<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian Journal of Medical Microbiology</title>
<title_fa>مجله میکروب شناسی پزشکی ایران</title_fa>
<short_title>Iran J Med Microbiol</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://ijmm.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-8612</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2345-4342</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.30699/ijmm</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1401</year>
	<month>1</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2022</year>
	<month>4</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>16</volume>
<number>2</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>en</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>اولین مطالعه ایزوله های بالینی Alcaligenes xylosoxidans و Alcaligenes faecalis به روش فنوتیپی و ژنتیکی در ایران.</title_fa>
	<title>The First Study of Investigation of Clinical Isolates of Alcaligenes Xylosoxidans and Alcaligenes Faecalis by Phenotypic and Genetic Methods in Iran</title>
	<subject_fa>باکتری شناسی پزشکی </subject_fa>
	<subject>Medical Bacteriology</subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Original Research Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;p style=&quot;font-style: normal; text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;زمینه و اهداف:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Alcaligenes&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; یک باسیل گرم منفی غیر تخمیری است که باعث عفونت های بیمارستانی از جمله عفونت های مجاری ادراری، ذات الریه و سپسیس می شود و ممکن است با سودوموناس آئروژینوزا اشتباه گرفته شود. عفونت&#8204;های آلکالیژنز معمولاً به خوبی شناسایی نمی&#8204;شوند و به دلیل وجود خطاها و شباهت&#8204;های احتمالی با سودوموناس، تشخیص آن&#8204;ها با آزمایش&#8204;های فنوتیپی کافی نیست. در این مورد روش های مولکولی موثرتر به نظر می رسد. هدف ما&amp;nbsp;در این مطالعه، بررسی حضور واقعی ایزوله&#8204;های بالینی&amp;nbsp;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;em&gt;xylosoxidans&lt;/em&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Alcaligenes&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&amp;nbsp;و &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Alcaligenes faecalis&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&amp;nbsp;با روش&#8204;های فنوتیپی و ژنتیکی و تعیین حساسیت آنتی&#8204;بیوتیکی آن&#8204;ها بود.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;مواد و روش کار:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/strong&gt;از ابتدای مهرماه ۱۳۹۸ تا ابتدای فروردین ۱۳۹۹، ۳۶ ایزوله بالینی از بیمارستان&#8204; سینا همدان که به&#8204;عنوان آلکالیژنز در آزمایشگاه میکروبیولوژی بیمارستان شناسایی شده&#8204; بودند ، ابتدا با روش&#8204;های روتین فنوتیپی مورد تجزیه و تحلیل قرار دادیم. سپس با استفاده از روش&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt; PCR &lt;/span&gt;و ردیابی ژن های &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;AX&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; و ۷۷&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;F-r&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;، به ترتیب سویه های &amp;nbsp;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;A. xylosoxidans&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; و &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;A. faecalis&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; را شناسایی کردیم. همچنین &amp;nbsp;مقاومت آنتی بیوتیکی هر ایزوله به روش دیسک دیفیوژن تعیین شد&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;.&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;یافته ها:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;از ۳۶ نمونه آلکالیژنز های شناسایی شده از نظر فنوتیپی، تنها ۱۳ نمونه (۳۶/۱۱ درصد) به عنوان &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;A. xylosoxidans&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; و ۳ نمونه (۸/۳۳ درصد) به عنوان &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;A. faecalis&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; با آزمایش &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt; تأیید شدند. در بین جدایه های &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;A. xylosoxidans&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; بیشترین حساسیت (۹۲/۳ درصد) به سفالوسپورین و بیشترین مقاومت (۷۶/۹۲&amp;nbsp;درصد) به سیپروفلوکساسین بود. در بین جدایه های &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;A .faecalis&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; بیشترین حساسیت (۱۰۰%) به سفتازیدیم، پیپراسیلین/تازوباکتام، ایمی پنم، مروپنم و سفپیم و بیشترین مقاومت (۶۶/۶۶%) در مقابل جنتامایسین و سفتریاکسون مشاهده شد.