<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian Journal of Medical Microbiology</title>
<title_fa>مجله میکروب شناسی پزشکی ایران</title_fa>
<short_title>Iran J Med Microbiol</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://ijmm.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-8612</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2345-4342</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.30699/ijmm</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1392</year>
	<month>6</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2013</year>
	<month>9</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>7</volume>
<number>2</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>بررسی فاکتورهای ویرولانس، تعیین سروگروپ ها و مقاومت پادزیستی سویه‌های اشریشیا کلی یوروپاتوژن جداشده از کودکان مبتلا به پیلونفریت و التهاب مثانه</title_fa>
	<title>Characterization and study the antibiotic resistance of Uropathogenic Escherichia coli isolated from pediatrics with pyelonephritis and cystitis in Iran</title>
	<subject_fa>باکتری شناسی پزشکی </subject_fa>
	<subject>Medical Bacteriology</subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Original Research Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;div align=&quot;justify&quot; style=&quot;direction: rtl&quot;&gt;&lt;b&gt;زمینه و اهداف:&lt;/b&gt; سروگروپ ها و فاکتور های حدت &lt;i&gt;اشریشیا کلی&lt;/i&gt; نقش مهمی را در بروز علائم عفونت ادراری کودکان بازی می‌کنند. هدف از بررسی حاضر تعیین همزمان فراوانی فاکتور های حدت، سروگروپ ها و خصوصیات مقاومت پادزیستی باکتری &lt;i&gt;اشریشیا کلی&lt;/i&gt; یوروپاتوژنیک جداسازی شده از کودکان مبتلا به پیلونفریت و التهاب مثانه بود.
&lt;br&gt;&lt;b&gt;مواد و روش کار:&lt;/b&gt; در این مطالعه که در طی سال‌های 92-1391 انجام گرفت، 121 سویه اشریشیا کلی از نمونه‌های ادرار افراد مبتلا به پیلونفریت و التهاب مثانه، بستری‌شده در بیمارستان بقیه ا... (عج) تهران، جمع‌آوری شد. مقاومت پادزیستی سویه‌ها علیه 10 پادزیست رایج با استفاده از روش دیسک گذاری ساده ارزیابی شد. در نهایت با استفاده از پرایمرهای اختصاصی فاکتور های حدت، سروگروپ ها و ژن های کد کننده مقاومت پادزیستی، ارزیابی شدند.&lt;br&gt;&lt;b&gt;یافته‌ها: &lt;/b&gt;در جامعه نمونه‌ها، 09/45% پسران و 71/55% دختران بودند. بیش‌ترین فراوانی باکتری در پسران زیر 1 سال (42/71 %) و دختران 12-5 ساله (75%) دیده شد. فراوانی &lt;i&gt;اشریشیا کلی&lt;/i&gt; در کودکان مبتلا به ترتیب 55/55% و 89/44%، بود. سروگروپ های اصلی ردیابی شده در کودکان مبتلا به پیلونفریت، O1، O2، O4، O7 و  O25 و سروگروپ های اصلی ردیابی شده در کودکان مبتلا به التهاب مثانه، O16، O18، O75 و O22 بودند.
فاکتور های حدت در موارد پیلونفریت، pap (100%)، afa (5/97%)، sfa (95%)، hly 95% و cnf-1 5/92% و در موارد التهاب مثانه، fim (100%)، pap (7/72%)، afa 6/63% و hly 4/45%، بودند. ژن های کد کننده مقاومت پادزیستی علیه جنتامایسین (7/96%)، بتا لاکتام ها (به ترتیب 3/90 و 7/88%) و تتراسیکلین (2/82%)، بیش‌ترین فراوانی را در جدایه های باکتری داشتند. جدایه های &lt;i&gt;اشریشیا کلی&lt;/i&gt; بیش‌ترین مقاومت پادزیستی را علیه پادزیست جنتامایسین (1/95%) و آمپی‌سیلین (9/91%)، داشتند.
&lt;br&gt;&lt;b&gt;نتیجه‌گیری:&lt;/b&gt; در بررسی حاضر تنها 4/6% از جدایه ها به پادزیست ایمی پنم مقاوم بودند. در نتیجه این پادزیست می‌تواند انتخاب مناسبی برای درمان موارد مبتلا به عفونت های ادراری ناشی از &lt;i&gt;اشریشیا کلی&lt;/i&gt; باشد.

&lt;/div&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p dir=&quot;ltr&quot;&gt;&lt;strong&gt;Background:&lt;/strong&gt; A lot of children suffer from urinary infections which can lead to pyelonephritis and cystitis. The main cause of these infections is uropathogenic strains of &lt;em&gt;Escherichia coli&lt;/em&gt;.  Serogroups and virulence factors of this bacterium play an important role in occurrence of infection’s symptoms. Unfortunately, due to the occurrence of antibiotic resistances, common treatments are ineffective and costly. The aim of this study was to study the distribution of virulence factors, serogroups and antibiotic resistance properties of uropathogenic &lt;em&gt;Escherichia coli&lt;/em&gt; isolated from pediatrics with pyelonephritis and cystitis.&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;ltr&quot;&gt;&lt;strong&gt;Material and Methods: &lt;/strong&gt;In this study which was conducted during the year 2012 to 2013, 121 &lt;em&gt;Escherichia coli&lt;/em&gt; strains were isolated from boys (51 samples) and girls (70 samples) with pyelonephritis and cystitis impatient in Baqiat-alah Hospital, Tehran. Antibiotic resistance of the isolates against commonly used antibiotics in the cases of urinary infections was investigated using disk diffusion method. Finally, PCR reactions using specific primers were done in order to detect  virulence factors, serogroups and antibiotic resistance genes.&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;ltr&quot;&gt;&lt;strong&gt;Results: &lt;/strong&gt;Totally, 45.09% of boys and 55.71% of girls were positive for presence of uropathogenic&lt;em&gt; Escherichia coli&lt;/em&gt;. The highest distribution of bacterium was seen in less than one year old boys (71.42%) and 5-12 years old girls (75%). Results showed that the distribution of &lt;em&gt;Escherichia coli&lt;/em&gt; in children with pyelonephritis and cystitis were 55.55% and 44.89%, respectively. The most commonly detected serogroups in children with pyelonephritis were O1, O2, O4 and O7 while, the most commonly detected serogroups in children with cystitis were O1, O2, O6 and O16. The most frequent virulence factors in the cases of pyelonephritis were &lt;em&gt;pap&lt;/em&gt; (100%), &lt;em&gt;afa&lt;/em&gt; (97.5%), &lt;em&gt;sfa&lt;/em&gt; (95%), &lt;em&gt;hly&lt;/em&gt; (95%) and &lt;em&gt;cnf-1&lt;/em&gt; (92.5%) and their most frequent in the cases of cystitis were &lt;em&gt;fim&lt;/em&gt; (100%), &lt;em&gt;pap&lt;/em&gt; (72.7%), &lt;em&gt;afa&lt;/em&gt; (63.6%) and &lt;em&gt;hly&lt;/em&gt; (45.4%). The genes which encode antibiotic resistance against gentamicin (&lt;em&gt;aac(3)-IV&lt;/em&gt;) (96.7%), beta-lactams (&lt;em&gt;blaSHV&lt;/em&gt; and &lt;em&gt;CITM&lt;/em&gt;) (90.3% and 88.7%, respectively), tetracycline (&lt;em&gt;tetA&lt;/em&gt;) (82.2%), had the highest incidence in the bacterial isolates. &lt;em&gt;Escherichia coli &lt;/em&gt;isolates had the highest antibiotic resistance against gentamicin (95.1%), ampicillin (91.9%), amikacin (85.4%) and ciprofloxacin (83.8%).&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;ltr&quot;&gt;&lt;strong&gt;Discussion: &lt;/strong&gt;Determination of the antibiotic resistance pattern in uropathogenic&lt;em&gt; Escherichia coli&lt;/em&gt; isolated from children with urinary infections is important in each area or in hospital. Imipenem, due to its low antibiotic resistance, can be an effective drug for treatments of children with pyelonephritis and cystitis.&lt;/p&gt;

</abstract>
	<keyword_fa>کلمات کلیدی: اشریشیا کلی یوروپاتوژنیک, سروگروپ ها, فاکتور های حدت, خصوصیات مقاومت آنتی بیوتیکی, عفونت های ادراری, کودکان, ایران.</keyword_fa>
	<keyword>Uropathogenic Escherichia coli, Antibiotic resistance, Urinary infections.</keyword>
	<start_page>27</start_page>
	<end_page>39</end_page>
	<web_url>http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-31-1&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>banafshe</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>dormanesh</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>بنفشه</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>درمنش</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>banafshedormanesh@gmail.com</email>
	<code>10031947532846001792</code>
	<orcid>10031947532846001792</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Urology, AJA University of Medical Science, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه اورولوژی دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی آجا، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>reza</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>mirnejad</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>رضا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>میرنژاد</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>rmirnejad@yahoo.com</email>
	<code>10031947532846001793</code>
	<orcid>10031947532846001793</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>2Molecular Biology Research Center, Baqiat-alah University of Medical Science, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات بیولوژی مولکولی، دانشگاه علوم پزشکی بقیه ا...(عج)، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>ebrahim</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>khodaverdi dariyan</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>ابراهیم</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>خداوردی داریان</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>ebrahim_khodaverdi@yahoo.com</email>
	<code>10031947532846001794</code>
	<orcid>10031947532846001794</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>3Young Researchers and Elites Club, Islamic Azad University of Karaj, Karaj, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>باشگاه پژوهشگران جوان و نخبگان، دانشگاه آزاد اسلامی واحد کرج، کرج، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>hasan</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>momtaz</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>حسن</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>ممتاز</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>hasanmomtaz@gmail.com</email>
	<code>10031947532846001795</code>
	<orcid>10031947532846001795</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>4Associated Professor of Veterinary Microbiology, College of Veterinary Medicine, Islamic Azad University, Shahrekord Branch, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشیار گروه میکروبیولوژی، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد شهرکرد، شهرکرد، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>emad</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>yahaghi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>عماد</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>یاحقی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>emadyahaghi10@yahoo.com</email>
	<code>10031947532846001796</code>
	<orcid>10031947532846001796</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>5Young Researchers and Elites Club, North Tehran Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>5باشگاه پژوهشگران جوان و نخبگان، دانشگاه آزاد اسلامی واحد تهران شمال، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>farhad</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>safarpour dehkordi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>فرهاد</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>صفرپوردهکوردی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>farhadsafarpourdehkordi@gmail.com</email>
	<code>10031947532846001797</code>
	<orcid>10031947532846001797</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>6Young Researchers and Elites Club, Shahrekord Branch, Islamic Azad University, Shahrekord Branch, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>باشگاه پژوهشگران جوان و نخبگان، دانشگاه آزاد اسلامی واحد شهرکرد، شهرکرد، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Motahareh</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Pilevarzadeh</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مطهره </first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>پیله ورزاده</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846001798</code>
	<orcid>10031947532846001798</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa>7.	دانشگاه علوم پزشکی جیرفت، جیرفت، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
