<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian Journal of Medical Microbiology</title>
<title_fa>مجله میکروب شناسی پزشکی ایران</title_fa>
<short_title>Iran J Med Microbiol</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://ijmm.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-8612</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2345-4342</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.30699/ijmm</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1401</year>
	<month>10</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2023</year>
	<month>1</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>17</volume>
<number>1</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>en</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>تنوع در پروتکل های تشخیصی تب روده و توصیه برای استاندارد مرجع کامپوزیتی</title_fa>
	<title>Diversity in Enteric Fever Diagnostic Protocols and Recommendation for Composite Reference Standard</title>
	<subject_fa>باکتری شناسی پزشکی </subject_fa>
	<subject>Medical Bacteriology</subject>
	<content_type_fa>مقاله مروری</content_type_fa>
	<content_type>Systematic Review</content_type>
	<abstract_fa>&lt;p style=&quot;font-style: normal; text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span class=&quot;sanspYW&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;زمینه و اهداف:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:150%&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;تب روده به دلیل عدم وجود روش&#8204;های تشخیصی قاطع، باعث مشکلات جدی سلامتی و مرگ و میر و ناخوشی قابل توجهی در سطح جهان می&#8204;شود. توانایی روشی که اغلب استفاده می شود برای تأیید عدم وجود تب روده قابل بحث است. این مطالعه با هدف ارزیابی ویژگی و حساسیت تشخیص تیفوئید برای ایجاد تکنیک&#8204;های تشخیصی بسیار دقیق و توصیه مرجع کامپوزیتی استاندارد شده مناسب انجام &lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;&amp;nbsp;شد&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span class=&quot;sanspYW&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;مواد و روش کار:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:150%&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;مقالات منتشر شده در نمایه های Google Scholar، MEDLINE و PubMed برای یافته های بیمارستانی بررسی شدند. برای تعیین تفاوت در میانگین درصد ویژگی و حساسیت، از آزمون تی مستقل استفاده شده است.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span class=&quot;sanspYW&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;یافته ها:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;از ۴۳۲ مقاله شناسایی شده در این مطالعه، ۵۳ مقاله در تجزیه و تحلیل استفاده شد. نتایج حاصل نشان می&#8204;دهد که تکنیک&#8204;های &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; lang=&quot;EN-GB&quot;&gt;Widal&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt; دقت متوسطی را با درصد میانگین ویژگی (۵۵%)، حساسیت (۵۳/۸%)، ارزش اخباری مثبت ۵۷/۸% و ارزش اخباری منفی ۵۵/۶% در مقایسه با ۲۸%، ۲۹/۴%، ۲۹/۵% نشان می&#8204;دهند. و ۲۷/۸% از &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; lang=&quot;EN-GB&quot;&gt;Typhidot&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt; به ترتیب ۳۴/۴ درصد از مطالعات از طرح مطالعه آینده نگر استفاده کردند. نتایج نشان داد که بین حساسیت تیفیدوت و ویدال در &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; lang=&quot;EN-GB&quot;&gt;p&lt;۰.۰۵&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt; ارتباط آماری معنی&#8204;داری وجود دارد. این یافته همچنین آزمایش&#8204;های تشخیصی تب روده&#8204;ای مانند بیومارکرهای پروتئین، بیومارکرهای متابولیت، بیومارکرهای اسید نوکلئیک و ژنومیک را ارائه کرد. آنتی ژن هایی که به طور منظم مورد سنجش قرار می گیرند لیپوپلی ساکاریدها (&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; lang=&quot;EN-GB&quot;&gt;LPS&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt;) و همولیزین &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; lang=&quot;EN-GB&quot;&gt;E (HlyE)&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt; هستند. بیشترین ویژگی ۹۶ درصد و حساسیت ۹۶ درصد در آنتی &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; lang=&quot;EN-GB&quot;&gt;LPS IgA&lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot;&gt; به دست آمد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span class=&quot;sanspYW&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;نتیجه&#8204;گیری:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:150%&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span lang=&quot;FA&quot;&gt;بر اساس نتایج به دست آمده، توصیه می شود که از روش کشت خون و ویدال با حساسیت ۶۰ درصد و ۵۳/۸ درصد به عنوان استاندارد مرجع کامپوزیتی هماهنگ شده برای تشخیص تب روده برای بهبود و ارزیابی شیوع استفاده شود.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p style=&quot;font-style: normal; text-align: justify;&quot;&gt;&lt;/p&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;line-height:2;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Background and Aim:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span lang=&quot;EN-GB&quot;&gt;Enteric fever causes serious health problem and brings about significant death and ill health globally because of the absence of decisive diagnostic techniques. The ability of frequently used assay to authenticate the absence of enteric fever is debatable. This research study aimed to appraise the specificity and sensitivity of typhoid diagnosis for establishing highly accurate diagnostic techniques and to recommend appropriate standardized composite reference.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Materials and Methods:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span lang=&quot;EN-GB&quot;&gt;Published articles indexed in Google scholar, MEDLINE and PubMed were reviewed for hospital-based findings. Independent sample &lt;i&gt;t&lt;/i&gt;-test was utilized to ascertain differences in mean percentage specificity and sensitivity.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Results:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span lang=&quot;EN-GB&quot;&gt;From the 432 articles identified in this study, 53 were used in the analysis. The result outcome reveals that, Widal techniques show &lt;/span&gt;moderate accuracy &lt;span lang=&quot;EN-GB&quot;&gt;with percentage average specificity (55%), sensitivity (53.8%), positive predictive value of 57.8% and negative predictive value of 55.6% in comparison to 28%, 29.4%, &amp;nbsp;29.5%, and 27.8% of Typhidot &amp;nbsp;respectively. 34.4% of the studies used prospective study design. The results revealed a statistically significant association in the sensitivity between Typhidot and Widal at &lt;i&gt;p&lt;/i&gt;&lt;0.05&lt;/span&gt;. &lt;span lang=&quot;EN-GB&quot;&gt;The finding also presented emerging enteric fever diagnostic tests such as protein biomarkers, metabolite biomarkers, nucleic acid biomarkers and genomics. Antigens that were regularly assayed are &lt;/span&gt;lipopolysaccharides (LPS) and hemolysin E (HlyE). &amp;nbsp;Highest specificity of 96% and sensitivity of 96% was obtained in anti-LPS IgA.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Conclusion:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span lang=&quot;EN-GB&quot;&gt;Based on the result outcome, it is recommended that, blood culture and Widal techniques having sensitivity of 60% and 53.8% respectively be used as a harmonized composite reference standard for enteric fever diagnosis to improve prevalence appraisals.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;/p&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;div&gt;&lt;/div&gt;&lt;/p&gt;</abstract>
