<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian Journal of Medical Microbiology</title>
<title_fa>مجله میکروب شناسی پزشکی ایران</title_fa>
<short_title>Iran J Med Microbiol</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://ijmm.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-8612</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2345-4342</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.30699/ijmm</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1401</year>
	<month>1</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2022</year>
	<month>4</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>16</volume>
<number>2</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>en</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>ارتباط بین واریانت های ژنتیکی باسیل های گرم منفی تولید کننده بتالاکتاماز وسیع الطیف و بتالاکتاماز AmpC و مقاومت آنتی بیوتیکی</title_fa>
	<title>The Association Between Genetic Variants in Extended Spectrum Beta-Lactamases and AmpC-producing Gram-Negative Bacilli and Antibiotic Resistance</title>
	<subject_fa>میکروب شناسی مولکولی</subject_fa>
	<subject>Molecular Microbiology</subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Original Research Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;p style=&quot;font-style: normal; text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;زمینه و اهداف:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;گروه بزرگی از ژن&#8204;های بیان شده مرتبط با بتالاکتامازهای وسیع الطیف (&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;ESBL&lt;/span&gt;) و &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;AmpC&lt;/span&gt; در ایجاد مقاومت آنتی&#8204; بیوتیکی در باکتری&#8204; های مختلف نقش دارند. شناسایی این ژن ها و ارزیابی جایگاه آنها در تعیین الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی بسیار مهم است. این مطالعه با هدف تعیین انواع ژنتیکی در باسیل های گرم منفی تولید کننده بتالاکتامازهای وسیع الطیف، بتالاکتاماز &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;AmpC&lt;/span&gt; و مقاومت آنتی بیوتیکی مرتبط انجام شد.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;مواد و روش کار:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/strong&gt;این پژوهش مقطعی بر روی نمونه&#8204;های بالینی بیماران بستری در بیمارستان رسول اکرم (ص) تهران در سال&#8204;های ۱۳۹۸ و ۱۳۹۹ انجام شد. واریانت های ژنتیکی با روش واکنش زنجیره ی پلیمر از (&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt;) ارزیابی شدند. الگوی مقاومت آنتی بیوتیک ها توسط روش دیسک دیفیوژن تعیین شد.&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;یافته ها:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;از ۸۰ ایزوله ای که &amp;nbsp;بتالاکتاماز وسیع الطیف (&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;ESBL&lt;/span&gt;) وبتالاکتاماز &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;AmpC&lt;/span&gt; تولید کردند، ۷۵ مورد تولید کننده &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;ESBL&lt;/span&gt; و ۵ مورد هم تولید کننده مشترک &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;ESBL&lt;/span&gt; و &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;AmpC&lt;/span&gt; بودند. شایعترین سویه های کشت شده شامل اشریشیا کلی (۶۱/۲ درصد) و کلبسیلا پنومونیه (۳۱/۳ درصد) بود. بیشترین مقاومت آنتی بیوتیکی در تولیدکنندگان &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;ESBL&lt;/span&gt; مربوط به سفوتاکسیم، تری متوپریم-سولفامتوکسازول و سفازولین و کمترین میزان مقاومت مربوط به کولیستین، سفوکسیتین و سفتریاکسون بود. فراوانی کلی ژن&#8204;های شایع باسیل&#8204;های گرم منفی مولد بتالاکتاماز وسیع الطیف (&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;ESBL&lt;/span&gt;)، (&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;(%۷۶/۰&lt;/span&gt;&amp;nbsp;bla&lt;em&gt;CTX-M&lt;/em&gt;، (&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;۴۶/۷&lt;/span&gt;%)&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;TEM&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;bla&lt;/span&gt;&amp;nbsp;و&amp;nbsp;(&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;۲۶/۷&lt;/span&gt;%)HV&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;S&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;bla&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;بود، در حالی که موارد &amp;nbsp;چند ژنی نیز در ۴۹/۳% مشاهده شد. سطح مقاومت دارویی به ایمی پنم، آمیکاسین وسفتازیدیم در افرادی که دارای ژن&amp;nbsp;HV&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;S&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;bla&lt;/span&gt; بودند به طور قابل توجهی بالاتر از سایر موارد بود.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;نتیجه&#8204;گیری:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/strong&gt;شایع ترین سویه های کشت شده شامل اشریشیا کلی و کلبسیلا پنومونیه بود و بیان چند ژنی مشاهده شد. تشخیص ژن&amp;nbsp;HV&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;S&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;bla&lt;/span&gt; با افزایش مقاومت آنتی بیوتیکی به ایمی پنم، آمیکاسین و سفتازیدیم مرتبط است.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Background and Objective:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;A large group of genes associated with extended-spectrum beta-lactamases (ESBL) and AmpC expression is involved in inducing antibiotic resistance in various bacteria. Identifying these genes and assessing their harboring will be crucial in determining the pattern of antibiotic resistance. This study aimed to characterize genetic variants in extended-spectrum beta-lactamases, AmpC-producing gram-negative bacilli, and associated antibiotic resistance.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Methods:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;This cross-sectional research was conducted on clinical samples of patients admitted to Rasool-e-Akram Hospital, Tehran, Iran (2019 and 2020). The genetic variants were assessed by the Polymerase chain reaction method. The pattern of durability to antibiotics was determined by the disk diffusion system.