<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian Journal of Medical Microbiology</title>
<title_fa>مجله میکروب شناسی پزشکی ایران</title_fa>
<short_title>Iran J Med Microbiol</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://ijmm.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-8612</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2345-4342</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.30699/ijmm</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1401</year>
	<month>10</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2023</year>
	<month>1</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>17</volume>
<number>1</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>en</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>فراوانی ژن‌های تولیدکننده بتالاکتاماز طیف گسترده مرتبط در باکتری‌های گرم منفی جدا شده از بیماران عفونی شهر کرمانشاه (2019-2020)</title_fa>
	<title>Frequency of Extended-Spectrum Beta-Lactamase-producing Genes associated in gram-negative bacteria isolated from infectious patients in Kermanshah (2019-2020)</title>
	<subject_fa>باکتری شناسی پزشکی </subject_fa>
	<subject>Medical Bacteriology</subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Original Research Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;p style=&quot;font-style: normal; text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span class=&quot;sanspYW&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;زمینه و اهداف:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:150%&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;عفونت های بیمارستانی ناشی از باکتری های مقاوم به آنتی بیوتیک و همچنین گسترش سریع آن ها به عنوان یکی از تهدیدات سلامت عمومی محسوب می شود. هدف این مطالعه تعیین فراوانی ژن&#8204;های کدکننده بتالاکتاماز طیف گسترده&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt; (ESBL)&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;در باکتری&#8204;های گرم منفی بود&lt;/span&gt;.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span class=&quot;sanspYW&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;مواد و روش کار:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:150%&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;شناسایی و الگوی حساسیت آنتی بیوتیکی ۱۶۵ ایزوله به ترتیب با روش بیوشیمیایی و دیسک دیفیوژن انجام شد. علاوه بر این، غربالگری و تایید حضور ژن&#8204;های&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt; ESBL &lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;به روش تست ترکیبی دوتایی&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt; (DDCT) &lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;انجام شد. وجود ژن های کدکننده&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt; ESBL &lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;در هر ایزوله با روش واکنش زنجیره ای پلیمراز&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt; (PCR) &lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;شناسایی شد&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span class=&quot;sanspYW&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;یافته ها:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:150%&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;از ۱۶۵ ایزوله، ۸۳ سویه به تمام آنتی بیوتیک ها مقاوم بودند&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;.&lt;/span&gt; &lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;کمترین فراوانی مقاومت در مقابل جنتامایسین و همچنین بیشترین فراوانی مقاومت در سفوتاکسیم و سفازولین مشاهده شد.&lt;/span&gt; &lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;از بین تمامی سویه های مورد تجزیه و تحلیل، ۵۰ (&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;۳۰/۳۰%&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;) و ۸۰ (۴۸/۴۸%) ایزوله به ترتیب از نظر فنوتیپی و ژنوتیپی&lt;/span&gt; &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;ESBL &lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;مثبت بودند. شایع ترین ژن های کد کننده&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt; ESBL &lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;به ترتیب&lt;/span&gt; &lt;i&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;SHVOS&lt;/span&gt;&lt;/i&gt; &lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;و&lt;/span&gt; &lt;i&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;SHV-۱&lt;/span&gt;&lt;/i&gt; &lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;با فراوانی ۳۴ (۶۱/۲۰ %) و ۳۶ (۸۲/۲۱%) بودند&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span class=&quot;sanspYW&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;نتیجه&#8204;گیری:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:150%&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;فراوانی تولید&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt; ESBL &lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;و شیوع بالای ژن&#8204;های&lt;/span&gt; &lt;i&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;blaSHV&lt;/span&gt;&lt;/i&gt; &lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;و&lt;/span&gt; &lt;i&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;blaCTX-M&lt;/span&gt;&lt;/i&gt; &lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;در کلبسیلا پنومونیه و اشریشیا کلی در ایزوله&#8204;های باکتریایی ذکر شده در کرمانشاه رو به افزایش است.&lt;/span&gt; &lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;اما برخلاف برخی گزارش&#8204;های قبلی از کرمانشاه، شیوع ژن&#8204;های کدکننده&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt; ESBL &lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;در سودوموناس آئروژینوزا کم بود و ژن&lt;/span&gt; &lt;i&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;blaVEB&lt;/span&gt;&lt;/i&gt; &lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;یافت نشد&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:2;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Background and Aim:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;Nosocomial infections caused by antibiotic-resistant bacteria and their rapid spread threaten public health. This study aimed to determine the frequency of genes encoding Extended-Spectrum Beta-Lactamase (ESBL) in gram-negative bacteria in Kermanshah city, west of Iran.