<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian Journal of Medical Microbiology</title>
<title_fa>مجله میکروب شناسی پزشکی ایران</title_fa>
<short_title>Iran J Med Microbiol</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://ijmm.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-8612</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2345-4342</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.30699/ijmm</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1400</year>
	<month>3</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2021</year>
	<month>6</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>15</volume>
<number>3</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>شیوع ژن‌های مرتبط با فاکتور ویرولانس و بیوفیلم در اسینتوباکتر بومانی جداشده از نمونۀ تنفسی بیماران بستری در بیمارستان امام خمینی تهران، ایران در سال 1397</title_fa>
	<title>Prevalence Determination of Virulence Related and Biofilm Formation Genes in Acinetobacter baumannii Isolates from Clinical Respiratory Samples in Imam Khomeini Hospital, Tehran, Iran in 2018</title>
	<subject_fa>باکتری شناسی پزشکی </subject_fa>
	<subject>Medical Bacteriology</subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Original Research Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;p style=&quot;font-style: normal; text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;زمینه و اهداف :&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt; &lt;em&gt;اسینتو باکتر بومانی &lt;/em&gt;یک&amp;nbsp;کوکوباسیل گرم&#8204; منفی&amp;nbsp;است که در طبیعت انتشار وسیعی&amp;nbsp;داشته و به&#8204;عنوان یکی&amp;nbsp;از عوامل مهم عفونت&#8204;های بیمارستانی محسوب می شود. به واسطۀ ایجاد مقاومت&#8204;های&amp;nbsp;آنتی&#8204;بیوتیکی در این باکتری، درمان موفقیت&#8204;آمیز بیماران با مشکلات فراوانی&amp;nbsp;روبرو و در پی&amp;nbsp;آن منجر به مرگ و میر آن&#8204;ها شده است. مطالعۀ حاضر برای بررسی ۹ ژن بیماری&#8204;زایی در نمونه&#8204;های بالینی &lt;em&gt;اسینتوباکتر بومانی&lt;/em&gt; جداشده از بیماران طراحی و انجام گردید.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;مواد و روش کار&amp;nbsp;:&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;/strong&gt;در این مطالعه تعداد ۵۰ نمونه &lt;em&gt;اسینتوباکتر بومانی&lt;/em&gt; ذخیره شده در مرکز کلکسیون میکروارگانسیم&#8204;های دانشگاه علوم پزشکی ایران که جداشده از دستگاه تنفسی بیماران مراجعه&#8204;کننده به بیمارستان امام خمینی، تهران، ایران بودند، انتخاب شدند و با روش&#8204;های میکروب&#8204;شناسی و بیوشیمیایی تایید گردیدند. پس از تایید سویه&#8204;ها، با استفاده از پرایمرهای اختصاصی، برای ژن&#8204;های &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;basD, plD, csuA)&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;) و ژن&#8204;های (&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;surA,&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt; &lt;em&gt;pbpG ,bfmR&lt;/em&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;) &lt;/em&gt;و ژن&#8204;های &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;bap, ompA)&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;em&gt;) &lt;/em&gt;آزمون &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Multiplex PCR&lt;/span&gt; انجام شد. ژن &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;espA&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; به&#8204;صورت جداگانه با &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt; معمولی ارزیابی شد. نتایج به&#8204;دست&#8204;آمده از &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt; در نهایت برای تعیین توالی دوطرفه به شرکت پیشگام ارسال شد.&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;یافته ها :&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt; از بین ۵۰ نمونه بالینی &lt;em&gt;اسینتوباکتر بومانی&lt;/em&gt;، نتایج حاصل از &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Multiplex PCR&lt;/span&gt; نشان داد که به ترتیب فراوانی دو ژن &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;pbpG&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; و &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;bfmR&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; (۱۰۰%)۵۰، فراوانی ژن&#8204;های &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;bap&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;em&gt; و &lt;/em&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;,plD&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;surA&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;em&gt; و&lt;/em&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt; csuA&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; (۹۸%) ۴۹، فراوانی ژن&#8204;های &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;ompA&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; و&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;basD&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; (۹۶%) ۴۸ و همچنین ژن&amp;nbsp;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;espA&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; (۱۰%) ۵ مشاهده شد.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;نتیجه&#8204;گیری :&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;/strong&gt;شیوع فاکتورهای بیماری&#8204;زایی در جدایه&#8204;های &lt;em&gt;اسینتوباکتر بومانی&lt;/em&gt;، بیشتر از ۹۰% بود&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;.