<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian Journal of Medical Microbiology</title>
<title_fa>مجله میکروب شناسی پزشکی ایران</title_fa>
<short_title>Iran J Med Microbiol</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://ijmm.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-8612</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2345-4342</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.30699/ijmm</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1401</year>
	<month>7</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2022</year>
	<month>10</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>16</volume>
<number>6</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>en</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>طراحی کیت تشخیص Coxiella burneiti از بیماران مبتلا به اندوکاردیت عفونی با استفاده از PCR</title_fa>
	<title>Molecular Detection of Infectious Endocarditis (Coxiella burnetii) Bacteria from Selected Military Hospitals</title>
	<subject_fa>باکتری شناسی پزشکی </subject_fa>
	<subject>Medical Bacteriology</subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Original Research Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;p style=&quot;font-style: normal; text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span class=&quot;sanspYW&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;زمینه و اهداف:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Coxiella burnetii&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; عامل بیماری &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Query Fever&lt;/span&gt; است. &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Query Fever&lt;/span&gt; یک بیماری زئونوز و اندمیک با گسترش جهانی است. &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Query Fever&lt;/span&gt; در می&#8204;تواند به عنوان یک پنومونی یا اندوکاردیت ظاهر گردد. با توجه به فقدان آمار از درصد آلودگی به &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;C. burnetii&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; در بیمارستان&#8204;های ایران و همچنین مقاومت بسیار زیاد این باکتری، بررسی وجود آلودگی&#8204;های بیمارستانی به این باکتری حائز اهمیت می&#8204;گردد. هدف از این مطالعه تشخیص مولکولی باکتری&#8204;های &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;C. burnetii&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; ایجادکننده اندوکاردیت عفونی از بیمارستان&#8204;های ارتش بود.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p style=&quot;font-style: normal; text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span class=&quot;sanspYW&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;مواد و روش کار:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;نمونه&#8204;های اندوکاردیت کشت منفی از بیماران جمع&#8204;&#8204;آوری شد. &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt;، انجام گرفت و ژن&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Is۱۱۱۱ &lt;/span&gt;&amp;nbsp;تکثیر و جداسازی شد. نمونه&#8204;هایی اندوکاردیت تعیین توالی شدند. نمونه کنترل مثبت سنتز شد و درون وکتور &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PUC ۱۸&lt;/span&gt; آماده گردید. تعیین ویژگی برای باکتری&#8204;ها انجام گرفت و ژن کلون گردید. جهت تایید کلونینگ، کلنی &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt; انجام گرفت. پلاسمیدها، استخراج شدند و در نهایت حساسیت و حد تشخیص تعیین گردید.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p style=&quot;font-style: normal; text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span class=&quot;sanspYW&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;یافته ها:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;تعیین توالی نشان داد که نمونه&#8204;ها مربوط به باکتری&#8204;های &lt;em&gt;کلبیسلا پنومونیه&lt;/em&gt; بودند. به منظور بررسی ویژگی، هیچ باندی روی ژل آگارز مشاهده نگردید. این موضوع نشان&#8204;داد که پرایمرهای طراحی شده فقط به باکتری مورد نظر متصل می&#8204;شود. آخرین رقت پلاسمید با غلظت &amp;nbsp;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;ng/&amp;micro;l&lt;/span&gt;۷۰۰ که باند قابل تشخیصی را در روی ژل ایجاد نمود، &lt;sup&gt;۷-&lt;/sup&gt;۱۰ و کمترین تعداد کپی قابل تشخیص در &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR &lt;/span&gt;&amp;nbsp;برابر ۲۲ کپی محاسبه گردید.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p style=&quot;font-style: normal; text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span class=&quot;sanspYW&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;نتیجه&#8204;گیری:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;در سال&#8204;های اخیر تلاش زیادی برای توسعه روش&#8204;های مولکولی سریع و خاص برای تشخیص &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;C. burnetii&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; انجام شده است. به نظر می&#8204;رسد روش &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt; ابزار مفیدی است که ممکن است زمان تشخیص &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;C. burnetii&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; را در طول عفونت&#8204;های سیستمیک، مانند اندوکاریت کاهش دهد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Background and Aim:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;i&gt;Coxiella burnetii&lt;/i&gt; is a mandatory gram-negative and intracellular bacterium. The most common pathogens are Query Fever in humans and Coxiellosis in animals&lt;span dir=&quot;RTL&quot; lang=&quot;FA&quot;&gt;.&lt;/span&gt; Due to the variety of ways of infection and the lack of accurate, comprehensive, and reliable research, and the lack of statistics on the percentage of infection with &lt;i&gt;C. burnetiii&lt;/i&gt; and the high resistance of this bacterium in the environment, it is important to investigate the presence of nosocomial infections with this bacterium&lt;span dir=&quot;RTL&quot; lang=&quot;FA&quot;&gt;.&lt;/span&gt; Therefore, this study aimed to molecularly detect &lt;i&gt;C. burnetiii&lt;/i&gt; bacteria that cause infective endocarditis in military hospitals.