	<keyword_fa>تب حصبه, تشخیصی, متابولومیک, استاندارد مرجع کامپوزیت, دقت, حساسیت</keyword_fa>
	<keyword>Typhoid fever, Lipopolysaccharides, Metabolomics, Composite reference standard, Biomarkers, Sensitivity</keyword>
	<start_page>22</start_page>
	<end_page>38</end_page>
	<web_url>http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-1838-1&amp;slc_lang=en&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Bernard Egwu</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Igiri</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>برنادو اگوو</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>ایگیری</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>egwubernard2@gmail.com</email>
	<code>100319475328460023785</code>
	<orcid>0000000312991705</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Directorate of Research and Development, Nigerian Institute of Leather and Science Technology, Zaria, Nigeria</affiliation>
	<affiliation_fa>اداره تحقیق و توسعه، موسسه چرم و فناوری علوم نیجریه، زاریا، نیجریه</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Stanley Irobekhian Reuben</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Okoduwa</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>استانلی ایرابِخ</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>اوکوداوا</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>siroplc@gmail.com</email>
	<code>100319475328460023786</code>
	<orcid>000000023542495X</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Directorate of Research and Development, Nigerian Institute of Leather and Science Technology, Zaria, Nigeria</affiliation>
	<affiliation_fa>اداره تحقیق و توسعه، موسسه چرم و فناوری علوم نیجریه، زاریا، نیجریه</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Shaibu Ahmed</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Munirat</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>شعیبو احمد</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>مونیرات</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>ozohurasta2017@gmail.com</email>
	<code>100319475328460023787</code>
	<orcid>0000000344843993</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, Ahmadu Bello University, Zaria, Nigeria</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروبیولوژی، دانشگاه احمدو بلو، زاریا، نیجریه</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Iquo Bassey</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Otu-Bassey</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>اُی کیو بَسِی</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>اُتو-بَسِی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>iquobasseyotu@gmail.com</email>
	<code>100319475328460023788</code>
	<orcid>0000000154943360</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Medical Laboratory Sciences, University of Calabar, Calabar, Nigeria</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه علوم آزمایشگاهی پزشکی، دانشگاه کالابار، کالابار، نیجریه</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Abdullahi</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Bashir</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>عبداللهی</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>بشیر</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>albishir13@yahoo.com</email>
	<code>100319475328460023789</code>
	<orcid>0000000219573912</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, Ahmadu Bello University, Zaria, Nigeria</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروبیولوژی، دانشگاه احمدو بلو، زاریا، نیجریه</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Otori Mercy</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Onyiyioza</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>اُتوری</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>اّنی یواُزا</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>otorimercy@yahoo.com</email>
	<code>100319475328460023790</code>
	<orcid>0000000150194606</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, Ahmadu Bello University, Zaria, Nigeria</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروبیولوژی، دانشگاه احمدو بلو، زاریا، نیجریه</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Idongesit Asuquo</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Enang</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>ایدُنگِسیت آسوکیو</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>اِنانگ</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>idongenang@gmail.com</email>
	<code>100319475328460023791</code>
	<orcid>0000000218708985</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Industrial and Environmental Pollution Department, National Research Institute for Chemical Technology, Zaria, Nigeria</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه آلودگی صنعتی و محیطی، موسسه ملی تحقیقات فناوری شیمیایی، زاریا، نیجریه</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Ugochi Judith</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Okoduwa</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>اوگُچی جودیث</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>اُکُدو وا</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>judithsplendour@gmail.com</email>
	<code>100319475328460023792</code>
	<orcid>0000000325411116</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Industrial and Environmental Pollution Department, National Research Institute for Chemical Technology, Zaria, Nigeria</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه آلودگی صنعتی و محیطی، موسسه ملی تحقیقات فناوری شیمیایی، زاریا، نیجریه</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
