<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian Journal of Medical Microbiology</title>
<title_fa>مجله میکروب شناسی پزشکی ایران</title_fa>
<short_title>Iran J Med Microbiol</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://ijmm.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-8612</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2345-4342</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.30699/ijmm</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1401</year>
	<month>2</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2022</year>
	<month>5</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>16</volume>
<number>3</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>en</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>آشکارسازی الگوهای رفتاری SARS-CoV-2 با استفاده از تحلیل خوشه‌ای و مدل‌های پیش‌بینی خطای XGBoost</title_fa>
	<title>Revealing Behavior Patterns of SARS-CoV-2 using Clustering Analysis and XGBoost Error Forecasting Models</title>
	<subject_fa>یادگیری عمیق</subject_fa>
	<subject>Deep learning</subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Original Research Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;p style=&quot;font-style: normal; text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;زمینه و اهداف:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;کووید-۱۹ یک بیماری عفونی بسیار مسری است و زندگی روزمره مردم را تحت تأثیر قرار داده و نگرانی زیادی برای دولت&#8204;&#8204;ها و مسئولان بهداشت عمومی ایجاد کرده است. پیش&#8204;بینی رفتار آینده آن ممکن است برای تخصیص منابع پزشکی و تعریف استراتژی&#8204;های مؤثر برای کنترل بیماری و غیره مفید باشد.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;مواد و روش کار:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/strong&gt;داده&#8204;های جمع&#8204;آوری&#8204;شده، شامل تعداد تجمعی و مطلق موارد تأیید شده، فوت و بهبود مربوط به کووید-۱۹ از تاریخ ۳۰ فوریه تا ۳ جولای ۲۰۲۱ می&#8204;باشد. در این مطالعه از تحلیل خوشه&#8204;ای سلسله مراتبی استفاده شد. برای پیش&#8204;بینی رفتار آینده کووید-۱۹، از مدل&#8204;های اتورگرسیو میانگین متحرک تلفیق&#8204;شده (&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;ARIMA&lt;/span&gt;)، هموارسازی نمایی (&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;ETS&lt;/span&gt;)، روش پیش&#8204;بینی خودکار (&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Prophet&lt;/span&gt;)، نایو، نایو فصلی &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;(s-Naive)&lt;/span&gt;، &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;ARIMA&lt;/span&gt; تقویت&#8204;شده (&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;boosted ARIMA&lt;/span&gt;)، &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Prophet&lt;/span&gt; تقویت&#8204;شده (&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;boosted Prophet&lt;/span&gt;) استفاده شد.&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;یافته ها:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;نتایج خوشه&#8204;بندی نشان&#8204;دهنده رفتار مشابهی از ویروس کرونا در ایران و سایر کشورها مانند فرانسه، روسیه، ترکیه، انگلستان (انگلیس)، آرژانتین، کلمبیا، ایتالیا، اسپانیا، آلمان، لهستان، مکزیک و اندونزی بود. به طور کلی نتایج در شش گروه (خوشه) دسته&#8204;بندی شدند. نتایج پیش&#8204;بینی نیز نشان داد که خانواده مدل&#8204;های &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;XGBoost&lt;/span&gt; از دقت بالایی نسبت به مدل&#8204;های دیگر برخوردار بودند.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;نتیجه&#8204;گیری:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/strong&gt;در ایران، کووید-۱۹، الگوهای رفتاری مشابهی را با کشورهای توسعه&#8204;یافته موردنظر در این مطالعه نشان داد. خانواده مدل&#8204;های &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;XGBoost&lt;/span&gt; نتایج کاربردی و دقت بالایی در پیش&#8204;بینی الگوهای رفتاری ویروس نشان دادند. با توجه به گسترش سریع ویروس در سراسر جهان، این مدل&#8204;ها می&#8204;توانند برای پیش&#8204;بینی الگوهای رفتاری &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;SARS-CoV-۲&lt;/span&gt; استفاده شوند. پیش&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&#8204;&lt;/span&gt;گیری از شیوع ویروس کرونا، کنترل بیماری و گسستن زنجیره آن مستلزم کمک به جامعه است و در این مأموریت نمی&#8204;توان از نقش آمارگیران غافل شد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Background and Objective:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;COVID-19 is a highly contagious infectious disease, and it has affected people&amp;#39;s daily life and has raised great concern for governments and public health officials. Forecasting its future behavior may be useful for allocating medical resources and defining effective strategies for disease control, etc.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Methods:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&amp;nbsp;The collected data was the cumulative and the absolute number of confirmed, death, and recovered cases of COVID-19 from February 20 to July 03, 2021. We used hierarchical cluster analysis. To forecast the future behavior of COVID-19, the Auto-Regressive Integrated Moving Average (ARIMA), Exponential Smoothing (ETS), Automatic Forecasting Procedure (Prophet), Naive, Seasonal Naive (s-Naive), boosted ARIMA, and boosted Prophet models were used.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Results:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; The results of clustering showed a similar behavior of coronavirus in Iran and other countries such as France, Russia, Turkey, United Kingdom (UK), Argentina, Colombia, Italy, Spain, Germany, Poland, Mexico, and Indonesia. It also revealed similar patterns of SARS-CoV-2 for the same countries in six groups. Results showed that XGBoost models&amp;#39; family had higher accuracy than other models.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Conclusion:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; In Iran, COVID-19 showed similar behavior patterns compared to the studied developed countries. The family of XGBoost models showed practical results and high precision in forecasting behavior patterns of the virus. Concerning the rapid spread of the virus worldwide, these models can be used to forecast the behavior patterns of SARS-CoV-2. Preventing the spread of the coronavirus, controlling the disease, and breaking down its chain necessitates community assistance, and in this mission, the role of statisticians cannot be neglected.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;

&lt;div&gt;&lt;div&gt;&lt;/div&gt;&lt;/div&gt;</abstract>
	<keyword_fa>آریما, تحلیل خوشه‌ای, کووید-19, پیش‌بینی, نایو, مدل خطای XGBoost</keyword_fa>
	<keyword>ARIMA, Cluster Analysis, COVID-19, Forecasting, Naïve, XGBoost Error</keyword>
	<start_page>221</start_page>
	<end_page>232</end_page>
	<web_url>http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-1653-1&amp;slc_lang=en&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Nasrin</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Talkhi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>نسرین</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>تلخی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>talkhin961@mums.ac.ir</email>
	<code>100319475328460019580</code>
	<orcid>100319475328460019580</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Biostatistics, School of Health, Mashhad University of Medical Sciences, Mashhad, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه آمار زیستی، دانشکده بهداشت، دانشگاه علوم پزشکی مشهد، مشهد، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Narges</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Akhavan Fatemi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>نرگس</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>اخوان فاطمی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>n.akhavan_f@yahoo.com</email>
	<code>100319475328460019581</code>
	<orcid>100319475328460019581</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Statistics, Ferdowsi University of Mashhad, Mashhad, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه آمار، دانشکده علوم ریاضی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mehdi</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Jabbari Nooghabi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مهدی</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>جباری نوغابی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>jabbarinm@um.ac.ir</email>
	<code>100319475328460019582</code>
	<orcid>0000000256362209</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Statistics, Ferdowsi University of Mashhad, Mashhad, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه آمار، دانشکده علوم ریاضی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