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Results:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; Of the 80 isolates that produced ESBL and AmpC beta-lactamase, 75 cases were ESBL producers and 5 cases co-producers of ESBL and AmpC. The most common cultivated strains included &lt;em&gt;Escherichia coli&lt;/em&gt; (61.2%) and &lt;em&gt;Klebsiella pneumoniae&lt;/em&gt; (31.3%). The highest antibiotic resistance in ESBL producers was related to cefotaxime, trimethoprim-sulfamethoxazole, and cefazolin, and the lowest resistance level was related to colistin, cefoxitin, and ceftriaxone. The total frequencies of common genes of ESBL-producing gram-negative bacilli were &lt;em&gt;bla&lt;sub&gt;CTX-M&lt;/sub&gt;&lt;/em&gt; (76.0%), &lt;em&gt;bla&lt;sub&gt;TEM&lt;/sub&gt;&lt;/em&gt; (46.7%), and &lt;em&gt;bla&lt;sub&gt;SHV&lt;/sub&gt;&lt;/em&gt; (26.7%), while multigenic harboring was also observed in 49.3%. The level of drug resistance to Imipenem, Amikacin, and Ceftazidime in people who harbored the &lt;em&gt;bla&lt;/em&gt;&lt;em&gt;&lt;sub&gt;SHV&lt;/sub&gt;&lt;/em&gt; gene was significantly higher than in other cases.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Conclusion:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; The most common cultivated strains included &lt;em&gt;E.&lt;/em&gt;&lt;em&gt; coli&lt;/em&gt; and &lt;em&gt;K.&lt;/em&gt;&lt;em&gt; pneumoniae&lt;/em&gt;. &lt;em&gt;bla&lt;/em&gt;&lt;em&gt;&lt;sub&gt;CTX-M&lt;/sub&gt;&lt;/em&gt;&lt;em&gt;, &lt;/em&gt;&lt;em&gt;bla&lt;sub&gt;TEM&lt;/sub&gt;&lt;/em&gt;&lt;em&gt;,&lt;/em&gt; &lt;em&gt;bla&lt;sub&gt;SHV&lt;/sub&gt;&lt;/em&gt;&lt;em&gt;,&lt;/em&gt; and multigenic expression were observed. The detection of the &lt;em&gt;bla&lt;sub&gt;SHV&lt;/sub&gt;&lt;/em&gt; gene is associated with increased antibiotic resistance to Imipenem, Amikacin, and Ceftazidime.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;

&lt;div&gt;&lt;div&gt;&lt;/div&gt;&lt;/div&gt;</abstract>
	<keyword_fa>بتالاکتاماز AmpC, مقاومت آنتی بیوتیکی, بتالاکتاماز وسیع الطیف, باسیل گرم منفی</keyword_fa>
	<keyword>AmpC beta-lactamase, Antibiotic resistance, Extended-spectrum beta-lactamase, Gram-negative bacilli</keyword>
	<start_page>116</start_page>
	<end_page>126</end_page>
	<web_url>http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-1739-1&amp;slc_lang=en&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Pegah</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Babaheidarian</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>پگاه</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>بابا حیدریان</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>Babaheidarian.p@iums.ac.ir</email>
	<code>100319475328460019414</code>
	<orcid>100319475328460019414</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Pathology, School of Medicine, Iran University of Medical Sciences, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه آسیب شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی ایران، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Majid</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Mehdinejad</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مجید</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>مهدی نژاد</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>m.mehdinejad1017@gmail.com</email>
	<code>100319475328460019415</code>
	<orcid>100319475328460019415</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Pathology, School of Medicine, Iran University of Medical Sciences, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه آسیب شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی ایران، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Ali</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Zare-Mirzaie</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>علی</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>زارع میرزایی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>zaremir@gmail.com</email>
	<code>100319475328460019416</code>
	<orcid>100319475328460019416</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Pathology, School of Medicine, Iran University of Medical Sciences, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه آسیب شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی ایران، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Roya</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Mokarinejad</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>رویا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>مکاری نژاد</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>royamokari@gmail.com</email>
	<code>100319475328460019417</code>
	<orcid>100319475328460019417</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Pathology, RASOOL-E-AKRAM Hospital, Iran University of Medical Sciences, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>بخش آسیب شناسی ، بیمارستان رسول اکرم (ص)، دانشگاه علوم پزشکی ایران، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Ensieh</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Jafari</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>انسیه</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>جعفری</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>Ensy.jafari20@gmail.com</email>
	<code>100319475328460019418</code>
	<orcid>100319475328460019418</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Pathology, RASOOL-E-AKRAM Hospital, Iran University of Medical Sciences, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>بخش آسیب شناسی ، بیمارستان رسول اکرم (ص)، دانشگاه علوم پزشکی ایران، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