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Materials and Methods:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;Identification and antibiotic susceptibility pattern of 165 isolates were performed by biochemical and disk diffusion methods, respectively. Screening and confirming the presence of ESBL genes were performed according to the double disk combination test (DDCT) method. The presence of genes encoding ESBL in each isolate was identified by Polymerase Chain Reaction (PCR) method.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Results:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;Out of 165 isolates, 83 strains were resistant to all antibiotics. The lowest frequency of resistance was observed for Gentamicin, while the highest frequency was observed for Cefotaxime and Cefazolin. Among all strains, 50 (30.30 %) and 80 (48.48%) isolates were phenotypically and genotypically ESBL-positive, respectively. The most prevalent genes encoding ESBL were &lt;i&gt;SHVOS&lt;/i&gt; and &lt;i&gt;SHV-1,&lt;/i&gt; with a frequency of 20.61 % and 21.82 %, respectively.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Conclusion:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;The frequency of producing ESBL bacteria and the prevalence of &lt;i&gt;blaSHV&lt;/i&gt; and &lt;i&gt;blaCTX-M&lt;/i&gt; genes in our studied &lt;i&gt;Klebsiella pneumoniae&lt;/i&gt; and &lt;i&gt;Escherichia coli&lt;/i&gt; isolates were high. However, unlike some previous reports from Kermanshah, the prevalence of ESBL-encoding genes in &lt;i&gt;Pseudomonas aeruginosa&lt;/i&gt; was low, and the &lt;i&gt;blaVEB&lt;/i&gt; gene was not found.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;/p&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;div&gt;&lt;/div&gt;&lt;/p&gt;</abstract>
	<keyword_fa>مقاومت آنتی بیوتیکی, ژن های کد کنندهESBL, انتروباکتریاسه تولید کنندهESBL, فراوانی</keyword_fa>
	<keyword>Antibiotic resistance, ESBL-encoding genes, ESBL-producing Enterobacteriaceae, Frequency</keyword>
	<start_page>39</start_page>
	<end_page>49</end_page>
	<web_url>http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-1383-3&amp;slc_lang=en&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Sepide</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Kadivarian</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سپیده</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>کدیوریان</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>sepide.kadivarian@yahoo.com</email>
	<code>100319475328460023799</code>
	<orcid>0000000202334261</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, School of Medicine, Kermanshah University of Medical Sciences, Kermanshah, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروب شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی کرمانشاه، کرمانشاه، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Somayeh</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Hosseinabadi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سمیه</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>حسین آبادی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>s.hosseinabadi83@gmail.com</email>
	<code>100319475328460023800</code>
	<orcid>000000016552927X</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, School of Medicine, Kermanshah University of Medical Sciences, Kermanshah, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروب شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی کرمانشاه، کرمانشاه، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Ramin</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Abiri</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>رامین</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>عبیری</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>ramin_abiri@yahoo.com</email>
	<code>100319475328460023801</code>
	<orcid>0000000246572413</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, School of Medicine, Fertility and Infertility Research Center, Research Institute for Health Technology, Kermanshah University of Medical Sciences, Kermanshah, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات باروری و ناباروری، پژوهشکده فناوری سلامت، دانشگاه علوم پزشکی کرمانشاه، کرمانشاه، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Sara</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Kooti</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سارا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>کوتی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>sara.kooti@yahoo.com</email>
	<code>100319475328460023802</code>
	<orcid>0000000181534239</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Behbahan Faculty of Medical Sciences, Behbahan, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشکده علوم پزشکی بهبهان، بهبهان، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Amirhooshang</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Alvandi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>امیرهوشنگ</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>الوندی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>ah_alvandi@kums.ac.ir</email>
	<code>100319475328460023803</code>
	<orcid>0000000249632485</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, School of Medicine, Medical Technology Research Center, Research Institute for Health Technology, Kermanshah University of Medical Sciences, Kermanshah, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات تکنولوژی پزشکی، پژوهشکده فناوری سلامت، دانشگاه علوم پزشکی کرمانشاه علوم، کرمانشاه، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
