<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian Journal of Medical Microbiology</title>
<title_fa>مجله میکروب شناسی پزشکی ایران</title_fa>
<short_title>Iran J Med Microbiol</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://ijmm.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-8612</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2345-4342</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.30699/ijmm</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1387</year>
	<month>12</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2009</year>
	<month>3</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>2</volume>
<number>3</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>ارزیابی اپیدمیولوژیک ژن های ویرولانس hly, cnf-1, sfa, pap در سویه های اشریشیاکلی جداشده از کودکان مبتلا به عفونت مجاری ادراری</title_fa>
	<title>Epidemiologic evaluation of virulence genes, pap، sfa، cnf-1، hlyin E. colistrains isolated from children withurinary tract infection</title>
	<subject_fa>اپیدمیولوژی مولکولی</subject_fa>
	<subject>Molecular Epidemiology</subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Original Research Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;div align=&quot;right&quot; style=&quot;direction: rtl&quot;&gt;
&lt;b&gt;زمینه و اهداف:&lt;/b&gt; عفونت دستگاه ادراری ناشی از &lt;i&gt;اشریشیاکلی&lt;/i&gt; یکی از شایع ترین بیماری ها در کودکان است. چهار ژن ویرولانس pap, cnf-1, hly و sfa در این ارگانیسم عامل مهمی در پاتوژنیسیته و به ویژه اتصال به سلول های اپی تلیال هستند. این مطالعه برای ارزیابی چهارژن ویرولانس در سویه های &lt;i&gt;اشریشیاکلی&lt;/i&gt; جداشده از نمونه های ادراری کودکان مبتلا به عفونت ادراری و همچنین در راستای برقراری ارتباط آنها با شواهد بالینی انجام گرفت. &lt;br&gt;&lt;b&gt;روش بررسی: &lt;/b&gt;سویه های &lt;i&gt;اشریشیاکلی&lt;/i&gt; از نمونه ادرار کودکان مبتلا به عفونت های ادراری مراجعه کننده به بیمارستان مطهری جهرم (مرداد 1384 الی مرداد 1385) جداشد، و با تست های افتراقی شناسایی گردید. سویه ها از نظر وجود ژن های pap, cnf-1, hly و sfa، با روش واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR)، ارزیابی شدند.
&lt;br&gt;&lt;b&gt;یافته ها:&lt;/b&gt; در مجموع 96 سویه &lt;i&gt;اشریشیاکلی&lt;/i&gt; از نمونه های ادرار 101 کودک 1 ماهه تا 14 ساله، با میانگین سنی 26.9±21.8 ماه، جدا شد. تشخیص افتراقی بیماری بالینی در 46 مورد (%47.9) سیستیت و در 50 مورد (%52.1) پیلونفریت بود. درصد شیوع ژن های hly, sfa, pap و cnf-1 به ترتیب در میان سویه ها (n=26)%27.1، (n=14)%14.6،‌ (n=13)%13.5 و (n=22)%22.9 بود. 32 نمونه (%33.3) برای حداقل یکی از ژن ها و 6 نمونه (%6.3) برای تمامی چهار ژن مثبت بودند. شایع ترین ژن ها در گروه سنی بالای 36 ماه ژن های pap و sfa بودند اما در سنین زیر 48 ماه hly شیوع بیشتری داشت (P&lt;0.05). ژن cnf-1 به طور قابل ملاحظه ای در تعدادی از بیماران، که در سونوگرافی یافته های غیرطبیعی کلیوی داشتند، متداول تر بود (P=0.049).&lt;br&gt;&lt;b&gt;نتیجه گیری: &lt;/b&gt;شیوع ژن ها، ویرولانس pap, cnf-1, hly و sfa مشابه سایر بررسی ها است. به دلیل شیوع بیشتر موارد پیلونفریت در ارتباط با ارگانیسم های حامل این ژن ها، تشخیص سریع آنها در نمونه های ادرار ممکن است ما را در تشخیص زود هنگام پیلونفریت احتمالی و تسریع در مدیریت درمانی کمک نماید
&lt;/div&gt;</abstract_fa>
	<abstract>
&lt;b&gt;Background and objectives:&lt;/b&gt; Urinary tract infection (UTI) caused by &lt;i&gt;E coli &lt;/i&gt;is one of the most common diseases 
in children. Presence of four virulence genes of pap, sfa, hly and cnf have important role in organism 
pathogenicity and adhesion to epithelial cell. The present study was aimed to evaluate the prevalence of these 
four important virulence genes in  &lt;i&gt;E. coli&lt;/i&gt; strains isolated from urine samples of children with UTI and their 
correlation with clinical data. &lt;br&gt;&lt;b&gt;Materials and Methods:&lt;/b&gt; &lt;i&gt;E. coli &lt;/i&gt;strains were isolated from urine samples of children with UTI who presented 
during 2005-2006 in Motahary hospital, Jahrom, Iran. The isolates were then studied for presence of genes hly, 
cnf-1, pap and sfa by PCR terchnique.&lt;br&gt;&lt;b&gt;Results:&lt;/b&gt;Totally 96 &lt;i&gt;E. coli &lt;/i&gt;strains were isolated from urine samples of children with UTI aged from 1 month to 
14 years (mean 21.8± 26.9 months). Cystitis was diagnosed in 49.2% and pyelonephritis in 50.8% of these 
patients. Prevalence of genes pap, sfa, hly and cnf-1among the strains was 27.1%, 14.6%, 13.5% and 22.9 %, 
respectively. Overall 32 samples (33.3%) were positive for at least one of the genes and 6 samples ( 6.3%) were 
positive for all four genes. pap and sfa were more common in ages over 36 months but hly was more detected in 
age under 48 months (P&lt;0.05). cnf-1gene was significantly more common in samples of the patients with 
abnormal kidney sonography (P=0.049). &lt;br&gt;
&lt;b&gt;Conclusion:&lt;/b&gt;This study showed that the prevalence of virulence genes hly, cnf-1, pap and sfa in&lt;i&gt; E.&lt;/i&gt; &lt;i&gt;coli &lt;/i&gt;isolates 
was similar to the results of other studies. Because of higher prevalence of pyelonephritis in presence of these 
genes, rapid detection of the genes in urine samples may help in more suspicious and rapid management of 
pyelonephritis
</abstract>
	<keyword_fa>اشریشیاکلی، پیلونفریت، سیستیت، واکنش زنجیره ای پلیمراز، ژن های ویرولانس</keyword_fa>
	<keyword>E. coli, PCR , pyelonephritis , cystitis, virulence genes</keyword>
	<start_page>31</start_page>
	<end_page>37</end_page>
	<web_url>http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-1-102&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Shohre</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Farshad</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>شهره</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>فرشاد </last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>s_farshad@yahoo.com</email>
	<code>1003194753284600569</code>
	<orcid>1003194753284600569</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Professor Alborzi Clinical Microbiology Research Center,Shiraz University of Medical Science, Shiraz, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات میکروب شناسی بالینی استاد البرزی، دانشگاه علوم پزشکی شیراز</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Fatemeh</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Emamghorashi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>فاطمه</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>امام قریشی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>1003194753284600570</code>
	<orcid>1003194753284600570</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Pediatric Department, Jahrom University of Medical Sciences, Medical School, Jahrom, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa></affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Manli</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Amin Shahidi </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مانلی</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>امین شهیدی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>1003194753284600571</code>
	<orcid>1003194753284600571</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Professor Alborzi Clinical Microbiology Research Center,Shiraz University of Medical Science, Shiraz, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات میکروب شناسی بالینی استاد البرزی، دانشگاه علوم پزشکی شیراز</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
