Iranian Journal of Medical Microbiology

fa تنوع ژنتیکی و رابطه فیلوژنی ایزوله‌های بالینی بروسلا ملی تنسیس بر اساس پلی‌مورفیسم ژن زیرواحد β آنزیم RNA پلیمراز) ژن (rpoB در ایران Genetic Diversity and Phylogenetic Relationship of Clinical Isolates of Brucella melitensis Based on Gene Polymorphism of β Subunit of RNA Polymerase (rpoB) Gene in Iran بیماری های مشترک انسان - دام Zoonoses Research مقاله پژوهشی Original Research Article <div style="text-align: justify;">زمینه و اهداف: گسترش عفونت‌های بروسلا در حیوانات و انسان‌ نیاز اساسی آزمایشگاه‌های مرجع منطقه‌ای/ محلی مختلف را برای استفاده از رویکردهای معتبر تعیین گونه به منظور تسهیل تبادل داده‌ها و مقایسه آنها نشان داده ‌است. هدف از این مطالعه ارزیابی زیرواحد β آنزیم RNA پلیمراز  (rpoB) به عنوان یک نشانگر مولکولی در تمایز گونه های بروسلا و تعیین ژنوتیپ گونه های بروسلا ملی تنسیس با استفاده از تجزیه و تحلیل چندشکلی تک نوکلیوتیدی (SNP) است. مواد و روش کار: در این مطالعه، نمونه خون و مایع مغزی نخاعی از ۱۰۸بیمار مبتلا به بروسلوزیس گرفته شد. پس از کشت نمونه ها در محیط کشت بروسلا آگار حاوی آنتی بیوتیک، تعداد ۱۱ سویه باکتری بروسلا جداسازی شد و با روش های بیوتایپینگ کلاسیک و مولکولی شناسایی شد. سپس ژن rpoB هر کدام از ایزوله ها تکثیر و توالی یابی گردید. نتایج توالی یابی توسط برنامه Mega۶ آنالیز گردید. یافته ها: طبق نتایج، ژن rpoB  قادر به تمایز گونه های بروسلا از همدیگر و سایر باکتری‌ها بود و همچنین مشخص شد که ایزوله های بالینی بروسلا دارای تیپ دو rpoB و ژنوتیپ ۲ بروسلا ملی تنسیس  هستند. در حالی که تنها یکی از ایزوله ها متعلق به تیپ ۱ بود. از ۱۰ سویه rpoB تیپ ۲، شش نمونه با تنها یک نوع منحصر به فرد جهش نقطه ای در کدون ۹۸۵ مشاهده شدند که نوع جدیدی از تحت گونه ژنوتیپ ۲ می باشد. نتیجه‌گیری: نتایج ما نشان‌دهنده قدرت تمایز بالای ژن rpoB در بین جدایه های بروسلا از برخی مناطق مختلف ایران است که منجر به تعیین ژنوتایپ دقیق و شناسایی این باکتری‌ها شد.</div> <div style="text-align: justify;"> <div style="direction: ltr;">Background:  The prevalence of Brucella infections in animals and humans has indicated the important need for different regional/local reference laboratories to use valid species-determining approaches to facilitate and compare data exchange. The purpose of current study was to evaluate the RNA Polymerase Beta Subunit (rpoB) as a molecular marker in Brucella species differentiation and to determine the genotype of Brucella melitensis species using single-nucleotide polymorphism (SNP) analysis.</div> <div style="direction: ltr;">Materials & Methods:  In this study, blood and cerebrospinal fluid (CSF) samples were taken from 108 patients with brucellosis. After culturing the samples insupplemented Brucella agar, eleven isolates of Brucella bacteria were isolated and identified by classical and molecular biotyping methods. Then the complete sequence of their rpoB gene was multiplied and sequenced. Sequencing results were analyzed by Mega6 program.</div> <div style="direction: ltr;">Results:   According to the results, the rpoB gene was able to differentiate between Brucella species and other bacteria.Moreover, the rpoB typing grouped the majority of Iranian isolates in the rpoB type 2, while only one strain belonged to the rpoB type 1. Among the 10 isolates of rpoB type 2, there are six different isolates with only one unique type-2 SNPs in codon 985, which gives rise to new genotype 2 variants.</div> <div style="direction: ltr;">Conclusion:   Our results shown a high discriminative power of rpoB gene among B. melitensis strains from some regions of Iran, which leads to accurate genotype and identification of these bacteria.</div> </div> تب مالت, بروسلا ملی تنسیس, چندشکلی تک نوکلئوتیدی, rpoB RpoB, Brucella melitensis, SNP analysis, Phylogenetic 425 440 http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-1436-1&slc_lang=fa&sid=1 Nasim Bazrgari نسیم بذرگری ba.nasim2020@gmail.com 100319475328460015742 100319475328460015742 No Agricultural Biotechnology Department, Faculty of Engineering & Technology, Imam Khomeini International University, Qazvin, Iran گروه بیوتکنولوژی کشاورزی ، دانشگاه بین المللی امام خمینی ، قزوین ، ایران Ghasem Ali Garoosi قاسم علی گروسی ga.garoosi@ikiu.ac.ir 100319475328460015743 100319475328460015743 No Agricultural Biotechnology Department, Faculty of Engineering & Technology, Imam Khomeini International University, Qazvin, Iran گروه بیوتکنولوژی کشاورزی ، دانشگاه بین المللی امام خمینی ، قزوین ، ایران Maryam Dadar مریم دادار dadar.m77@gmail.com 100319475328460015744 000000015831801X Yes Brucellosis Department, Razi vaccine and serum Research Institute (RVSRI), Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran. بخش بروسلوز، موسسه تحقیقات واکسن و سرم‌سازی رازی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران.