<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian Journal of Medical Microbiology</title>
<title_fa>مجله میکروب شناسی پزشکی ایران</title_fa>
<short_title>Iran J Med Microbiol</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://ijmm.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-8612</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2345-4342</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.30699/ijmm</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1399</year>
	<month>12</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2021</year>
	<month>3</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>15</volume>
<number>2</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>en</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>بررسی مقاومت آنتی‌بیوتیکی و توانایی تشکیل بیوفیلم در اشریشیا کلی یوروپاتوژن جداسازی شده از زنان باردار در شهر کرج</title_fa>
	<title>Evaluation of Antibiotic Resistance and Biofilm Formation Ability Uropathogenic E. coli (UPEC) Isolated From Pregnant Women in Karaj</title>
	<subject_fa>باکتری شناسی پزشکی </subject_fa>
	<subject>Medical Bacteriology</subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Original Research Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;p style=&quot;font-style: normal; text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;زمینه و اهداف:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt; &lt;em&gt;اشریشیا کلی&lt;/em&gt; یوروپاتوژن شایع&#8204;ترین عامل عفونت دستگاه ادراری است. اتصال این باکتری&#8204;ها به سلول&#8204;های اپی&#8204;تلیال و تشکیل بیوفیلم سبب می&#8204;گردد، تا این باکتری&#8204;ها بیشتر در مجاری ادراری کلونیزه و به&#8204;سختی حذف شوند. هدف از این مطالعه تعیین مقاومت آنتی&#8204;بیوتیکی و بررسی قدرت تشکیل بیوفیلم در &lt;em&gt;اشریشیا کلی&lt;/em&gt; یوروپاتوژن جداسازی&#8204;شده از زنان باردار در شهر کرج بود.&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;مواد و روش کار&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt; این مطالعه به&#8204;صورت توصیفی &amp;ndash; تحلیلی بر روی ۶۴ جدایه &lt;em&gt;اشریشیا کلی&lt;/em&gt; یوروپاتوژن انجام شد. شناسایی این باکتری&#8204;ها با استفاده از تست&#8204;های بیوشیمیایی و مقاومت آنتی&#8204;بیوتیکی از طریق روش کربی- بوئر و مطابق توصیه موسسه استاندارد آزمایشگاهی و بالینی &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;CLSI (۲۰۱۷)&lt;/span&gt; تعیین شد. توانایی تشکیل بیوفیلم، با &amp;nbsp;استفاده از روش میکروتیترپلیت و حضور ژن&#8204;های &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;pap&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; و &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;sfa&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; به روش&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Duplex PCR &lt;/span&gt;&amp;nbsp;بررسی شد&lt;strong&gt;.&lt;/strong&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;نتایج:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt; بر اساس نتایج، بیشترین میزان مقاومت مربوط به کوتریموکسازول (۴۰/۶٪) و آمپی&#8204;سیلین (۳۱/۳٪)، بود. بررسی تشکیل بیوفیلم به روش فنوتیپی نیز نشان داد که ۴۸/۴ ٪ با توان بالا، ۱۵/۶٪ با توان متوسط و ۲۱/۸٪ با توان ضعیف، دارای قدرت تشکیل بیوفیلم دارند. بر اساس نتایج به&#8204;دست&#8204;آمده&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Duplex PCR&lt;/span&gt;، ۱۵ جدایه واجد ژن &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;pap&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;C&lt;/span&gt;، ۱۰ جدایه واجد ژن&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&amp;nbsp;&lt;em&gt;sfa&lt;/em&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;و ۹ جدایه نیز به&#8204;طور هم&#8204;زمان دارای هر دو ژن بودند&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;.&lt;/span&gt; ۱۰۰٪ جدایه&#8204;هایی که دارای هر دو ژن &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&amp;nbsp;&lt;em&gt;pap&lt;/em&gt;C&lt;/span&gt; و&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt; sfa&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; بودند، توانایی ایجاد بیوفیلم را داشتند.&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;نتیجه&#8204;گیری:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt; نتایج نشان داد که بیشتر&amp;nbsp;&lt;em&gt;اشریشیا کلی&lt;/em&gt; یوروپاتوژن عامل عفونت&#8204;های ادراری، توانایی تشکیل بیوفیلم رادارند. همچنین فراوانی ژن&#8204;های&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&amp;nbsp;papC&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&amp;nbsp;و&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&amp;nbsp;&lt;em&gt;sfa&lt;/em&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt; کد کننده پیلی نیز در این جدایه&#8204;ها می&#8204;توانند به&#8204;عنوان یکی از عوامل اتصال این باکتری&#8204;ها عمل کند&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;.