<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian Journal of Medical Microbiology</title>
<title_fa>مجله میکروب شناسی پزشکی ایران</title_fa>
<short_title>Iran J Med Microbiol</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://ijmm.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-8612</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2345-4342</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.30699/ijmm</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1399</year>
	<month>6</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2020</year>
	<month>9</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>14</volume>
<number>5</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>بررسی فنوتیپی و ژنوتیپی تشکیل بیوفیلم توسط استافیلوکوکوس اورئوس‌های جداشده  از نمونه‌های بالینی و ارتباط آن با مقاومت میکروبی</title_fa>
	<title>Evaluation of Genotypic and Phenotypic Biofilm Formation by Staphylococcus aureus Isolated from Clinical Samples and Their Association with Antimicrobial Resistance</title>
	<subject_fa>باکتری شناسی پزشکی </subject_fa>
	<subject>Medical Bacteriology</subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Original Research Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;div style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:IRANsans;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#2980b9;&quot;&gt;زمینه و اهداف:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;em&gt;استافیلوکوکوس اورئوس&lt;/em&gt; از مهمترین عوامل عفونت&#8204;های بیمارستانی، با تشکیل بیوفیلم در ایجاد بیماری&#8204;های مزمن و تقویت مقاومت دارویی موثر است. مطالعه حاضر با هدف بررسی فنوتیپی و ژنوتیپی تشکیل بیوفیلم توسط جدایه&#8204;های &lt;em&gt;استافیلوکوکوس&lt;/em&gt; &lt;em&gt;اورئوس&lt;/em&gt; از نمونه&#8204;های بالینی و ارتباط آن با مقاومت میکروبی انجام گردید.&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#2980b9;&quot;&gt;مواد و روش کار: &lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;در این مطالعه مقطعی-توصیفی از دی ماه 1397 تا شهریور ماه 1398، 200 نمونه بالینی از بیمارستان&#8204;های آجا در تهران اخذ گردید. کلیه نمونه&#8204;ها با استفاده از محیط های کشت بلاد آگار، مانیتول سالت آگار، بردپارکر و تست&#8204;های کاتالاز، &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;OF&lt;/span&gt; و کوآگولاز مورد بررسی قرار گرفت. تعیین مقاومت جدایه&#8204;ها با تست آنتی&#8204;بیوگرام انجام شد. به&#8204;منظور شناسایی حضور ژن&#8204;های کد کننده بیوفیلم شامل&amp;nbsp; &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;icaA&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;، &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;icaB&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;em&gt;،&lt;/em&gt; &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;icaC&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; و &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;icaD&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; از روش &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Multiplex PCR&lt;/span&gt; استفاده گردید. داده&#8204;ها با نرم افزار &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;SPSS&lt;/span&gt; و آزمون کای2 بررسی گردید. &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:9.0pt;&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#2980b9;&quot;&gt;یافته&#8204;ها:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt; از 200 نمونۀ کشت شده، 83 (41/5%) جدایه به عنوان &lt;em&gt;استافیلوکوکوس&lt;/em&gt; &lt;em&gt;اورئوس&lt;/em&gt; تأیید گردید. بیشترین مقاومت در پنی&#8204;سیلین (94%)، تتراسایکلین (72%)، آمپی&#8204;سیلین (54%) و سفکسیتین (51%) مشاهده شد. تولید بیوفیلم به&#8204;صورت فنوتیپی در 65% جدایه&#8204;ها گزارش شد. فراوانی حضور ژن&#8204;های &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;icaA&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;، &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;icaB&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;em&gt;،&lt;/em&gt; &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;icaC&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; و &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;icaD&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; به ترتیب 67/4%، 60/2%، 61/4% و 6/62%، برآورد گردید. 87% از سویه&#8204;های مولد بیوفیلم توانایی مقاومت چندگانه داشتند، در مقابل سویه&#8204;های بیوفیلم منفی فاقد این توانایی بودند (0/05&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;P&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;).&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;color:#ffffff;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;background-color:#2980b9;&quot;&gt;نتیجه&#8204;گیری:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;با توجه به نتایج حاصله، سویه&#8204;های مولد بیوفیلم تمایل بیشتری برای ایجاد مقاومت میکروبی، مقاومت چند دارویی و مقاومت به متی&#8204;سیلین نشان می&#8204;دهند.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/div&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;div style=&quot;direction: ltr; text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background:#1F497D;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:white;&quot;&gt;Background:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &amp;nbsp;&lt;/strong&gt;&lt;em&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;Staphylococcus&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;color: black;&quot;&gt; &lt;em&gt;aureus&lt;/em&gt; is one of the most important bacteria causes nosocomial infections, which by the biofilm formation can be effective in the creation of chronic diseases, and the creation and strengthening of drug resistance. &lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;color: black;&quot;&gt;The present study aimed &lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;color: black;&quot;&gt;to evaluate the genotypic and phenotypic biofilm formation by &lt;em&gt;S.&lt;/em&gt; &lt;em&gt;aureus&lt;/em&gt; isolated from clinical samples and their &lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;color: black;&quot;&gt;association &lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;color: black;&quot;&gt;with antimicrobial resistance.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&amp;nbsp;&lt;span style=&quot;letter-spacing:-.1pt;background:#1F497D;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:white;&quot;&gt;Materials &amp; Methods:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/strong&gt; &amp;nbsp;&lt;span style=&quot;letter-spacing: -0.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;In this&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;letter-spacing: -0.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;descriptive&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;letter-spacing: -0.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt; cross-sectional study from &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;letter-spacing: -0.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;Dec &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;letter-spacing: -0.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;2019 to &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;letter-spacing: -0.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;Sep &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;letter-spacing: -0.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;2019, 200 clinical samples were obtained from AJA hospitals in Tehran. &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;letter-spacing: -0.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;All samples were analyzed using blood agar, &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;letter-spacing: -0.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;Baird-Parker Agar&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;letter-spacing: -0.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;, mannitol salt agar and catalase, OF and coagulase assays.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;letter-spacing: -0.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt; Antimicrobial resistance pattern &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;letter-spacing: -0.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;of isolates was determined by the disc diffusion method&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;letter-spacing: -0.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;. Multiplex PCR method was used to identify biofilm formation genes, &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;letter-spacing: -0.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;includes&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;em&gt;&lt;span style=&quot;letter-spacing:-.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;icaA&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;letter-spacing: -0.1pt;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;, &lt;em&gt;icaB&lt;/em&gt;, &lt;em&gt;icaC&lt;/em&gt;, and &lt;em&gt;icaD&lt;/em&gt; genes. Data analyzed using SPSS 20 and the X&lt;sup&gt;2&lt;/sup&gt; test.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/div&gt;
&lt;div style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;/div&gt;

