<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian Journal of Medical Microbiology</title>
<title_fa>مجله میکروب شناسی پزشکی ایران</title_fa>
<short_title>Iran J Med Microbiol</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://ijmm.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-8612</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2345-4342</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.30699/ijmm</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1400</year>
	<month>6</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2021</year>
	<month>9</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>15</volume>
<number>5</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>ارزیابی تشکیل بیوفیلم شیگلا فلکسنری و تأثیر آن بر بیان ژن های توکسین-آنتی توکسین</title_fa>
	<title>Evaluation of Shigella flexneri Biofilm Formation and Its Effect on the Expression of Toxin-antitoxin Genes</title>
	<subject_fa>باکتری شناسی پزشکی </subject_fa>
	<subject>Medical Bacteriology</subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Original Research Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;p style=&quot;font-style: normal; text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;زمینه و اهداف:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;em&gt;شیگلا&lt;/em&gt; &lt;em&gt;فلکسنری&lt;/em&gt;، باکتری گرم منفی بسیار مسری است که باعث اسهال شدید بخصوص در کودکان زیر ده سال می شود. تشکیل بیوفیلم در این گونه سبب افزایش مقاومت آن در برابر آنتی بیوتیک ها می&#8204;گردد. با توجه به نقش مهم سیستم های توکسین-آنتی توکسین (&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;TA&lt;/span&gt;) در پایداری و بقای باکتری ها تحت شرایط استرس، هدف مطالعه&amp;nbsp;حاضر، ارزیابی بیان ژن&#8204;های کدکننده&amp;nbsp;سیستم های &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;TA&lt;/span&gt; و همچنین &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Lon&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt; پروتئاز&lt;/span&gt; به&#8204;عنوان پروتئین اصلی تنظیم کننده&amp;nbsp;بیان و عملکرد سیستم&#8204;های مذکور در این میکروارگانیسم در شرایط تشکیل بیوفیلم است.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;مواد و روش کار:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/strong&gt;در این مطالعه، از سویه&amp;nbsp;استاندارد &lt;em&gt;شیگلا فلکسنری&amp;nbsp;&lt;/em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;۱۲۰۲۲&lt;/span&gt; &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;ATCC&lt;/span&gt; استفاده شد. پس از کشت باکتری روی محیط کشت اختصاصی، توانایی تشکیل بیوفیلم به صورت کمی به روش میکروتیترپلیت ارزیابی شد. در ادامه سطح بیان ژن&#8204;های مذکور نسبت به گروه کنترل با استفاده از ریل تایم &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt; ارزیابی گردید.&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;یافته ها:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;نتایج تست میکروتیترپلیت نشان داد که باکتری &lt;em&gt;شیگلا فلکسنری&lt;/em&gt; مورد مطالعه یک سویه&amp;nbsp;بیوفیلم قوی است و نتایج &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;qPCR&lt;/span&gt; حاکی از افزایش بیان ژن&#8204;های توکسین&#8204;های مورد مطالعه و &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;lon&lt;/span&gt; پروتئاز، ۸ و ۲۴ ساعت پس از القای تشکیل بیوفیلم بود (۰/۰۱&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;P&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;).&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;نتیجه&#8204;گیری:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/strong&gt;با توجه به افزایش معنی دار میزان بیان ژن&#8204;های مورد مطالعه بخصوص &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;lon&lt;/span&gt; پروتئاز و توکسین&#8204;های &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;GNAT&lt;/span&gt; و &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;maz&lt;/span&gt; در ساعت ۲۴ پس از تشکیل بیوفیلم، می&#8204;توانند به&#8204;طور بالقوه به&#8204;عنوان هدف داروی ضد میکروبی در مطالعات جدید مورد استفاده قرار گیرند.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Background and Objective:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;em&gt;Shigella flexneri&lt;/em&gt; is a highly contagious Gram-negative bacterium that causes severe diarrhea, especially in children under ten years old. The biofilm formation in this species increases its resistance to antibiotics. Given the important role of toxin-antitoxin (TA) systems in the stability and survival of bacteria under stress condition, this study was aimed to evaluate the expression of genes encoding TA systems and Lon protease (&lt;em&gt;lonp&lt;/em&gt;) as the main protein regulating the expression and function of these systems in this microorganism in terms of biofilm formation.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Materials and Methods:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/strong&gt;In this study, the standard &lt;em&gt;Shigella flexneri&lt;/em&gt; ATCC 12022 was used. After the bacteria culture on the specific culture medium, the ability to form biofilm was quantitatively evaluated by microtiter plate method. Then, the expression level of the mentioned genes was assessed compared to the control group using real-time PCR.&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Results:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;The results of microtiter plate test showed that the studied &lt;em&gt;Shigella flexneri&lt;/em&gt; was a strong biofilm strain. The qPCR results showed an increase in gene expression of the studied toxins and Lon protease at 8 and 24 h following biofilm formation induction (&lt;em&gt;P&lt;/em&gt;&lt;0.01).&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Conclusion:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;Due to the significant increase in the expression of the studied genes, especially &lt;em&gt;Lon protease&lt;/em&gt;, &lt;em&gt;GNAT&lt;/em&gt; and &lt;em&gt;maz&lt;/em&gt; toxins at 24 h after biofilm formation, they can be potentially used as antimicrobial targets in new studies.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;

&lt;div&gt;&lt;div&gt;&lt;/div&gt;&lt;/div&gt;</abstract>
	<keyword_fa>شیگلا فلکسنری, بیوفیلم, میکروتیترپلیت, توکسین-آنتی توکسین, ریل تایم PCR</keyword_fa>
	<keyword>Biofilm, Microtiter plate, Real-Time PCR, Shigella flexneri, Toxin-antitoxin</keyword>
	<start_page>538</start_page>
	<end_page>550</end_page>
	<web_url>http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-1587-1&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Erfan</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Kheradmand</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>عرفان</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>خردمند</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>erfan.kheradmand@yahoo.com</email>
	<code>100319475328460018280</code>
	<orcid>100319475328460018280</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Biology, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه زیست شناسی، دانشکده علوم و فناوری های همگرا، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد علوم و تحقیقات، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Shabnam</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Razavi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>شبنم</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>رضوی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>razavi.sh@iums.ac.ir</email>
	<code>100319475328460018281</code>
	<orcid>0000000345663089</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Microbial Biotechnology Research Center, Iran University of Medical Sciences, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات بیوتکنولوژی میکروبی، دانشگاه علوم پزشکی ایران، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Malihe</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Talebi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>ملیحه</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>طالبی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>talebi.m@iums.ac.ir</email>
	<code>100319475328460018282</code>
	<orcid>0000000291118121</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, School of Medicine, Iran University of Medical Sciences, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروب شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی ایران، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mahmood</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Jamshidian</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمود</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>جمشیدیان</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>jam34m@gmail.com</email>
	<code>100319475328460018283</code>
	<orcid>100319475328460018283</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Pathobiology, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه پاتوبیولوژی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد علوم و تحقیقات، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