&lt;/span&gt; به خصوص در مورد ژن&#8204;های دخیل در تشکیل بیوفیلم، می&#8204;توان نتیجه گرفت که اکثر سویه&#8204;های مورد مطالعه، توانایی بالایی برای تشکیل ساختارهای بیوفیلم دارند. افزایش میزان شیوع بیمارستانی &lt;em&gt;اسینتوباکتر بومانی&lt;/em&gt;، لزوم طراحی برنامه&#8204;های&amp;nbsp;حفاظتی نظیر کنترل عفونت&#8204;های&amp;nbsp;ایجادشده در بخش مراقبت&#8204;های&amp;nbsp;ویژه را خاطر نشان می&#8204;کند. همچنین با استفاده از روش&#8204;های&amp;nbsp;مولکولی می&#8204;توان این باکتری های پاتوژن را شناسایی و ویژگی مقاومت آنتی&#8204;بیوتیکی آنها را تعیین کرد و متناسب با آن آنتی&#8204;بیوتیک&#8204;ها را تجویز نمود&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Background and Objective:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;em&gt;Acinetobacter baumannii&lt;/em&gt; is considered to be a re-emerging causative agent of nosocomial infections. There is a significant relation between pathogenicity of this bacterium and the numerous virulence factors. The purpose of this study was to investigate nine virulence factor genes in &lt;em&gt;A. baumannii&lt;/em&gt; isolates derived from hospitalized patients.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Materials and Methods:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;/strong&gt;A total of 50 &lt;em&gt;A. baumannii&lt;/em&gt; isolates were recovered from patients with pneumonia in Imam Khomeini Hospital, Tehran, Iran. Following biochemical and microbiological identification of the bacteria, Multiplex PCR was performed for &lt;em&gt;basD, plD, csuA&lt;/em&gt; genes, &lt;em&gt;surA, pbpG, bfmR&lt;/em&gt; genes, and &lt;em&gt;bap, ompA&lt;/em&gt; genes using specific sets of primers which were specifically designed for this study. The &lt;em&gt;espA &lt;/em&gt;was identified separately by a Uniplex PCR assay. All amplified DNA fragments were sequenced for the products&amp;rsquo; confirmation.&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Results:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt; Among the 50 clinical isolates of &lt;em&gt;A. baumannii&lt;/em&gt; studied, &lt;em&gt;bfmR&lt;/em&gt; and &lt;em&gt;pbpG&lt;/em&gt; genes were reported in all samples (100%), &lt;em&gt;bap&lt;/em&gt;, &lt;em&gt;plD&lt;/em&gt;, &lt;em&gt;surA&lt;/em&gt;, and &lt;em&gt;csuA&lt;/em&gt; genes were collected from 49 samples (98%), 48 (96%) of these isolates had &lt;em&gt;ompA&lt;/em&gt; and &lt;em&gt;basD&lt;/em&gt; genes, and &lt;em&gt;espA&lt;/em&gt; gene was observed in only five isolates (10%).&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Conclusion:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt; According to this study results, virulence factors genes in clinical &lt;em&gt;A. baumannii&lt;/em&gt; have a prevalence rate more than 90%. Additionally, the high incidence rate of those genes related to biofilm formation indicates that most clinical strains have the ability to form biofilm structures.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;</abstract>
	<keyword_fa>اسینتوباکتر بومانی, ژن‌های بیماری‌زایی, عفونت‌های تنفسی</keyword_fa>
	<keyword>Acinetobacter baumannii, Multiplex Polymerase Chain Reaction, Pneumonia, Virulence Factors</keyword>
	<start_page>266</start_page>
	<end_page>280</end_page>
	<web_url>http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-1526-1&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Haniyeh</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Mozafari</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>هانیه</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>مظفری</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>honey_mozafari@yahoo.com</email>
	<code>100319475328460016896</code>
	<orcid>100319475328460016896</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, School of Medicine, Iran University of Medical Sciences, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروب‌شناسی، دانشکدۀ پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی وخدمات بهداشتی درمانی ایران، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Shiva</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Mirkalantari</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>شیوا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>میرکلانتری</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>sh_mirkalantary@yahoo.com</email>
	<code>100319475328460016897</code>
	<orcid>100319475328460016897</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, School of Medicine, Iran University of Medical Sciences, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروب‌شناسی، دانشکدۀ پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی وخدمات بهداشتی درمانی ایران، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Behrooz</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Sadeghi Kalani</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>بهروز</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>صادقی کلانی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>behroz.sadeghi@gmail.com</email>
	<code>100319475328460016898</code>
	<orcid>100319475328460016898</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, School of Medicine, Iran University of Medical Sciences, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروب‌شناسی، دانشکدۀ پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی وخدمات بهداشتی درمانی ایران، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Nour</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Amirmozafari</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>نور</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>امیرمظفری</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>amirmozafari@yahoo.com</email>
	<code>100319475328460016899</code>
	<orcid>100319475328460016899</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, School of Medicine, Iran University of Medical Sciences, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروب‌شناسی، دانشکدۀ پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی وخدمات بهداشتی درمانی ایران، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