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;نتیجه&#8204;گیری:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/strong&gt;با توجه به اهمیت تشخیص دقیق آلکالیژنزها در مبارزه با عفونت&#8204;های بیمارستانی، به نظر می&#8204;رسد با آزمایش&#8204;های فنوتیپی و بیوشیمیایی، احتمال خطا در تشخیص آنها وجود دارد. بنابراین با استفاده از روش &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt; می توان هر گونه را با دقت بیشتری شناسایی کرد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Background and Objective:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;em&gt;Alcaligenes&lt;/em&gt; &lt;em&gt;sp&lt;/em&gt;. is a non-fermentative Gram-negative bacillus, which causes nosocomial infections, including urinary tract infections, pneumonia, sepsis, and may be confused with &lt;em&gt;Pseudomonas aeruginosa&lt;/em&gt;. &lt;em&gt;Alcaligenes &lt;/em&gt;infections usually are not well identified and due to possible errors and similarities with &lt;em&gt;Pseudomonas&lt;/em&gt;, their diagnosis with phenotypic tests is not sufficient. In this case, molecular methods seem to be more effective. We aimed to investigate the real presence of clinical isolates of&amp;nbsp; &lt;em&gt;Alcaligenes xylosoxidans&lt;/em&gt; and&amp;nbsp; &lt;em&gt;Alcaligenes faecalis&lt;/em&gt; by phenotypical, and genetic methods and their antibiotic susceptibility.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Materials and Methods:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/strong&gt;From September 2019 to March 2020, we analyzed 36 clinical isolates from a Sina hospital in Hamadan, Iran, which have been identified as &lt;em&gt;Alcaligenes &lt;/em&gt;in the hospital&amp;#39;s microbiology lab, by routine phenotypicall methods. Using the PCR method and tracking &lt;em&gt;AX&lt;/em&gt; and &lt;em&gt;77F-r&lt;/em&gt; genes, we identified &lt;em&gt;A. xylosoxidans&lt;/em&gt; and &lt;em&gt;A. faecalis&lt;/em&gt; respectively; the antibiotic resistance of each isolate was determined by the disc diffusion method.&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Results:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;Of 36 samples of phenotypically identified &lt;em&gt;Alcaligenes&lt;/em&gt;, only 13 (36.11%) were confirmed as &lt;em&gt;A. xylosoxidans&lt;/em&gt; and 3 (8.33%) &amp;nbsp;as &lt;em&gt;A. faecalis&lt;/em&gt; by PCR test. Among &lt;em&gt;A. xylosoxidans&lt;/em&gt; isolates, the highest susceptibility(92.3%) was against cephalosporin and the highest resistance (76.92%) was against ciprofloxacin. Among &lt;em&gt;A. faecalis&lt;/em&gt; isolates, the most susceptibility (100%) was against ceftazidime, piperacillin/tazobactam, imipenem, meropenem, and cefepime, and the most resistance (66.66%) was against gentamicin and ceftriaxone.&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Conclusion:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;Regarding the importance of accurate diagnosis of &lt;em&gt;Alcaligenes &lt;/em&gt;in combating nosocomial infections&lt;em&gt;, &lt;/em&gt;it seems with phenotypic and biochemical tests, there is a possibility of error in their diagnosis; so using the PCR method, each species can be determined more accurately.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;

&lt;div&gt;&lt;div&gt;&lt;/div&gt;&lt;/div&gt;</abstract>
	<keyword_fa>Alcaligenes, تشخیص مولکولی, روش PCR, عفونت بیمارستانی</keyword_fa>
	<keyword>Alcaligenes, Molecular detection, PCR method, Nosocomial infection</keyword>
	<start_page>148</start_page>
	<end_page>154</end_page>
	<web_url>http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-1769-3&amp;slc_lang=en&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Maryam</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Adabi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مریم</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>آدابی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>maryam_adabi@yahoo.com</email>
	<code>100319475328460019429</code>
	<orcid>100319475328460019429</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Brucellosis Research Center, Hamadan University of Medical Sciences, Hamadan, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات بروسلوز، دانشگاه علوم پزشکی همدان، همدان، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Seyyed Hamid</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Hashemi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سید حمید</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>هاشمی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>shahashemi@yahoo.com</email>
	<code>100319475328460019430</code>
	<orcid>100319475328460019430</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Brucellosis Research Center, Hamadan University of Medical Sciences, Hamadan, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات بروسلوز، دانشگاه علوم پزشکی همدان، همدان، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Somayeh</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Bakhtiyari</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سمیه</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>بختیاری</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>bakhtiarisomaye@gmail.com</email>
	<code>100319475328460019431</code>
	<orcid>100319475328460019431</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Brucellosis Research Center, Hamadan University of Medical Sciences, Hamadan, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات بروسلوز، دانشگاه علوم پزشکی همدان، همدان، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
