. isolated and DNA extraction was done. All extracted DNA specimens analyzed by nanoDrop to ensure about quantity and quality. The PCR technique was used to identify parasite genotypes and all samples were sequenced for genotype confirmation.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Results:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:200%&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:200%&quot;&gt;Finally 14 samples detected as positive microscopically and 8 samples confirmed by PCR. Identified isolated genotypes were 4 samples ST1 (50%), 3 ST3 (37.5%), and one ST2 (12.5%). All negative and positive samples analyzed 3 times to confirm accuracy.&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Conclusion:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:150%&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:150%&quot;&gt;&lt;i&gt;Blastocystis&lt;/i&gt; sp. is the most common protozoan parasite of the human intestine, which despite the studies, there are many uncertainties about its pathogenicity.&amp;nbsp; The current study was designed and carried out during the Covid-19 pandemic and lower positive patients may be related to severe hygiene considerations and consumption of various antibiotics amongst the population.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;/p&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;div&gt;&lt;/div&gt;&lt;/p&gt;</abstract>
	<keyword_fa>Blastocystis sp., ژنوتیپ, اپیدمیولوژی مولکولی, آنالیز فیلوژنتیک, زیرتایپ</keyword_fa>
	<keyword>Blastocystis sp., genotype, Molecular epidemiology, Phylogenetic analysis, Subtyping</keyword>
	<start_page>441</start_page>
	<end_page>446</end_page>
	<web_url>http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-2238-1&amp;slc_lang=en&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Zahra</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Rajaei</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>زهرا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>رجایی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>m.rajaei.z92@gmail.com</email>
	<code>100319475328460026099</code>
	<orcid>100319475328460026099</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Molecular Medicine Research Center, Hormozgan Health Institute, Hormozgan University of Medical Sciences, Bandar Abbas, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات پزشکی مولکولی، پژوهشکده سلامت هرمزگان، دانشگاه علوم پزشکی هرمزگان، بندرعباس، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Abbas</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Farahani</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>عباس</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>فراهانی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>abbasfarahani25@yahoo.com</email>
	<code>100319475328460026100</code>
	<orcid>100319475328460026100</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Molecular and Medicine Research Center, Khomein University of Medical Sciences, Khomein, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات پزشکی و مولکولی، دانشکده علوم پزشکی خمین، خمین، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Habibollah</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Turki</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>حبیب اله</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>ترکی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>H.bastaki@yahoo.com</email>
	<code>100319475328460026101</code>
	<orcid>100319475328460026101</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Molecular Medicine Research Center, Hormozgan Health Institute, Hormozgan University of Medical Sciences, Bandar Abbas, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات پزشکی مولکولی، پژوهشکده سلامت هرمزگان، دانشگاه علوم پزشکی هرمزگان، بندرعباس، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Saeed</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Shoja</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سعید</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>شجاع</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>shojasaeed@gmail.com</email>
	<code>100319475328460026102</code>
	<orcid>100319475328460026102</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Infectious and Tropical Diseases Research Center, Hormozgan Health Institute, Hormozgan University of Medical Sciences, Bandar Abbas, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات بیماری‌ های عفونی و گرمسیری، پژوهشکده سلامت هرمزگان، دانشگاه علوم پزشکی هرمزگان، بندرعباس، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Amin</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Ghanbarnejad</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>امین</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>قنبرنژاد</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>aghanbarnejad@hums.ac.ir</email>
	<code>100319475328460026103</code>
	<orcid>100319475328460026103</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Social Determinants in Health Promotion Research Center, Hormozgan Health Institute, Hormozgan University of Medical Sciences, Bandar Abbas, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات عوامل اجتماعی در ارتقاء سلامت، پژوهشکده سلامت هرمزگان، دانشگاه علوم پزشکی هرمزگان، بندرعباس، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Hamed</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Kamali</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>حامد</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>کمالی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>hamedkamali0698@gmail.com</email>
	<code>100319475328460026104</code>
	<orcid>100319475328460026104</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Molecular Medicine Research Center, Hormozgan Health Institute, Hormozgan University of Medical Sciences, Bandar Abbas, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات پزشکی مولکولی، پژوهشکده سلامت هرمزگان، دانشگاه علوم پزشکی هرمزگان، بندرعباس، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Jebreil</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Shamseddin</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>جبرئیل</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>شمس الدین</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>Shams.jebreil@gmail.com</email>
	<code>100319475328460026105</code>
	<orcid>100319475328460026105</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Molecular Medicine Research Center, Hormozgan Health Institute, Hormozgan University of Medical Sciences, Bandar Abbas, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات پزشکی مولکولی، پژوهشکده سلامت هرمزگان، دانشگاه علوم پزشکی هرمزگان، بندرعباس، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
