<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian Journal of Medical Microbiology</title>
<title_fa>مجله میکروب شناسی پزشکی ایران</title_fa>
<short_title>Iran J Med Microbiol</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://ijmm.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-8612</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2345-4342</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.30699/ijmm</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1401</year>
	<month>10</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2023</year>
	<month>1</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>17</volume>
<number>1</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>en</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>شناسایی و بررسی ژن های nan1 و tox A سودوموناس آئروژینوزا در ایزوله‌های بیماران اوتیت میانی به‌ عنوان عوامل بیماری‌ زا</title_fa>
	<title>Detection and Study &lt;i&gt;nan1&lt;/i&gt; and &lt;i&gt;tox A&lt;/i&gt; genes of &lt;i&gt;Pseudomonas aeruginosa&lt;/i&gt; in Isolates from Otitis Media Patients Considered as Virulence Factors</title>
	<subject_fa>میکروب شناسی مولکولی</subject_fa>
	<subject>Molecular Microbiology</subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Original Research Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;p style=&quot;font-style: normal; text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span class=&quot;sanspYW&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;زمینه و اهداف:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;اوتیت میانی (OM) یا التهاب گوش میانی یک بیماری التهابی است که در اثر عفونت باکتریایی مانند&lt;em&gt; سودوموناس آئروژینوزا&lt;/em&gt; (&lt;em&gt;P. aeruginosa&lt;/em&gt;) ایجاد می&#8204;شود که با فاکتورهای حدت ژنتیکی همراه است. این مطالعه با هدف شناسایی ژن&#8204;های nan۱ و tox A در &lt;em&gt;P. aeruginosa&lt;/em&gt; جدا شده از بیماران مبتلا به OM مزمن انجام شد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span class=&quot;sanspYW&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;مواد و روش کار:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;یکصد و سی بیمار OM از سپتامبر تا ژانویه ۲۰۲۱ از شهر پزشکی الصدر و بیمارستان عمومی الحکیم در استان نجف عراق برای جمع&#8204;آوری تعویض گوش انتخاب شدند. شناسایی اولیه به رنگ آمیزی گرم و آزمایشات بیوشیمیایی بستگی دارد. همچنین از سیستم Vitek ۲ برای شناسایی دیگر و بررسی مقاومت به آنتی بیوتیک ها استفاده کردیم. برای تکثیر ژن های مورد نیاز از واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR) استفاده شد. علاوه بر این، الکتروفورز ژل برای نشان دادن ژن های تکثیر شده انجام شد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span class=&quot;sanspYW&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;یافته ها:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;نتایج نشان داد که ۱۱۵ نمونه (۸۸/۴۶ درصد) نتیجه مثبت و ۱۵ نمونه (۱۱/۵۴ درصد) از نظر باکتری کشت منفی است. تنها ۴۹ (۴۲/۷۶ درصد) از ۱۱۵ نمونه بالینی تست &lt;em&gt;P. aeruginosa&lt;/em&gt; مثبت نشان دادند. با این حال، ژن toxA در ۶۷/۳ درصد از جدایه های &lt;em&gt;P. aeruginosa&lt;/em&gt;، در حالی که ژن nan۱ در ۳۸/۷۷ درصد از جدایه ها یافت می شود.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span class=&quot;sanspYW&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;نتیجه&#8204;گیری:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;یافته های ما نشان می دهد که &lt;em&gt;P. aeruginosa&lt;/em&gt; یکی از شایع ترین علل عفونت OM در بیماران عراقی است. اکثر جدایه های باکتری وجود ژن های nan۱ و tox A را نشان می دهند که شیوع بالایی از Tox A نسبت به nan۱ دارد. وجود این ژن ها یکی از عوامل بیماری زاست و احتمالاً تا حدودی مقاومت به آنتی بیوتیک ها را توضیح می دهد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:2;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Background and Aim:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;Otitis media (OM) or middle ear inflammation is an inflammatory disease caused by a bacterial infection such as &lt;i&gt;Pseudomonas aeruginosa (P. aeruginosa), &lt;/i&gt;provided with genetic virulence factors. This study aims to detect &lt;i&gt;nan1&lt;/i&gt; &lt;i&gt;and tox A&lt;/i&gt; genes of &lt;i&gt;P. aeruginosa&lt;/i&gt; isolated from chronic OM patients.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Materials and Methods:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;One hundred thirty OM patients were recruited from Al-Sader medical city and Al-Hakim general hospital in Najaf province from September to January 2021 to collect ear swaps. The Primary identification depends on Gram stain and biochemical tests. We also used Vitek 2 system to make another identification and examine resistance to antibiotics. A polymerase chain reaction (PCR) was used to amplify the required genes. Furthermore, gel electrophoresis was performed to show the amplified genes.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Results:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;The results have revealed that 115 samples (88.46%) give a positive result, while 15 samples (11.54%) are negative for culture bacteria. Only 49 (42.76 %) of the 115 clinical specimens showed positive tests for &lt;i&gt;P. aeruginosa&lt;/i&gt;.&lt;b&gt; &lt;/b&gt;However, the &lt;i&gt;toxA&lt;/i&gt; gene is found in 67.3% of &lt;i&gt;P. aeruginosa&lt;/i&gt; isolates, while the &lt;i&gt;nan1&lt;/i&gt; gene is found in 38.77 % of the isolates.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Conclusion:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;Our findings suggest that &lt;i&gt;P. aeruginosa&lt;/i&gt; is one of the most common causes of OM infection in Iraqi patients. Most bacterial isolates show the presence of &lt;i&gt;nan1&lt;/i&gt; and &lt;i&gt;tox A&lt;/i&gt; genes, with a high prevalence of &lt;i&gt;tox A&lt;/i&gt; than &lt;i&gt;nan1&lt;/i&gt;. The presence of these genes is one of the virulence factors and probably partly explains the resistance to antibiotics.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;/p&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;div&gt;&lt;/div&gt;&lt;/p&gt;</abstract>