&lt;div style=&quot;direction: ltr; text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background:#1F497D;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:white;&quot;&gt;Results:&amp;nbsp; &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/strong&gt;&lt;span style=&quot;color: black;&quot;&gt;Out of 200 cultivated samples, 83 (41.5%) cases were confirmed as &lt;em&gt;S.&lt;/em&gt; &lt;em&gt;aureus&lt;/em&gt;. The highest resistance was observed to Penicillin (94%), Tetracycline (72%), Ampicillin (54%), and Cefoxitin (51%), respectively. Phenotypic biofilm formation ability reported in 65% of isolates. The frequency of presence of &lt;em&gt;icaA&lt;/em&gt;, &lt;em&gt;icaB&lt;/em&gt;, &lt;em&gt;icaC&lt;/em&gt;, and &lt;em&gt;icaD&lt;/em&gt; genes was estimated at 67.4%, 60.2%, 61.4%, and 62.6%, respectively. Eighty-seven percent of biofilm producing strains were multidrug&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;-&lt;/span&gt;resistant, &lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;color: black;&quot;&gt;while&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;color: black;&quot;&gt; all the biofilm negative strains were non- multiple drug resistance (&lt;em&gt;P&lt;/em&gt;&lt; 0/05).&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/div&gt;
&lt;div style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;/div&gt;

&lt;div style=&quot;direction: ltr; text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;background:#1F497D;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:white;&quot;&gt;Conclusion: &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;/strong&gt;&lt;span style=&quot;color: black;&quot;&gt;&amp;nbsp;According to the results, Biofilm-positive strains have a very high propensity to demonstrate antimicrobial resistance, multidrug resistance and resistance to methicillin.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/div&gt;
&lt;div style=&quot;direction: ltr; text-align: justify;&quot;&gt;&lt;/div&gt;

&lt;div style=&quot;direction: ltr; text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;display: none;&quot;&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/span&gt;&lt;/div&gt;

&lt;div style=&quot;direction: ltr; text-align: justify;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;display: none;&quot;&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/div&gt;</abstract>
	<keyword_fa>استافیلوکوکوس اورئوس, بیوفیلم, مقاومت ضدمیکروبی, MRSA</keyword_fa>
	<keyword>Staphylococcus aureus, Biofilm, Antimicrobial Resistance, MRSA</keyword>
	<start_page>441</start_page>
	<end_page>459</end_page>
	<web_url>http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-1051-1&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Hossein</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Ghaderi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>حسین</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>قادری</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>ghaderish93@gmail.com</email>
	<code>100319475328460015678</code>
	<orcid>100319475328460015678</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Ph.D. Student, Department of Bacteriology, School of Veterinary Science, Shiraz University, Shiraz. Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشجو دکتری، گروه باکتری شناسی، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه شیراز، شیراز، ایران.</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Ebadallah</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Shiri Malekabad</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>عبادالله</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>شیری ملک آباد</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>ebad.shiri1986@gmail.com</email>
	<code>100319475328460015679</code>
	<orcid>100319475328460015679</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Instructor, Department of Biostatistics, Army Medical University (AJA), Tehran, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>مربی، گروه آمار زیستی، دانشکده پیراپزشکی، دانشگاه علوم پزشکی ارتش (آجا)، تهران، ایرا ن.</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mahmoud</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Vahidi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمود</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>وحیدی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>mahmoud.vahidi@gmail.com</email>
	<code>100319475328460015680</code>
	<orcid>100319475328460015680</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Assistant Professor, Department of Laboratory Sciences, Army Medical University (AJA), Tehran, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>استادیار، گروه علوم آزمایشگاهی، دانشکده پیراپزشکی، دانشگاه علوم پزشکی ارتش (آجا)، تهران، ایران.</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Ali-Reza</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Dadashi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>علیرضا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>داداشی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>drdadashialireza@gmail.com</email>
	<code>100319475328460015681</code>
	<orcid>100319475328460015681</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Assistant Professor, Infectious Disease Department, AJA University of Medical Sciences, Tehran, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>استادیار، گروه بیماری های عفونی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی ارتش (آجا)، تهران، ایران.</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