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Materials and Methods:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;100 negatively cultured endocarditis specimens were collected for this purpose, and DNA was extracted from &lt;i&gt;C. burnetii&lt;/i&gt; with an extraction kit. Also, a PCR reaction was performed on the genome of negative control samples to evaluate the specificity of primers and determine the method&amp;#39;s specificity. After ligation steps, JM107 E. coli susceptible to calcium chloride was used to accept the plasmid containing the gene.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Results:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;In quantitative DNA analysis, its amount was calculated between 1.69 and 1.8. The last dilution of the PUC18 plasmid for &lt;i&gt;C. burnetii&lt;/i&gt; with an initial concentration of 700 ng / &amp;micro;l, which formed a detectable band on the gel, was calculated to be 7-10, and the minimum number of detectable copies in a 25 &amp;mu;L PCR reaction equal to 22 copies.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Conclusion:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;Although &lt;i&gt;C. burnetii&lt;/i&gt; was not detected in any of the blood samples in this study. However, &lt;i&gt;C. burnetii&lt;/i&gt; has a broad and varied host spectrum in the Epizootic and Enzootic foci.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;/p&gt;

&lt;div style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;div&gt;&lt;/div&gt;&lt;/div&gt;</abstract>
	<keyword_fa>کوکسیلا بورنتی, PCR, تب کوئری</keyword_fa>
	<keyword>Coxiella burnetii, PCR, Query fever</keyword>
	<start_page>594</start_page>
	<end_page>600</end_page>
	<web_url>http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-1936-2&amp;slc_lang=en&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Ashkan</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Dirbazian</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>اشکان</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>دیربازیان</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>ghadir02017@gmail.com</email>
	<code>100319475328460022494</code>
	<orcid>100319475328460022494</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Infectious Diseases Research Center, AJA University of Medical Sciences, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات بیماری‌های عفونی، دانشگاه علوم پزشکی آجا، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mohammad</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Soleimani</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمد</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>سلیمانی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>Soleimanidor@yahoo.com</email>
	<code>100319475328460022495</code>
	<orcid>0000000282709499</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, Faculty of Medicine, AJA University of Medical Sciences, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروب شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی آجا، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Seyyed Hossein</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Mousavi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سید حسین</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>موسوی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>dr.shmusavi@yahoo.com</email>
	<code>100319475328460022496</code>
	<orcid>100319475328460022496</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Cardiology, School of Medicine, AJA University of Medical Sciences, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه قلب و عروق، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی آجا، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mohammad</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Aminianfar</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمد</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>امینیان فر</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>m.b9854@yahoo.com</email>
	<code>100319475328460022497</code>
	<orcid>100319475328460022497</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Infectious Disease, School of Aerospace and Subaquatic Medicine, Beasat Hospital, AJA University of Medical Sciences, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه بیماری‌های عفونی، دانشکده هوافضا و پزشکی زیر سطحی، بیمارستان بعثت، دانشگاه علوم پزشکی آجا، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Rohollah</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Mirjani</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>روح اله</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>میرجانی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>mirjani.r@gmail.com</email>
	<code>100319475328460022498</code>
	<orcid>100319475328460022498</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Genetics and Advanced Medical Technology, Faculty of Medicine, AJA University of Medical Sciences, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه ژنتیک و فناوری پیشرفته پزشکی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی آجا، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mehran</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Khoshfetrat</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مهران</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>خوش فطرت</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>mhrn.khoshfetrat@gmail.com</email>
	<code>100319475328460022499</code>
	<orcid>100319475328460022499</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Cardiology, School of Medicine, AJA University of Medical Sciences, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه قلب و عروق، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی آجا، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Monireh</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Kamali</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>منیره</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>کمالی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>mklk59@gmail.com</email>
	<code>100319475328460022500</code>
	<orcid>100319475328460022500</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Cardiovascular Medical and Research Center, Iran University of Medical Sciences, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات پزشکی و قلب و عروق، دانشگاه علوم پزشکی ایران، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