&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14.0pt;&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:16px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Background and Objective:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;Uropathogenic &lt;em&gt;Escherichia coli&lt;/em&gt; (UPEC) are the most common cause of urinary tract infections. The binding of these bacteria to epithelial cells and the formation of biofilms cause these bacteria to be further colonized and difficult to remove in the urinary tract. This study aimed to determine the antibiotic resistance and to evaluate the biofilm formation power in &lt;em&gt;Escherichia coli&lt;/em&gt; isolated from pregnant women in the city of Karaj, Iran.&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Materials and Methods:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt; This descriptive-analytical study was performed on 64 isolates of UPEC. Identification of these bacteria was determined using biochemical tests and antibiotic resistance by Kirby &amp;ndash; Bauer method and according to the recommendation of the Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI 2017) guideline. The ability to form biofilms, using the microtiter plate method and the presence of &lt;em&gt;pap&lt;/em&gt;C and &lt;em&gt;sfa&lt;/em&gt; genes was examined by Duplex PCR.&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Results:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt; Based on the results; the highest levels of resistance were related to cotrimoxazole (40.6%), and ampicillin (31.3%). The examination of biofilm formation by the phenotypic method also showed that of the isolates, 48.4% (strongly), 15.6% (moderately) and 21.8% (weakly) have biofilm formation power. Based on the obtained Duplex PCR results, 15 isolates had &lt;em&gt;pap&lt;/em&gt;C gene, 10 isolates had &lt;em&gt;sfa&lt;/em&gt; gene and 9 isolates had both genes simultaneously. 100% of the isolates with both &lt;em&gt;pap&lt;/em&gt;C and &lt;em&gt;sfa&lt;/em&gt; genes were able to produce biofilms.&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#16a085;&quot;&gt;Conclusion:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt; The results showed that most UPEC causing urinary tract infections can form biofilms. Also, the abundance of &lt;em&gt;pap&lt;/em&gt;C and &lt;em&gt;sfa&lt;/em&gt; genes encoding pili in these strains can act as one of the binding factors of this bacterium.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;</abstract>
	<keyword_fa>اشریشیا کلی یوروپاتوژن, بیوفیلم, Duplex PCR</keyword_fa>
	<keyword>Uropathogenic Escherichia coli (UPEC), Biofilm formation, Duplex PCR, Antibiotic resistance</keyword>
	<start_page>195</start_page>
	<end_page>211</end_page>
	<web_url>http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-733-5&amp;slc_lang=en&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Maryam</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Nikzad</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مریم</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>نیک زاد</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>mnikzad376@gmail.com</email>
	<code>100319475328460016431</code>
	<orcid>100319475328460016431</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, Karaj Branch, Islamic Azad University, Karaj, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>کارشناسی ارشد رشته میکروبیولوژی، گروه میکروبیولوژی، واحد کرج، دانشگاه آزاد اسلامی، کرج، ایران.</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Reza</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Mirnejad</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>رضا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>میرنژاد</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>rmirnejad@yahoo.com</email>
	<code>100319475328460016432</code>
	<orcid>100319475328460016432</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Molecular Biology Research Center, Systems Biology and Poisonings Institute, Baqiyatallah University of Medical Sciences, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>استاد باکتری‌شناسی پزشکی، مرکز تحقیقات بیولوژی مولکولی، پژوهشگاه سیستم بیولوژی و مسمومیت‌ها دانشگاه علوم پزشکی بقیه‌ا...(عج). تهران، ایران.</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Ebrahim</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Babapour</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>ابراهیم</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>باباپور</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>e_babapoor@yahoo.com</email>
	<code>100319475328460016433</code>
	<orcid>100319475328460016433</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, Karaj Branch, Islamic Azad University, Karaj, Iran </affiliation>
	<affiliation_fa>استادیار میکروبیولوژی، گروه ‌میکروبیولوژی، واحد کرج، دانشگاه آزاد اسلامی، کرج، ایران.</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