	<keyword_fa>nan1, اوتیت میانی, سودوموناس آئروژینوزا, ژن های توکس A</keyword_fa>
	<keyword>nan1, otitis media, Pseudomonas aeruginosa, tox A genes</keyword>
	<start_page>81</start_page>
	<end_page>89</end_page>
	<web_url>http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-2001-3&amp;slc_lang=en&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Maryam R.</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Mansor</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مریم</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>ریاض منصور</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>mariam.riyadh@iunajaf.edu.iq</email>
	<code>100319475328460023833</code>
	<orcid>100319475328460023833</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Medical Laboratory Technology Department, College of Medical Technology, The Islamic University, Najaf, Iraq</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه فناوری آزمایشگاهی پزشکی، دانشکده فنی پزشکی، دانشگاه اسلامی، نجف، عراق</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Zainab Sabah</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>AL-Khalidi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>زینب صباح</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>عبد الامیر</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>Zainab.alkhalidi@iunajaf.edu.iq</email>
	<code>100319475328460023834</code>
	<orcid>100319475328460023834</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Medical Laboratory Technology Department, College of Medical Technology, The Islamic University, Najaf, Iraq</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه فناوری آزمایشگاهی پزشکی، دانشکده فنی پزشکی، دانشگاه اسلامی، نجف، عراق</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Estabraq Hassan</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Almuhanna</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>استبرق حسن</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>الموحنی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>Estabraqalmuhanna04@gmail.com</email>
	<code>100319475328460023835</code>
	<orcid>100319475328460023835</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Medical Laboratory Technology Department, College of Medical Technology, The Islamic University, Najaf, Iraq</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه فناوری آزمایشگاهی پزشکی، دانشکده فنی پزشکی، دانشگاه اسلامی، نجف، عراق</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Hiba Ridha</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Hussein</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>هبه رضا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>حسین</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>Heba.reda@iunajaf.edu.iq</email>
	<code>100319475328460023836</code>
	<orcid>100319475328460023836</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Medical Laboratory Technology Department, College of Medical Technology, The Islamic University, Najaf, Iraq</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه فناوری آزمایشگاهی پزشکی، دانشکده فنی پزشکی، دانشگاه اسلامی، نجف، عراق</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Abbas F.</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Almulla</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>عباس فاضل</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>الملا</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>abbass.chem.almulla1991@gmail.com</email>
	<code>100319475328460023837</code>
	<orcid>100319475328460023837</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Psychiatry, Faculty of Medicine, Chulalongkorn University, Bangkok, Thailand</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه روانپزشکی، دانشکده پزشکی، دانشگاه چولالانگکورن، بانکوک، تایلند</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Haider Ali</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Alnaji</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>حیدر علی</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>الناجی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>hgeoda995@gmail.com</email>
	<code>100319475328460023838</code>
	<orcid>100319475328460023838</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Medical Laboratory Technology Department, College of Medical Technology, The Islamic University, Najaf, Iraq</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه فناوری آزمایشگاهی پزشکی، دانشکده فنی پزشکی، دانشگاه اسلامی، نجف، عراق</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
